MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012984	ATT	2	6	245627	245632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555401
4002	NC_012984	AAC	2	6	245649	245654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555401
4003	NC_012984	GGT	2	6	245731	245736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555402
4004	NC_012984	TAT	2	6	245771	245776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555402
4005	NC_012984	TAT	2	6	245806	245811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555402
4006	NC_012984	A	6	6	245895	245900	100 %	0 %	0 %	0 %	254555402
4007	NC_012984	CAA	2	6	245908	245913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555402
4008	NC_012984	A	6	6	246427	246432	100 %	0 %	0 %	0 %	254555403
4009	NC_012984	TAT	2	6	246668	246673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555403
4010	NC_012984	ATCG	2	8	246695	246702	25 %	25 %	25 %	25 %	254555403
4011	NC_012984	CAAG	2	8	246716	246723	50 %	0 %	25 %	25 %	254555403
4012	NC_012984	CGG	2	6	246724	246729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555403
4013	NC_012984	CGA	2	6	246784	246789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555403
4014	NC_012984	TGA	2	6	246815	246820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555403
4015	NC_012984	GTT	2	6	246864	246869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555403
4016	NC_012984	ATGGCG	2	12	247060	247071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254555404
4017	NC_012984	T	6	6	247149	247154	0 %	100 %	0 %	0 %	254555404
4018	NC_012984	CAC	2	6	247159	247164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555404
4019	NC_012984	TAC	2	6	247194	247199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555404
4020	NC_012984	GAA	2	6	247236	247241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555404
4021	NC_012984	TGA	2	6	247343	247348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555404
4022	NC_012984	TCC	2	6	247376	247381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254555404
4023	NC_012984	TGG	2	6	247424	247429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555404
4024	NC_012984	GCC	2	6	247536	247541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555404
4025	NC_012984	GGC	2	6	247555	247560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555404
4026	NC_012984	TCA	2	6	247591	247596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555404
4027	NC_012984	TGG	2	6	247621	247626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555404
4028	NC_012984	GTT	2	6	247674	247679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555404
4029	NC_012984	ATT	2	6	247684	247689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555404
4030	NC_012984	CAA	2	6	247756	247761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555404
4031	NC_012984	CAT	2	6	247827	247832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555404
4032	NC_012984	ATT	2	6	247901	247906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555404
4033	NC_012984	TGG	3	9	247934	247942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555404
4034	NC_012984	AAT	2	6	247962	247967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555404
4035	NC_012984	TCA	2	6	248189	248194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555404
4036	NC_012984	GC	3	6	248223	248228	0 %	0 %	50 %	50 %	254555404
4037	NC_012984	GAT	2	6	248256	248261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555404
4038	NC_012984	ACT	2	6	248280	248285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555404
4039	NC_012984	CGA	2	6	248317	248322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555404
4040	NC_012984	TAT	2	6	248364	248369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555404
4041	NC_012984	TCG	2	6	248404	248409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555404
4042	NC_012984	TGG	2	6	248414	248419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555404
4043	NC_012984	GAT	2	6	248439	248444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555404
4044	NC_012984	CAA	2	6	248478	248483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555404
4045	NC_012984	TTA	2	6	248487	248492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555404
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4047	NC_012984	GTCA	2	8	248512	248519	25 %	25 %	25 %	25 %	254555404
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4050	NC_012984	ATG	2	6	248755	248760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555405
4051	NC_012984	GTT	2	6	248797	248802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555405
4052	NC_012984	CAGT	2	8	248807	248814	25 %	25 %	25 %	25 %	254555405
4053	NC_012984	GGTCA	2	10	248815	248824	20 %	20 %	40 %	20 %	254555405
4054	NC_012984	TGG	2	6	248828	248833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555405
4055	NC_012984	TGA	2	6	248868	248873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555405
4056	NC_012984	GAT	2	6	248956	248961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555405
4057	NC_012984	CCA	2	6	248984	248989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555405
4058	NC_012984	GCT	2	6	248998	249003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555405
4059	NC_012984	CGT	2	6	249078	249083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555405
4060	NC_012984	GTGAC	2	10	249104	249113	20 %	20 %	40 %	20 %	254555405
4061	NC_012984	TGG	2	6	249219	249224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555405
4062	NC_012984	TAG	2	6	249237	249242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555405
4063	NC_012984	ATG	2	6	249299	249304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555405
4064	NC_012984	CGT	2	6	249306	249311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555405
4065	NC_012984	GCGG	2	8	249346	249353	0 %	0 %	75 %	25 %	254555405
4066	NC_012984	CTG	2	6	249377	249382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555405
4067	NC_012984	ATG	2	6	249395	249400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555405
4068	NC_012984	ATC	2	6	249403	249408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555405
4069	NC_012984	GCA	2	6	249472	249477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555405
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4071	NC_012984	TAATT	2	10	249525	249534	40 %	60 %	0 %	0 %	254555405
4072	NC_012984	ATT	2	6	249570	249575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555405
4073	NC_012984	AGC	2	6	249576	249581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555405
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4076	NC_012984	ACGT	2	8	249649	249656	25 %	25 %	25 %	25 %	254555405
4077	NC_012984	ATT	2	6	249658	249663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555405
4078	NC_012984	TCG	2	6	249704	249709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555405
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4084	NC_012984	ATT	2	6	249987	249992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555405
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4092	NC_012984	CTTG	2	8	250306	250313	0 %	50 %	25 %	25 %	254555405
4093	NC_012984	GGC	2	6	250410	250415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555405
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4106	NC_012984	ACG	2	6	251410	251415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555406
4107	NC_012984	GGGC	2	8	251454	251461	0 %	0 %	75 %	25 %	254555406
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4109	NC_012984	CGGA	2	8	251666	251673	25 %	0 %	50 %	25 %	254555406
4110	NC_012984	ACC	2	6	251682	251687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555406
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4114	NC_012984	TATC	2	8	251994	252001	25 %	50 %	0 %	25 %	254555406
4115	NC_012984	GAT	2	6	252099	252104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555406
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4118	NC_012984	TGG	2	6	252321	252326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555406
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4120	NC_012984	CGA	2	6	252395	252400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555406
4121	NC_012984	GTG	2	6	252452	252457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555406
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4125	NC_012984	TAA	2	6	252837	252842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555406
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4129	NC_012984	TGG	2	6	253060	253065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555407
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4242	NC_012984	T	6	6	260448	260453	0 %	100 %	0 %	0 %	254555416
4243	NC_012984	AAAT	2	8	260466	260473	75 %	25 %	0 %	0 %	254555416
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4354	NC_012984	ACG	2	6	267692	267697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555424
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4360	NC_012984	CCGC	2	8	268282	268289	0 %	0 %	25 %	75 %	254555425
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4484	NC_012984	TAC	2	6	275428	275433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555430
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