MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013198	ACC	2	6	32861	32866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507027
502	NC_013198	GCA	2	6	32883	32888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507027
503	NC_013198	CTT	2	6	32962	32967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507027
504	NC_013198	GGT	2	6	32984	32989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507027
505	NC_013198	GAA	3	9	33014	33022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507027
506	NC_013198	ATC	2	6	33092	33097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507027
507	NC_013198	TGG	2	6	33129	33134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507027
508	NC_013198	TTGC	2	8	33148	33155	0 %	50 %	25 %	25 %	258507027
509	NC_013198	CCG	2	6	33190	33195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507027
510	NC_013198	GCT	2	6	33204	33209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507027
511	NC_013198	GGCA	2	8	33215	33222	25 %	0 %	50 %	25 %	258507027
512	NC_013198	CAGG	2	8	33430	33437	25 %	0 %	50 %	25 %	258507027
513	NC_013198	GCT	2	6	33575	33580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507027
514	NC_013198	GGC	2	6	33667	33672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507027
515	NC_013198	GATT	2	8	33691	33698	25 %	50 %	25 %	0 %	258507027
516	NC_013198	T	6	6	33706	33711	0 %	100 %	0 %	0 %	258507027
517	NC_013198	ACA	2	6	33729	33734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507027
518	NC_013198	TGAC	2	8	33793	33800	25 %	25 %	25 %	25 %	258507027
519	NC_013198	AGT	2	6	33833	33838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507027
520	NC_013198	CAG	2	6	33842	33847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507027
521	NC_013198	ATA	2	6	33948	33953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507027
522	NC_013198	ATG	2	6	33954	33959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507027
523	NC_013198	TCG	2	6	34074	34079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507028
524	NC_013198	TGC	2	6	34084	34089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507028
525	NC_013198	CAT	2	6	34099	34104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507028
526	NC_013198	CAA	2	6	34111	34116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507028
527	NC_013198	TGA	2	6	34153	34158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507028
528	NC_013198	TCA	2	6	34248	34253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507028
529	NC_013198	TGC	2	6	34305	34310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507028
530	NC_013198	GTG	2	6	34377	34382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507028
531	NC_013198	AGCC	2	8	34408	34415	25 %	0 %	25 %	50 %	258507028
532	NC_013198	GTC	2	6	34434	34439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507028
533	NC_013198	AAAAC	2	10	34467	34476	80 %	0 %	0 %	20 %	258507028
534	NC_013198	CCGTC	2	10	34531	34540	0 %	20 %	20 %	60 %	258507028
535	NC_013198	ATCC	2	8	34568	34575	25 %	25 %	0 %	50 %	258507028
536	NC_013198	TGA	2	6	34678	34683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507028
537	NC_013198	AT	3	6	34728	34733	50 %	50 %	0 %	0 %	258507028
538	NC_013198	ATG	2	6	34908	34913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507029
539	NC_013198	AAT	2	6	34926	34931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507029
540	NC_013198	GCG	2	6	34965	34970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507029
541	NC_013198	TTG	2	6	34971	34976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507029
542	NC_013198	ATT	2	6	35084	35089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507029
543	NC_013198	TTA	2	6	35109	35114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507029
544	NC_013198	ATGAC	2	10	35149	35158	40 %	20 %	20 %	20 %	258507029
545	NC_013198	TCA	2	6	35185	35190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507029
546	NC_013198	CA	3	6	35189	35194	50 %	0 %	0 %	50 %	258507029
547	NC_013198	ATT	2	6	35214	35219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507029
548	NC_013198	CAGACG	2	12	35268	35279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507029
549	NC_013198	TTA	2	6	35330	35335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507029
550	NC_013198	GAAA	2	8	35502	35509	75 %	0 %	25 %	0 %	258507030
551	NC_013198	TTG	2	6	35551	35556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507030
552	NC_013198	ACC	2	6	35574	35579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507030
553	NC_013198	TCAA	2	8	35606	35613	50 %	25 %	0 %	25 %	258507030
554	NC_013198	TGG	2	6	35712	35717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507030
555	NC_013198	ATC	2	6	35740	35745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507030
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557	NC_013198	ATC	2	6	35894	35899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507030
558	NC_013198	A	7	7	35904	35910	100 %	0 %	0 %	0 %	258507030
559	NC_013198	CTGAT	2	10	35915	35924	20 %	40 %	20 %	20 %	258507030
560	NC_013198	GGC	2	6	35925	35930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507030
561	NC_013198	CCGG	2	8	36003	36010	0 %	0 %	50 %	50 %	258507030
562	NC_013198	GCG	2	6	36041	36046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507030
563	NC_013198	GCC	2	6	36107	36112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507030
564	NC_013198	ATG	2	6	36136	36141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507030
565	NC_013198	CGGT	2	8	36182	36189	0 %	25 %	50 %	25 %	258507030
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570	NC_013198	TGC	2	6	36373	36378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507031
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573	NC_013198	CAT	2	6	36582	36587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507031
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576	NC_013198	TGC	2	6	36877	36882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507032
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580	NC_013198	GAT	2	6	36922	36927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507032
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582	NC_013198	GTG	2	6	36995	37000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507032
583	NC_013198	TTC	2	6	37049	37054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507032
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589	NC_013198	CAAT	2	8	37320	37327	50 %	25 %	0 %	25 %	258507032
590	NC_013198	AGA	2	6	37328	37333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507032
591	NC_013198	TAC	2	6	37347	37352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507032
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593	NC_013198	GAG	2	6	37415	37420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507032
594	NC_013198	AACC	2	8	37428	37435	50 %	0 %	0 %	50 %	258507032
595	NC_013198	TGG	2	6	37480	37485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507032
596	NC_013198	GTC	2	6	37907	37912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507033
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598	NC_013198	CAG	2	6	37982	37987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507033
599	NC_013198	T	6	6	37999	38004	0 %	100 %	0 %	0 %	258507033
600	NC_013198	T	6	6	38014	38019	0 %	100 %	0 %	0 %	258507033
601	NC_013198	ATT	2	6	38098	38103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507033
602	NC_013198	TTA	2	6	38109	38114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507033
603	NC_013198	ATTT	2	8	38137	38144	25 %	75 %	0 %	0 %	258507033
604	NC_013198	GCGA	2	8	38163	38170	25 %	0 %	50 %	25 %	258507033
605	NC_013198	A	6	6	38174	38179	100 %	0 %	0 %	0 %	258507033
606	NC_013198	GGA	2	6	38203	38208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507033
607	NC_013198	TTG	2	6	38235	38240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507033
608	NC_013198	TTAT	2	8	38244	38251	25 %	75 %	0 %	0 %	258507033
609	NC_013198	TTG	2	6	38286	38291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507033
610	NC_013198	AAT	2	6	38324	38329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507033
611	NC_013198	AAGAT	2	10	38627	38636	60 %	20 %	20 %	0 %	258507034
612	NC_013198	GGC	2	6	38691	38696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507034
613	NC_013198	A	7	7	38764	38770	100 %	0 %	0 %	0 %	258507034
614	NC_013198	TTCA	2	8	38813	38820	25 %	50 %	0 %	25 %	258507034
615	NC_013198	TGG	2	6	38826	38831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507034
616	NC_013198	TGG	2	6	38882	38887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507034
617	NC_013198	ATA	2	6	38996	39001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507034
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619	NC_013198	ATA	2	6	39074	39079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507034
620	NC_013198	TGT	2	6	39126	39131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507034
621	NC_013198	GAA	2	6	39172	39177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507034
622	NC_013198	GTC	2	6	39296	39301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507035
623	NC_013198	TAA	2	6	39341	39346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507035
624	NC_013198	AGA	2	6	39394	39399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507035
625	NC_013198	AGC	2	6	39446	39451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507035
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627	NC_013198	AAT	2	6	39514	39519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507035
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635	NC_013198	TGA	2	6	40390	40395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507036
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658	NC_013198	ATT	2	6	41970	41975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507037
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1000	NC_013198	GGCGT	2	10	66301	66310	0 %	20 %	60 %	20 %	258507055

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