MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013198	GT	3	6	66392	66397	0 %	50 %	50 %	0 %	258507055
1002	NC_013198	TTA	2	6	66620	66625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507056
1003	NC_013198	AAC	2	6	66642	66647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507056
1004	NC_013198	TGC	2	6	66666	66671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507056
1005	NC_013198	TTTG	2	8	66676	66683	0 %	75 %	25 %	0 %	258507056
1006	NC_013198	CAT	2	6	66741	66746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507056
1007	NC_013198	CTC	2	6	66762	66767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507056
1008	NC_013198	TGC	2	6	66772	66777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507056
1009	NC_013198	GAT	2	6	66920	66925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507056
1010	NC_013198	TGA	2	6	66928	66933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507056
1011	NC_013198	GGCA	2	8	66999	67006	25 %	0 %	50 %	25 %	258507056
1012	NC_013198	ACA	2	6	67254	67259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507056
1013	NC_013198	TAC	2	6	67372	67377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507056
1014	NC_013198	TGGCAT	2	12	67378	67389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258507056
1015	NC_013198	GGC	2	6	67484	67489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507056
1016	NC_013198	A	6	6	67639	67644	100 %	0 %	0 %	0 %	258507056
1017	NC_013198	AAGTG	2	10	67672	67681	40 %	20 %	40 %	0 %	258507056
1018	NC_013198	GCT	2	6	67823	67828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507056
1019	NC_013198	GAT	2	6	67865	67870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507056
1020	NC_013198	ATC	2	6	67955	67960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507056
1021	NC_013198	ACC	2	6	67967	67972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507056
1022	NC_013198	TTA	2	6	67994	67999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507056
1023	NC_013198	GAT	2	6	68066	68071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507056
1024	NC_013198	GGC	2	6	68114	68119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507056
1025	NC_013198	ATGG	2	8	68141	68148	25 %	25 %	50 %	0 %	258507056
1026	NC_013198	ACA	2	6	68188	68193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507056
1027	NC_013198	TGG	2	6	68422	68427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507056
1028	NC_013198	TTG	2	6	68511	68516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507056
1029	NC_013198	CGC	2	6	68693	68698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507056
1030	NC_013198	GTG	2	6	68906	68911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507056
1031	NC_013198	GGT	2	6	68944	68949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507056
1032	NC_013198	GACT	2	8	68950	68957	25 %	25 %	25 %	25 %	258507056
1033	NC_013198	TCA	2	6	68971	68976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507056
1034	NC_013198	ATG	2	6	69371	69376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507057
1035	NC_013198	CTG	2	6	69399	69404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507057
1036	NC_013198	ACG	2	6	69425	69430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507057
1037	NC_013198	TTGG	2	8	69478	69485	0 %	50 %	50 %	0 %	258507057
1038	NC_013198	ATC	2	6	69489	69494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507057
1039	NC_013198	TGA	2	6	69504	69509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507057
1040	NC_013198	CGG	3	9	69565	69573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507057
1041	NC_013198	ATGT	2	8	69590	69597	25 %	50 %	25 %	0 %	258507057
1042	NC_013198	ATC	2	6	69633	69638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507057
1043	NC_013198	GGT	2	6	69640	69645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507057
1044	NC_013198	ATGA	2	8	69882	69889	50 %	25 %	25 %	0 %	258507058
1045	NC_013198	AAG	2	6	70176	70181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507058
1046	NC_013198	CTG	2	6	70206	70211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507058
1047	NC_013198	TGA	2	6	70223	70228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507058
1048	NC_013198	CAT	2	6	70464	70469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507059
1049	NC_013198	TGA	2	6	70591	70596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507059
1050	NC_013198	GCCGG	2	10	70674	70683	0 %	0 %	60 %	40 %	258507059
1051	NC_013198	GAT	2	6	70745	70750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507059
1052	NC_013198	GTGA	2	8	70784	70791	25 %	25 %	50 %	0 %	258507059
1053	NC_013198	GCG	2	6	70847	70852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507059
1054	NC_013198	TAA	2	6	70925	70930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507059
1055	NC_013198	GCCA	2	8	70931	70938	25 %	0 %	25 %	50 %	258507059
1056	NC_013198	GAA	2	6	71018	71023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507059
1057	NC_013198	GT	3	6	71088	71093	0 %	50 %	50 %	0 %	258507059
1058	NC_013198	GAT	2	6	71114	71119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507059
1059	NC_013198	CGA	2	6	71134	71139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507059
1060	NC_013198	GAT	2	6	71309	71314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507059
1061	NC_013198	ATC	2	6	71334	71339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507059
1062	NC_013198	GTA	2	6	71351	71356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507059
1063	NC_013198	GCA	2	6	71509	71514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507059
1064	NC_013198	CAG	2	6	71558	71563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507059
1065	NC_013198	AAT	2	6	71598	71603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507059
1066	NC_013198	GT	3	6	71608	71613	0 %	50 %	50 %	0 %	258507059
1067	NC_013198	A	6	6	71628	71633	100 %	0 %	0 %	0 %	258507059
1068	NC_013198	GGT	2	6	71636	71641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507059
1069	NC_013198	AGA	2	6	71664	71669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507059
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1071	NC_013198	AGC	2	6	72284	72289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507060
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1073	NC_013198	T	6	6	72296	72301	0 %	100 %	0 %	0 %	258507060
1074	NC_013198	GAC	2	6	72302	72307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507060
1075	NC_013198	AGC	2	6	72327	72332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507060
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1080	NC_013198	TGC	2	6	72669	72674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507060
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1082	NC_013198	TGC	2	6	72710	72715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507060
1083	NC_013198	A	6	6	72754	72759	100 %	0 %	0 %	0 %	258507060
1084	NC_013198	TGA	2	6	72768	72773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507060
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1087	NC_013198	GCT	2	6	72877	72882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507060
1088	NC_013198	T	6	6	72882	72887	0 %	100 %	0 %	0 %	258507060
1089	NC_013198	AGTA	2	8	72891	72898	50 %	25 %	25 %	0 %	258507060
1090	NC_013198	CTT	2	6	72922	72927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507060
1091	NC_013198	GGT	2	6	72945	72950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507060
1092	NC_013198	T	7	7	72988	72994	0 %	100 %	0 %	0 %	258507060
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1095	NC_013198	TTA	2	6	73053	73058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507060
1096	NC_013198	GTT	2	6	73107	73112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507060
1097	NC_013198	GAA	2	6	73124	73129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507060
1098	NC_013198	GAT	2	6	73220	73225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507060
1099	NC_013198	AT	3	6	73224	73229	50 %	50 %	0 %	0 %	258507060
1100	NC_013198	CAAA	2	8	73276	73283	75 %	0 %	0 %	25 %	258507060
1101	NC_013198	CATAG	2	10	73292	73301	40 %	20 %	20 %	20 %	258507060
1102	NC_013198	T	6	6	73317	73322	0 %	100 %	0 %	0 %	258507060
1103	NC_013198	TTA	2	6	73354	73359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507061
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1106	NC_013198	A	6	6	73472	73477	100 %	0 %	0 %	0 %	258507061
1107	NC_013198	TGA	2	6	73489	73494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507061
1108	NC_013198	CAG	2	6	73524	73529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507061
1109	NC_013198	T	7	7	73532	73538	0 %	100 %	0 %	0 %	258507061
1110	NC_013198	GCT	2	6	73548	73553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507061
1111	NC_013198	AATA	2	8	73574	73581	75 %	25 %	0 %	0 %	258507061
1112	NC_013198	AAC	2	6	73610	73615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507061
1113	NC_013198	CTT	2	6	73647	73652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507061
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1120	NC_013198	CAT	2	6	73822	73827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507061
1121	NC_013198	AGA	2	6	73831	73836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507061
1122	NC_013198	TCGC	2	8	73852	73859	0 %	25 %	25 %	50 %	258507061
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1124	NC_013198	A	6	6	73964	73969	100 %	0 %	0 %	0 %	258507061
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1126	NC_013198	A	6	6	74029	74034	100 %	0 %	0 %	0 %	258507061
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1251	NC_013198	GGC	2	6	80613	80618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507066
1252	NC_013198	GTT	2	6	80726	80731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507066
1253	NC_013198	TCG	2	6	80848	80853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507066
1254	NC_013198	TCA	2	6	80999	81004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507067
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1273	NC_013198	GACC	2	8	82108	82115	25 %	0 %	25 %	50 %	258507068
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1370	NC_013198	TTCGT	2	10	87163	87172	0 %	60 %	20 %	20 %	258507075
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