MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_013198	TTG	2	6	1968799	1968804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508926
31003	NC_013198	TGGT	2	8	1968807	1968814	0 %	50 %	50 %	0 %	258508926
31004	NC_013198	CGT	2	6	1968825	1968830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508926
31005	NC_013198	GGC	2	6	1968835	1968840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508926
31006	NC_013198	CGG	2	6	1968858	1968863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508926
31007	NC_013198	CCAAT	2	10	1968884	1968893	40 %	20 %	0 %	40 %	258508926
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31011	NC_013198	GTC	2	6	1969527	1969532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508927
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31014	NC_013198	AAAACC	2	12	1969602	1969613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508927
31015	NC_013198	GAT	2	6	1969614	1969619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508927
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31018	NC_013198	ATC	2	6	1969711	1969716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508927
31019	NC_013198	CGA	2	6	1969768	1969773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508927
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31022	NC_013198	CAA	2	6	1969887	1969892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508927
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31051	NC_013198	AAT	2	6	1971419	1971424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508928
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31054	NC_013198	TAA	2	6	1971512	1971517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508928
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31062	NC_013198	GCG	3	9	1972298	1972306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508929
31063	NC_013198	CTG	2	6	1972400	1972405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508929
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31067	NC_013198	TAG	2	6	1972701	1972706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508929
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31088	NC_013198	GCG	2	6	1973538	1973543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508930
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31111	NC_013198	TCAAA	2	10	1975217	1975226	60 %	20 %	0 %	20 %	258508932
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31113	NC_013198	GC	3	6	1975270	1975275	0 %	0 %	50 %	50 %	258508932
31114	NC_013198	CGG	2	6	1975282	1975287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508932
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31231	NC_013198	TGC	2	6	1982004	1982009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508940
31232	NC_013198	ATC	2	6	1982039	1982044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508940
31233	NC_013198	TAAA	2	8	1982057	1982064	75 %	25 %	0 %	0 %	258508940
31234	NC_013198	GGTC	2	8	1982083	1982090	0 %	25 %	50 %	25 %	258508940
31235	NC_013198	CCTT	2	8	1982112	1982119	0 %	50 %	0 %	50 %	258508940
31236	NC_013198	CAA	2	6	1982120	1982125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508940
31237	NC_013198	TGCC	2	8	1982126	1982133	0 %	25 %	25 %	50 %	258508940
31238	NC_013198	TGT	2	6	1982146	1982151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508940
31239	NC_013198	CTT	2	6	1982164	1982169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508940
31240	NC_013198	ATC	2	6	1982279	1982284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508940
31241	NC_013198	TGCG	2	8	1982394	1982401	0 %	25 %	50 %	25 %	258508940
31242	NC_013198	TTA	2	6	1982412	1982417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508940
31243	NC_013198	TTA	2	6	1982430	1982435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508940
31244	NC_013198	CGT	2	6	1982519	1982524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508940
31245	NC_013198	GTAA	2	8	1982528	1982535	50 %	25 %	25 %	0 %	258508940
31246	NC_013198	CTT	2	6	1982552	1982557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508940
31247	NC_013198	CTT	2	6	1982666	1982671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508940
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31251	NC_013198	TTA	2	6	1982781	1982786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508940
31252	NC_013198	TGA	2	6	1982848	1982853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508940
31253	NC_013198	TCTT	2	8	1982886	1982893	0 %	75 %	0 %	25 %	258508940
31254	NC_013198	CCG	2	6	1982900	1982905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258508940
31255	NC_013198	CTG	2	6	1982921	1982926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508940
31256	NC_013198	TAAG	2	8	1982979	1982986	50 %	25 %	25 %	0 %	258508940
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31264	NC_013198	CTT	2	6	1983263	1983268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508940
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31268	NC_013198	TGC	2	6	1984438	1984443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508941
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31274	NC_013198	CTGA	2	8	1984736	1984743	25 %	25 %	25 %	25 %	258508942
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31300	NC_013198	CTG	2	6	1986097	1986102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508942
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31304	NC_013198	CACC	2	8	1986278	1986285	25 %	0 %	0 %	75 %	258508943
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31323	NC_013198	AACT	2	8	1987442	1987449	50 %	25 %	0 %	25 %	258508943
31324	NC_013198	CAAC	2	8	1987463	1987470	50 %	0 %	0 %	50 %	258508943
31325	NC_013198	GCA	2	6	1987472	1987477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508943
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31329	NC_013198	ACC	2	6	1987817	1987822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508943
31330	NC_013198	TTC	2	6	1987825	1987830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508943
31331	NC_013198	GCATA	2	10	1987856	1987865	40 %	20 %	20 %	20 %	258508943
31332	NC_013198	TCA	2	6	1988339	1988344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508944
31333	NC_013198	CTT	2	6	1988352	1988357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508944
31334	NC_013198	CAT	2	6	1988519	1988524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508944
31335	NC_013198	ATCCGG	2	12	1988544	1988555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258508944
31336	NC_013198	TCA	2	6	1988557	1988562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508944
31337	NC_013198	CCGC	2	8	1988619	1988626	0 %	0 %	25 %	75 %	258508944
31338	NC_013198	CAT	2	6	1988630	1988635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508944
31339	NC_013198	CAA	2	6	1988643	1988648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508944
31340	NC_013198	TCT	2	6	1988654	1988659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508944
31341	NC_013198	CTT	3	9	1988670	1988678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508944
31342	NC_013198	ATCAA	2	10	1988680	1988689	60 %	20 %	0 %	20 %	258508944
31343	NC_013198	CAT	2	6	1988718	1988723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508944
31344	NC_013198	TCA	2	6	1988886	1988891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508945
31345	NC_013198	AGGC	2	8	1988913	1988920	25 %	0 %	50 %	25 %	258508945
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