MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 58903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44004	NC_011660	GCA	2	6	2205998	2206003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217965498
44005	NC_011660	T	6	6	2206027	2206032	0 %	100 %	0 %	0 %	217965498
44006	NC_011660	CTG	3	9	2206068	2206076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965498
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44117	NC_011660	GTT	2	6	2211544	2211549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217965504
44118	NC_011660	TCCG	2	8	2211562	2211569	0 %	25 %	25 %	50 %	217965504
44119	NC_011660	GAAA	2	8	2211604	2211611	75 %	0 %	25 %	0 %	217965504
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44122	NC_011660	TTA	2	6	2211750	2211755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965505
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44234	NC_011660	TTGAG	2	10	2217775	2217784	20 %	40 %	40 %	0 %	217965509
44235	NC_011660	GTA	2	6	2217862	2217867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965509
44236	NC_011660	CAT	2	6	2217906	2217911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217965509
44237	NC_011660	GTTT	2	8	2217932	2217939	0 %	75 %	25 %	0 %	217965509
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44239	NC_011660	TCT	2	6	2218229	2218234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965509
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44241	NC_011660	TTG	2	6	2218329	2218334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217965509
44242	NC_011660	TAT	2	6	2218427	2218432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965510
44243	NC_011660	TCA	2	6	2218445	2218450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217965510
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44253	NC_011660	CTT	2	6	2218779	2218784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965510
44254	NC_011660	GTA	2	6	2218790	2218795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217965510
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44263	NC_011660	AACC	2	8	2219183	2219190	50 %	0 %	0 %	50 %	217965510
44264	NC_011660	GAA	2	6	2219194	2219199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217965510
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44347	NC_011660	TGT	2	6	2222955	2222960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217965516
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44350	NC_011660	GTT	2	6	2222995	2223000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217965516
44351	NC_011660	A	8	8	2223045	2223052	100 %	0 %	0 %	0 %	217965516
44352	NC_011660	TCTT	2	8	2223053	2223060	0 %	75 %	0 %	25 %	217965516
44353	NC_011660	TAT	2	6	2223069	2223074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965516
44354	NC_011660	CTT	2	6	2223283	2223288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965517
44355	NC_011660	T	6	6	2223314	2223319	0 %	100 %	0 %	0 %	217965517
44356	NC_011660	ATT	2	6	2223342	2223347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965517
44357	NC_011660	T	7	7	2223346	2223352	0 %	100 %	0 %	0 %	217965517
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44359	NC_011660	T	6	6	2223394	2223399	0 %	100 %	0 %	0 %	217965517
44360	NC_011660	GT	3	6	2223515	2223520	0 %	50 %	50 %	0 %	217965517
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44375	NC_011660	TTAA	2	8	2224465	2224472	50 %	50 %	0 %	0 %	217965518
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44380	NC_011660	T	6	6	2224820	2224825	0 %	100 %	0 %	0 %	217965519
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44465	NC_011660	TTA	2	6	2229628	2229633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217965524
44466	NC_011660	CTG	2	6	2229652	2229657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965524
44467	NC_011660	T	7	7	2229687	2229693	0 %	100 %	0 %	0 %	217965524
44468	NC_011660	TTC	2	6	2229770	2229775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965524
44469	NC_011660	ACCA	2	8	2229791	2229798	50 %	0 %	0 %	50 %	217965524
44470	NC_011660	AT	3	6	2229864	2229869	50 %	50 %	0 %	0 %	217965524
44471	NC_011660	GTT	2	6	2229903	2229908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217965524
44472	NC_011660	T	6	6	2229919	2229924	0 %	100 %	0 %	0 %	217965524
44473	NC_011660	TCC	2	6	2229939	2229944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217965525
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44480	NC_011660	CAT	2	6	2230286	2230291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217965525
44481	NC_011660	TCG	2	6	2230299	2230304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217965525
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44483	NC_011660	AAT	2	6	2230313	2230318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217965525
44484	NC_011660	AAT	2	6	2230345	2230350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217965525
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44486	NC_011660	CAT	2	6	2230417	2230422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217965525
44487	NC_011660	T	6	6	2230422	2230427	0 %	100 %	0 %	0 %	217965525
44488	NC_011660	AACT	2	8	2230435	2230442	50 %	25 %	0 %	25 %	217965525
44489	NC_011660	AGC	2	6	2230497	2230502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217965525
44490	NC_011660	TA	3	6	2230517	2230522	50 %	50 %	0 %	0 %	217965525
44491	NC_011660	TCT	2	6	2230536	2230541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965525
44492	NC_011660	GCCAA	2	10	2230620	2230629	40 %	0 %	20 %	40 %	217965525
44493	NC_011660	AT	3	6	2230686	2230691	50 %	50 %	0 %	0 %	217965525
44494	NC_011660	CAG	2	6	2230717	2230722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217965525
44495	NC_011660	ACC	2	6	2230790	2230795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217965525
44496	NC_011660	TTC	2	6	2230820	2230825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217965525
44497	NC_011660	CG	3	6	2230865	2230870	0 %	0 %	50 %	50 %	217965525
44498	NC_011660	TGTT	2	8	2230905	2230912	0 %	75 %	25 %	0 %	217965525
44499	NC_011660	TCA	2	6	2231107	2231112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217965526
44500	NC_011660	GATT	2	8	2231162	2231169	25 %	50 %	25 %	0 %	217965526

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