MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_013198	ATC	2	6	643538	643543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507626
10003	NC_013198	AGC	2	6	643617	643622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507626
10004	NC_013198	CATT	2	8	643640	643647	25 %	50 %	0 %	25 %	258507626
10005	NC_013198	AAT	2	6	643668	643673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507626
10006	NC_013198	CAT	2	6	643800	643805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507626
10007	NC_013198	AGT	2	6	643835	643840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507626
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10010	NC_013198	CAT	3	9	644429	644437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507627
10011	NC_013198	CAC	2	6	644438	644443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507627
10012	NC_013198	AGC	2	6	644457	644462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507627
10013	NC_013198	GCT	2	6	644568	644573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507627
10014	NC_013198	TGC	2	6	644619	644624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507627
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10017	NC_013198	CCA	2	6	644822	644827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507627
10018	NC_013198	GCC	2	6	644916	644921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507627
10019	NC_013198	ATCA	2	8	645021	645028	50 %	25 %	0 %	25 %	258507627
10020	NC_013198	ATC	2	6	645064	645069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507627
10021	NC_013198	GCTG	2	8	645309	645316	0 %	25 %	50 %	25 %	258507628
10022	NC_013198	CTT	2	6	645320	645325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507628
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10024	NC_013198	CAA	2	6	645395	645400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507628
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10028	NC_013198	GCC	3	9	645495	645503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507628
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10031	NC_013198	ATC	2	6	645808	645813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507628
10032	NC_013198	GCT	2	6	645826	645831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507628
10033	NC_013198	GCG	2	6	645832	645837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507628
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10042	NC_013198	TGA	2	6	646211	646216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507628
10043	NC_013198	CAT	2	6	646224	646229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507628
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10050	NC_013198	AAACC	2	10	646479	646488	60 %	0 %	0 %	40 %	258507628
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10088	NC_013198	AT	3	6	650162	650167	50 %	50 %	0 %	0 %	258507632
10089	NC_013198	AAT	2	6	650208	650213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507633
10090	NC_013198	TCGGA	2	10	650229	650238	20 %	20 %	40 %	20 %	258507633
10091	NC_013198	ATT	2	6	650289	650294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507633
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10093	NC_013198	TGA	2	6	650437	650442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507633
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10100	NC_013198	A	6	6	650964	650969	100 %	0 %	0 %	0 %	258507633
10101	NC_013198	CAAG	2	8	651032	651039	50 %	0 %	25 %	25 %	258507633
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10104	NC_013198	TTA	2	6	651150	651155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507633
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10106	NC_013198	TGACG	2	10	651257	651266	20 %	20 %	40 %	20 %	258507633
10107	NC_013198	GCTG	2	8	651287	651294	0 %	25 %	50 %	25 %	258507633
10108	NC_013198	GAC	2	6	651335	651340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507633
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10119	NC_013198	ACG	2	6	651763	651768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507633
10120	NC_013198	GGC	2	6	651803	651808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507633
10121	NC_013198	TTA	2	6	652003	652008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507634
10122	NC_013198	GTT	2	6	652024	652029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507634
10123	NC_013198	TGC	2	6	652037	652042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507634
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10224	NC_013198	GAT	3	9	658564	658572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507639
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10229	NC_013198	T	7	7	658857	658863	0 %	100 %	0 %	0 %	258507640
10230	NC_013198	GGTTG	2	10	658965	658974	0 %	40 %	60 %	0 %	258507640
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10233	NC_013198	TCA	2	6	659047	659052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507640
10234	NC_013198	AATTGA	2	12	659167	659178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	258507640
10235	NC_013198	GCC	2	6	659184	659189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507640
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10238	NC_013198	GCA	2	6	659263	659268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507640
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