MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_013198	GAA	2	6	1600054	1600059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508582
25003	NC_013198	AGC	2	6	1600112	1600117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508582
25004	NC_013198	CATTCA	2	12	1600143	1600154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508582
25005	NC_013198	A	6	6	1600194	1600199	100 %	0 %	0 %	0 %	258508582
25006	NC_013198	CCA	2	6	1600317	1600322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508582
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25008	NC_013198	CGA	2	6	1600404	1600409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508582
25009	NC_013198	AATATC	2	12	1600447	1600458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258508582
25010	NC_013198	AAT	2	6	1600488	1600493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508582
25011	NC_013198	TTAAT	2	10	1600521	1600530	40 %	60 %	0 %	0 %	258508582
25012	NC_013198	CAT	2	6	1600590	1600595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508582
25013	NC_013198	GCT	2	6	1600622	1600627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508582
25014	NC_013198	A	6	6	1600653	1600658	100 %	0 %	0 %	0 %	258508582
25015	NC_013198	TTCA	2	8	1600663	1600670	25 %	50 %	0 %	25 %	258508582
25016	NC_013198	TCT	2	6	1600772	1600777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508583
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25019	NC_013198	TTTGC	2	10	1600923	1600932	0 %	60 %	20 %	20 %	258508583
25020	NC_013198	CTT	2	6	1601019	1601024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508583
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25024	NC_013198	TGC	2	6	1601129	1601134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508583
25025	NC_013198	CTG	2	6	1601164	1601169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508583
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25037	NC_013198	GCT	2	6	1601612	1601617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508583
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25039	NC_013198	CAGT	2	8	1601697	1601704	25 %	25 %	25 %	25 %	258508583
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25230	NC_013198	CT	3	6	1611029	1611034	0 %	50 %	0 %	50 %	258508587
25231	NC_013198	GCT	2	6	1611056	1611061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508587
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25323	NC_013198	ATG	2	6	1615101	1615106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508587
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25325	NC_013198	TTC	2	6	1615151	1615156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508587
25326	NC_013198	CTG	2	6	1615185	1615190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25327	NC_013198	TTTAC	2	10	1615214	1615223	20 %	60 %	0 %	20 %	258508587
25328	NC_013198	CTTG	2	8	1615235	1615242	0 %	50 %	25 %	25 %	258508587
25329	NC_013198	TTG	2	6	1615332	1615337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508587
25330	NC_013198	GCA	2	6	1615394	1615399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25331	NC_013198	CTG	3	9	1615566	1615574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25332	NC_013198	GCG	2	6	1615610	1615615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508587
25333	NC_013198	TTG	2	6	1615633	1615638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508587
25334	NC_013198	GCA	3	9	1615649	1615657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25335	NC_013198	CAG	2	6	1615659	1615664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25336	NC_013198	GGC	3	9	1615720	1615728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508587
25337	NC_013198	GCT	2	6	1615730	1615735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25338	NC_013198	GGC	2	6	1615753	1615758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508587
25339	NC_013198	GCA	2	6	1615790	1615795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25340	NC_013198	GCA	2	6	1615805	1615810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25341	NC_013198	AGC	2	6	1615927	1615932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25342	NC_013198	GCA	2	6	1616009	1616014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25343	NC_013198	AGC	2	6	1616017	1616022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25344	NC_013198	CAT	2	6	1616193	1616198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508587
25345	NC_013198	ATT	2	6	1616320	1616325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508587
25346	NC_013198	TAC	2	6	1616334	1616339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508587
25347	NC_013198	AAC	2	6	1616503	1616508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508587
25348	NC_013198	CAT	2	6	1616526	1616531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508587
25349	NC_013198	CCA	2	6	1616532	1616537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508587
25350	NC_013198	GCA	2	6	1616546	1616551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25351	NC_013198	TTG	2	6	1616582	1616587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508587
25352	NC_013198	TTTCGG	2	12	1616589	1616600	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258508587
25353	NC_013198	GCA	2	6	1616612	1616617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25354	NC_013198	CAG	2	6	1616628	1616633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25355	NC_013198	ACT	2	6	1616644	1616649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508587
25356	NC_013198	TGCT	2	8	1616658	1616665	0 %	50 %	25 %	25 %	258508587
25357	NC_013198	AGT	2	6	1616692	1616697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508587
25358	NC_013198	TTG	2	6	1616830	1616835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508587
25359	NC_013198	TGT	3	9	1616866	1616874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508587
25360	NC_013198	GCG	2	6	1616909	1616914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508587
25361	NC_013198	GCA	2	6	1617005	1617010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508587
25362	NC_013198	CAC	2	6	1617078	1617083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508587
25363	NC_013198	T	6	6	1617169	1617174	0 %	100 %	0 %	0 %	258508587
25364	NC_013198	TTG	2	6	1618010	1618015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508588
25365	NC_013198	TTA	2	6	1618018	1618023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508588
25366	NC_013198	CAT	2	6	1618069	1618074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508588
25367	NC_013198	CGGT	2	8	1618161	1618168	0 %	25 %	50 %	25 %	258508588
25368	NC_013198	CCA	2	6	1618190	1618195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508588
25369	NC_013198	TCAT	2	8	1618206	1618213	25 %	50 %	0 %	25 %	258508588
25370	NC_013198	TTG	2	6	1618262	1618267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508588
25371	NC_013198	AAC	2	6	1618286	1618291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508588
25372	NC_013198	GTT	2	6	1618332	1618337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508588
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25375	NC_013198	CG	3	6	1618435	1618440	0 %	0 %	50 %	50 %	258508588
25376	NC_013198	AT	3	6	1618530	1618535	50 %	50 %	0 %	0 %	258508588
25377	NC_013198	TGC	2	6	1618546	1618551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508588
25378	NC_013198	GAT	2	6	1618627	1618632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508588
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25380	NC_013198	GCT	2	6	1618678	1618683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508588
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25382	NC_013198	TCA	3	9	1618777	1618785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508588
25383	NC_013198	TCT	2	6	1618818	1618823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508588
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25385	NC_013198	AGATAA	2	12	1618836	1618847	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	258508588
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25387	NC_013198	CTG	2	6	1619159	1619164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508589
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25391	NC_013198	TGA	2	6	1619277	1619282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508589
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25393	NC_013198	GATCAT	2	12	1619395	1619406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258508589
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25396	NC_013198	GTC	2	6	1619520	1619525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508589
25397	NC_013198	ATA	2	6	1619546	1619551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508589
25398	NC_013198	TGC	2	6	1619652	1619657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508589
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25400	NC_013198	GCA	2	6	1619730	1619735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508589
25401	NC_013198	CAA	2	6	1619795	1619800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508589
25402	NC_013198	T	6	6	1619804	1619809	0 %	100 %	0 %	0 %	258508589
25403	NC_013198	TA	3	6	1619887	1619892	50 %	50 %	0 %	0 %	258508589
25404	NC_013198	ATTG	2	8	1619893	1619900	25 %	50 %	25 %	0 %	258508589
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25426	NC_013198	CAAC	2	8	1621323	1621330	50 %	0 %	0 %	50 %	258508592
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25430	NC_013198	ATG	2	6	1621783	1621788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508593
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25441	NC_013198	ATGG	2	8	1622518	1622525	25 %	25 %	50 %	0 %	258508593
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25444	NC_013198	GGTT	2	8	1622692	1622699	0 %	50 %	50 %	0 %	258508593
25445	NC_013198	CCA	2	6	1622712	1622717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508593
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25450	NC_013198	CTT	2	6	1623027	1623032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508593
25451	NC_013198	GGC	2	6	1623040	1623045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508593
25452	NC_013198	CG	3	6	1623054	1623059	0 %	0 %	50 %	50 %	258508593
25453	NC_013198	GAT	2	6	1623094	1623099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508593
25454	NC_013198	TGC	2	6	1623145	1623150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508593
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25456	NC_013198	GCG	2	6	1623168	1623173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508593
25457	NC_013198	GAC	2	6	1623265	1623270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508593
25458	NC_013198	GCT	2	6	1623335	1623340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508593
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25460	NC_013198	GCT	2	6	1623523	1623528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508593
25461	NC_013198	T	6	6	1623567	1623572	0 %	100 %	0 %	0 %	258508593
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25483	NC_013198	CCA	2	6	1625265	1625270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508596
25484	NC_013198	CGG	2	6	1625302	1625307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508596
25485	NC_013198	CAAAG	2	10	1625362	1625371	60 %	0 %	20 %	20 %	258508596
25486	NC_013198	TCG	2	6	1625627	1625632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508597
25487	NC_013198	CTT	2	6	1625698	1625703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508597
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25490	NC_013198	CTG	2	6	1625848	1625853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508597
25491	NC_013198	TGG	2	6	1625862	1625867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508597
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