MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51229	NC_012984	CTT	2	6	3156149	3156154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254558081
51230	NC_012984	CGC	2	6	3156249	3156254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558081
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51232	NC_012984	CTG	2	6	3156345	3156350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254558081
51233	NC_012984	ATC	2	6	3156540	3156545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254558081
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51239	NC_012984	GTA	2	6	3157088	3157093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254558082
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51252	NC_012984	CAAC	2	8	3157940	3157947	50 %	0 %	0 %	50 %	254558082
51253	NC_012984	CAA	2	6	3157967	3157972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254558082
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51335	NC_012984	ACT	2	6	3162106	3162111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254558085
51336	NC_012984	CA	3	6	3162334	3162339	50 %	0 %	0 %	50 %	254558085
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51341	NC_012984	TC	3	6	3162490	3162495	0 %	50 %	0 %	50 %	254558085
51342	NC_012984	AGC	2	6	3162513	3162518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254558085
51343	NC_012984	CG	3	6	3162524	3162529	0 %	0 %	50 %	50 %	254558085
51344	NC_012984	AGC	2	6	3162559	3162564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254558085
51345	NC_012984	TACTC	2	10	3162589	3162598	20 %	40 %	0 %	40 %	254558085
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51348	NC_012984	TTA	2	6	3162690	3162695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254558085
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51351	NC_012984	CTG	2	6	3163120	3163125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254558086
51352	NC_012984	CTG	2	6	3163165	3163170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254558086
51353	NC_012984	AAT	2	6	3163199	3163204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254558086
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51448	NC_012984	TCA	2	6	3167528	3167533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254558091
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51451	NC_012984	CTGC	2	8	3167790	3167797	0 %	25 %	25 %	50 %	254558091
51452	NC_012984	TTCACG	2	12	3167816	3167827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254558091
51453	NC_012984	ATT	2	6	3167920	3167925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254558091
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51455	NC_012984	CAA	2	6	3168009	3168014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254558091
51456	NC_012984	TTGA	2	8	3168043	3168050	25 %	50 %	25 %	0 %	254558091
51457	NC_012984	AAT	2	6	3168083	3168088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254558091
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51462	NC_012984	CCA	2	6	3168525	3168530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254558092
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51464	NC_012984	TAAG	2	8	3168665	3168672	50 %	25 %	25 %	0 %	254558092
51465	NC_012984	CGC	2	6	3168677	3168682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558092
51466	NC_012984	GAA	3	9	3168689	3168697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254558092
51467	NC_012984	GAT	2	6	3168704	3168709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254558092
51468	NC_012984	TCC	2	6	3168822	3168827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254558092
51469	NC_012984	CCA	2	6	3168828	3168833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254558092
51470	NC_012984	CGT	2	6	3169076	3169081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254558092
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51472	NC_012984	ACC	2	6	3169280	3169285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254558092
51473	NC_012984	CCAA	2	8	3169316	3169323	50 %	0 %	0 %	50 %	254558092
51474	NC_012984	GTA	2	6	3169353	3169358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254558092
51475	NC_012984	CTT	2	6	3169480	3169485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254558093
51476	NC_012984	TTC	2	6	3169489	3169494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254558093
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51480	NC_012984	TAA	2	6	3169767	3169772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254558093
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51484	NC_012984	AC	3	6	3169925	3169930	50 %	0 %	0 %	50 %	254558094
51485	NC_012984	TAC	2	6	3170039	3170044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254558094
51486	NC_012984	GTTTCC	2	12	3170140	3170151	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	254558094
51487	NC_012984	CTG	2	6	3170351	3170356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254558094
51488	NC_012984	CAC	2	6	3170375	3170380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254558094
51489	NC_012984	CAT	2	6	3170408	3170413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254558094
51490	NC_012984	GATT	2	8	3170440	3170447	25 %	50 %	25 %	0 %	254558094
51491	NC_012984	CAG	2	6	3170513	3170518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254558094
51492	NC_012984	ACC	3	9	3170595	3170603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254558094
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51494	NC_012984	TTTC	2	8	3170837	3170844	0 %	75 %	0 %	25 %	254558095
51495	NC_012984	AATT	2	8	3170845	3170852	50 %	50 %	0 %	0 %	254558095
51496	NC_012984	GTG	2	6	3170863	3170868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254558095
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51500	NC_012984	ATC	2	6	3171019	3171024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254558095

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