MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_013198	TCA	2	6	1128703	1128708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508124
17502	NC_013198	TGGCT	2	10	1128731	1128740	0 %	40 %	40 %	20 %	258508124
17503	NC_013198	TGG	2	6	1128785	1128790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508124
17504	NC_013198	TGCAA	2	10	1128821	1128830	40 %	20 %	20 %	20 %	258508124
17505	NC_013198	CAAT	2	8	1128886	1128893	50 %	25 %	0 %	25 %	258508124
17506	NC_013198	TGGT	2	8	1128919	1128926	0 %	50 %	50 %	0 %	258508124
17507	NC_013198	AAG	2	6	1128972	1128977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508124
17508	NC_013198	GTT	2	6	1128981	1128986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508124
17509	NC_013198	GAT	2	6	1129282	1129287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508125
17510	NC_013198	AC	3	6	1129302	1129307	50 %	0 %	0 %	50 %	258508125
17511	NC_013198	GAT	2	6	1129310	1129315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508125
17512	NC_013198	TAC	2	6	1129339	1129344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508125
17513	NC_013198	TG	3	6	1129424	1129429	0 %	50 %	50 %	0 %	258508125
17514	NC_013198	CGA	2	6	1129430	1129435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508125
17515	NC_013198	AGG	2	6	1129476	1129481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258508125
17516	NC_013198	CGTTCA	2	12	1129488	1129499	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258508125
17517	NC_013198	GAT	2	6	1129514	1129519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508125
17518	NC_013198	TGA	2	6	1129525	1129530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508125
17519	NC_013198	AAG	2	6	1129545	1129550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508125
17520	NC_013198	TGA	3	9	1129652	1129660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508126
17521	NC_013198	TGA	3	9	1129838	1129846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508126
17522	NC_013198	ACA	2	6	1129941	1129946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508127
17523	NC_013198	GATG	2	8	1129999	1130006	25 %	25 %	50 %	0 %	258508127
17524	NC_013198	CAAA	2	8	1130011	1130018	75 %	0 %	0 %	25 %	258508127
17525	NC_013198	CAG	2	6	1130027	1130032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508127
17526	NC_013198	GCA	2	6	1130033	1130038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508127
17527	NC_013198	GGC	2	6	1130132	1130137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508127
17528	NC_013198	TTA	2	6	1130253	1130258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508127
17529	NC_013198	AGC	2	6	1130272	1130277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508127
17530	NC_013198	ATCAC	2	10	1130294	1130303	40 %	20 %	0 %	40 %	258508128
17531	NC_013198	ATT	2	6	1130322	1130327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508128
17532	NC_013198	ATC	2	6	1130344	1130349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508128
17533	NC_013198	GCA	2	6	1130380	1130385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508128
17534	NC_013198	TTG	2	6	1130412	1130417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508128
17535	NC_013198	GTT	2	6	1130429	1130434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508128
17536	NC_013198	CAA	2	6	1130442	1130447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508128
17537	NC_013198	A	6	6	1130498	1130503	100 %	0 %	0 %	0 %	258508128
17538	NC_013198	T	6	6	1130537	1130542	0 %	100 %	0 %	0 %	258508128
17539	NC_013198	GAT	2	6	1130570	1130575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508128
17540	NC_013198	AGA	2	6	1130596	1130601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508128
17541	NC_013198	CTCAAT	2	12	1130669	1130680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508128
17542	NC_013198	AGG	2	6	1130688	1130693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258508128
17543	NC_013198	GTT	2	6	1130737	1130742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508129
17544	NC_013198	AAC	2	6	1130911	1130916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508129
17545	NC_013198	AAG	2	6	1131047	1131052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258508129
17546	NC_013198	CAG	2	6	1131054	1131059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508129
17547	NC_013198	ACTCG	2	10	1131080	1131089	20 %	20 %	20 %	40 %	258508129
17548	NC_013198	GAT	2	6	1131142	1131147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508129
17549	NC_013198	CACTGA	2	12	1131195	1131206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258508129
17550	NC_013198	CGG	2	6	1131213	1131218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508129
17551	NC_013198	CTG	2	6	1131260	1131265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508129
17552	NC_013198	GCGG	2	8	1131277	1131284	0 %	0 %	75 %	25 %	258508129
17553	NC_013198	TGC	2	6	1131539	1131544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508130
17554	NC_013198	CGTC	2	8	1131591	1131598	0 %	25 %	25 %	50 %	258508130
17555	NC_013198	A	6	6	1131704	1131709	100 %	0 %	0 %	0 %	258508130
17556	NC_013198	TTG	2	6	1131834	1131839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508131
17557	NC_013198	GACA	2	8	1131881	1131888	50 %	0 %	25 %	25 %	258508131
17558	NC_013198	AGCA	2	8	1131903	1131910	50 %	0 %	25 %	25 %	258508131
17559	NC_013198	ACC	2	6	1131935	1131940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508131
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17561	NC_013198	TGA	2	6	1131976	1131981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508131
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17564	NC_013198	AG	3	6	1132077	1132082	50 %	0 %	50 %	0 %	258508131
17565	NC_013198	GAAA	2	8	1132154	1132161	75 %	0 %	25 %	0 %	258508131
17566	NC_013198	GGAG	2	8	1132162	1132169	25 %	0 %	75 %	0 %	258508131
17567	NC_013198	CAA	2	6	1132288	1132293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508132
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17573	NC_013198	TGA	2	6	1132625	1132630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508132
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17584	NC_013198	CAAG	2	8	1133300	1133307	50 %	0 %	25 %	25 %	258508132
17585	NC_013198	ATT	2	6	1133361	1133366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508132
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17588	NC_013198	GGC	2	6	1133459	1133464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508132
17589	NC_013198	TTA	2	6	1133530	1133535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508132
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17599	NC_013198	CAAA	2	8	1133754	1133761	75 %	0 %	0 %	25 %	258508132
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17601	NC_013198	GCA	2	6	1134015	1134020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508132
17602	NC_013198	TTC	2	6	1134048	1134053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508132
17603	NC_013198	TGGAA	2	10	1134063	1134072	40 %	20 %	40 %	0 %	258508132
17604	NC_013198	TGG	2	6	1134107	1134112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508132
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17610	NC_013198	CAT	2	6	1134604	1134609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508132
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17614	NC_013198	CTT	2	6	1134859	1134864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508132
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17616	NC_013198	CTG	2	6	1134916	1134921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508132
17617	NC_013198	CAT	2	6	1134929	1134934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508132
17618	NC_013198	TGC	2	6	1135019	1135024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508132
17619	NC_013198	CAT	2	6	1135063	1135068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508132
17620	NC_013198	GCAA	2	8	1135135	1135142	50 %	0 %	25 %	25 %	258508132
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17633	NC_013198	GGCA	2	8	1135768	1135775	25 %	0 %	50 %	25 %	258508133
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17636	NC_013198	CTGG	2	8	1135949	1135956	0 %	25 %	50 %	25 %	258508133
17637	NC_013198	CA	3	6	1135969	1135974	50 %	0 %	0 %	50 %	258508133
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17965	NC_013198	A	6	6	1159543	1159548	100 %	0 %	0 %	0 %	258508158
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17992	NC_013198	TGA	3	9	1160830	1160838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508158
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17995	NC_013198	TCGC	2	8	1160964	1160971	0 %	25 %	25 %	50 %	258508158
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17998	NC_013198	TTG	2	6	1161099	1161104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508158
17999	NC_013198	TGGT	2	8	1161165	1161172	0 %	50 %	50 %	0 %	258508158
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