MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34503	NC_013198	AATC	2	8	2191533	2191540	50 %	25 %	0 %	25 %	258509112
34504	NC_013198	GCC	2	6	2191657	2191662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509113
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34512	NC_013198	TTC	2	6	2191906	2191911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509113
34513	NC_013198	ACAT	2	8	2191933	2191940	50 %	25 %	0 %	25 %	258509113
34514	NC_013198	TGA	2	6	2191996	2192001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509113
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34732	NC_013198	CGTT	2	8	2206176	2206183	0 %	50 %	25 %	25 %	258509133
34733	NC_013198	TTC	2	6	2206226	2206231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509133
34734	NC_013198	TTAA	2	8	2206308	2206315	50 %	50 %	0 %	0 %	258509133
34735	NC_013198	TGCTT	2	10	2206326	2206335	0 %	60 %	20 %	20 %	258509133
34736	NC_013198	CCAG	2	8	2206370	2206377	25 %	0 %	25 %	50 %	258509133
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34740	NC_013198	T	6	6	2206760	2206765	0 %	100 %	0 %	0 %	258509134
34741	NC_013198	TGAA	2	8	2206801	2206808	50 %	25 %	25 %	0 %	258509134
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34832	NC_013198	ATG	2	6	2211998	2212003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509140
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34835	NC_013198	GCA	2	6	2212062	2212067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509140
34836	NC_013198	GCGAT	2	10	2212167	2212176	20 %	20 %	40 %	20 %	258509140
34837	NC_013198	TCA	2	6	2212188	2212193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509140
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34840	NC_013198	A	6	6	2212351	2212356	100 %	0 %	0 %	0 %	258509140
34841	NC_013198	CGC	2	6	2212415	2212420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509140
34842	NC_013198	CAA	2	6	2212553	2212558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509140
34843	NC_013198	CAT	2	6	2212606	2212611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509140
34844	NC_013198	CAT	2	6	2212676	2212681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509140
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34846	NC_013198	GCT	2	6	2212739	2212744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509140
34847	NC_013198	TCA	2	6	2212752	2212757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509140
34848	NC_013198	TTC	2	6	2212773	2212778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509140
34849	NC_013198	TG	3	6	2212814	2212819	0 %	50 %	50 %	0 %	258509140
34850	NC_013198	AAT	2	6	2213009	2213014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509140
34851	NC_013198	TCA	2	6	2213068	2213073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509140
34852	NC_013198	ACAT	2	8	2213106	2213113	50 %	25 %	0 %	25 %	258509140
34853	NC_013198	AATC	2	8	2213135	2213142	50 %	25 %	0 %	25 %	258509140
34854	NC_013198	TCA	2	6	2213163	2213168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509140
34855	NC_013198	GCCG	2	8	2213171	2213178	0 %	0 %	50 %	50 %	258509140
34856	NC_013198	CGC	2	6	2213201	2213206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509140
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34864	NC_013198	GTT	2	6	2213422	2213427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509140
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34875	NC_013198	TTC	2	6	2214296	2214301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509141
34876	NC_013198	TGCAGC	2	12	2214313	2214324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509141
34877	NC_013198	GCG	2	6	2214525	2214530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509141
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34879	NC_013198	CGC	2	6	2214592	2214597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509141
34880	NC_013198	TTCTT	2	10	2214623	2214632	0 %	80 %	0 %	20 %	258509141
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34890	NC_013198	GCT	2	6	2215117	2215122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509142
34891	NC_013198	CGG	2	6	2215176	2215181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509142
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34921	NC_013198	GTT	2	6	2216373	2216378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509143
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34928	NC_013198	T	6	6	2216728	2216733	0 %	100 %	0 %	0 %	258509143
34929	NC_013198	GATT	2	8	2216829	2216836	25 %	50 %	25 %	0 %	258509143
34930	NC_013198	CACT	2	8	2216862	2216869	25 %	25 %	0 %	50 %	258509143
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34944	NC_013198	ACG	2	6	2218403	2218408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509146
34945	NC_013198	TTC	2	6	2218554	2218559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509146
34946	NC_013198	T	6	6	2218564	2218569	0 %	100 %	0 %	0 %	258509146
34947	NC_013198	TGC	2	6	2218574	2218579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509146
34948	NC_013198	GAG	2	6	2218704	2218709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509146
34949	NC_013198	TCA	5	15	2218713	2218727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509146
34950	NC_013198	TTTAT	2	10	2218829	2218838	20 %	80 %	0 %	0 %	258509147
34951	NC_013198	CA	3	6	2218839	2218844	50 %	0 %	0 %	50 %	258509147
34952	NC_013198	AT	3	6	2218899	2218904	50 %	50 %	0 %	0 %	258509147
34953	NC_013198	CGT	2	6	2218952	2218957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509147
34954	NC_013198	CGG	2	6	2219011	2219016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509147
34955	NC_013198	TGC	2	6	2219065	2219070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509147
34956	NC_013198	GCT	2	6	2219174	2219179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509147
34957	NC_013198	TTTGA	2	10	2219288	2219297	20 %	60 %	20 %	0 %	258509147
34958	NC_013198	CAT	2	6	2219390	2219395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509147
34959	NC_013198	ATG	2	6	2219402	2219407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509147
34960	NC_013198	TCA	2	6	2219448	2219453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509147
34961	NC_013198	GAA	2	6	2219470	2219475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509147
34962	NC_013198	GAAT	2	8	2219538	2219545	50 %	25 %	25 %	0 %	258509147
34963	NC_013198	TCGG	2	8	2219598	2219605	0 %	25 %	50 %	25 %	258509147
34964	NC_013198	TTC	2	6	2219705	2219710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509147
34965	NC_013198	CGCA	2	8	2219836	2219843	25 %	0 %	25 %	50 %	258509147
34966	NC_013198	AGC	2	6	2219847	2219852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509147
34967	NC_013198	T	6	6	2219896	2219901	0 %	100 %	0 %	0 %	258509147
34968	NC_013198	ATC	2	6	2220012	2220017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509147
34969	NC_013198	GAAC	2	8	2220023	2220030	50 %	0 %	25 %	25 %	258509147
34970	NC_013198	CCATA	2	10	2220034	2220043	40 %	20 %	0 %	40 %	258509147
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34978	NC_013198	CA	3	6	2220846	2220851	50 %	0 %	0 %	50 %	258509148
34979	NC_013198	GCA	2	6	2220872	2220877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509148
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34982	NC_013198	CG	3	6	2221002	2221007	0 %	0 %	50 %	50 %	258509148
34983	NC_013198	ATC	2	6	2221123	2221128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509148
34984	NC_013198	TTG	2	6	2221230	2221235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509148
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34988	NC_013198	GC	3	6	2221349	2221354	0 %	0 %	50 %	50 %	258509149
34989	NC_013198	TCA	2	6	2221399	2221404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509149
34990	NC_013198	GTC	2	6	2221412	2221417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509149
34991	NC_013198	CG	3	6	2221451	2221456	0 %	0 %	50 %	50 %	258509149
34992	NC_013198	TGC	2	6	2221527	2221532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509149
34993	NC_013198	CAA	2	6	2221565	2221570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509149
34994	NC_013198	GCA	2	6	2221593	2221598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509149
34995	NC_013198	TTC	2	6	2221703	2221708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509149
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34997	NC_013198	TAG	2	6	2221749	2221754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509149
34998	NC_013198	GTTGGC	2	12	2221868	2221879	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258509149
34999	NC_013198	TGA	2	6	2221893	2221898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509149
35000	NC_013198	ATA	2	6	2222030	2222035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509149

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