MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_010610	GCT	2	6	2003254	2003259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156237
33002	NC_010610	GGT	2	6	2003372	2003377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156237
33003	NC_010610	GGT	2	6	2003414	2003419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156237
33004	NC_010610	CGC	2	6	2003464	2003469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156237
33005	NC_010610	GAA	2	6	2003567	2003572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156237
33006	NC_010610	CGA	2	6	2003578	2003583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156237
33007	NC_010610	TGA	2	6	2003623	2003628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156237
33008	NC_010610	CTG	2	6	2003691	2003696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156237
33009	NC_010610	GAC	2	6	2003714	2003719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156237
33010	NC_010610	GAC	2	6	2003726	2003731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156237
33011	NC_010610	TTG	2	6	2003745	2003750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156237
33012	NC_010610	GTG	2	6	2003766	2003771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156237
33013	NC_010610	TCT	2	6	2003795	2003800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156237
33014	NC_010610	TGG	2	6	2003815	2003820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156237
33015	NC_010610	CAC	2	6	2003823	2003828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156237
33016	NC_010610	GCAA	2	8	2003894	2003901	50 %	0 %	25 %	25 %	184156237
33017	NC_010610	CGA	3	9	2003938	2003946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156237
33018	NC_010610	AAG	2	6	2003948	2003953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156237
33019	NC_010610	CAT	2	6	2004100	2004105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156237
33020	NC_010610	CTT	2	6	2004170	2004175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156237
33021	NC_010610	GAC	2	6	2004176	2004181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156237
33022	NC_010610	AAG	2	6	2004200	2004205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156237
33023	NC_010610	TTCC	2	8	2004261	2004268	0 %	50 %	0 %	50 %	184156237
33024	NC_010610	CGC	2	6	2004271	2004276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156237
33025	NC_010610	ACT	2	6	2004285	2004290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156237
33026	NC_010610	CTGC	2	8	2004314	2004321	0 %	25 %	25 %	50 %	184156237
33027	NC_010610	ACT	2	6	2004345	2004350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156237
33028	NC_010610	ACCG	2	8	2004374	2004381	25 %	0 %	25 %	50 %	184156237
33029	NC_010610	ACT	2	6	2004396	2004401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156237
33030	NC_010610	GAA	2	6	2004410	2004415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156237
33031	NC_010610	T	7	7	2004671	2004677	0 %	100 %	0 %	0 %	184156238
33032	NC_010610	CAC	2	6	2004712	2004717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156238
33033	NC_010610	AGG	2	6	2004750	2004755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156238
33034	NC_010610	CAT	2	6	2004805	2004810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156238
33035	NC_010610	TGG	2	6	2004824	2004829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156238
33036	NC_010610	ACC	2	6	2004851	2004856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156238
33037	NC_010610	TGT	2	6	2004891	2004896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156238
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33039	NC_010610	CAG	2	6	2004925	2004930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156238
33040	NC_010610	TTG	2	6	2005079	2005084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156238
33041	NC_010610	TGCT	2	8	2005096	2005103	0 %	50 %	25 %	25 %	184156238
33042	NC_010610	A	6	6	2005327	2005332	100 %	0 %	0 %	0 %	184156239
33043	NC_010610	TCA	2	6	2005333	2005338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156239
33044	NC_010610	TGC	2	6	2005342	2005347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156239
33045	NC_010610	A	7	7	2005348	2005354	100 %	0 %	0 %	0 %	184156239
33046	NC_010610	CGG	2	6	2005381	2005386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156239
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33050	NC_010610	ACCAC	2	10	2005459	2005468	40 %	0 %	0 %	60 %	184156239
33051	NC_010610	TTCA	2	8	2005506	2005513	25 %	50 %	0 %	25 %	184156239
33052	NC_010610	A	8	8	2005534	2005541	100 %	0 %	0 %	0 %	184156239
33053	NC_010610	ACT	2	6	2005603	2005608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156239
33054	NC_010610	ACC	2	6	2005635	2005640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156239
33055	NC_010610	TCA	2	6	2005657	2005662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156239
33056	NC_010610	CCA	2	6	2005711	2005716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156239
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33058	NC_010610	CAT	2	6	2005965	2005970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156240
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33060	NC_010610	TAC	2	6	2005999	2006004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156240
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33063	NC_010610	TGG	2	6	2006097	2006102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156240
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33068	NC_010610	TAC	2	6	2006293	2006298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156240
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33088	NC_010610	TCC	2	6	2007081	2007086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156241
33089	NC_010610	TGA	2	6	2007096	2007101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156241
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33100	NC_010610	GAC	2	6	2007539	2007544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156241
33101	NC_010610	GTC	2	6	2007565	2007570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156241
33102	NC_010610	CAC	2	6	2007577	2007582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156241
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33105	NC_010610	A	6	6	2007622	2007627	100 %	0 %	0 %	0 %	184156241
33106	NC_010610	CCT	2	6	2007628	2007633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156241
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33223	NC_010610	A	6	6	2014616	2014621	100 %	0 %	0 %	0 %	184156246
33224	NC_010610	ATTT	2	8	2014739	2014746	25 %	75 %	0 %	0 %	184156246
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33229	NC_010610	CGT	2	6	2015231	2015236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156247
33230	NC_010610	ACTG	2	8	2015275	2015282	25 %	25 %	25 %	25 %	184156247
33231	NC_010610	GAC	2	6	2015327	2015332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156247
33232	NC_010610	CCT	2	6	2015441	2015446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156247
33233	NC_010610	GGA	2	6	2015470	2015475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156247
33234	NC_010610	TCA	2	6	2015481	2015486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156247
33235	NC_010610	GA	3	6	2015534	2015539	50 %	0 %	50 %	0 %	184156247
33236	NC_010610	ACT	3	9	2015550	2015558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156247
33237	NC_010610	ACCA	2	8	2015560	2015567	50 %	0 %	0 %	50 %	184156247
33238	NC_010610	CGGA	2	8	2015588	2015595	25 %	0 %	50 %	25 %	184156247
33239	NC_010610	TG	3	6	2015648	2015653	0 %	50 %	50 %	0 %	184156247
33240	NC_010610	CGG	2	6	2015737	2015742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156247
33241	NC_010610	ACCG	2	8	2015770	2015777	25 %	0 %	25 %	50 %	184156247
33242	NC_010610	ACT	2	6	2015800	2015805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156247
33243	NC_010610	GTT	2	6	2015842	2015847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156247
33244	NC_010610	GCC	2	6	2016023	2016028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156247
33245	NC_010610	GGC	2	6	2016040	2016045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156247
33246	NC_010610	GGA	2	6	2016103	2016108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156247
33247	NC_010610	TTC	2	6	2016119	2016124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156247
33248	NC_010610	CGA	2	6	2016159	2016164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156247
33249	NC_010610	GAA	2	6	2016193	2016198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156247
33250	NC_010610	CG	3	6	2017312	2017317	0 %	0 %	50 %	50 %	184156248
33251	NC_010610	GTC	2	6	2017406	2017411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156248
33252	NC_010610	AAG	2	6	2017479	2017484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156248
33253	NC_010610	GCC	2	6	2017529	2017534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156248
33254	NC_010610	GGT	2	6	2017567	2017572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156248
33255	NC_010610	TTGGC	2	10	2017582	2017591	0 %	40 %	40 %	20 %	184156248
33256	NC_010610	TGG	2	6	2017615	2017620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156248
33257	NC_010610	GTC	2	6	2017683	2017688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156248
33258	NC_010610	TTCG	2	8	2017700	2017707	0 %	50 %	25 %	25 %	184156248
33259	NC_010610	CCA	2	6	2017723	2017728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156248
33260	NC_010610	AC	3	6	2017773	2017778	50 %	0 %	0 %	50 %	184156248
33261	NC_010610	CCA	2	6	2017843	2017848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156248
33262	NC_010610	ATG	2	6	2017887	2017892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156248
33263	NC_010610	GCC	2	6	2017895	2017900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156248
33264	NC_010610	TTC	2	6	2017902	2017907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156248
33265	NC_010610	A	6	6	2018509	2018514	100 %	0 %	0 %	0 %	184156249
33266	NC_010610	ACC	2	6	2018547	2018552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156249
33267	NC_010610	TAC	2	6	2018588	2018593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156249
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33269	NC_010610	CCG	2	6	2018620	2018625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156249
33270	NC_010610	CCGT	2	8	2018658	2018665	0 %	25 %	25 %	50 %	184156249
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33272	NC_010610	TTC	2	6	2018756	2018761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156249
33273	NC_010610	CTT	2	6	2018767	2018772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156249
33274	NC_010610	CCAG	2	8	2018783	2018790	25 %	0 %	25 %	50 %	184156249
33275	NC_010610	TCG	2	6	2018881	2018886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156250
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33279	NC_010610	AAC	2	6	2019206	2019211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184156251
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33283	NC_010610	TCCC	2	8	2019395	2019402	0 %	25 %	0 %	75 %	184156251
33284	NC_010610	AAG	2	6	2019430	2019435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156251
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33292	NC_010610	TAG	2	6	2019758	2019763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156251
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33299	NC_010610	GCA	2	6	2021276	2021281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156252
33300	NC_010610	TAA	2	6	2021332	2021337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156252
33301	NC_010610	AAT	2	6	2021399	2021404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156252
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33303	NC_010610	T	6	6	2021423	2021428	0 %	100 %	0 %	0 %	184156252
33304	NC_010610	TTA	2	6	2021460	2021465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156252
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33306	NC_010610	TA	3	6	2021519	2021524	50 %	50 %	0 %	0 %	184156252
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33310	NC_010610	AT	3	6	2021635	2021640	50 %	50 %	0 %	0 %	184156252
33311	NC_010610	AGT	2	6	2022531	2022536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156253
33312	NC_010610	AGT	2	6	2022564	2022569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156253
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33314	NC_010610	GA	3	6	2022746	2022751	50 %	0 %	50 %	0 %	184156253
33315	NC_010610	CCAG	2	8	2022755	2022762	25 %	0 %	25 %	50 %	184156253
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33321	NC_010610	ACC	2	6	2023119	2023124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156253
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33323	NC_010610	CAG	2	6	2023232	2023237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156253
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33331	NC_010610	TTG	2	6	2023848	2023853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156253
33332	NC_010610	AATGG	2	10	2023874	2023883	40 %	20 %	40 %	0 %	184156253
33333	NC_010610	ATC	2	6	2023989	2023994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156253
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33335	NC_010610	GTT	2	6	2024182	2024187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156253
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33340	NC_010610	GTT	2	6	2024432	2024437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156253
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33342	NC_010610	ATC	2	6	2024526	2024531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156253
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33344	NC_010610	ATA	2	6	2024647	2024652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156253
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33346	NC_010610	TGAA	2	8	2025037	2025044	50 %	25 %	25 %	0 %	184156254
33347	NC_010610	CGT	2	6	2025051	2025056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156254
33348	NC_010610	ACTG	2	8	2025095	2025102	25 %	25 %	25 %	25 %	184156254
33349	NC_010610	GAC	2	6	2025147	2025152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156254
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33351	NC_010610	GGA	2	6	2025290	2025295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156254
33352	NC_010610	TCA	2	6	2025301	2025306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156254
33353	NC_010610	GA	3	6	2025354	2025359	50 %	0 %	50 %	0 %	184156254
33354	NC_010610	ACT	3	9	2025370	2025378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156254
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33360	NC_010610	ACT	2	6	2025620	2025625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156254
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33451	NC_010610	GCA	2	6	2036250	2036255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156259
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33459	NC_010610	T	7	7	2037038	2037044	0 %	100 %	0 %	0 %	184156260
33460	NC_010610	T	6	6	2037085	2037090	0 %	100 %	0 %	0 %	184156260
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33462	NC_010610	CTA	2	6	2037121	2037126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156260
33463	NC_010610	TTC	2	6	2037137	2037142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156260
33464	NC_010610	T	6	6	2037190	2037195	0 %	100 %	0 %	0 %	184156260
33465	NC_010610	T	6	6	2037218	2037223	0 %	100 %	0 %	0 %	184156260
33466	NC_010610	ATTT	2	8	2037248	2037255	25 %	75 %	0 %	0 %	184156260
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33472	NC_010610	TAA	2	6	2037632	2037637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156261
33473	NC_010610	ATA	2	6	2037652	2037657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156261
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33481	NC_010610	TAC	2	6	2038130	2038135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156261
33482	NC_010610	T	6	6	2038152	2038157	0 %	100 %	0 %	0 %	184156261
33483	NC_010610	CTA	2	6	2038184	2038189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156261
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