MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_013198	GGC	2	6	2222075	2222080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509149
35003	NC_013198	CGC	2	6	2222111	2222116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509149
35004	NC_013198	GT	3	6	2222191	2222196	0 %	50 %	50 %	0 %	258509149
35005	NC_013198	CGC	2	6	2222303	2222308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509149
35006	NC_013198	ATG	2	6	2222343	2222348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509149
35007	NC_013198	GTA	2	6	2222386	2222391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509149
35008	NC_013198	GCA	2	6	2222532	2222537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509149
35009	NC_013198	TAA	2	6	2222600	2222605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509149
35010	NC_013198	CTT	2	6	2222659	2222664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509149
35011	NC_013198	CTTG	2	8	2222674	2222681	0 %	50 %	25 %	25 %	258509149
35012	NC_013198	TTG	2	6	2222687	2222692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509149
35013	NC_013198	GCG	2	6	2222882	2222887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509150
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35015	NC_013198	ACA	2	6	2222977	2222982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509150
35016	NC_013198	TGT	2	6	2223018	2223023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509150
35017	NC_013198	GGC	2	6	2223037	2223042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509150
35018	NC_013198	GCA	2	6	2223078	2223083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509150
35019	NC_013198	CCTG	2	8	2223129	2223136	0 %	25 %	25 %	50 %	258509150
35020	NC_013198	TCA	2	6	2223140	2223145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509150
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35022	NC_013198	ACT	2	6	2223187	2223192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509150
35023	NC_013198	GGC	2	6	2223196	2223201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509150
35024	NC_013198	TGC	2	6	2223228	2223233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509150
35025	NC_013198	TTG	2	6	2223334	2223339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509150
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35031	NC_013198	GTC	2	6	2223515	2223520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509150
35032	NC_013198	GGC	2	6	2223612	2223617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509150
35033	NC_013198	CTG	2	6	2223812	2223817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509150
35034	NC_013198	TGC	2	6	2223824	2223829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509150
35035	NC_013198	CCGAT	2	10	2223833	2223842	20 %	20 %	20 %	40 %	258509150
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35039	NC_013198	CGG	2	6	2224058	2224063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509151
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35042	NC_013198	ATCA	2	8	2224275	2224282	50 %	25 %	0 %	25 %	258509151
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35045	NC_013198	CG	3	6	2224372	2224377	0 %	0 %	50 %	50 %	258509151
35046	NC_013198	TGC	2	6	2224433	2224438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509151
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35051	NC_013198	TCA	2	6	2224514	2224519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509151
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35053	NC_013198	TGC	2	6	2224553	2224558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509151
35054	NC_013198	GC	3	6	2224578	2224583	0 %	0 %	50 %	50 %	258509151
35055	NC_013198	GGCT	2	8	2224618	2224625	0 %	25 %	50 %	25 %	258509151
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35058	NC_013198	CCAG	2	8	2224781	2224788	25 %	0 %	25 %	50 %	258509151
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35100	NC_013198	GGCG	2	8	2227169	2227176	0 %	0 %	75 %	25 %	258509153
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35115	NC_013198	GAC	2	6	2228208	2228213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509154
35116	NC_013198	AGCA	2	8	2228318	2228325	50 %	0 %	25 %	25 %	258509155
35117	NC_013198	TTC	2	6	2228463	2228468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509155
35118	NC_013198	TTTG	2	8	2228476	2228483	0 %	75 %	25 %	0 %	258509155
35119	NC_013198	CCA	2	6	2228547	2228552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509155
35120	NC_013198	GCC	2	6	2228714	2228719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509155
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35122	NC_013198	T	7	7	2228830	2228836	0 %	100 %	0 %	0 %	258509156
35123	NC_013198	AAGT	2	8	2228894	2228901	50 %	25 %	25 %	0 %	258509156
35124	NC_013198	AGA	2	6	2229177	2229182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509157
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35126	NC_013198	GAT	2	6	2229301	2229306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509157
35127	NC_013198	AAT	2	6	2229320	2229325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509157
35128	NC_013198	CA	3	6	2229384	2229389	50 %	0 %	0 %	50 %	258509157
35129	NC_013198	GTC	2	6	2229423	2229428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509157
35130	NC_013198	CAA	2	6	2229511	2229516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509157
35131	NC_013198	TTAA	2	8	2229591	2229598	50 %	50 %	0 %	0 %	258509158
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35134	NC_013198	TCAA	2	8	2229847	2229854	50 %	25 %	0 %	25 %	258509158
35135	NC_013198	GGC	2	6	2229927	2229932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509158
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35138	NC_013198	GT	3	6	2229965	2229970	0 %	50 %	50 %	0 %	258509158
35139	NC_013198	GCGA	2	8	2230095	2230102	25 %	0 %	50 %	25 %	258509158
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35143	NC_013198	ATC	2	6	2230185	2230190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509158
35144	NC_013198	CG	3	6	2230199	2230204	0 %	0 %	50 %	50 %	258509158
35145	NC_013198	AATC	2	8	2230227	2230234	50 %	25 %	0 %	25 %	258509158
35146	NC_013198	GCATG	2	10	2230235	2230244	20 %	20 %	40 %	20 %	258509158
35147	NC_013198	GCA	2	6	2230318	2230323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509158
35148	NC_013198	GCA	2	6	2230516	2230521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509158
35149	NC_013198	TCA	2	6	2230528	2230533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509158
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35151	NC_013198	TCA	3	9	2230580	2230588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509158
35152	NC_013198	CCTA	2	8	2230627	2230634	25 %	25 %	0 %	50 %	258509159
35153	NC_013198	GCC	2	6	2230666	2230671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509159
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35155	NC_013198	TCA	2	6	2230886	2230891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509159
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35162	NC_013198	CCG	2	6	2231357	2231362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509159
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35200	NC_013198	T	6	6	2234191	2234196	0 %	100 %	0 %	0 %	258509163
35201	NC_013198	TTA	2	6	2234256	2234261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509163
35202	NC_013198	CAGT	2	8	2234275	2234282	25 %	25 %	25 %	25 %	258509163
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35206	NC_013198	CA	3	6	2234541	2234546	50 %	0 %	0 %	50 %	258509163
35207	NC_013198	TGA	2	6	2234583	2234588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509163
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35210	NC_013198	TTGA	2	8	2234788	2234795	25 %	50 %	25 %	0 %	258509164
35211	NC_013198	TGAC	2	8	2234825	2234832	25 %	25 %	25 %	25 %	258509164
35212	NC_013198	ATC	2	6	2234866	2234871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509164
35213	NC_013198	AACT	2	8	2234875	2234882	50 %	25 %	0 %	25 %	258509164
35214	NC_013198	CAA	2	6	2234899	2234904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509164
35215	NC_013198	CAA	2	6	2234907	2234912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509164
35216	NC_013198	TTCA	2	8	2234950	2234957	25 %	50 %	0 %	25 %	258509164
35217	NC_013198	AAC	2	6	2234999	2235004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509164
35218	NC_013198	GAAA	2	8	2235006	2235013	75 %	0 %	25 %	0 %	258509164
35219	NC_013198	TGC	2	6	2235037	2235042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509164
35220	NC_013198	TTG	2	6	2235190	2235195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509164
35221	NC_013198	TCCT	2	8	2235214	2235221	0 %	50 %	0 %	50 %	258509164
35222	NC_013198	CTG	2	6	2235244	2235249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509164
35223	NC_013198	TAC	2	6	2235279	2235284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509164
35224	NC_013198	AAG	2	6	2235549	2235554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509165
35225	NC_013198	ATG	2	6	2235583	2235588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509165
35226	NC_013198	TGG	2	6	2235599	2235604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509165
35227	NC_013198	TATC	2	8	2235636	2235643	25 %	50 %	0 %	25 %	258509165
35228	NC_013198	TTAC	2	8	2235716	2235723	25 %	50 %	0 %	25 %	258509165
35229	NC_013198	A	6	6	2235729	2235734	100 %	0 %	0 %	0 %	258509165
35230	NC_013198	CAG	2	6	2235748	2235753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509165
35231	NC_013198	TCA	2	6	2235792	2235797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509165
35232	NC_013198	ACC	2	6	2235886	2235891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509165
35233	NC_013198	CTA	2	6	2235892	2235897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509165
35234	NC_013198	ACC	2	6	2235901	2235906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509165
35235	NC_013198	ATCAA	2	10	2235991	2236000	60 %	20 %	0 %	20 %	258509165
35236	NC_013198	GGC	2	6	2236080	2236085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509165
35237	NC_013198	CGG	2	6	2236089	2236094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509165
35238	NC_013198	ACC	2	6	2236105	2236110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509165
35239	NC_013198	CAA	2	6	2236117	2236122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509165
35240	NC_013198	AGCA	2	8	2236181	2236188	50 %	0 %	25 %	25 %	258509165
35241	NC_013198	AAC	2	6	2236251	2236256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509165
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35243	NC_013198	CCAA	2	8	2236316	2236323	50 %	0 %	0 %	50 %	258509165
35244	NC_013198	GCT	3	9	2236375	2236383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509165
35245	NC_013198	CAA	2	6	2236431	2236436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509165
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35247	NC_013198	TGG	2	6	2236552	2236557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509165
35248	NC_013198	TTA	2	6	2236591	2236596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509165
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35250	NC_013198	TTC	2	6	2236663	2236668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509165
35251	NC_013198	TTC	2	6	2236676	2236681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509165
35252	NC_013198	GTT	2	6	2236692	2236697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509165
35253	NC_013198	TCT	2	6	2236709	2236714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509165
35254	NC_013198	TCC	2	6	2236769	2236774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509165
35255	NC_013198	AGCT	2	8	2236775	2236782	25 %	25 %	25 %	25 %	258509165
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35257	NC_013198	GCAAC	2	10	2236978	2236987	40 %	0 %	20 %	40 %	258509166
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35261	NC_013198	CGA	2	6	2237202	2237207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509166
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35264	NC_013198	CG	3	6	2237354	2237359	0 %	0 %	50 %	50 %	258509166
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35322	NC_013198	TTTC	2	8	2241426	2241433	0 %	75 %	0 %	25 %	258509170
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35330	NC_013198	AT	3	6	2241713	2241718	50 %	50 %	0 %	0 %	258509170
35331	NC_013198	CAT	2	6	2241757	2241762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509170
35332	NC_013198	TTA	2	6	2241764	2241769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509170
35333	NC_013198	TTGTC	2	10	2241792	2241801	0 %	60 %	20 %	20 %	258509170
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35336	NC_013198	TGC	2	6	2242696	2242701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509172
35337	NC_013198	T	6	6	2242711	2242716	0 %	100 %	0 %	0 %	258509172
35338	NC_013198	T	6	6	2242735	2242740	0 %	100 %	0 %	0 %	258509172
35339	NC_013198	AT	3	6	2242790	2242795	50 %	50 %	0 %	0 %	258509172
35340	NC_013198	TC	3	6	2242899	2242904	0 %	50 %	0 %	50 %	258509172
35341	NC_013198	TTG	2	6	2242917	2242922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509172
35342	NC_013198	CAT	2	6	2242935	2242940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509172
35343	NC_013198	GTA	2	6	2242961	2242966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509172
35344	NC_013198	T	6	6	2243014	2243019	0 %	100 %	0 %	0 %	258509172
35345	NC_013198	CCCA	2	8	2243021	2243028	25 %	0 %	0 %	75 %	258509172
35346	NC_013198	CAA	2	6	2243089	2243094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509172
35347	NC_013198	T	6	6	2243110	2243115	0 %	100 %	0 %	0 %	258509172
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35349	NC_013198	GCG	2	6	2243217	2243222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509172
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35462	NC_013198	TCG	2	6	2251454	2251459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509180
35463	NC_013198	AGT	2	6	2251516	2251521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509180
35464	NC_013198	TTC	2	6	2251555	2251560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509180
35465	NC_013198	GCC	2	6	2251591	2251596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509180
35466	NC_013198	GTTG	2	8	2251608	2251615	0 %	50 %	50 %	0 %	258509180
35467	NC_013198	TTG	2	6	2251691	2251696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509180
35468	NC_013198	ATG	3	9	2251753	2251761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509180
35469	NC_013198	TGC	2	6	2251791	2251796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509180
35470	NC_013198	CGTT	2	8	2251921	2251928	0 %	50 %	25 %	25 %	258509180
35471	NC_013198	CCGC	2	8	2251943	2251950	0 %	0 %	25 %	75 %	258509180
35472	NC_013198	AATC	2	8	2252011	2252018	50 %	25 %	0 %	25 %	258509181
35473	NC_013198	AGC	2	6	2252175	2252180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509181
35474	NC_013198	CCG	2	6	2252321	2252326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509181
35475	NC_013198	CAA	2	6	2252410	2252415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509182
35476	NC_013198	CCTG	2	8	2252455	2252462	0 %	25 %	25 %	50 %	258509182
35477	NC_013198	TAT	2	6	2252470	2252475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509182
35478	NC_013198	ACA	2	6	2252507	2252512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509182
35479	NC_013198	GTG	2	6	2252550	2252555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509182
35480	NC_013198	ACC	2	6	2252576	2252581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509182
35481	NC_013198	GTT	2	6	2252618	2252623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509182
35482	NC_013198	GGATG	2	10	2252626	2252635	20 %	20 %	60 %	0 %	258509182
35483	NC_013198	T	6	6	2252686	2252691	0 %	100 %	0 %	0 %	258509182
35484	NC_013198	A	6	6	2252748	2252753	100 %	0 %	0 %	0 %	258509182
35485	NC_013198	CAT	2	6	2252816	2252821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509182
35486	NC_013198	CGA	2	6	2252911	2252916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509182
35487	NC_013198	TAT	2	6	2252947	2252952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509182
35488	NC_013198	ACTT	2	8	2252981	2252988	25 %	50 %	0 %	25 %	258509182
35489	NC_013198	TAT	2	6	2253043	2253048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509182
35490	NC_013198	CAA	2	6	2253107	2253112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509182
35491	NC_013198	TGA	2	6	2253204	2253209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509182
35492	NC_013198	TTG	2	6	2253256	2253261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509183
35493	NC_013198	AAG	2	6	2253294	2253299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509183
35494	NC_013198	TTTGG	2	10	2253304	2253313	0 %	60 %	40 %	0 %	258509183
35495	NC_013198	TTG	2	6	2253333	2253338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509183
35496	NC_013198	GGC	2	6	2253381	2253386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509183
35497	NC_013198	TGA	2	6	2253412	2253417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509183
35498	NC_013198	CCG	2	6	2253476	2253481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509183
35499	NC_013198	TAC	2	6	2253482	2253487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509183
35500	NC_013198	TGA	2	6	2253517	2253522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509183

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