MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32234	NC_013198	ATTTG	2	10	2048862	2048871	20 %	60 %	20 %	0 %	258508996
32235	NC_013198	AAC	2	6	2048912	2048917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508996
32236	NC_013198	CAA	2	6	2048992	2048997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508996
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32238	NC_013198	CCA	2	6	2049132	2049137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508997
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32241	NC_013198	TTG	2	6	2049175	2049180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508997
32242	NC_013198	CTG	2	6	2049193	2049198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508997
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32244	NC_013198	TGC	2	6	2049251	2049256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508997
32245	NC_013198	T	6	6	2049275	2049280	0 %	100 %	0 %	0 %	258508997
32246	NC_013198	TTGAT	2	10	2049383	2049392	20 %	60 %	20 %	0 %	258508998
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32252	NC_013198	CTT	2	6	2049673	2049678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508998
32253	NC_013198	AG	3	6	2049708	2049713	50 %	0 %	50 %	0 %	258508998
32254	NC_013198	ATCA	2	8	2049823	2049830	50 %	25 %	0 %	25 %	258508998
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32262	NC_013198	TCG	2	6	2050511	2050516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508998
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32349	NC_013198	GCT	2	6	2056182	2056187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509003
32350	NC_013198	ATC	2	6	2056195	2056200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509003
32351	NC_013198	AAC	2	6	2056207	2056212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509003
32352	NC_013198	TGAT	2	8	2056448	2056455	25 %	50 %	25 %	0 %	258509004
32353	NC_013198	TCG	2	6	2056496	2056501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509004
32354	NC_013198	ACC	3	9	2056601	2056609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509004
32355	NC_013198	TCT	2	6	2056632	2056637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509004
32356	NC_013198	TGT	2	6	2056748	2056753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509004
32357	NC_013198	T	7	7	2056968	2056974	0 %	100 %	0 %	0 %	258509004
32358	NC_013198	AAGTCA	2	12	2056982	2056993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	258509004
32359	NC_013198	CAAT	2	8	2056998	2057005	50 %	25 %	0 %	25 %	258509004
32360	NC_013198	CAC	2	6	2057086	2057091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509004
32361	NC_013198	CGAT	2	8	2057099	2057106	25 %	25 %	25 %	25 %	258509004
32362	NC_013198	T	6	6	2057120	2057125	0 %	100 %	0 %	0 %	258509004
32363	NC_013198	CTAC	2	8	2057484	2057491	25 %	25 %	0 %	50 %	258509005
32364	NC_013198	TGA	2	6	2057495	2057500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509005
32365	NC_013198	CGG	2	6	2057524	2057529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509005
32366	NC_013198	TTC	2	6	2057530	2057535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509005
32367	NC_013198	CGGC	2	8	2057607	2057614	0 %	0 %	50 %	50 %	258509005
32368	NC_013198	GCT	2	6	2057679	2057684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509005
32369	NC_013198	GGC	2	6	2057746	2057751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509005
32370	NC_013198	GAT	2	6	2057757	2057762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509005
32371	NC_013198	GCC	2	6	2057842	2057847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509005
32372	NC_013198	TGA	2	6	2057850	2057855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509005
32373	NC_013198	TGC	2	6	2057873	2057878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509005
32374	NC_013198	GC	3	6	2057904	2057909	0 %	0 %	50 %	50 %	258509005
32375	NC_013198	GCT	2	6	2057925	2057930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509005
32376	NC_013198	TCA	2	6	2057963	2057968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509005
32377	NC_013198	TGC	2	6	2058038	2058043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509005
32378	NC_013198	CCG	2	6	2058063	2058068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509005
32379	NC_013198	GCA	2	6	2058140	2058145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509005
32380	NC_013198	AAG	2	6	2058230	2058235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509005
32381	NC_013198	ACA	2	6	2058260	2058265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509005
32382	NC_013198	CAC	2	6	2058285	2058290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509005
32383	NC_013198	ATA	2	6	2058425	2058430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509005
32384	NC_013198	CAT	2	6	2058445	2058450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509005
32385	NC_013198	ACT	2	6	2058480	2058485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509006
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32387	NC_013198	GTG	2	6	2058550	2058555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509006
32388	NC_013198	GTT	2	6	2058628	2058633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509006
32389	NC_013198	GATG	2	8	2058646	2058653	25 %	25 %	50 %	0 %	258509006
32390	NC_013198	GACT	2	8	2058670	2058677	25 %	25 %	25 %	25 %	258509006
32391	NC_013198	TGC	2	6	2058678	2058683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509006
32392	NC_013198	ATTTT	2	10	2058761	2058770	20 %	80 %	0 %	0 %	258509006
32393	NC_013198	TTGA	2	8	2058807	2058814	25 %	50 %	25 %	0 %	258509006
32394	NC_013198	CGG	2	6	2058879	2058884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509006
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32399	NC_013198	GTG	2	6	2059342	2059347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509007
32400	NC_013198	TGCG	2	8	2059475	2059482	0 %	25 %	50 %	25 %	258509007
32401	NC_013198	CCG	2	6	2059506	2059511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509007
32402	NC_013198	AAT	2	6	2059536	2059541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509007
32403	NC_013198	GCT	2	6	2059557	2059562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509007
32404	NC_013198	CTG	2	6	2059754	2059759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509008
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32406	NC_013198	CTG	2	6	2060115	2060120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509009
32407	NC_013198	TCA	2	6	2060173	2060178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509009
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32409	NC_013198	ACG	2	6	2060302	2060307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509009
32410	NC_013198	CTT	2	6	2060309	2060314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509009
32411	NC_013198	TTC	2	6	2060389	2060394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509009
32412	NC_013198	TGA	2	6	2060409	2060414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509009
32413	NC_013198	ATA	2	6	2060487	2060492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509009
32414	NC_013198	TG	3	6	2060532	2060537	0 %	50 %	50 %	0 %	258509009
32415	NC_013198	TCA	2	6	2060540	2060545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509009
32416	NC_013198	GTT	2	6	2060587	2060592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509009
32417	NC_013198	TAC	2	6	2060793	2060798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509010
32418	NC_013198	ATC	2	6	2060845	2060850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509010
32419	NC_013198	CTA	2	6	2060889	2060894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509010
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32422	NC_013198	TCGCCA	2	12	2060975	2060986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258509010
32423	NC_013198	CAT	2	6	2061018	2061023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509010
32424	NC_013198	TTC	2	6	2061068	2061073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509010
32425	NC_013198	CCAA	2	8	2061094	2061101	50 %	0 %	0 %	50 %	258509010
32426	NC_013198	ATA	2	6	2061161	2061166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509010
32427	NC_013198	GAC	2	6	2061618	2061623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509011
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32430	NC_013198	CAG	2	6	2061885	2061890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509011
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32433	NC_013198	CGGAAA	2	12	2061957	2061968	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258509011
32434	NC_013198	TGC	2	6	2061972	2061977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509011
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32440	NC_013198	TGC	2	6	2062546	2062551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509011
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32443	NC_013198	CAA	2	6	2062675	2062680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509011
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32449	NC_013198	ACCA	2	8	2063302	2063309	50 %	0 %	0 %	50 %	258509012
32450	NC_013198	GCG	2	6	2063333	2063338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509012
32451	NC_013198	ATC	2	6	2063376	2063381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509012
32452	NC_013198	CAAC	2	8	2063531	2063538	50 %	0 %	0 %	50 %	258509012
32453	NC_013198	TCA	2	6	2063548	2063553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509012
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32455	NC_013198	AATCA	2	10	2063763	2063772	60 %	20 %	0 %	20 %	258509012
32456	NC_013198	GCCG	2	8	2063775	2063782	0 %	0 %	50 %	50 %	258509012
32457	NC_013198	GGA	2	6	2063846	2063851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509012
32458	NC_013198	ATT	2	6	2063940	2063945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509012
32459	NC_013198	AAC	2	6	2063953	2063958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509012
32460	NC_013198	TCG	2	6	2064031	2064036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509012
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32462	NC_013198	TCG	2	6	2064080	2064085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509012
32463	NC_013198	TTC	2	6	2064285	2064290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509012
32464	NC_013198	GCG	2	6	2064803	2064808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509013
32465	NC_013198	GGT	2	6	2064817	2064822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509013
32466	NC_013198	CATC	2	8	2064869	2064876	25 %	25 %	0 %	50 %	258509013
32467	NC_013198	CAG	2	6	2064954	2064959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509013
32468	NC_013198	GAA	2	6	2065090	2065095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509014
32469	NC_013198	GCC	2	6	2065142	2065147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509014
32470	NC_013198	CAGCCA	2	12	2065151	2065162	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258509014
32471	NC_013198	GCA	2	6	2065209	2065214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509014
32472	NC_013198	GCT	2	6	2065250	2065255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509014
32473	NC_013198	TCA	2	6	2065282	2065287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509014
32474	NC_013198	GCACTT	2	12	2065348	2065359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258509014
32475	NC_013198	CAC	2	6	2065400	2065405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509014
32476	NC_013198	ATA	2	6	2065522	2065527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509014
32477	NC_013198	ATT	2	6	2065556	2065561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509014
32478	NC_013198	GCC	2	6	2065572	2065577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509014
32479	NC_013198	ACC	2	6	2065628	2065633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509014
32480	NC_013198	CGC	2	6	2065652	2065657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509014
32481	NC_013198	GTT	2	6	2065693	2065698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509014
32482	NC_013198	ATA	3	9	2065979	2065987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509015
32483	NC_013198	CGG	2	6	2066004	2066009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509015
32484	NC_013198	GAT	2	6	2066044	2066049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509015
32485	NC_013198	GCTG	2	8	2066058	2066065	0 %	25 %	50 %	25 %	258509015
32486	NC_013198	TGT	2	6	2066214	2066219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509015
32487	NC_013198	GCC	2	6	2066232	2066237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509015
32488	NC_013198	GACAAC	2	12	2066392	2066403	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258509016
32489	NC_013198	ATG	2	6	2066520	2066525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509016
32490	NC_013198	AAG	2	6	2066799	2066804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509016
32491	NC_013198	GGC	2	6	2066888	2066893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509016
32492	NC_013198	TTGA	2	8	2066894	2066901	25 %	50 %	25 %	0 %	258509016
32493	NC_013198	GCA	2	6	2066994	2066999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509016
32494	NC_013198	ACC	3	9	2067081	2067089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509016
32495	NC_013198	GTCGA	2	10	2067116	2067125	20 %	20 %	40 %	20 %	258509016
32496	NC_013198	GGC	2	6	2067461	2067466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509017
32497	NC_013198	GAC	2	6	2067565	2067570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509017
32498	NC_013198	TGC	2	6	2067634	2067639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509017
32499	NC_013198	GCT	2	6	2067644	2067649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509017
32500	NC_013198	GATC	2	8	2067660	2067667	25 %	25 %	25 %	25 %	258509017

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