MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_013198	TGA	2	6	222703	222708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507204
3503	NC_013198	CTTTT	2	10	222746	222755	0 %	80 %	0 %	20 %	258507204
3504	NC_013198	TG	3	6	222786	222791	0 %	50 %	50 %	0 %	258507204
3505	NC_013198	A	6	6	222815	222820	100 %	0 %	0 %	0 %	258507204
3506	NC_013198	CCG	2	6	222831	222836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507204
3507	NC_013198	ATC	2	6	222842	222847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507204
3508	NC_013198	A	6	6	222858	222863	100 %	0 %	0 %	0 %	258507204
3509	NC_013198	TTCGT	2	10	222888	222897	0 %	60 %	20 %	20 %	258507204
3510	NC_013198	GT	3	6	222896	222901	0 %	50 %	50 %	0 %	258507204
3511	NC_013198	GAG	2	6	222938	222943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507204
3512	NC_013198	GCA	2	6	222957	222962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507204
3513	NC_013198	AAG	2	6	222991	222996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507204
3514	NC_013198	GCA	2	6	223017	223022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507204
3515	NC_013198	GAA	2	6	223037	223042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507204
3516	NC_013198	TTA	2	6	223116	223121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507204
3517	NC_013198	TAA	2	6	223297	223302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507204
3518	NC_013198	TCAG	2	8	223308	223315	25 %	25 %	25 %	25 %	258507204
3519	NC_013198	TCAA	2	8	223356	223363	50 %	25 %	0 %	25 %	258507204
3520	NC_013198	AGT	2	6	223389	223394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507204
3521	NC_013198	TTG	2	6	223417	223422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507204
3522	NC_013198	TTA	2	6	223576	223581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507205
3523	NC_013198	CT	3	6	223650	223655	0 %	50 %	0 %	50 %	258507205
3524	NC_013198	CGAA	2	8	223661	223668	50 %	0 %	25 %	25 %	258507205
3525	NC_013198	CTA	2	6	223687	223692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507205
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3529	NC_013198	AAC	2	6	223812	223817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507205
3530	NC_013198	CG	3	6	223848	223853	0 %	0 %	50 %	50 %	258507205
3531	NC_013198	TCAA	2	8	224059	224066	50 %	25 %	0 %	25 %	258507205
3532	NC_013198	GGC	2	6	224081	224086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507205
3533	NC_013198	TGA	2	6	224209	224214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507205
3534	NC_013198	ATG	2	6	224238	224243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507205
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3536	NC_013198	A	6	6	224326	224331	100 %	0 %	0 %	0 %	258507205
3537	NC_013198	TCT	2	6	224455	224460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507205
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3542	NC_013198	AGC	2	6	224878	224883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507206
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3544	NC_013198	AAG	3	9	225136	225144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507206
3545	NC_013198	CTGA	2	8	225159	225166	25 %	25 %	25 %	25 %	258507206
3546	NC_013198	GC	3	6	225224	225229	0 %	0 %	50 %	50 %	258507206
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3553	NC_013198	CGG	2	6	225643	225648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507206
3554	NC_013198	GAT	2	6	225683	225688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507206
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3556	NC_013198	GAC	2	6	225743	225748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507206
3557	NC_013198	TCA	2	6	225749	225754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507206
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3559	NC_013198	CTT	2	6	225824	225829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507206
3560	NC_013198	GT	3	6	225861	225866	0 %	50 %	50 %	0 %	258507206
3561	NC_013198	CG	3	6	225896	225901	0 %	0 %	50 %	50 %	258507206
3562	NC_013198	T	6	6	225910	225915	0 %	100 %	0 %	0 %	258507206
3563	NC_013198	CT	3	6	225955	225960	0 %	50 %	0 %	50 %	258507206
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3566	NC_013198	TGC	2	6	226015	226020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507206
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3569	NC_013198	GTT	2	6	226155	226160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507206
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3571	NC_013198	GCA	2	6	226285	226290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507206
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3573	NC_013198	TGA	2	6	226618	226623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507207
3574	NC_013198	TGA	2	6	226678	226683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507207
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3588	NC_013198	CA	3	6	227585	227590	50 %	0 %	0 %	50 %	258507207
3589	NC_013198	TGA	2	6	227696	227701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507207
3590	NC_013198	ATG	2	6	227803	227808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507207
3591	NC_013198	TGA	2	6	227836	227841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507207
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3593	NC_013198	TTC	2	6	228043	228048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507208
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3595	NC_013198	GGC	2	6	228098	228103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507208
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3598	NC_013198	GTT	2	6	228150	228155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507208
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3600	NC_013198	TGA	2	6	228267	228272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507208
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3602	NC_013198	GCAT	2	8	228530	228537	25 %	25 %	25 %	25 %	258507208
3603	NC_013198	TTG	2	6	228590	228595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507208
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3605	NC_013198	TGCT	2	8	228804	228811	0 %	50 %	25 %	25 %	258507209
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3614	NC_013198	A	6	6	229505	229510	100 %	0 %	0 %	0 %	258507210
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3618	NC_013198	ATG	2	6	229632	229637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507210
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3622	NC_013198	CTT	2	6	229696	229701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507210
3623	NC_013198	CAT	2	6	229702	229707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507210
3624	NC_013198	TGC	2	6	229711	229716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507210
3625	NC_013198	CGCT	2	8	229723	229730	0 %	25 %	25 %	50 %	258507210
3626	NC_013198	GATGC	2	10	229736	229745	20 %	20 %	40 %	20 %	258507210
3627	NC_013198	GCT	2	6	229754	229759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507210
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3677	NC_013198	TGA	2	6	233181	233186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507215
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3728	NC_013198	ATC	2	6	236423	236428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507222
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3735	NC_013198	TGA	2	6	236632	236637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507223
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3740	NC_013198	GCGGAT	2	12	236855	236866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258507223
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3742	NC_013198	GC	3	6	236928	236933	0 %	0 %	50 %	50 %	258507223
3743	NC_013198	GCA	2	6	237136	237141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507224
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3750	NC_013198	TG	3	6	237641	237646	0 %	50 %	50 %	0 %	258507225
3751	NC_013198	GC	3	6	237656	237661	0 %	0 %	50 %	50 %	258507225
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3855	NC_013198	TG	3	6	245601	245606	0 %	50 %	50 %	0 %	258507237
3856	NC_013198	A	6	6	245783	245788	100 %	0 %	0 %	0 %	258507237
3857	NC_013198	CGC	2	6	245790	245795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507237
3858	NC_013198	CG	3	6	245825	245830	0 %	0 %	50 %	50 %	258507237
3859	NC_013198	GGC	2	6	245833	245838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507237
3860	NC_013198	AGC	2	6	245877	245882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507237
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3985	NC_013198	ATT	2	6	252182	252187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507244
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3987	NC_013198	TGC	2	6	252232	252237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507244
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