MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 58903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011660	CAA	2	6	25233	25238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963327
502	NC_011660	GAAA	2	8	25268	25275	75 %	0 %	25 %	0 %	217963327
503	NC_011660	CAAA	2	8	25331	25338	75 %	0 %	0 %	25 %	217963327
504	NC_011660	AGA	2	6	25361	25366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963327
505	NC_011660	A	6	6	25394	25399	100 %	0 %	0 %	0 %	217963327
506	NC_011660	AACA	2	8	25511	25518	75 %	0 %	0 %	25 %	217963327
507	NC_011660	CA	3	6	25530	25535	50 %	0 %	0 %	50 %	217963327
508	NC_011660	A	6	6	25603	25608	100 %	0 %	0 %	0 %	217963327
509	NC_011660	ACT	2	6	25619	25624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963327
510	NC_011660	CG	3	6	25686	25691	0 %	0 %	50 %	50 %	217963327
511	NC_011660	A	6	6	25699	25704	100 %	0 %	0 %	0 %	217963327
512	NC_011660	A	7	7	25762	25768	100 %	0 %	0 %	0 %	217963327
513	NC_011660	CAG	2	6	26008	26013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963328
514	NC_011660	AAG	2	6	26050	26055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963328
515	NC_011660	CAA	2	6	26140	26145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963328
516	NC_011660	TCG	2	6	26176	26181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963328
517	NC_011660	CCAAG	2	10	26204	26213	40 %	0 %	20 %	40 %	217963328
518	NC_011660	AGT	2	6	26238	26243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963328
519	NC_011660	T	6	6	26293	26298	0 %	100 %	0 %	0 %	217963329
520	NC_011660	CTT	2	6	26361	26366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963329
521	NC_011660	GGT	2	6	26386	26391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963329
522	NC_011660	TG	3	6	26823	26828	0 %	50 %	50 %	0 %	217963330
523	NC_011660	ATA	2	6	26840	26845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963330
524	NC_011660	GAT	2	6	26890	26895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963330
525	NC_011660	TCGG	2	8	26908	26915	0 %	25 %	50 %	25 %	217963330
526	NC_011660	A	6	6	26957	26962	100 %	0 %	0 %	0 %	217963330
527	NC_011660	TGT	2	6	27072	27077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963330
528	NC_011660	GAAA	2	8	27213	27220	75 %	0 %	25 %	0 %	217963330
529	NC_011660	AGA	2	6	27222	27227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963330
530	NC_011660	A	6	6	27268	27273	100 %	0 %	0 %	0 %	217963330
531	NC_011660	ATTT	2	8	27322	27329	25 %	75 %	0 %	0 %	217963330
532	NC_011660	AGCAA	2	10	27396	27405	60 %	0 %	20 %	20 %	217963330
533	NC_011660	TGA	2	6	27461	27466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963330
534	NC_011660	GAA	2	6	27559	27564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963330
535	NC_011660	CTA	2	6	27582	27587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963330
536	NC_011660	GAGAG	2	10	27626	27635	40 %	0 %	60 %	0 %	217963330
537	NC_011660	AGA	2	6	27668	27673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963331
538	NC_011660	AAT	2	6	27722	27727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963331
539	NC_011660	CCA	2	6	27773	27778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963331
540	NC_011660	GAC	2	6	27785	27790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963331
541	NC_011660	AAT	2	6	27863	27868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963331
542	NC_011660	GAA	2	6	27906	27911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963331
543	NC_011660	TGG	2	6	27916	27921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963331
544	NC_011660	TG	3	6	27925	27930	0 %	50 %	50 %	0 %	217963331
545	NC_011660	GAA	2	6	28068	28073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963331
546	NC_011660	TGC	2	6	28088	28093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963331
547	NC_011660	TAT	2	6	28094	28099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963331
548	NC_011660	ATT	2	6	28168	28173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963331
549	NC_011660	TAT	2	6	28188	28193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963331
550	NC_011660	GAGT	2	8	28198	28205	25 %	25 %	50 %	0 %	217963331
551	NC_011660	ATGC	2	8	28290	28297	25 %	25 %	25 %	25 %	217963331
552	NC_011660	AGA	2	6	28301	28306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963331
553	NC_011660	TAT	2	6	28310	28315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963331
554	NC_011660	CAA	2	6	28335	28340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963331
555	NC_011660	TAT	3	9	28375	28383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963331
556	NC_011660	GC	3	6	28397	28402	0 %	0 %	50 %	50 %	217963331
557	NC_011660	AAG	2	6	28404	28409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963331
558	NC_011660	TGA	2	6	28502	28507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963331
559	NC_011660	TAT	2	6	28521	28526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963331
560	NC_011660	GAA	2	6	28545	28550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963331
561	NC_011660	T	6	6	28580	28585	0 %	100 %	0 %	0 %	217963331
562	NC_011660	AGA	2	6	28625	28630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963331
563	NC_011660	CTT	2	6	28659	28664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963331
564	NC_011660	CGT	2	6	28684	28689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963331
565	NC_011660	ATT	2	6	28690	28695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963331
566	NC_011660	TGAT	2	8	28699	28706	25 %	50 %	25 %	0 %	217963331
567	NC_011660	ATTAT	2	10	28862	28871	40 %	60 %	0 %	0 %	217963331
568	NC_011660	AGAA	2	8	28916	28923	75 %	0 %	25 %	0 %	217963331
569	NC_011660	CATT	2	8	28944	28951	25 %	50 %	0 %	25 %	217963331
570	NC_011660	ATA	2	6	28961	28966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963331
571	NC_011660	CGC	2	6	29019	29024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963332
572	NC_011660	T	7	7	29040	29046	0 %	100 %	0 %	0 %	217963332
573	NC_011660	TCT	2	6	29051	29056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963332
574	NC_011660	ACT	2	6	29102	29107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963332
575	NC_011660	CTAA	2	8	29120	29127	50 %	25 %	0 %	25 %	217963332
576	NC_011660	CTTT	2	8	29130	29137	0 %	75 %	0 %	25 %	217963332
577	NC_011660	ATT	2	6	29311	29316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963333
578	NC_011660	GAT	2	6	29372	29377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963333
579	NC_011660	CT	4	8	29399	29406	0 %	50 %	0 %	50 %	217963333
580	NC_011660	GTA	2	6	29414	29419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963333
581	NC_011660	TTGG	2	8	29463	29470	0 %	50 %	50 %	0 %	217963333
582	NC_011660	TTAAA	2	10	29496	29505	60 %	40 %	0 %	0 %	217963333
583	NC_011660	AGTA	2	8	29548	29555	50 %	25 %	25 %	0 %	217963333
584	NC_011660	GAT	2	6	29569	29574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963333
585	NC_011660	ATT	2	6	29604	29609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963333
586	NC_011660	CTT	2	6	29611	29616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963333
587	NC_011660	T	6	6	29641	29646	0 %	100 %	0 %	0 %	217963333
588	NC_011660	TTCCGC	2	12	29694	29705	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	217963333
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592	NC_011660	A	7	7	30012	30018	100 %	0 %	0 %	0 %	217963334
593	NC_011660	GATG	2	8	30051	30058	25 %	25 %	50 %	0 %	217963334
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595	NC_011660	T	6	6	30092	30097	0 %	100 %	0 %	0 %	217963334
596	NC_011660	ACT	2	6	30186	30191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963334
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598	NC_011660	ATA	2	6	30239	30244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963334
599	NC_011660	GAA	2	6	30313	30318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963334
600	NC_011660	AGG	2	6	30422	30427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963334
601	NC_011660	GAAT	2	8	30433	30440	50 %	25 %	25 %	0 %	217963334
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603	NC_011660	GGTT	2	8	30500	30507	0 %	50 %	50 %	0 %	217963335
604	NC_011660	AGA	2	6	30509	30514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963335
605	NC_011660	ATT	2	6	30568	30573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963335
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607	NC_011660	ACA	2	6	30661	30666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963335
608	NC_011660	AATT	2	8	30667	30674	50 %	50 %	0 %	0 %	217963335
609	NC_011660	AAG	2	6	30676	30681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963335
610	NC_011660	TTA	2	6	30703	30708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963335
611	NC_011660	TTTA	2	8	30712	30719	25 %	75 %	0 %	0 %	217963335
612	NC_011660	GA	3	6	30926	30931	50 %	0 %	50 %	0 %	217963335
613	NC_011660	ATG	2	6	30943	30948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963335
614	NC_011660	TAA	2	6	30962	30967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963335
615	NC_011660	GTG	2	6	31042	31047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963335
616	NC_011660	ATT	2	6	31053	31058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963335
617	NC_011660	GCT	2	6	31077	31082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963335
618	NC_011660	CA	3	6	31104	31109	50 %	0 %	0 %	50 %	217963335
619	NC_011660	GAA	2	6	31113	31118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963335
620	NC_011660	CCGTT	2	10	31124	31133	0 %	40 %	20 %	40 %	217963335
621	NC_011660	AGA	2	6	31184	31189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963335
622	NC_011660	TGA	2	6	31205	31210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963335
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624	NC_011660	AATCA	2	10	31355	31364	60 %	20 %	0 %	20 %	217963335
625	NC_011660	CAC	2	6	31461	31466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963335
626	NC_011660	TGC	2	6	31487	31492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963335
627	NC_011660	AAT	2	6	31535	31540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963335
628	NC_011660	GAA	2	6	31626	31631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963335
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630	NC_011660	TAT	2	6	31737	31742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963335
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