MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010610	ACG	2	6	179205	179210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154622
3002	NC_010610	GAT	2	6	179213	179218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154622
3003	NC_010610	GAC	2	6	179219	179224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154622
3004	NC_010610	CTAC	2	8	179268	179275	25 %	25 %	0 %	50 %	184154622
3005	NC_010610	TGG	2	6	179385	179390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154622
3006	NC_010610	TGA	2	6	179460	179465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154622
3007	NC_010610	AATT	2	8	179532	179539	50 %	50 %	0 %	0 %	184154622
3008	NC_010610	ATT	2	6	179589	179594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154623
3009	NC_010610	CAGC	2	8	179684	179691	25 %	0 %	25 %	50 %	184154623
3010	NC_010610	ACG	2	6	179706	179711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154623
3011	NC_010610	AAG	2	6	179721	179726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154623
3012	NC_010610	GGC	2	6	179741	179746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154623
3013	NC_010610	AAC	2	6	179999	180004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154624
3014	NC_010610	GCCAA	2	10	180014	180023	40 %	0 %	20 %	40 %	184154624
3015	NC_010610	CGC	2	6	180081	180086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154624
3016	NC_010610	GGT	2	6	180147	180152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154624
3017	NC_010610	CCG	2	6	180185	180190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154624
3018	NC_010610	ATG	2	6	180250	180255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154624
3019	NC_010610	TTA	2	6	181931	181936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154625
3020	NC_010610	TCA	2	6	181951	181956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154625
3021	NC_010610	GAA	2	6	182052	182057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154625
3022	NC_010610	CTT	2	6	182078	182083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154625
3023	NC_010610	AGC	2	6	182138	182143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3024	NC_010610	AGTT	2	8	182146	182153	25 %	50 %	25 %	0 %	184154625
3025	NC_010610	GAA	2	6	182157	182162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154625
3026	NC_010610	GGA	2	6	182198	182203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154625
3027	NC_010610	ACC	2	6	182226	182231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154625
3028	NC_010610	GCG	2	6	182277	182282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3029	NC_010610	GCG	2	6	182328	182333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3030	NC_010610	AGC	2	6	182381	182386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3031	NC_010610	AGC	2	6	182408	182413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3032	NC_010610	GCA	2	6	182421	182426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3033	NC_010610	CGG	2	6	182428	182433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3034	NC_010610	GCG	2	6	182451	182456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3035	NC_010610	AGC	2	6	182471	182476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3036	NC_010610	GCG	2	6	182502	182507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3037	NC_010610	AGC	2	6	182528	182533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3038	NC_010610	GCA	2	6	182550	182555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3039	NC_010610	AGC	2	6	182570	182575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3040	NC_010610	TGG	2	6	182593	182598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154625
3041	NC_010610	GTC	2	6	182723	182728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3042	NC_010610	CTT	2	6	182770	182775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154625
3043	NC_010610	GAG	2	6	182831	182836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154625
3044	NC_010610	TTG	2	6	182867	182872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154625
3045	NC_010610	TTGGG	2	10	182885	182894	0 %	40 %	60 %	0 %	184154625
3046	NC_010610	TCA	2	6	182905	182910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154625
3047	NC_010610	AAC	2	6	183008	183013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154625
3048	NC_010610	GCG	3	9	183048	183056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3049	NC_010610	GCA	2	6	183105	183110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3050	NC_010610	CGG	3	9	183115	183123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3051	NC_010610	GAA	2	6	183144	183149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154625
3052	NC_010610	AGC	2	6	183152	183157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3053	NC_010610	AGC	2	6	183164	183169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3054	NC_010610	GCG	2	6	183183	183188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3055	NC_010610	GCG	2	6	183201	183206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3056	NC_010610	GCC	2	6	183213	183218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154625
3057	NC_010610	GCT	2	6	183237	183242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154625
3058	NC_010610	CGG	3	9	183256	183264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154625
3059	NC_010610	TGG	2	6	183310	183315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154625
3060	NC_010610	GTG	2	6	183324	183329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154625
3061	NC_010610	TGG	2	6	183346	183351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154625
3062	NC_010610	GTG	3	9	183366	183374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154625
3063	NC_010610	GGT	2	6	183416	183421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154625
3064	NC_010610	GGA	2	6	183631	183636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154626
3065	NC_010610	GGC	2	6	183694	183699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154626
3066	NC_010610	CGC	2	6	183718	183723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154626
3067	NC_010610	TGG	2	6	183756	183761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154626
3068	NC_010610	ACG	2	6	183798	183803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154626
3069	NC_010610	ACC	2	6	183920	183925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154626
3070	NC_010610	ACG	2	6	183927	183932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154626
3071	NC_010610	ACG	2	6	183993	183998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154626
3072	NC_010610	CAA	2	6	184000	184005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154626
3073	NC_010610	CCA	2	6	184008	184013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154626
3074	NC_010610	GCTAGT	2	12	184184	184195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184154626
3075	NC_010610	CAG	2	6	184207	184212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154626
3076	NC_010610	CCA	2	6	184275	184280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154626
3077	NC_010610	CCCAG	2	10	184305	184314	20 %	0 %	20 %	60 %	184154626
3078	NC_010610	CCA	2	6	184320	184325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154626
3079	NC_010610	GACCC	2	10	184373	184382	20 %	0 %	20 %	60 %	184154626
3080	NC_010610	GCC	2	6	184568	184573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154626
3081	NC_010610	CTTTG	2	10	184603	184612	0 %	60 %	20 %	20 %	184154626
3082	NC_010610	ATG	2	6	184692	184697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154626
3083	NC_010610	ACG	2	6	184709	184714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154626
3084	NC_010610	ACC	2	6	184757	184762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154626
3085	NC_010610	CGC	2	6	184798	184803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154626
3086	NC_010610	CTA	2	6	184831	184836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154626
3087	NC_010610	ACC	2	6	184958	184963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154626
3088	NC_010610	GGC	2	6	184976	184981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154626
3089	NC_010610	GAT	2	6	184982	184987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154626
3090	NC_010610	CGA	2	6	185124	185129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154626
3091	NC_010610	CGCT	2	8	185223	185230	0 %	25 %	25 %	50 %	184154626
3092	NC_010610	CGGGAC	2	12	185266	185277	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	184154626
3093	NC_010610	AAG	2	6	185309	185314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154626
3094	NC_010610	GCC	2	6	185387	185392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154626
3095	NC_010610	CTT	2	6	185398	185403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154626
3096	NC_010610	GGC	2	6	185410	185415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154626
3097	NC_010610	ACC	2	6	185438	185443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154626
3098	NC_010610	GGC	2	6	185445	185450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154626
3099	NC_010610	A	6	6	185462	185467	100 %	0 %	0 %	0 %	184154626
3100	NC_010610	TTA	2	6	185502	185507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154627
3101	NC_010610	GTTA	2	8	185568	185575	25 %	50 %	25 %	0 %	184154627
3102	NC_010610	CTA	2	6	185621	185626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154627
3103	NC_010610	CGCC	2	8	185627	185634	0 %	0 %	25 %	75 %	184154627
3104	NC_010610	CCA	2	6	185692	185697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154627
3105	NC_010610	GTC	3	9	185715	185723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154627
3106	NC_010610	GCG	2	6	185770	185775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154627
3107	NC_010610	TAC	2	6	185778	185783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154627
3108	NC_010610	ACC	2	6	185802	185807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154627
3109	NC_010610	CAG	2	6	185831	185836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154627
3110	NC_010610	GCG	2	6	185947	185952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154627
3111	NC_010610	CGG	3	9	185974	185982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154627
3112	NC_010610	GTC	2	6	185996	186001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154627
3113	NC_010610	GCA	2	6	186016	186021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154627
3114	NC_010610	CCT	2	6	186067	186072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154627
3115	NC_010610	TCG	2	6	186078	186083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154627
3116	NC_010610	GCCAAG	2	12	186087	186098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154627
3117	NC_010610	CTA	2	6	186173	186178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154627
3118	NC_010610	CGG	2	6	186191	186196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154627
3119	NC_010610	GCC	2	6	186225	186230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154627
3120	NC_010610	AAG	2	6	186252	186257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154627
3121	NC_010610	GAA	3	9	186292	186300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154628
3122	NC_010610	ATT	2	6	186305	186310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154628
3123	NC_010610	TCG	2	6	186321	186326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154628
3124	NC_010610	ACC	2	6	186375	186380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154628
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3129	NC_010610	ACC	2	6	186702	186707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154628
3130	NC_010610	CCAG	2	8	186711	186718	25 %	0 %	25 %	50 %	184154628
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3133	NC_010610	G	6	6	186878	186883	0 %	0 %	100 %	0 %	184154628
3134	NC_010610	CGC	2	6	186895	186900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154628
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3150	NC_010610	T	6	6	187472	187477	0 %	100 %	0 %	0 %	184154629
3151	NC_010610	GTC	2	6	187488	187493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154629
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3153	NC_010610	TCG	2	6	187623	187628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154629
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3229	NC_010610	GCT	2	6	191987	191992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154633
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3231	NC_010610	CGA	3	9	192037	192045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154633
3232	NC_010610	AAG	3	9	192113	192121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154633
3233	NC_010610	TCAA	2	8	192298	192305	50 %	25 %	0 %	25 %	184154634
3234	NC_010610	GCT	2	6	192307	192312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154634
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3237	NC_010610	CTC	2	6	192486	192491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154634
3238	NC_010610	GC	3	6	192502	192507	0 %	0 %	50 %	50 %	184154634
3239	NC_010610	TA	3	6	192533	192538	50 %	50 %	0 %	0 %	184154634
3240	NC_010610	TAA	2	6	192813	192818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154634
3241	NC_010610	CCA	2	6	192819	192824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154634
3242	NC_010610	CGGC	2	8	192827	192834	0 %	0 %	50 %	50 %	184154634
3243	NC_010610	GA	3	6	192851	192856	50 %	0 %	50 %	0 %	184154634
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3350	NC_010610	TAAT	2	8	207579	207586	50 %	50 %	0 %	0 %	184154640
3351	NC_010610	AGA	2	6	207710	207715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154641
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3358	NC_010610	A	6	6	208130	208135	100 %	0 %	0 %	0 %	184154641
3359	NC_010610	TCG	2	6	208208	208213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154641
3360	NC_010610	CACC	2	8	208278	208285	25 %	0 %	0 %	75 %	184154641
3361	NC_010610	TTG	2	6	208360	208365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154641
3362	NC_010610	CTT	2	6	208368	208373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154641
3363	NC_010610	GAC	2	6	208497	208502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154641
3364	NC_010610	TAC	2	6	208537	208542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154641
3365	NC_010610	CGT	2	6	208745	208750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154642
3366	NC_010610	GA	3	6	208872	208877	50 %	0 %	50 %	0 %	184154642
3367	NC_010610	GAC	2	6	208895	208900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154642
3368	NC_010610	CAG	2	6	208912	208917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154642
3369	NC_010610	AAGC	2	8	208930	208937	50 %	0 %	25 %	25 %	184154642
3370	NC_010610	AC	3	6	209017	209022	50 %	0 %	0 %	50 %	184154642
3371	NC_010610	TTTA	2	8	209085	209092	25 %	75 %	0 %	0 %	184154642
3372	NC_010610	GAT	2	6	209152	209157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154642
3373	NC_010610	CGC	2	6	209161	209166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154642
3374	NC_010610	CAT	2	6	209221	209226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154642
3375	NC_010610	GGTGCT	2	12	209257	209268	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	184154642
3376	NC_010610	ATT	2	6	209315	209320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154642
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3379	NC_010610	TTC	2	6	209527	209532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154643
3380	NC_010610	TCG	2	6	209568	209573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154643
3381	NC_010610	CCA	2	6	209604	209609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154643
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3383	NC_010610	ACC	2	6	209627	209632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154643
3384	NC_010610	GAA	2	6	209819	209824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154643
3385	NC_010610	GAC	2	6	209891	209896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154643
3386	NC_010610	TGA	2	6	209917	209922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154643
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3390	NC_010610	GCCC	2	8	210002	210009	0 %	0 %	25 %	75 %	184154643
3391	NC_010610	G	6	6	210106	210111	0 %	0 %	100 %	0 %	184154643
3392	NC_010610	CGG	2	6	210232	210237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154644
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3395	NC_010610	GGACC	2	10	210368	210377	20 %	0 %	40 %	40 %	184154644
3396	NC_010610	GAC	2	6	210383	210388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154644
3397	NC_010610	TCAA	2	8	210718	210725	50 %	25 %	0 %	25 %	184154645
3398	NC_010610	GAA	2	6	210754	210759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154645
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3400	NC_010610	CACG	2	8	210813	210820	25 %	0 %	25 %	50 %	184154645
3401	NC_010610	TAC	2	6	210910	210915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154645
3402	NC_010610	CGC	2	6	211032	211037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154645
3403	NC_010610	GGT	3	9	211068	211076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154645
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3406	NC_010610	ATC	2	6	211141	211146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154645
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3411	NC_010610	GTC	2	6	211325	211330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154645
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3428	NC_010610	CTTG	2	8	212212	212219	0 %	50 %	25 %	25 %	184154646
3429	NC_010610	GTC	2	6	212235	212240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154646
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3434	NC_010610	AAG	2	6	212358	212363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154646
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3454	NC_010610	GCCG	2	8	213053	213060	0 %	0 %	50 %	50 %	184154646
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3465	NC_010610	CAAAGG	2	12	213769	213780	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	184154646
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3469	NC_010610	TCG	2	6	213927	213932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154646
3470	NC_010610	GGCG	2	8	213949	213956	0 %	0 %	75 %	25 %	184154646
3471	NC_010610	GGT	2	6	213959	213964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154646
3472	NC_010610	TGC	2	6	213993	213998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154646
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3474	NC_010610	CAT	2	6	214031	214036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154646
3475	NC_010610	ACCGG	2	10	214077	214086	20 %	0 %	40 %	40 %	184154646
3476	NC_010610	TCA	2	6	214119	214124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154646
3477	NC_010610	GTC	2	6	214155	214160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154646
3478	NC_010610	TGCTT	2	10	214245	214254	0 %	60 %	20 %	20 %	184154646
3479	NC_010610	AAT	2	6	214609	214614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154647
3480	NC_010610	GTT	2	6	214672	214677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154647
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3482	NC_010610	CG	3	6	214738	214743	0 %	0 %	50 %	50 %	184154647
3483	NC_010610	GGC	2	6	214763	214768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154647
3484	NC_010610	GGC	3	9	214793	214801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154647
3485	NC_010610	TGG	2	6	214927	214932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154647
3486	NC_010610	TGG	2	6	214942	214947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154647
3487	NC_010610	GAT	2	6	215057	215062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154648
3488	NC_010610	ACT	2	6	215068	215073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154648
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3490	NC_010610	GCC	2	6	215124	215129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154648
3491	NC_010610	CAAC	2	8	215145	215152	50 %	0 %	0 %	50 %	184154648
3492	NC_010610	GGC	2	6	215249	215254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154648
3493	NC_010610	TCG	2	6	215314	215319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154648
3494	NC_010610	GGT	2	6	215348	215353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154648
3495	NC_010610	ATT	2	6	215367	215372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154648
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3497	NC_010610	CGA	2	6	215414	215419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154648
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