MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36502	NC_013198	CCATAG	2	12	2313398	2313409	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258509239
36503	NC_013198	TGT	2	6	2313602	2313607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509239
36504	NC_013198	TCA	2	6	2313644	2313649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509239
36505	NC_013198	TGC	2	6	2313658	2313663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509239
36506	NC_013198	TAG	2	6	2313672	2313677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509239
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36508	NC_013198	ATT	2	6	2313839	2313844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509239
36509	NC_013198	ATG	2	6	2313855	2313860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509240
36510	NC_013198	TTCA	2	8	2313909	2313916	25 %	50 %	0 %	25 %	258509240
36511	NC_013198	TGC	2	6	2313939	2313944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509240
36512	NC_013198	CCCG	2	8	2313986	2313993	0 %	0 %	25 %	75 %	258509240
36513	NC_013198	ACT	2	6	2314024	2314029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509240
36514	NC_013198	TGC	2	6	2314075	2314080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509240
36515	NC_013198	AACA	2	8	2314125	2314132	75 %	0 %	0 %	25 %	258509240
36516	NC_013198	T	6	6	2314232	2314237	0 %	100 %	0 %	0 %	258509240
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36518	NC_013198	TCAA	2	8	2314384	2314391	50 %	25 %	0 %	25 %	258509240
36519	NC_013198	GGC	2	6	2314440	2314445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509240
36520	NC_013198	TGC	2	6	2314480	2314485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509240
36521	NC_013198	A	6	6	2314496	2314501	100 %	0 %	0 %	0 %	258509240
36522	NC_013198	CGGTT	2	10	2314518	2314527	0 %	40 %	40 %	20 %	258509240
36523	NC_013198	TGG	2	6	2314598	2314603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509240
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36553	NC_013198	GCA	2	6	2316461	2316466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509243
36554	NC_013198	GGT	2	6	2316576	2316581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509243
36555	NC_013198	CTG	3	9	2316609	2316617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509243
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36599	NC_013198	T	6	6	2318464	2318469	0 %	100 %	0 %	0 %	258509244
36600	NC_013198	GGC	2	6	2318699	2318704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509245
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36615	NC_013198	CAA	2	6	2319319	2319324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509245
36616	NC_013198	GGTCA	2	10	2319364	2319373	20 %	20 %	40 %	20 %	258509245
36617	NC_013198	CTT	2	6	2319390	2319395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509245
36618	NC_013198	GAC	2	6	2319438	2319443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509245
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36620	NC_013198	TGA	2	6	2319476	2319481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509245
36621	NC_013198	GCT	2	6	2319559	2319564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509245
36622	NC_013198	AATT	2	8	2319577	2319584	50 %	50 %	0 %	0 %	258509245
36623	NC_013198	TGC	2	6	2319589	2319594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509245
36624	NC_013198	CAT	3	9	2319662	2319670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509246
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36633	NC_013198	CAT	2	6	2320170	2320175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509247
36634	NC_013198	GTT	2	6	2320204	2320209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509247
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36638	NC_013198	CAA	2	6	2320389	2320394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509247
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36649	NC_013198	GCA	2	6	2320752	2320757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509247
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36710	NC_013198	AACC	2	8	2324828	2324835	50 %	0 %	0 %	50 %	258509252
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36714	NC_013198	TTCCG	2	10	2324900	2324909	0 %	40 %	20 %	40 %	258509252
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36716	NC_013198	CACC	2	8	2324969	2324976	25 %	0 %	0 %	75 %	258509252
36717	NC_013198	TCA	2	6	2325055	2325060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509252
36718	NC_013198	TCT	2	6	2325117	2325122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509252
36719	NC_013198	CAT	2	6	2325226	2325231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509253
36720	NC_013198	CAAC	2	8	2325265	2325272	50 %	0 %	0 %	50 %	258509253
36721	NC_013198	GCA	2	6	2325279	2325284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509253
36722	NC_013198	ATG	2	6	2325378	2325383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509253
36723	NC_013198	AGC	2	6	2325407	2325412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509253
36724	NC_013198	CGC	2	6	2325515	2325520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509253
36725	NC_013198	GCT	2	6	2325598	2325603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509253
36726	NC_013198	TAAAA	2	10	2325633	2325642	80 %	20 %	0 %	0 %	258509253
36727	NC_013198	CAAT	2	8	2325667	2325674	50 %	25 %	0 %	25 %	258509253
36728	NC_013198	AAC	2	6	2325707	2325712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509253
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36730	NC_013198	TCAC	2	8	2325783	2325790	25 %	25 %	0 %	50 %	258509253
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36732	NC_013198	CAA	2	6	2325899	2325904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509253
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36846	NC_013198	ATC	2	6	2333230	2333235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509264
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