MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33349	NC_013198	TCA	2	6	2121587	2121592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509063
33350	NC_013198	GCA	2	6	2121624	2121629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509063
33351	NC_013198	ATC	2	6	2121709	2121714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509063
33352	NC_013198	T	6	6	2121736	2121741	0 %	100 %	0 %	0 %	258509063
33353	NC_013198	ATG	2	6	2121749	2121754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509063
33354	NC_013198	CGATTT	2	12	2121756	2121767	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258509063
33355	NC_013198	T	6	6	2121765	2121770	0 %	100 %	0 %	0 %	258509063
33356	NC_013198	GTC	2	6	2121785	2121790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509063
33357	NC_013198	GAAC	2	8	2121806	2121813	50 %	0 %	25 %	25 %	258509063
33358	NC_013198	ATG	2	6	2121859	2121864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509063
33359	NC_013198	CGA	2	6	2122486	2122491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509064
33360	NC_013198	TGA	2	6	2122531	2122536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509064
33361	NC_013198	AAT	2	6	2122642	2122647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509064
33362	NC_013198	CCGCAG	2	12	2122750	2122761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258509064
33363	NC_013198	TGG	3	9	2122939	2122947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509064
33364	NC_013198	GTT	2	6	2123025	2123030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509064
33365	NC_013198	GAT	2	6	2123059	2123064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509064
33366	NC_013198	CGGC	2	8	2123085	2123092	0 %	0 %	50 %	50 %	258509064
33367	NC_013198	ATCA	2	8	2123135	2123142	50 %	25 %	0 %	25 %	258509064
33368	NC_013198	TGC	2	6	2123160	2123165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509065
33369	NC_013198	TGT	2	6	2123170	2123175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509065
33370	NC_013198	GGT	2	6	2123209	2123214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509065
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33372	NC_013198	GTTT	2	8	2123269	2123276	0 %	75 %	25 %	0 %	258509065
33373	NC_013198	TGT	2	6	2123288	2123293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509065
33374	NC_013198	CAT	2	6	2123337	2123342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509065
33375	NC_013198	GCCGAC	2	12	2123391	2123402	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258509065
33376	NC_013198	CAT	2	6	2123451	2123456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509065
33377	NC_013198	GCACC	2	10	2123588	2123597	20 %	0 %	20 %	60 %	258509065
33378	NC_013198	AACCGT	2	12	2123618	2123629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258509065
33379	NC_013198	CAGG	2	8	2123664	2123671	25 %	0 %	50 %	25 %	258509065
33380	NC_013198	TGC	2	6	2123723	2123728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509065
33381	NC_013198	CCG	2	6	2123831	2123836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509065
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33383	NC_013198	GCG	2	6	2124036	2124041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509065
33384	NC_013198	GTC	2	6	2124177	2124182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509065
33385	NC_013198	AAAT	2	8	2124191	2124198	75 %	25 %	0 %	0 %	258509065
33386	NC_013198	GATT	2	8	2124257	2124264	25 %	50 %	25 %	0 %	258509065
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33388	NC_013198	TGGATT	2	12	2124278	2124289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	258509065
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33416	NC_013198	GTGG	2	8	2126135	2126142	0 %	25 %	75 %	0 %	258509068
33417	NC_013198	CGA	2	6	2126158	2126163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509068
33418	NC_013198	CAG	2	6	2126183	2126188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509068
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33421	NC_013198	A	7	7	2126331	2126337	100 %	0 %	0 %	0 %	258509068
33422	NC_013198	GCCA	2	8	2126623	2126630	25 %	0 %	25 %	50 %	258509069
33423	NC_013198	TCA	2	6	2126652	2126657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509069
33424	NC_013198	GAT	2	6	2126658	2126663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509069
33425	NC_013198	TAG	2	6	2126677	2126682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509069
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33427	NC_013198	CGG	2	6	2126715	2126720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509069
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33429	NC_013198	GCA	2	6	2126789	2126794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509069
33430	NC_013198	GCT	2	6	2126813	2126818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509069
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33442	NC_013198	TGC	2	6	2127568	2127573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509070
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33450	NC_013198	CA	3	6	2128115	2128120	50 %	0 %	0 %	50 %	258509071
33451	NC_013198	CAAC	2	8	2128155	2128162	50 %	0 %	0 %	50 %	258509071
33452	NC_013198	GTT	2	6	2128185	2128190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509071
33453	NC_013198	CTT	2	6	2128223	2128228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509071
33454	NC_013198	TCA	2	6	2128288	2128293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509071
33455	NC_013198	TTG	2	6	2128458	2128463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509071
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33457	NC_013198	AAG	2	6	2128474	2128479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509071
33458	NC_013198	CTCTT	2	10	2128598	2128607	0 %	60 %	0 %	40 %	258509072
33459	NC_013198	ACC	2	6	2128647	2128652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509072
33460	NC_013198	ATC	2	6	2128795	2128800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509073
33461	NC_013198	T	6	6	2128816	2128821	0 %	100 %	0 %	0 %	258509073
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33463	NC_013198	TTG	2	6	2128859	2128864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509073
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33466	NC_013198	TAA	2	6	2129215	2129220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509073
33467	NC_013198	GAA	2	6	2129383	2129388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509073
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33492	NC_013198	ATG	2	6	2131682	2131687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509074
33493	NC_013198	CG	3	6	2131730	2131735	0 %	0 %	50 %	50 %	258509074
33494	NC_013198	ATC	2	6	2131928	2131933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509074
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33496	NC_013198	CAGC	2	8	2132007	2132014	25 %	0 %	25 %	50 %	258509074
33497	NC_013198	CAA	2	6	2132041	2132046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509074
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