MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_013198	TCC	2	6	2343322	2343327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509269
37003	NC_013198	GTC	2	6	2343427	2343432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509269
37004	NC_013198	TAA	2	6	2343468	2343473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509269
37005	NC_013198	TTGG	2	8	2343505	2343512	0 %	50 %	50 %	0 %	258509269
37006	NC_013198	ATC	2	6	2343513	2343518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509269
37007	NC_013198	GAT	2	6	2343537	2343542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509269
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37009	NC_013198	GTC	2	6	2343579	2343584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509269
37010	NC_013198	TAA	2	6	2343850	2343855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509269
37011	NC_013198	GACTTT	2	12	2343915	2343926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258509269
37012	NC_013198	GGT	2	6	2343927	2343932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509269
37013	NC_013198	AAC	2	6	2343942	2343947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509269
37014	NC_013198	CTG	2	6	2344038	2344043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509269
37015	NC_013198	TTTA	2	8	2344149	2344156	25 %	75 %	0 %	0 %	258509269
37016	NC_013198	TTG	2	6	2344159	2344164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509269
37017	NC_013198	TTG	2	6	2344287	2344292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509269
37018	NC_013198	CCTTT	2	10	2344381	2344390	0 %	60 %	0 %	40 %	258509269
37019	NC_013198	GAA	2	6	2344688	2344693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509270
37020	NC_013198	A	6	6	2344692	2344697	100 %	0 %	0 %	0 %	258509270
37021	NC_013198	ATG	2	6	2344722	2344727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509270
37022	NC_013198	GGT	2	6	2344800	2344805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509270
37023	NC_013198	CA	3	6	2344811	2344816	50 %	0 %	0 %	50 %	258509270
37024	NC_013198	ACC	2	6	2344851	2344856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509270
37025	NC_013198	TATC	2	8	2344880	2344887	25 %	50 %	0 %	25 %	258509270
37026	NC_013198	GC	3	6	2344888	2344893	0 %	0 %	50 %	50 %	258509270
37027	NC_013198	CAA	2	6	2344895	2344900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509270
37028	NC_013198	ACTTC	2	10	2344975	2344984	20 %	40 %	0 %	40 %	258509270
37029	NC_013198	T	6	6	2344985	2344990	0 %	100 %	0 %	0 %	258509270
37030	NC_013198	AACC	2	8	2345036	2345043	50 %	0 %	0 %	50 %	258509270
37031	NC_013198	A	6	6	2345063	2345068	100 %	0 %	0 %	0 %	258509270
37032	NC_013198	AAAG	2	8	2345072	2345079	75 %	0 %	25 %	0 %	258509270
37033	NC_013198	TCA	2	6	2345176	2345181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509270
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37037	NC_013198	AAAGAT	2	12	2345529	2345540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	258509270
37038	NC_013198	ATT	2	6	2345789	2345794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509271
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37040	NC_013198	CGT	2	6	2345846	2345851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509271
37041	NC_013198	CCTT	2	8	2345863	2345870	0 %	50 %	0 %	50 %	258509271
37042	NC_013198	TAACCT	2	12	2345948	2345959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509271
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37046	NC_013198	AGC	2	6	2346036	2346041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509271
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37048	NC_013198	TCGA	2	8	2346076	2346083	25 %	25 %	25 %	25 %	258509271
37049	NC_013198	ATG	2	6	2346133	2346138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509271
37050	NC_013198	CATCTA	2	12	2346140	2346151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509271
37051	NC_013198	TGTT	2	8	2346158	2346165	0 %	75 %	25 %	0 %	258509271
37052	NC_013198	GCA	2	6	2346203	2346208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509272
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37054	NC_013198	CAG	2	6	2346295	2346300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509272
37055	NC_013198	GAT	2	6	2346364	2346369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509272
37056	NC_013198	CAT	2	6	2346480	2346485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509272
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37059	NC_013198	T	7	7	2346679	2346685	0 %	100 %	0 %	0 %	258509272
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37090	NC_013198	TGC	2	6	2348885	2348890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509274
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37098	NC_013198	CG	3	6	2349398	2349403	0 %	0 %	50 %	50 %	258509275
37099	NC_013198	CAAAC	2	10	2349410	2349419	60 %	0 %	0 %	40 %	258509275
37100	NC_013198	GT	3	6	2349440	2349445	0 %	50 %	50 %	0 %	258509275
37101	NC_013198	TAG	2	6	2349469	2349474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509275
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37103	NC_013198	CGG	2	6	2349608	2349613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509275
37104	NC_013198	ATA	2	6	2349681	2349686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509275
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37111	NC_013198	CGT	2	6	2350376	2350381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509276
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37114	NC_013198	A	6	6	2350542	2350547	100 %	0 %	0 %	0 %	258509276
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37116	NC_013198	GTTC	2	8	2350602	2350609	0 %	50 %	25 %	25 %	258509276
37117	NC_013198	TGT	2	6	2350618	2350623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509276
37118	NC_013198	TGG	2	6	2350639	2350644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509276
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37145	NC_013198	GCA	2	6	2352090	2352095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509277
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37220	NC_013198	ACT	2	6	2356514	2356519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509278
37221	NC_013198	GCC	2	6	2356526	2356531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509278
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37223	NC_013198	CTG	3	9	2356596	2356604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509278
37224	NC_013198	ACTTGC	2	12	2356616	2356627	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258509278
37225	NC_013198	ACT	2	6	2356658	2356663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509278
37226	NC_013198	CCGATG	2	12	2356755	2356766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509278
37227	NC_013198	AAT	2	6	2356770	2356775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509278
37228	NC_013198	TCT	2	6	2356792	2356797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509278
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37464	NC_013198	ATGC	2	8	2371183	2371190	25 %	25 %	25 %	25 %	258509291
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37497	NC_013198	TTTC	2	8	2372832	2372839	0 %	75 %	0 %	25 %	258509291
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