MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_013198	GAG	2	6	1224532	1224537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258508230
19003	NC_013198	TGG	2	6	1224650	1224655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508230
19004	NC_013198	ATCG	2	8	1224669	1224676	25 %	25 %	25 %	25 %	258508230
19005	NC_013198	TAT	2	6	1224811	1224816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508230
19006	NC_013198	GGA	2	6	1224837	1224842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258508230
19007	NC_013198	GAA	2	6	1224942	1224947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508230
19008	NC_013198	AGA	2	6	1224963	1224968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508230
19009	NC_013198	ATTT	2	8	1225221	1225228	25 %	75 %	0 %	0 %	258508231
19010	NC_013198	A	6	6	1225350	1225355	100 %	0 %	0 %	0 %	258508231
19011	NC_013198	T	6	6	1225379	1225384	0 %	100 %	0 %	0 %	258508231
19012	NC_013198	TTC	2	6	1225422	1225427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508231
19013	NC_013198	AAT	2	6	1225432	1225437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508231
19014	NC_013198	ACC	2	6	1225553	1225558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508231
19015	NC_013198	GT	3	6	1225765	1225770	0 %	50 %	50 %	0 %	258508231
19016	NC_013198	AGT	2	6	1226289	1226294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508232
19017	NC_013198	TTTG	2	8	1226334	1226341	0 %	75 %	25 %	0 %	258508232
19018	NC_013198	TCA	2	6	1226457	1226462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508232
19019	NC_013198	AGC	2	6	1226527	1226532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508232
19020	NC_013198	GGTA	2	8	1226587	1226594	25 %	25 %	50 %	0 %	258508232
19021	NC_013198	GCGT	2	8	1226597	1226604	0 %	25 %	50 %	25 %	258508232
19022	NC_013198	GGC	2	6	1226672	1226677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508232
19023	NC_013198	ATC	2	6	1226737	1226742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508232
19024	NC_013198	ATC	3	9	1226810	1226818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508232
19025	NC_013198	CCT	2	6	1226822	1226827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258508233
19026	NC_013198	AAGT	2	8	1226834	1226841	50 %	25 %	25 %	0 %	258508233
19027	NC_013198	GTT	2	6	1226903	1226908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508233
19028	NC_013198	ATG	2	6	1227010	1227015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508233
19029	NC_013198	CAT	2	6	1227174	1227179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508233
19030	NC_013198	CTG	2	6	1227192	1227197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508233
19031	NC_013198	TGA	2	6	1227293	1227298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508233
19032	NC_013198	T	6	6	1227304	1227309	0 %	100 %	0 %	0 %	258508233
19033	NC_013198	ATC	2	6	1227331	1227336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508233
19034	NC_013198	GT	3	6	1227353	1227358	0 %	50 %	50 %	0 %	258508233
19035	NC_013198	CG	3	6	1227370	1227375	0 %	0 %	50 %	50 %	258508233
19036	NC_013198	AAC	2	6	1227399	1227404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508233
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19039	NC_013198	GC	3	6	1227456	1227461	0 %	0 %	50 %	50 %	258508233
19040	NC_013198	AAT	2	6	1227663	1227668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508233
19041	NC_013198	GCCA	2	8	1227736	1227743	25 %	0 %	25 %	50 %	258508233
19042	NC_013198	CGAT	2	8	1227745	1227752	25 %	25 %	25 %	25 %	258508233
19043	NC_013198	TGG	2	6	1227824	1227829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508233
19044	NC_013198	ATA	2	6	1227844	1227849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508233
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19046	NC_013198	CA	3	6	1227868	1227873	50 %	0 %	0 %	50 %	258508233
19047	NC_013198	GTT	2	6	1227942	1227947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508234
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19054	NC_013198	TCA	3	9	1228347	1228355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508234
19055	NC_013198	TAA	2	6	1228379	1228384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508234
19056	NC_013198	A	6	6	1228412	1228417	100 %	0 %	0 %	0 %	258508234
19057	NC_013198	GAA	2	6	1228465	1228470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508234
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19059	NC_013198	TAAA	2	8	1228573	1228580	75 %	25 %	0 %	0 %	258508234
19060	NC_013198	ATG	2	6	1228592	1228597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508234
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19065	NC_013198	CACT	2	8	1228738	1228745	25 %	25 %	0 %	50 %	258508235
19066	NC_013198	AGC	2	6	1228761	1228766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508235
19067	NC_013198	GC	3	6	1228776	1228781	0 %	0 %	50 %	50 %	258508235
19068	NC_013198	CTGTG	2	10	1228798	1228807	0 %	40 %	40 %	20 %	258508235
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19070	NC_013198	AGT	2	6	1228869	1228874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508235
19071	NC_013198	TGG	2	6	1228897	1228902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508235
19072	NC_013198	GGAG	2	8	1228930	1228937	25 %	0 %	75 %	0 %	258508235
19073	NC_013198	CAG	2	6	1228970	1228975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508235
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19079	NC_013198	TTA	2	6	1229235	1229240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508235
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19087	NC_013198	GTTAA	2	10	1229487	1229496	40 %	40 %	20 %	0 %	258508235
19088	NC_013198	T	6	6	1229513	1229518	0 %	100 %	0 %	0 %	258508235
19089	NC_013198	AAT	2	6	1229549	1229554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508235
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19091	NC_013198	CAT	2	6	1229881	1229886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508236
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19097	NC_013198	GTTC	2	8	1230280	1230287	0 %	50 %	25 %	25 %	258508236
19098	NC_013198	TGA	2	6	1230347	1230352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508236
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19100	NC_013198	TGA	2	6	1230381	1230386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508236
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19106	NC_013198	TGC	2	6	1230576	1230581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508236
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19109	NC_013198	TAG	2	6	1230699	1230704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508236
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19112	NC_013198	TGA	2	6	1230900	1230905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508236
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19116	NC_013198	GAT	2	6	1231009	1231014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508236
19117	NC_013198	CGAG	2	8	1231019	1231026	25 %	0 %	50 %	25 %	258508236
19118	NC_013198	CGG	2	6	1231057	1231062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508236
19119	NC_013198	TGG	2	6	1231070	1231075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508236
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19121	NC_013198	TGC	2	6	1231152	1231157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508236
19122	NC_013198	TGC	2	6	1231176	1231181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508236
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19128	NC_013198	TGC	2	6	1231403	1231408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508237
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19219	NC_013198	GGT	2	6	1236452	1236457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508240
19220	NC_013198	GT	3	6	1236472	1236477	0 %	50 %	50 %	0 %	258508240
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19224	NC_013198	GAG	2	6	1236672	1236677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258508240
19225	NC_013198	AGC	2	6	1236680	1236685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508240
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19227	NC_013198	CG	3	6	1236772	1236777	0 %	0 %	50 %	50 %	258508240
19228	NC_013198	GATGA	2	10	1236786	1236795	40 %	20 %	40 %	0 %	258508240
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19231	NC_013198	TCA	2	6	1237183	1237188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508241
19232	NC_013198	TCT	2	6	1237213	1237218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508241
19233	NC_013198	AAC	2	6	1237247	1237252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508241
19234	NC_013198	TAC	2	6	1237265	1237270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508241
19235	NC_013198	ATC	2	6	1237331	1237336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508241
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19238	NC_013198	AT	3	6	1237570	1237575	50 %	50 %	0 %	0 %	258508241
19239	NC_013198	CAA	2	6	1237576	1237581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508241
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19243	NC_013198	TTG	2	6	1237773	1237778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508241
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19251	NC_013198	T	6	6	1238130	1238135	0 %	100 %	0 %	0 %	258508241
19252	NC_013198	TGC	2	6	1238166	1238171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508241
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19341	NC_013198	CAT	2	6	1244789	1244794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508245
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19344	NC_013198	GATT	2	8	1244903	1244910	25 %	50 %	25 %	0 %	258508245
19345	NC_013198	ATC	2	6	1244913	1244918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508245
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19348	NC_013198	GCT	2	6	1245107	1245112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508245
19349	NC_013198	T	6	6	1245147	1245152	0 %	100 %	0 %	0 %	258508245
19350	NC_013198	ATC	2	6	1245464	1245469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508246
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19353	NC_013198	GCA	2	6	1245626	1245631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508246
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19357	NC_013198	TTAA	2	8	1245761	1245768	50 %	50 %	0 %	0 %	258508246
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19453	NC_013198	T	6	6	1250656	1250661	0 %	100 %	0 %	0 %	258508249
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19459	NC_013198	CATGC	2	10	1250942	1250951	20 %	20 %	20 %	40 %	258508249
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19461	NC_013198	TGA	2	6	1251255	1251260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508249
19462	NC_013198	CAC	2	6	1251292	1251297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508249
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19464	NC_013198	GGA	2	6	1251356	1251361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258508249
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19500	NC_013198	AGCTG	2	10	1253595	1253604	20 %	20 %	40 %	20 %	258508252

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