MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_013198	TTGC	2	8	447193	447200	0 %	50 %	25 %	25 %	258507439
7003	NC_013198	GTT	2	6	447223	447228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507439
7004	NC_013198	TAA	2	6	447378	447383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507439
7005	NC_013198	T	6	6	447402	447407	0 %	100 %	0 %	0 %	258507439
7006	NC_013198	GTC	3	9	447424	447432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507439
7007	NC_013198	AT	4	8	447517	447524	50 %	50 %	0 %	0 %	258507439
7008	NC_013198	CTG	2	6	447584	447589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507439
7009	NC_013198	ATC	2	6	447680	447685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507439
7010	NC_013198	T	7	7	447687	447693	0 %	100 %	0 %	0 %	258507439
7011	NC_013198	TTG	2	6	447796	447801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507439
7012	NC_013198	CTGG	2	8	447802	447809	0 %	25 %	50 %	25 %	258507439
7013	NC_013198	CAA	2	6	448014	448019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507439
7014	NC_013198	CGT	2	6	448080	448085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507439
7015	NC_013198	ATT	2	6	448138	448143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507439
7016	NC_013198	TAT	3	9	448203	448211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507439
7017	NC_013198	TTGA	2	8	448240	448247	25 %	50 %	25 %	0 %	258507439
7018	NC_013198	TGT	2	6	448256	448261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507439
7019	NC_013198	AACTG	2	10	448345	448354	40 %	20 %	20 %	20 %	258507439
7020	NC_013198	TCA	2	6	448383	448388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507439
7021	NC_013198	CAA	2	6	448617	448622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507440
7022	NC_013198	GCT	2	6	448662	448667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507440
7023	NC_013198	CTCGA	2	10	448755	448764	20 %	20 %	20 %	40 %	258507440
7024	NC_013198	TTC	2	6	448869	448874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507440
7025	NC_013198	CG	3	6	448906	448911	0 %	0 %	50 %	50 %	258507440
7026	NC_013198	GCT	2	6	449003	449008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507440
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7028	NC_013198	AAG	2	6	449034	449039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507440
7029	NC_013198	CGC	2	6	449046	449051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507440
7030	NC_013198	AAG	2	6	449088	449093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507440
7031	NC_013198	TGA	2	6	449192	449197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507440
7032	NC_013198	ATC	2	6	449241	449246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507440
7033	NC_013198	CGA	2	6	449303	449308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507440
7034	NC_013198	TTG	2	6	449377	449382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507440
7035	NC_013198	TTC	2	6	449463	449468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507440
7036	NC_013198	TAC	2	6	449577	449582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507440
7037	NC_013198	TGA	2	6	450284	450289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507441
7038	NC_013198	CTG	2	6	450647	450652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507441
7039	NC_013198	TGC	2	6	450688	450693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507441
7040	NC_013198	GCG	2	6	450770	450775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507441
7041	NC_013198	TCT	2	6	450785	450790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507441
7042	NC_013198	ATT	2	6	450927	450932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507442
7043	NC_013198	CAG	2	6	451006	451011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507442
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7045	NC_013198	AG	3	6	451286	451291	50 %	0 %	50 %	0 %	258507442
7046	NC_013198	A	6	6	451419	451424	100 %	0 %	0 %	0 %	258507442
7047	NC_013198	CAATC	2	10	451485	451494	40 %	20 %	0 %	40 %	258507442
7048	NC_013198	CCG	2	6	451500	451505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507442
7049	NC_013198	GAT	2	6	451533	451538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507443
7050	NC_013198	CG	3	6	451557	451562	0 %	0 %	50 %	50 %	258507443
7051	NC_013198	TGG	2	6	451613	451618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507443
7052	NC_013198	CAC	3	9	451633	451641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507443
7053	NC_013198	GAA	2	6	451653	451658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507443
7054	NC_013198	TAT	2	6	451689	451694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507443
7055	NC_013198	CGT	2	6	451705	451710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507443
7056	NC_013198	AGT	2	6	451712	451717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507443
7057	NC_013198	TAA	2	6	451776	451781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507443
7058	NC_013198	GT	3	6	451893	451898	0 %	50 %	50 %	0 %	258507444
7059	NC_013198	T	9	9	451910	451918	0 %	100 %	0 %	0 %	258507444
7060	NC_013198	TAA	2	6	451953	451958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507444
7061	NC_013198	GAC	2	6	451967	451972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507444
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7066	NC_013198	TTG	2	6	452180	452185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507444
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7078	NC_013198	TA	3	6	452873	452878	50 %	50 %	0 %	0 %	258507444
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7102	NC_013198	CT	3	6	454281	454286	0 %	50 %	0 %	50 %	258507445
7103	NC_013198	T	6	6	454351	454356	0 %	100 %	0 %	0 %	258507445
7104	NC_013198	AT	3	6	454386	454391	50 %	50 %	0 %	0 %	258507445
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7111	NC_013198	TTA	2	6	454620	454625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507445
7112	NC_013198	AT	4	8	454632	454639	50 %	50 %	0 %	0 %	258507445
7113	NC_013198	CTG	2	6	454697	454702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507445
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7120	NC_013198	GATTC	2	10	455089	455098	20 %	40 %	20 %	20 %	258507445
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7122	NC_013198	TAT	2	6	455129	455134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507445
7123	NC_013198	TCC	2	6	455145	455150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507445
7124	NC_013198	TGC	2	6	455204	455209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507445
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7127	NC_013198	ATC	2	6	455567	455572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507445
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7143	NC_013198	CTT	2	6	456971	456976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507446
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7231	NC_013198	CCA	2	6	462895	462900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507451
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7235	NC_013198	CTTGA	2	10	462956	462965	20 %	40 %	20 %	20 %	258507451
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7238	NC_013198	TGGC	2	8	463249	463256	0 %	25 %	50 %	25 %	258507451
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7487	NC_013198	GTT	2	6	481676	481681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507466
7488	NC_013198	TGG	2	6	481903	481908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507467
7489	NC_013198	TCG	2	6	481929	481934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507467
7490	NC_013198	CATTGG	2	12	481987	481998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258507467
7491	NC_013198	GCTTT	2	10	482106	482115	0 %	60 %	20 %	20 %	258507467
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7499	NC_013198	TGC	2	6	482605	482610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507467
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