MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_012984	ATT	2	6	213999	214004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555369
3503	NC_012984	GAC	2	6	214014	214019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555369
3504	NC_012984	GCA	2	6	214095	214100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555369
3505	NC_012984	TCA	2	6	214140	214145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555369
3506	NC_012984	AGC	2	6	214158	214163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555369
3507	NC_012984	GAAC	2	8	214276	214283	50 %	0 %	25 %	25 %	254555369
3508	NC_012984	GTT	2	6	214440	214445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555369
3509	NC_012984	CGG	2	6	214571	214576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555369
3510	NC_012984	CAGT	2	8	214624	214631	25 %	25 %	25 %	25 %	254555369
3511	NC_012984	AGTC	2	8	214650	214657	25 %	25 %	25 %	25 %	254555369
3512	NC_012984	GTG	3	9	214742	214750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555369
3513	NC_012984	AACC	2	8	214814	214821	50 %	0 %	0 %	50 %	254555369
3514	NC_012984	ATT	2	6	214823	214828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555369
3515	NC_012984	TTAC	2	8	214860	214867	25 %	50 %	0 %	25 %	254555369
3516	NC_012984	ATG	2	6	214901	214906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555369
3517	NC_012984	GTT	2	6	214978	214983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555369
3518	NC_012984	TCT	2	6	215059	215064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555369
3519	NC_012984	GCT	2	6	215068	215073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555369
3520	NC_012984	CAA	2	6	215089	215094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555369
3521	NC_012984	CGC	2	6	215280	215285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555370
3522	NC_012984	TCCAA	2	10	215298	215307	40 %	20 %	0 %	40 %	254555370
3523	NC_012984	AGTG	2	8	215331	215338	25 %	25 %	50 %	0 %	254555370
3524	NC_012984	AGGAC	2	10	215445	215454	40 %	0 %	40 %	20 %	254555370
3525	NC_012984	CAG	2	6	215472	215477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555370
3526	NC_012984	AAAC	2	8	215631	215638	75 %	0 %	0 %	25 %	254555370
3527	NC_012984	ACC	2	6	215748	215753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555370
3528	NC_012984	AAT	2	6	215803	215808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555370
3529	NC_012984	TGAA	2	8	215838	215845	50 %	25 %	25 %	0 %	254555370
3530	NC_012984	ATG	2	6	215858	215863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555370
3531	NC_012984	AGT	2	6	215864	215869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555370
3532	NC_012984	AAT	3	9	215870	215878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555370
3533	NC_012984	CAC	2	6	215901	215906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555371
3534	NC_012984	TCAA	2	8	215944	215951	50 %	25 %	0 %	25 %	254555371
3535	NC_012984	TAA	3	9	215978	215986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555371
3536	NC_012984	GGT	2	6	216012	216017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555371
3537	NC_012984	TAA	2	6	216021	216026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555371
3538	NC_012984	CTCA	2	8	216141	216148	25 %	25 %	0 %	50 %	254555371
3539	NC_012984	TCA	2	6	216166	216171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555371
3540	NC_012984	AGTTG	2	10	216182	216191	20 %	40 %	40 %	0 %	254555371
3541	NC_012984	AGT	2	6	216224	216229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555371
3542	NC_012984	TTC	2	6	216261	216266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555371
3543	NC_012984	GCGTTT	2	12	216333	216344	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	254555371
3544	NC_012984	GACG	2	8	216398	216405	25 %	0 %	50 %	25 %	254555371
3545	NC_012984	TTGTG	2	10	216460	216469	0 %	60 %	40 %	0 %	254555371
3546	NC_012984	CCTG	2	8	216511	216518	0 %	25 %	25 %	50 %	254555371
3547	NC_012984	GCT	2	6	216587	216592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555371
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3549	NC_012984	GAC	2	6	216663	216668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555371
3550	NC_012984	CGA	2	6	216674	216679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555371
3551	NC_012984	GAT	2	6	216714	216719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555371
3552	NC_012984	TAG	2	6	216807	216812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555371
3553	NC_012984	CAA	2	6	216914	216919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555371
3554	NC_012984	TAAG	2	8	216932	216939	50 %	25 %	25 %	0 %	254555371
3555	NC_012984	CTG	2	6	217020	217025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555371
3556	NC_012984	CAT	2	6	217041	217046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555371
3557	NC_012984	GC	3	6	217060	217065	0 %	0 %	50 %	50 %	254555371
3558	NC_012984	TAG	2	6	217079	217084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555371
3559	NC_012984	TGAC	2	8	217089	217096	25 %	25 %	25 %	25 %	254555371
3560	NC_012984	GTA	2	6	217133	217138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555371
3561	NC_012984	ATT	2	6	217275	217280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555371
3562	NC_012984	AAAC	2	8	217399	217406	75 %	0 %	0 %	25 %	254555372
3563	NC_012984	AGT	2	6	217502	217507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555372
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3565	NC_012984	TGC	2	6	217652	217657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555372
3566	NC_012984	GAG	2	6	217658	217663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555372
3567	NC_012984	AGT	3	9	217737	217745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555372
3568	NC_012984	ATA	2	6	217860	217865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555372
3569	NC_012984	GTG	2	6	218278	218283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555373
3570	NC_012984	ACTTG	2	10	218288	218297	20 %	40 %	20 %	20 %	254555373
3571	NC_012984	AGA	2	6	218375	218380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555373
3572	NC_012984	CAG	2	6	218397	218402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555373
3573	NC_012984	CAAT	2	8	218432	218439	50 %	25 %	0 %	25 %	254555373
3574	NC_012984	TCA	2	6	218441	218446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555373
3575	NC_012984	TGA	2	6	218537	218542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555373
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3577	NC_012984	GGC	2	6	218573	218578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555373
3578	NC_012984	CGGC	2	8	218664	218671	0 %	0 %	50 %	50 %	254555373
3579	NC_012984	AGC	2	6	218681	218686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555373
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3581	NC_012984	TACGT	2	10	218785	218794	20 %	40 %	20 %	20 %	254555374
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3587	NC_012984	TGAT	2	8	219138	219145	25 %	50 %	25 %	0 %	254555374
3588	NC_012984	TTCG	2	8	219165	219172	0 %	50 %	25 %	25 %	254555374
3589	NC_012984	TGC	2	6	219382	219387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555374
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3592	NC_012984	AAT	2	6	219569	219574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555374
3593	NC_012984	CAG	2	6	219582	219587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555374
3594	NC_012984	CG	3	6	220111	220116	0 %	0 %	50 %	50 %	254555375
3595	NC_012984	AGCG	2	8	220192	220199	25 %	0 %	50 %	25 %	254555375
3596	NC_012984	T	6	6	220227	220232	0 %	100 %	0 %	0 %	254555375
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3603	NC_012984	GCCGCA	2	12	220463	220474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254555375
3604	NC_012984	GTT	2	6	220500	220505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555375
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3606	NC_012984	TCT	2	6	220851	220856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555376
3607	NC_012984	ATC	2	6	220905	220910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555376
3608	NC_012984	CGTA	2	8	220933	220940	25 %	25 %	25 %	25 %	254555376
3609	NC_012984	T	7	7	220959	220965	0 %	100 %	0 %	0 %	254555376
3610	NC_012984	AAAAT	2	10	220978	220987	80 %	20 %	0 %	0 %	254555376
3611	NC_012984	AAC	2	6	221013	221018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555376
3612	NC_012984	TCAA	2	8	221187	221194	50 %	25 %	0 %	25 %	254555377
3613	NC_012984	GTA	2	6	221685	221690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555378
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3617	NC_012984	ACG	2	6	222099	222104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555378
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3619	NC_012984	ATG	2	6	222166	222171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555378
3620	NC_012984	AAGC	2	8	222177	222184	50 %	0 %	25 %	25 %	254555378
3621	NC_012984	CAT	2	6	222206	222211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555378
3622	NC_012984	AGCA	2	8	222216	222223	50 %	0 %	25 %	25 %	254555378
3623	NC_012984	GCT	2	6	222357	222362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555378
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3625	NC_012984	TTAATT	2	12	222383	222394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555378
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3628	NC_012984	CATA	2	8	222518	222525	50 %	25 %	0 %	25 %	254555379
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3641	NC_012984	AGCT	2	8	223187	223194	25 %	25 %	25 %	25 %	254555379
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3732	NC_012984	GTG	2	6	228393	228398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555383
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3742	NC_012984	TGG	2	6	228991	228996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555383
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3987	NC_012984	TCG	2	6	244785	244790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555400
3988	NC_012984	GTT	2	6	244808	244813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555400
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