MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29003	NC_013198	CTT	2	6	1837261	1837266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508803
29004	NC_013198	TCA	2	6	1837314	1837319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508803
29005	NC_013198	CAA	2	6	1837342	1837347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508803
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29007	NC_013198	TGC	2	6	1837487	1837492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508803
29008	NC_013198	TGG	2	6	1837663	1837668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508803
29009	NC_013198	ATCG	2	8	1837697	1837704	25 %	25 %	25 %	25 %	258508803
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29012	NC_013198	GCC	2	6	1837787	1837792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258508803
29013	NC_013198	ACC	2	6	1837809	1837814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508803
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29016	NC_013198	CTG	2	6	1838122	1838127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508803
29017	NC_013198	GCCC	2	8	1838154	1838161	0 %	0 %	25 %	75 %	258508803
29018	NC_013198	CTT	2	6	1838266	1838271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508803
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29101	NC_013198	GTT	2	6	1843028	1843033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508808
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29117	NC_013198	GCT	2	6	1844062	1844067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508810
29118	NC_013198	CAA	2	6	1844132	1844137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508810
29119	NC_013198	CA	3	6	1844200	1844205	50 %	0 %	0 %	50 %	258508810
29120	NC_013198	A	6	6	1844234	1844239	100 %	0 %	0 %	0 %	258508810
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29129	NC_013198	CGC	2	6	1844610	1844615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258508810
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29135	NC_013198	TGA	2	6	1845402	1845407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508811
29136	NC_013198	CCT	2	6	1845888	1845893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258508811
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29141	NC_013198	TGCC	2	8	1846183	1846190	0 %	25 %	25 %	50 %	258508812
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29230	NC_013198	CCGA	2	8	1850289	1850296	25 %	0 %	25 %	50 %	258508817
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29235	NC_013198	GAT	2	6	1850779	1850784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508818
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29341	NC_013198	AAAG	2	8	1857754	1857761	75 %	0 %	25 %	0 %	258508822
29342	NC_013198	A	6	6	1857779	1857784	100 %	0 %	0 %	0 %	258508822
29343	NC_013198	CAA	2	6	1857966	1857971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508823
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29466	NC_013198	TCAT	2	8	1866023	1866030	25 %	50 %	0 %	25 %	258508831
29467	NC_013198	CAT	2	6	1866111	1866116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508831
29468	NC_013198	CTG	2	6	1866150	1866155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508831
29469	NC_013198	CTT	2	6	1866219	1866224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508831
29470	NC_013198	TAAT	2	8	1866242	1866249	50 %	50 %	0 %	0 %	258508831
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29472	NC_013198	TCT	2	6	1866332	1866337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508831
29473	NC_013198	GCA	2	6	1866359	1866364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508831
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29475	NC_013198	TCA	2	6	1866919	1866924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508832
29476	NC_013198	CAT	2	6	1867020	1867025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508832
29477	NC_013198	TAGT	2	8	1867083	1867090	25 %	50 %	25 %	0 %	258508832
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29479	NC_013198	GTT	2	6	1867116	1867121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508832
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29485	NC_013198	T	6	6	1867369	1867374	0 %	100 %	0 %	0 %	258508832
29486	NC_013198	ATG	2	6	1867432	1867437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508832
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29489	NC_013198	CGAT	2	8	1867558	1867565	25 %	25 %	25 %	25 %	258508832
29490	NC_013198	CAG	2	6	1867588	1867593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508832
29491	NC_013198	ATC	2	6	1867613	1867618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508832
29492	NC_013198	CAT	2	6	1867735	1867740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508832
29493	NC_013198	CAGCG	2	10	1867741	1867750	20 %	0 %	40 %	40 %	258508832
29494	NC_013198	CTT	2	6	1867767	1867772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508832
29495	NC_013198	CCGC	2	8	1867782	1867789	0 %	0 %	25 %	75 %	258508832
29496	NC_013198	ATGA	2	8	1867816	1867823	50 %	25 %	25 %	0 %	258508832
29497	NC_013198	GCG	2	6	1867916	1867921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508832
29498	NC_013198	GCCGAT	2	12	1867981	1867992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258508832
29499	NC_013198	TATT	2	8	1867997	1868004	25 %	75 %	0 %	0 %	258508832
29500	NC_013198	ATC	2	6	1868008	1868013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508832

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