MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_012984	GCA	2	6	1312306	1312311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556380
21502	NC_012984	CCT	2	6	1312362	1312367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254556381
21503	NC_012984	T	6	6	1312426	1312431	0 %	100 %	0 %	0 %	254556381
21504	NC_012984	ATC	2	6	1312448	1312453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556381
21505	NC_012984	ATC	2	6	1312459	1312464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556381
21506	NC_012984	ATT	2	6	1312531	1312536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556381
21507	NC_012984	GTC	2	6	1312726	1312731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556381
21508	NC_012984	ATT	2	6	1312766	1312771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556381
21509	NC_012984	ACA	2	6	1313032	1313037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556382
21510	NC_012984	TGG	2	6	1313044	1313049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556382
21511	NC_012984	TTG	2	6	1313168	1313173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556382
21512	NC_012984	ATTGG	2	10	1313395	1313404	20 %	40 %	40 %	0 %	254556382
21513	NC_012984	TTGT	2	8	1313448	1313455	0 %	75 %	25 %	0 %	254556382
21514	NC_012984	TCA	2	6	1313460	1313465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556382
21515	NC_012984	GTT	2	6	1313476	1313481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556382
21516	NC_012984	ATT	2	6	1313483	1313488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556382
21517	NC_012984	TTG	2	6	1313531	1313536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556382
21518	NC_012984	ATTG	2	8	1313539	1313546	25 %	50 %	25 %	0 %	254556382
21519	NC_012984	TAT	2	6	1313628	1313633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556382
21520	NC_012984	TGA	2	6	1313746	1313751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556382
21521	NC_012984	CATTG	2	10	1313834	1313843	20 %	40 %	20 %	20 %	254556383
21522	NC_012984	T	6	6	1313847	1313852	0 %	100 %	0 %	0 %	254556383
21523	NC_012984	CGG	2	6	1313855	1313860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556383
21524	NC_012984	GGCT	2	8	1313866	1313873	0 %	25 %	50 %	25 %	254556383
21525	NC_012984	CAG	2	6	1313904	1313909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556383
21526	NC_012984	TTA	2	6	1313937	1313942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556383
21527	NC_012984	GGGC	2	8	1313944	1313951	0 %	0 %	75 %	25 %	254556383
21528	NC_012984	GTCA	2	8	1313958	1313965	25 %	25 %	25 %	25 %	254556383
21529	NC_012984	ATT	2	6	1313975	1313980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556383
21530	NC_012984	TGG	2	6	1314060	1314065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556383
21531	NC_012984	TTG	2	6	1314091	1314096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556383
21532	NC_012984	TCA	2	6	1314160	1314165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556383
21533	NC_012984	GGT	2	6	1314241	1314246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556383
21534	NC_012984	ACT	2	6	1314293	1314298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556383
21535	NC_012984	GAC	2	6	1314399	1314404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556383
21536	NC_012984	ATTT	2	8	1314451	1314458	25 %	75 %	0 %	0 %	254556383
21537	NC_012984	CGT	2	6	1314492	1314497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556383
21538	NC_012984	TAC	2	6	1314514	1314519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556383
21539	NC_012984	GGT	2	6	1314520	1314525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556383
21540	NC_012984	CAG	2	6	1314537	1314542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556383
21541	NC_012984	TA	3	6	1314559	1314564	50 %	50 %	0 %	0 %	254556383
21542	NC_012984	GGTGC	2	10	1314624	1314633	0 %	20 %	60 %	20 %	254556383
21543	NC_012984	GGTT	2	8	1314654	1314661	0 %	50 %	50 %	0 %	254556383
21544	NC_012984	TTAT	2	8	1314681	1314688	25 %	75 %	0 %	0 %	254556383
21545	NC_012984	TTG	2	6	1314708	1314713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556383
21546	NC_012984	ATA	2	6	1314733	1314738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254556383
21547	NC_012984	TCA	2	6	1314889	1314894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556383
21548	NC_012984	ATCT	2	8	1314909	1314916	25 %	50 %	0 %	25 %	254556383
21549	NC_012984	TGA	2	6	1315086	1315091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556384
21550	NC_012984	A	8	8	1315144	1315151	100 %	0 %	0 %	0 %	254556384
21551	NC_012984	GCG	2	6	1315195	1315200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556384
21552	NC_012984	GAA	2	6	1315210	1315215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254556384
21553	NC_012984	CAA	2	6	1315306	1315311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556384
21554	NC_012984	GGT	2	6	1315390	1315395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556384
21555	NC_012984	GAT	2	6	1315447	1315452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556384
21556	NC_012984	TGAA	2	8	1315484	1315491	50 %	25 %	25 %	0 %	254556384
21557	NC_012984	CAA	2	6	1315582	1315587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556384
21558	NC_012984	CG	3	6	1315611	1315616	0 %	0 %	50 %	50 %	254556384
21559	NC_012984	CTA	2	6	1315648	1315653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556384
21560	NC_012984	GAC	2	6	1315713	1315718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556384
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21564	NC_012984	GCC	2	6	1315982	1315987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556385
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21567	NC_012984	ATT	2	6	1316171	1316176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556385
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21569	NC_012984	GCG	2	6	1316540	1316545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556385
21570	NC_012984	ATT	2	6	1316561	1316566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556385
21571	NC_012984	TTA	2	6	1316721	1316726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556386
21572	NC_012984	TAC	2	6	1316747	1316752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556386
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21574	NC_012984	TAG	2	6	1316821	1316826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556386
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21576	NC_012984	CTTC	2	8	1316897	1316904	0 %	50 %	0 %	50 %	254556386
21577	NC_012984	CG	3	6	1316910	1316915	0 %	0 %	50 %	50 %	254556386
21578	NC_012984	GCG	2	6	1316949	1316954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556386
21579	NC_012984	GCC	2	6	1316970	1316975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556386
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21581	NC_012984	ATG	2	6	1317046	1317051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556386
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21583	NC_012984	AAT	2	6	1317444	1317449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254556387
21584	NC_012984	TTA	2	6	1317450	1317455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556387
21585	NC_012984	GTT	3	9	1317639	1317647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556387
21586	NC_012984	ATG	2	6	1317663	1317668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556387
21587	NC_012984	ATT	2	6	1317681	1317686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556387
21588	NC_012984	AATTAC	2	12	1317742	1317753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254556387
21589	NC_012984	CCG	2	6	1317790	1317795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556387
21590	NC_012984	ATG	2	6	1317900	1317905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556388
21591	NC_012984	AAT	2	6	1317950	1317955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254556388
21592	NC_012984	TCAA	2	8	1317967	1317974	50 %	25 %	0 %	25 %	254556388
21593	NC_012984	CTG	2	6	1318008	1318013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556388
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21595	NC_012984	GCCA	2	8	1318039	1318046	25 %	0 %	25 %	50 %	254556388
21596	NC_012984	ACT	2	6	1318082	1318087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556388
21597	NC_012984	TGC	2	6	1318099	1318104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556388
21598	NC_012984	CCAGC	2	10	1318163	1318172	20 %	0 %	20 %	60 %	254556388
21599	NC_012984	GCG	2	6	1318178	1318183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556388
21600	NC_012984	ATT	2	6	1318224	1318229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556388
21601	NC_012984	CTT	2	6	1318267	1318272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556388
21602	NC_012984	GCA	2	6	1318286	1318291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556388
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21604	NC_012984	GGAC	2	8	1318341	1318348	25 %	0 %	50 %	25 %	254556388
21605	NC_012984	CGGAA	2	10	1318395	1318404	40 %	0 %	40 %	20 %	254556388
21606	NC_012984	GCA	2	6	1318445	1318450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556388
21607	NC_012984	GCT	2	6	1318460	1318465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556388
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21611	NC_012984	CGG	2	6	1318680	1318685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556388
21612	NC_012984	CCG	2	6	1318686	1318691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556388
21613	NC_012984	CTG	2	6	1318767	1318772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556388
21614	NC_012984	GCT	2	6	1318787	1318792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556388
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21616	NC_012984	CAA	2	6	1318926	1318931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556388
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21717	NC_012984	TTG	2	6	1325196	1325201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556392
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