MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_013198	TAA	2	6	2407443	2407448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509328
38003	NC_013198	CAT	2	6	2407501	2407506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509328
38004	NC_013198	ATT	2	6	2407534	2407539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509328
38005	NC_013198	TCAA	2	8	2407568	2407575	50 %	25 %	0 %	25 %	258509329
38006	NC_013198	GTA	2	6	2407715	2407720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509329
38007	NC_013198	A	6	6	2407720	2407725	100 %	0 %	0 %	0 %	258509329
38008	NC_013198	ACC	2	6	2407727	2407732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509329
38009	NC_013198	ACGC	2	8	2407958	2407965	25 %	0 %	25 %	50 %	258509329
38010	NC_013198	TAA	2	6	2408039	2408044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509329
38011	NC_013198	AGCA	2	8	2408124	2408131	50 %	0 %	25 %	25 %	258509329
38012	NC_013198	TGC	2	6	2408241	2408246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509329
38013	NC_013198	GAT	2	6	2408276	2408281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509329
38014	NC_013198	GAC	2	6	2408346	2408351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509329
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38017	NC_013198	AAC	2	6	2408480	2408485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509329
38018	NC_013198	GCG	2	6	2408501	2408506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509329
38019	NC_013198	GCA	2	6	2408518	2408523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509329
38020	NC_013198	CAA	2	6	2408536	2408541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509329
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38024	NC_013198	TG	3	6	2408812	2408817	0 %	50 %	50 %	0 %	258509330
38025	NC_013198	TTG	2	6	2408920	2408925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509330
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38028	NC_013198	ATC	2	6	2409138	2409143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509331
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38032	NC_013198	TTC	2	6	2409393	2409398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509331
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38039	NC_013198	CCG	2	6	2409949	2409954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509331
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38041	NC_013198	GC	3	6	2410140	2410145	0 %	0 %	50 %	50 %	258509331
38042	NC_013198	TGG	2	6	2410201	2410206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509331
38043	NC_013198	AAAT	2	8	2410225	2410232	75 %	25 %	0 %	0 %	258509331
38044	NC_013198	CAT	2	6	2410248	2410253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509331
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38050	NC_013198	CCGT	2	8	2410688	2410695	0 %	25 %	25 %	50 %	258509331
38051	NC_013198	T	6	6	2410695	2410700	0 %	100 %	0 %	0 %	258509331
38052	NC_013198	ATG	2	6	2410714	2410719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509331
38053	NC_013198	A	6	6	2410795	2410800	100 %	0 %	0 %	0 %	258509331
38054	NC_013198	ACT	2	6	2411224	2411229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509332
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38057	NC_013198	CTG	2	6	2411296	2411301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509332
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38059	NC_013198	GCT	2	6	2411384	2411389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509332
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38062	NC_013198	TG	3	6	2411652	2411657	0 %	50 %	50 %	0 %	258509332
38063	NC_013198	CTTG	2	8	2411665	2411672	0 %	50 %	25 %	25 %	258509332
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38082	NC_013198	CAGC	2	8	2413173	2413180	25 %	0 %	25 %	50 %	258509333
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38085	NC_013198	TTCGA	2	10	2413370	2413379	20 %	40 %	20 %	20 %	258509333
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38087	NC_013198	AATTTC	2	12	2413513	2413524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258509333
38088	NC_013198	TGA	2	6	2413673	2413678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509334
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38090	NC_013198	CGT	2	6	2413791	2413796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509334
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38098	NC_013198	ACCC	2	8	2414371	2414378	25 %	0 %	0 %	75 %	258509334
38099	NC_013198	AAT	2	6	2414396	2414401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509334
38100	NC_013198	ATG	3	9	2414405	2414413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509334
38101	NC_013198	GCG	2	6	2414433	2414438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509334
38102	NC_013198	GGC	2	6	2414470	2414475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509334
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38105	NC_013198	T	6	6	2414544	2414549	0 %	100 %	0 %	0 %	258509334
38106	NC_013198	AAG	2	6	2414603	2414608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509334
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38108	NC_013198	CCAA	2	8	2414665	2414672	50 %	0 %	0 %	50 %	258509334
38109	NC_013198	AAAT	2	8	2414735	2414742	75 %	25 %	0 %	0 %	258509334
38110	NC_013198	TTC	2	6	2414750	2414755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509334
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38112	NC_013198	GCC	2	6	2414902	2414907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509335
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38466	NC_013198	ATC	2	6	2438238	2438243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509359
38467	NC_013198	TTA	2	6	2438273	2438278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509359
38468	NC_013198	CAT	2	6	2438309	2438314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509359
38469	NC_013198	CAA	2	6	2438368	2438373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509359
38470	NC_013198	TCA	2	6	2438379	2438384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509359
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38472	NC_013198	AGC	2	6	2438470	2438475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509359
38473	NC_013198	GTC	2	6	2438557	2438562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509359
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38477	NC_013198	TCAA	2	8	2438715	2438722	50 %	25 %	0 %	25 %	258509359
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38486	NC_013198	TG	3	6	2439196	2439201	0 %	50 %	50 %	0 %	258509360
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38490	NC_013198	CGCCCG	2	12	2439317	2439328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509360
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38492	NC_013198	GCA	2	6	2439369	2439374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509360
38493	NC_013198	ACA	2	6	2439465	2439470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509360
38494	NC_013198	GCCC	2	8	2439524	2439531	0 %	0 %	25 %	75 %	258509360
38495	NC_013198	CGGTA	2	10	2439545	2439554	20 %	20 %	40 %	20 %	258509360
38496	NC_013198	TTAA	2	8	2439573	2439580	50 %	50 %	0 %	0 %	258509360
38497	NC_013198	CCA	2	6	2439588	2439593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509360
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38499	NC_013198	GCA	3	9	2439801	2439809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509360
38500	NC_013198	ATC	2	6	2439840	2439845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509360

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