MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_013198	TGA	2	6	1345145	1345150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508342
21004	NC_013198	TGG	2	6	1345178	1345183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508342
21005	NC_013198	ATG	2	6	1345362	1345367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508342
21006	NC_013198	CAC	2	6	1345461	1345466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508342
21007	NC_013198	AGC	2	6	1345471	1345476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508342
21008	NC_013198	CTT	2	6	1345589	1345594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508342
21009	NC_013198	TG	3	6	1345631	1345636	0 %	50 %	50 %	0 %	258508342
21010	NC_013198	T	7	7	1345638	1345644	0 %	100 %	0 %	0 %	258508342
21011	NC_013198	TGC	2	6	1345743	1345748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508342
21012	NC_013198	CTG	2	6	1345749	1345754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508342
21013	NC_013198	ATC	2	6	1345860	1345865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508343
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21017	NC_013198	T	6	6	1346143	1346148	0 %	100 %	0 %	0 %	258508343
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21019	NC_013198	TGA	2	6	1346258	1346263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508344
21020	NC_013198	TGA	2	6	1346448	1346453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508344
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21063	NC_013198	TGA	2	6	1348253	1348258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508345
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21117	NC_013198	GAT	2	6	1351179	1351184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508347
21118	NC_013198	CAT	2	6	1351283	1351288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508347
21119	NC_013198	GTC	2	6	1351338	1351343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508347
21120	NC_013198	CTG	2	6	1351351	1351356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508347
21121	NC_013198	AAGGC	2	10	1351360	1351369	40 %	0 %	40 %	20 %	258508347
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21123	NC_013198	ATG	2	6	1351609	1351614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508348
21124	NC_013198	AGA	2	6	1351655	1351660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508348
21125	NC_013198	TTAA	2	8	1351725	1351732	50 %	50 %	0 %	0 %	258508348
21126	NC_013198	T	6	6	1351812	1351817	0 %	100 %	0 %	0 %	258508348
21127	NC_013198	GAT	2	6	1351880	1351885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508348
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21130	NC_013198	GTC	2	6	1351942	1351947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508348
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21133	NC_013198	TAT	2	6	1351992	1351997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508348
21134	NC_013198	TGT	2	6	1352060	1352065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508348
21135	NC_013198	ATG	2	6	1352143	1352148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508348
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21142	NC_013198	TAT	2	6	1353014	1353019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508351
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21145	NC_013198	GCTG	2	8	1353332	1353339	0 %	25 %	50 %	25 %	258508351
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21148	NC_013198	TAA	2	6	1353419	1353424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508351
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21152	NC_013198	TGA	2	6	1354021	1354026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508351
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21181	NC_013198	TTA	2	6	1356093	1356098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508353
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21193	NC_013198	CG	3	6	1356710	1356715	0 %	0 %	50 %	50 %	258508353
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21219	NC_013198	AGC	2	6	1358314	1358319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508354
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21221	NC_013198	CGTGAA	2	12	1358365	1358376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258508354
21222	NC_013198	ATGA	2	8	1358411	1358418	50 %	25 %	25 %	0 %	258508354
21223	NC_013198	CGC	2	6	1358436	1358441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258508354
21224	NC_013198	CAA	2	6	1358442	1358447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508354
21225	NC_013198	GCC	2	6	1358509	1358514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258508354
21226	NC_013198	TTCACT	2	12	1358524	1358535	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258508354
21227	NC_013198	CAG	2	6	1358556	1358561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508354
21228	NC_013198	TTC	2	6	1358593	1358598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508354
21229	NC_013198	T	6	6	1358680	1358685	0 %	100 %	0 %	0 %	258508354
21230	NC_013198	GCT	2	6	1358813	1358818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508354
21231	NC_013198	GCAG	2	8	1358851	1358858	25 %	0 %	50 %	25 %	258508354
21232	NC_013198	GCTT	2	8	1358909	1358916	0 %	50 %	25 %	25 %	258508354
21233	NC_013198	CTT	2	6	1358934	1358939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508354
21234	NC_013198	CTT	3	9	1358952	1358960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508354
21235	NC_013198	GCT	2	6	1358975	1358980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508354
21236	NC_013198	TCA	2	6	1359017	1359022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508354
21237	NC_013198	AGC	2	6	1359091	1359096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508354
21238	NC_013198	GAA	2	6	1359136	1359141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508354
21239	NC_013198	TGATTC	2	12	1359274	1359285	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258508354
21240	NC_013198	CGTCAG	2	12	1359312	1359323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258508354
21241	NC_013198	TCA	2	6	1359359	1359364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508354
21242	NC_013198	TGG	2	6	1359378	1359383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508354
21243	NC_013198	T	6	6	1359410	1359415	0 %	100 %	0 %	0 %	258508354
21244	NC_013198	AGT	2	6	1359416	1359421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508354
21245	NC_013198	TCC	2	6	1359443	1359448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258508355
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21247	NC_013198	CAT	2	6	1359567	1359572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508355
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21249	NC_013198	CAG	2	6	1359636	1359641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508355
21250	NC_013198	CAC	2	6	1359693	1359698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508355
21251	NC_013198	TGT	2	6	1359722	1359727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508355
21252	NC_013198	GCG	2	6	1359745	1359750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508355
21253	NC_013198	AGC	2	6	1359802	1359807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508355
21254	NC_013198	CAA	2	6	1359831	1359836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508355
21255	NC_013198	GAT	2	6	1359840	1359845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508355
21256	NC_013198	AGT	2	6	1359860	1359865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508355
21257	NC_013198	GGT	2	6	1359874	1359879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508355
21258	NC_013198	ATA	2	6	1359971	1359976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508355
21259	NC_013198	AGCTT	2	10	1360004	1360013	20 %	40 %	20 %	20 %	258508355
21260	NC_013198	CGT	2	6	1360269	1360274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508355
21261	NC_013198	AATC	2	8	1360326	1360333	50 %	25 %	0 %	25 %	258508355
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21264	NC_013198	CTT	2	6	1360547	1360552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508356
21265	NC_013198	GTG	2	6	1360564	1360569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508356
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21268	NC_013198	A	6	6	1360777	1360782	100 %	0 %	0 %	0 %	258508356
21269	NC_013198	GTC	2	6	1360801	1360806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508356
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21303	NC_013198	TGG	2	6	1363060	1363065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508358
21304	NC_013198	TAT	2	6	1363156	1363161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508358
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21306	NC_013198	GCG	2	6	1363253	1363258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508358
21307	NC_013198	ATG	2	6	1363279	1363284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508358
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21321	NC_013198	GTC	2	6	1364085	1364090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508358
21322	NC_013198	CG	4	8	1364096	1364103	0 %	0 %	50 %	50 %	258508358
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21327	NC_013198	TGC	2	6	1364514	1364519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508358
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21330	NC_013198	GTT	2	6	1364995	1365000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508359
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21332	NC_013198	GGC	2	6	1365140	1365145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508359
21333	NC_013198	TTG	2	6	1365248	1365253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508359
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21339	NC_013198	GTC	2	6	1365540	1365545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508359
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21344	NC_013198	TGT	2	6	1365778	1365783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508359
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21459	NC_013198	CGT	2	6	1373227	1373232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508366
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21463	NC_013198	TCT	2	6	1373331	1373336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508366
21464	NC_013198	GAA	2	6	1373371	1373376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508366
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21493	NC_013198	TGA	2	6	1374829	1374834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508368
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