MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_013198	TGC	2	6	2862285	2862290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509794
45003	NC_013198	A	6	6	2862310	2862315	100 %	0 %	0 %	0 %	258509794
45004	NC_013198	ACC	2	6	2862328	2862333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509794
45005	NC_013198	CAG	2	6	2862373	2862378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509794
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45007	NC_013198	TGA	2	6	2862489	2862494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509794
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45009	NC_013198	AAT	2	6	2862571	2862576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509794
45010	NC_013198	TGC	2	6	2862596	2862601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509794
45011	NC_013198	ATC	2	6	2862604	2862609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509794
45012	NC_013198	CAA	2	6	2862619	2862624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509794
45013	NC_013198	GCA	2	6	2862625	2862630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509794
45014	NC_013198	GAT	2	6	2862634	2862639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509794
45015	NC_013198	ATC	2	6	2862669	2862674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509794
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45019	NC_013198	GCT	2	6	2863006	2863011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509795
45020	NC_013198	CAT	3	9	2863196	2863204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509795
45021	NC_013198	CTG	2	6	2863232	2863237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509795
45022	NC_013198	GTC	2	6	2863251	2863256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509795
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45098	NC_013198	CAAC	2	8	2868501	2868508	50 %	0 %	0 %	50 %	258509798
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45115	NC_013198	AACCG	2	10	2869544	2869553	40 %	0 %	20 %	40 %	258509798
45116	NC_013198	AACC	2	8	2869568	2869575	50 %	0 %	0 %	50 %	258509798
45117	NC_013198	TCT	2	6	2869700	2869705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509798
45118	NC_013198	ATG	2	6	2869760	2869765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509798
45119	NC_013198	CCA	2	6	2869821	2869826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509798
45120	NC_013198	AAC	2	6	2869861	2869866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509798
45121	NC_013198	CAAC	2	8	2869938	2869945	50 %	0 %	0 %	50 %	258509798
45122	NC_013198	TAA	2	6	2869972	2869977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509798
45123	NC_013198	CTG	2	6	2869991	2869996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509798
45124	NC_013198	GCA	2	6	2870006	2870011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509798
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45126	NC_013198	ATC	2	6	2870054	2870059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509798
45127	NC_013198	ACTG	3	12	2870070	2870081	25 %	25 %	25 %	25 %	258509798
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45132	NC_013198	CAA	2	6	2870262	2870267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509798
45133	NC_013198	CAT	2	6	2870272	2870277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509798
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45172	NC_013198	ACCTG	2	10	2872815	2872824	20 %	20 %	20 %	40 %	258509801
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45178	NC_013198	TGA	2	6	2873267	2873272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509801
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45192	NC_013198	CA	3	6	2874331	2874336	50 %	0 %	0 %	50 %	258509804
45193	NC_013198	ACAA	2	8	2874337	2874344	75 %	0 %	0 %	25 %	258509804
45194	NC_013198	TTG	2	6	2874405	2874410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509804
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45198	NC_013198	CATC	2	8	2874509	2874516	25 %	25 %	0 %	50 %	258509804
45199	NC_013198	GCATCG	2	12	2874640	2874651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509804
45200	NC_013198	ATG	2	6	2874720	2874725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509804
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45202	NC_013198	AAC	2	6	2874817	2874822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509804
45203	NC_013198	TCA	2	6	2875004	2875009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509804
45204	NC_013198	GCT	3	9	2875092	2875100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509804
45205	NC_013198	TG	3	6	2875375	2875380	0 %	50 %	50 %	0 %	258509805
45206	NC_013198	ATT	2	6	2875395	2875400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509805
45207	NC_013198	TCA	2	6	2875448	2875453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509805
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45210	NC_013198	CATACT	2	12	2875622	2875633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509805
45211	NC_013198	T	6	6	2875693	2875698	0 %	100 %	0 %	0 %	258509805
45212	NC_013198	CTG	2	6	2875761	2875766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509805
45213	NC_013198	CGTG	2	8	2875779	2875786	0 %	25 %	50 %	25 %	258509805
45214	NC_013198	CG	3	6	2875871	2875876	0 %	0 %	50 %	50 %	258509805
45215	NC_013198	CTG	2	6	2875929	2875934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509805
45216	NC_013198	TCGC	2	8	2876093	2876100	0 %	25 %	25 %	50 %	258509806
45217	NC_013198	ACT	2	6	2876101	2876106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
45218	NC_013198	ATC	2	6	2876107	2876112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
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45220	NC_013198	CAGC	2	8	2876173	2876180	25 %	0 %	25 %	50 %	258509806
45221	NC_013198	ATA	2	6	2876215	2876220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509806
45222	NC_013198	CTA	2	6	2876255	2876260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
45223	NC_013198	CAC	2	6	2876332	2876337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509806
45224	NC_013198	CAT	2	6	2876523	2876528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509806
45225	NC_013198	TCG	2	6	2876680	2876685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509806
45226	NC_013198	ATA	2	6	2876773	2876778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509806
45227	NC_013198	TTG	2	6	2876788	2876793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509806
45228	NC_013198	GGC	2	6	2876813	2876818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509806
45229	NC_013198	TTC	2	6	2876869	2876874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509806
45230	NC_013198	GTC	2	6	2876900	2876905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509806
45231	NC_013198	TTAA	2	8	2876975	2876982	50 %	50 %	0 %	0 %	258509806
45232	NC_013198	T	6	6	2876989	2876994	0 %	100 %	0 %	0 %	258509806
45233	NC_013198	TTTGA	2	10	2877046	2877055	20 %	60 %	20 %	0 %	258509806
45234	NC_013198	CTTG	2	8	2877057	2877064	0 %	50 %	25 %	25 %	258509806
45235	NC_013198	A	6	6	2877067	2877072	100 %	0 %	0 %	0 %	258509806
45236	NC_013198	GATA	2	8	2877108	2877115	50 %	25 %	25 %	0 %	258509806
45237	NC_013198	TTG	2	6	2877214	2877219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509806
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45240	NC_013198	TAA	2	6	2877281	2877286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509806
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45250	NC_013198	CGC	2	6	2877766	2877771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509807
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45339	NC_013198	A	6	6	2882869	2882874	100 %	0 %	0 %	0 %	258509812
45340	NC_013198	GGT	2	6	2882892	2882897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509812
45341	NC_013198	GTC	2	6	2882955	2882960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509812
45342	NC_013198	CAA	2	6	2883000	2883005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509812
45343	NC_013198	TCA	2	6	2883085	2883090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509812
45344	NC_013198	ATC	2	6	2883150	2883155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509812
45345	NC_013198	CGCCCA	2	12	2883173	2883184	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258509812
45346	NC_013198	GAA	3	9	2883315	2883323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509812
45347	NC_013198	ATC	2	6	2883340	2883345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509812
45348	NC_013198	AGC	2	6	2883485	2883490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509812
45349	NC_013198	CAA	2	6	2883525	2883530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509812
45350	NC_013198	GCTG	2	8	2883566	2883573	0 %	25 %	50 %	25 %	258509812
45351	NC_013198	AAC	2	6	2883583	2883588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509812
45352	NC_013198	GCA	2	6	2883687	2883692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509812
45353	NC_013198	TCA	2	6	2883694	2883699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509812
45354	NC_013198	CAC	2	6	2883708	2883713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509812
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45356	NC_013198	CG	3	6	2883911	2883916	0 %	0 %	50 %	50 %	258509812
45357	NC_013198	TCA	2	6	2884003	2884008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509812
45358	NC_013198	GGC	2	6	2884093	2884098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509813
45359	NC_013198	CATC	2	8	2884142	2884149	25 %	25 %	0 %	50 %	258509813
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45361	NC_013198	CAT	2	6	2884224	2884229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509813
45362	NC_013198	GCA	2	6	2884288	2884293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509813
45363	NC_013198	GCCT	2	8	2884448	2884455	0 %	25 %	25 %	50 %	258509813
45364	NC_013198	CGC	2	6	2884515	2884520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509813
45365	NC_013198	GCA	2	6	2884548	2884553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509813
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45368	NC_013198	GCA	2	6	2884815	2884820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509813
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45402	NC_013198	TTTCA	2	10	2886704	2886713	20 %	60 %	0 %	20 %	258509814
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45445	NC_013198	CCAG	2	8	2889302	2889309	25 %	0 %	25 %	50 %	258509817
45446	NC_013198	GTT	2	6	2889324	2889329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509817
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45458	NC_013198	AATG	2	8	2890143	2890150	50 %	25 %	25 %	0 %	258509819
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45491	NC_013198	A	6	6	2893129	2893134	100 %	0 %	0 %	0 %	258509825
45492	NC_013198	TTG	2	6	2893196	2893201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509825
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