MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 58903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_011660	TTC	2	6	2231184	2231189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965526
44503	NC_011660	CTG	2	6	2231201	2231206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965526
44504	NC_011660	GCG	2	6	2231231	2231236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217965526
44505	NC_011660	CAAC	2	8	2231276	2231283	50 %	0 %	0 %	50 %	217965526
44506	NC_011660	GCT	2	6	2231354	2231359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965526
44507	NC_011660	TAA	2	6	2231381	2231386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217965526
44508	NC_011660	T	6	6	2231504	2231509	0 %	100 %	0 %	0 %	217965526
44509	NC_011660	CTCA	2	8	2231556	2231563	25 %	25 %	0 %	50 %	217965526
44510	NC_011660	CAA	2	6	2231585	2231590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217965526
44511	NC_011660	ACA	2	6	2231592	2231597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217965526
44512	NC_011660	CTC	2	6	2231613	2231618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217965526
44513	NC_011660	TTC	2	6	2231775	2231780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965527
44514	NC_011660	T	6	6	2231954	2231959	0 %	100 %	0 %	0 %	217965527
44515	NC_011660	ATT	2	6	2231985	2231990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965527
44516	NC_011660	AGAT	2	8	2232021	2232028	50 %	25 %	25 %	0 %	217965527
44517	NC_011660	CTT	2	6	2232044	2232049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965527
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44519	NC_011660	TTG	2	6	2232137	2232142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217965527
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44522	NC_011660	TTC	2	6	2232249	2232254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965527
44523	NC_011660	TTC	2	6	2232310	2232315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965527
44524	NC_011660	TCT	2	6	2232355	2232360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965527
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44540	NC_011660	TGA	2	6	2233157	2233162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965527
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44554	NC_011660	T	6	6	2233910	2233915	0 %	100 %	0 %	0 %	217965528
44555	NC_011660	ATA	2	6	2233923	2233928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217965528
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44618	NC_011660	AGT	2	6	2237216	2237221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965533
44619	NC_011660	T	6	6	2237307	2237312	0 %	100 %	0 %	0 %	217965533
44620	NC_011660	T	7	7	2237414	2237420	0 %	100 %	0 %	0 %	217965533
44621	NC_011660	CAA	2	6	2237425	2237430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217965533
44622	NC_011660	ATA	2	6	2237442	2237447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217965533
44623	NC_011660	TGTC	2	8	2237511	2237518	0 %	50 %	25 %	25 %	217965534
44624	NC_011660	A	7	7	2237540	2237546	100 %	0 %	0 %	0 %	217965534
44625	NC_011660	TGC	2	6	2237577	2237582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965534
44626	NC_011660	AC	3	6	2237664	2237669	50 %	0 %	0 %	50 %	217965534
44627	NC_011660	TAT	2	6	2237725	2237730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965534
44628	NC_011660	CCTA	2	8	2237732	2237739	25 %	25 %	0 %	50 %	217965534
44629	NC_011660	GAT	2	6	2237768	2237773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965534
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44632	NC_011660	A	6	6	2237847	2237852	100 %	0 %	0 %	0 %	217965534
44633	NC_011660	A	6	6	2237972	2237977	100 %	0 %	0 %	0 %	217965534
44634	NC_011660	AACCA	2	10	2238017	2238026	60 %	0 %	0 %	40 %	217965534
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44643	NC_011660	TTTATA	2	12	2238511	2238522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965535
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44646	NC_011660	TTTC	2	8	2238615	2238622	0 %	75 %	0 %	25 %	217965535
44647	NC_011660	ATA	2	6	2238698	2238703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217965535
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44649	NC_011660	CCG	2	6	2238818	2238823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217965536
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44653	NC_011660	T	6	6	2239028	2239033	0 %	100 %	0 %	0 %	217965536
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44657	NC_011660	AGAT	2	8	2239170	2239177	50 %	25 %	25 %	0 %	217965537
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44730	NC_011660	ATT	2	6	2242473	2242478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965539
44731	NC_011660	GAT	2	6	2242530	2242535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965539
44732	NC_011660	AAATC	2	10	2242581	2242590	60 %	20 %	0 %	20 %	217965539
44733	NC_011660	CTC	2	6	2242605	2242610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217965539
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44854	NC_011660	TCC	2	6	2248095	2248100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217965547
44855	NC_011660	TA	3	6	2248192	2248197	50 %	50 %	0 %	0 %	217965547
44856	NC_011660	ATC	2	6	2248205	2248210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217965548
44857	NC_011660	T	6	6	2248220	2248225	0 %	100 %	0 %	0 %	217965548
44858	NC_011660	CTG	2	6	2248281	2248286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965548
44859	NC_011660	AGTA	2	8	2248295	2248302	50 %	25 %	25 %	0 %	217965548
44860	NC_011660	ATAA	2	8	2248304	2248311	75 %	25 %	0 %	0 %	217965548
44861	NC_011660	GCA	2	6	2248394	2248399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217965548
44862	NC_011660	CAA	2	6	2248499	2248504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217965548
44863	NC_011660	T	6	6	2248518	2248523	0 %	100 %	0 %	0 %	217965548
44864	NC_011660	CTT	2	6	2248524	2248529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965548
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44866	NC_011660	GCC	2	6	2248592	2248597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217965548
44867	NC_011660	CTG	2	6	2248626	2248631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965548
44868	NC_011660	ATTG	2	8	2248666	2248673	25 %	50 %	25 %	0 %	217965548
44869	NC_011660	CTG	2	6	2248686	2248691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965548
44870	NC_011660	CAT	2	6	2248693	2248698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217965548
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44874	NC_011660	CAA	2	6	2248818	2248823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217965548
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44880	NC_011660	CCA	2	6	2249078	2249083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217965548
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44882	NC_011660	GTT	2	6	2249250	2249255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217965548
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44885	NC_011660	TTTC	2	8	2249371	2249378	0 %	75 %	0 %	25 %	217965548
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44893	NC_011660	CAAT	2	8	2249821	2249828	50 %	25 %	0 %	25 %	217965549
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44960	NC_011660	TGC	2	6	2252923	2252928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965552
44961	NC_011660	TAAT	2	8	2252941	2252948	50 %	50 %	0 %	0 %	217965552
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44963	NC_011660	ATG	2	6	2252964	2252969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965552
44964	NC_011660	T	7	7	2252986	2252992	0 %	100 %	0 %	0 %	217965552
44965	NC_011660	A	6	6	2253240	2253245	100 %	0 %	0 %	0 %	217965553
44966	NC_011660	A	6	6	2253277	2253282	100 %	0 %	0 %	0 %	217965553
44967	NC_011660	CTG	2	6	2253284	2253289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965553
44968	NC_011660	TGA	2	6	2253318	2253323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965553
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44970	NC_011660	A	6	6	2253367	2253372	100 %	0 %	0 %	0 %	217965553
44971	NC_011660	TAT	2	6	2253384	2253389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965553
44972	NC_011660	AGC	2	6	2253396	2253401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217965553
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