MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_012984	CAT	2	6	1162689	1162694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556254
19002	NC_012984	CGA	2	6	1162791	1162796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556254
19003	NC_012984	TGAAA	2	10	1162849	1162858	60 %	20 %	20 %	0 %	254556254
19004	NC_012984	TGC	2	6	1162989	1162994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556254
19005	NC_012984	CCAA	2	8	1163006	1163013	50 %	0 %	0 %	50 %	254556254
19006	NC_012984	T	6	6	1163031	1163036	0 %	100 %	0 %	0 %	254556254
19007	NC_012984	AAT	2	6	1163046	1163051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254556254
19008	NC_012984	ATT	2	6	1163229	1163234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556255
19009	NC_012984	ATT	3	9	1163254	1163262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556255
19010	NC_012984	TCG	2	6	1163320	1163325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556255
19011	NC_012984	T	7	7	1163329	1163335	0 %	100 %	0 %	0 %	254556255
19012	NC_012984	G	6	6	1163368	1163373	0 %	0 %	100 %	0 %	254556255
19013	NC_012984	ACC	2	6	1163477	1163482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254556255
19014	NC_012984	CGT	2	6	1163570	1163575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556255
19015	NC_012984	CGC	2	6	1163595	1163600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254556255
19016	NC_012984	TCT	2	6	1163610	1163615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556255
19017	NC_012984	GCA	2	6	1163705	1163710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556255
19018	NC_012984	ATTA	2	8	1163921	1163928	50 %	50 %	0 %	0 %	254556256
19019	NC_012984	T	6	6	1163934	1163939	0 %	100 %	0 %	0 %	254556256
19020	NC_012984	GAT	2	6	1164075	1164080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556256
19021	NC_012984	GCA	2	6	1164083	1164088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556256
19022	NC_012984	T	6	6	1164102	1164107	0 %	100 %	0 %	0 %	254556256
19023	NC_012984	AAT	2	6	1164110	1164115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254556256
19024	NC_012984	GAAT	2	8	1164146	1164153	50 %	25 %	25 %	0 %	254556256
19025	NC_012984	ACG	2	6	1164170	1164175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556256
19026	NC_012984	CGACAG	2	12	1164240	1164251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556256
19027	NC_012984	CGTTG	2	10	1164259	1164268	0 %	40 %	40 %	20 %	254556256
19028	NC_012984	TCG	2	6	1164269	1164274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556256
19029	NC_012984	ATG	2	6	1164302	1164307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556256
19030	NC_012984	TTTG	2	8	1164318	1164325	0 %	75 %	25 %	0 %	254556256
19031	NC_012984	GAT	2	6	1164400	1164405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556256
19032	NC_012984	ATC	2	6	1164415	1164420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556256
19033	NC_012984	T	6	6	1164430	1164435	0 %	100 %	0 %	0 %	254556256
19034	NC_012984	GC	3	6	1164586	1164591	0 %	0 %	50 %	50 %	254556257
19035	NC_012984	CATGT	2	10	1164601	1164610	20 %	40 %	20 %	20 %	254556257
19036	NC_012984	TAT	2	6	1164615	1164620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556257
19037	NC_012984	AGC	2	6	1164622	1164627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556257
19038	NC_012984	TCA	2	6	1164776	1164781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556257
19039	NC_012984	AGT	2	6	1164795	1164800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556257
19040	NC_012984	ATG	2	6	1164893	1164898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556257
19041	NC_012984	CGGT	2	8	1165002	1165009	0 %	25 %	50 %	25 %	254556257
19042	NC_012984	TGA	2	6	1165050	1165055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556257
19043	NC_012984	GT	3	6	1165087	1165092	0 %	50 %	50 %	0 %	254556257
19044	NC_012984	TTTG	2	8	1165140	1165147	0 %	75 %	25 %	0 %	254556257
19045	NC_012984	GTT	2	6	1165314	1165319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556257
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19050	NC_012984	CGG	2	6	1166114	1166119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556258
19051	NC_012984	ACA	2	6	1166166	1166171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556258
19052	NC_012984	AAC	2	6	1166208	1166213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556258
19053	NC_012984	TCC	2	6	1166219	1166224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254556258
19054	NC_012984	ACG	2	6	1166245	1166250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556258
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19057	NC_012984	TCAA	2	8	1166327	1166334	50 %	25 %	0 %	25 %	254556258
19058	NC_012984	T	6	6	1166407	1166412	0 %	100 %	0 %	0 %	254556258
19059	NC_012984	AT	3	6	1166442	1166447	50 %	50 %	0 %	0 %	254556258
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19061	NC_012984	CGA	2	6	1166516	1166521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556258
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19064	NC_012984	AAT	2	6	1166766	1166771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254556259
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19067	NC_012984	TTG	2	6	1166890	1166895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556259
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19073	NC_012984	CTAA	2	8	1167247	1167254	50 %	25 %	0 %	25 %	254556259
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19101	NC_012984	T	7	7	1168541	1168547	0 %	100 %	0 %	0 %	254556260
19102	NC_012984	TTTGGT	2	12	1168573	1168584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556260
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19104	NC_012984	GGC	2	6	1168620	1168625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556260
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19112	NC_012984	TTAT	2	8	1168864	1168871	25 %	75 %	0 %	0 %	254556261
19113	NC_012984	TGG	2	6	1168882	1168887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556261
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19117	NC_012984	GGC	3	9	1169176	1169184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556261
19118	NC_012984	TGG	3	9	1169257	1169265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556261
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19225	NC_012984	GC	3	6	1176312	1176317	0 %	0 %	50 %	50 %	254556266
19226	NC_012984	TCG	2	6	1176359	1176364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556266
19227	NC_012984	GTT	2	6	1176398	1176403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556266
19228	NC_012984	TGGGCA	2	12	1176404	1176415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254556266
19229	NC_012984	AAATGC	2	12	1176424	1176435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254556266
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19231	NC_012984	AGA	2	6	1176503	1176508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254556266
19232	NC_012984	ATG	2	6	1176673	1176678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556266
19233	NC_012984	TGA	2	6	1176680	1176685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556266
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19344	NC_012984	GCT	2	6	1183603	1183608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556271
19345	NC_012984	ATT	2	6	1183610	1183615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556271
19346	NC_012984	GCT	2	6	1183702	1183707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556271
19347	NC_012984	TTC	2	6	1183728	1183733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556271
19348	NC_012984	AGC	2	6	1183821	1183826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556271
19349	NC_012984	TGC	2	6	1183833	1183838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556271
19350	NC_012984	CAA	2	6	1183879	1183884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556271
19351	NC_012984	TGC	2	6	1183929	1183934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556271
19352	NC_012984	GCG	2	6	1183942	1183947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254556271
19353	NC_012984	TTA	2	6	1183986	1183991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556271
19354	NC_012984	GCT	2	6	1184008	1184013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556271
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19358	NC_012984	CAG	3	9	1184273	1184281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556271
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19365	NC_012984	TGG	2	6	1184481	1184486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556271
19366	NC_012984	ATC	2	6	1184538	1184543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254556271
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19369	NC_012984	TTA	2	6	1184734	1184739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556271
19370	NC_012984	TAG	2	6	1184793	1184798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556271
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19374	NC_012984	TGA	2	6	1184973	1184978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556271
19375	NC_012984	CAA	2	6	1185026	1185031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254556271
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19387	NC_012984	GCT	2	6	1185643	1185648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556271
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19389	NC_012984	AAAG	2	8	1185702	1185709	75 %	0 %	25 %	0 %	254556271
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19401	NC_012984	TCGGAT	2	12	1186549	1186560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254556271
19402	NC_012984	TCCGAC	2	12	1186567	1186578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254556271
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19406	NC_012984	TCGGAC	2	12	1186723	1186734	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254556271
19407	NC_012984	CGATTC	2	12	1186737	1186748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254556271
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19427	NC_012984	TGA	2	6	1187658	1187663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556271
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19430	NC_012984	GCT	2	6	1187764	1187769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556271
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19434	NC_012984	GAT	3	9	1187812	1187820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556271
19435	NC_012984	GAT	2	6	1187824	1187829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556271
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19440	NC_012984	TCAA	2	8	1188195	1188202	50 %	25 %	0 %	25 %	254556272
19441	NC_012984	ATCT	2	8	1188521	1188528	25 %	50 %	0 %	25 %	254556272
19442	NC_012984	GTG	2	6	1188559	1188564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556272
19443	NC_012984	TAAT	2	8	1188617	1188624	50 %	50 %	0 %	0 %	254556272
19444	NC_012984	TGT	2	6	1188696	1188701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254556272
19445	NC_012984	CCATT	2	10	1188737	1188746	20 %	40 %	0 %	40 %	254556272
19446	NC_012984	AGTTA	2	10	1188774	1188783	40 %	40 %	20 %	0 %	254556272
19447	NC_012984	A	6	6	1188801	1188806	100 %	0 %	0 %	0 %	254556272
19448	NC_012984	TCG	2	6	1188836	1188841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254556272
19449	NC_012984	TTA	2	6	1188877	1188882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556272
19450	NC_012984	GAT	2	6	1188919	1188924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254556272
19451	NC_012984	TTC	2	6	1188967	1188972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254556272
19452	NC_012984	AGC	2	6	1189026	1189031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254556272
19453	NC_012984	TAT	2	6	1189045	1189050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254556272
19454	NC_012984	TGG	2	6	1189142	1189147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254556272
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19456	NC_012984	AGTT	2	8	1189313	1189320	25 %	50 %	25 %	0 %	254556272
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