MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_010610	ACG	2	6	1823548	1823553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156088
30003	NC_010610	GCC	2	6	1823577	1823582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156088
30004	NC_010610	G	6	6	1823693	1823698	0 %	0 %	100 %	0 %	184156088
30005	NC_010610	GCC	2	6	1823704	1823709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156088
30006	NC_010610	CGCC	2	8	1823725	1823732	0 %	0 %	25 %	75 %	184156088
30007	NC_010610	ACC	2	6	1823788	1823793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156088
30008	NC_010610	CCA	2	6	1823798	1823803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156088
30009	NC_010610	CGC	3	9	1823831	1823839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156088
30010	NC_010610	GAC	2	6	1823889	1823894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156088
30011	NC_010610	TGGCC	2	10	1823909	1823918	0 %	20 %	40 %	40 %	184156088
30012	NC_010610	GCC	2	6	1823937	1823942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156088
30013	NC_010610	CCAAC	2	10	1824023	1824032	40 %	0 %	0 %	60 %	184156088
30014	NC_010610	GACC	2	8	1824041	1824048	25 %	0 %	25 %	50 %	184156088
30015	NC_010610	TGGCCG	2	12	1824052	1824063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	184156088
30016	NC_010610	CCG	2	6	1824100	1824105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156088
30017	NC_010610	GCC	2	6	1824165	1824170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156088
30018	NC_010610	TGG	2	6	1824178	1824183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156088
30019	NC_010610	AGG	2	6	1824235	1824240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156088
30020	NC_010610	CCG	2	6	1824269	1824274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156089
30021	NC_010610	CGC	2	6	1824287	1824292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156089
30022	NC_010610	ATC	2	6	1824408	1824413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156089
30023	NC_010610	TCA	2	6	1824448	1824453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156089
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30027	NC_010610	GGCC	2	8	1824572	1824579	0 %	0 %	50 %	50 %	184156089
30028	NC_010610	CGC	2	6	1824638	1824643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156089
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30033	NC_010610	G	6	6	1824861	1824866	0 %	0 %	100 %	0 %	184156089
30034	NC_010610	CTT	2	6	1824971	1824976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156089
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30039	NC_010610	TGG	2	6	1825273	1825278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156089
30040	NC_010610	CTG	2	6	1825326	1825331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156089
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30042	NC_010610	GGCT	2	8	1825398	1825405	0 %	25 %	50 %	25 %	184156089
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30053	NC_010610	CAT	2	6	1826143	1826148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156090
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30101	NC_010610	GCCA	2	8	1829386	1829393	25 %	0 %	25 %	50 %	184156093
30102	NC_010610	T	7	7	1829405	1829411	0 %	100 %	0 %	0 %	184156093
30103	NC_010610	CGCC	2	8	1829433	1829440	0 %	0 %	25 %	75 %	184156093
30104	NC_010610	ATC	2	6	1829515	1829520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156093
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30116	NC_010610	CCA	2	6	1830031	1830036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156093
30117	NC_010610	CGA	2	6	1830047	1830052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156093
30118	NC_010610	TTG	2	6	1830055	1830060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156093
30119	NC_010610	TGA	2	6	1830128	1830133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156093
30120	NC_010610	GCC	2	6	1830148	1830153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156093
30121	NC_010610	GCCC	2	8	1830205	1830212	0 %	0 %	25 %	75 %	184156093
30122	NC_010610	TGA	2	6	1830224	1830229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156093
30123	NC_010610	CCT	2	6	1830240	1830245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156093
30124	NC_010610	TGA	2	6	1830839	1830844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156094
30125	NC_010610	TTC	2	6	1830887	1830892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156094
30126	NC_010610	T	6	6	1831093	1831098	0 %	100 %	0 %	0 %	184156094
30127	NC_010610	TGT	2	6	1831108	1831113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156094
30128	NC_010610	GTAA	2	8	1831122	1831129	50 %	25 %	25 %	0 %	184156094
30129	NC_010610	GTT	2	6	1831152	1831157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156094
30130	NC_010610	GCTT	2	8	1831304	1831311	0 %	50 %	25 %	25 %	184156094
30131	NC_010610	AGT	2	6	1831452	1831457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156094
30132	NC_010610	TTC	2	6	1831560	1831565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156094
30133	NC_010610	GACC	3	12	1831585	1831596	25 %	0 %	25 %	50 %	184156094
30134	NC_010610	GGC	2	6	1831612	1831617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156094
30135	NC_010610	CCA	2	6	1831643	1831648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156094
30136	NC_010610	CAC	2	6	1831693	1831698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156094
30137	NC_010610	ATTC	2	8	1831765	1831772	25 %	50 %	0 %	25 %	184156094
30138	NC_010610	TTG	3	9	1831885	1831893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156094
30139	NC_010610	TAAT	2	8	1831926	1831933	50 %	50 %	0 %	0 %	184156094
30140	NC_010610	ATT	2	6	1832668	1832673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156095
30141	NC_010610	GGAGG	2	10	1832696	1832705	20 %	0 %	80 %	0 %	184156095
30142	NC_010610	GAT	2	6	1832744	1832749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156095
30143	NC_010610	TTC	2	6	1832771	1832776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156095
30144	NC_010610	GCG	2	6	1832788	1832793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156095
30145	NC_010610	GGA	2	6	1832803	1832808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184156095
30146	NC_010610	TGG	3	9	1832866	1832874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156095
30147	NC_010610	CGA	2	6	1832905	1832910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156095
30148	NC_010610	AAG	2	6	1832982	1832987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156095
30149	NC_010610	CCA	2	6	1833022	1833027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156095
30150	NC_010610	TTC	3	9	1833032	1833040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156095
30151	NC_010610	GGC	4	12	1833062	1833073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156095
30152	NC_010610	CGG	2	6	1833088	1833093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156095
30153	NC_010610	GGC	2	6	1833107	1833112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156095
30154	NC_010610	ACCG	2	8	1833185	1833192	25 %	0 %	25 %	50 %	184156095
30155	NC_010610	ACC	2	6	1833232	1833237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156095
30156	NC_010610	TGA	2	6	1833343	1833348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156095
30157	NC_010610	CCG	2	6	1833351	1833356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156095
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30159	NC_010610	CTT	2	6	1833391	1833396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156095
30160	NC_010610	CGGC	2	8	1833397	1833404	0 %	0 %	50 %	50 %	184156095
30161	NC_010610	AGGT	2	8	1833405	1833412	25 %	25 %	50 %	0 %	184156095
30162	NC_010610	GTC	2	6	1833458	1833463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156095
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30166	NC_010610	CGC	2	6	1833725	1833730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156095
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30168	NC_010610	GAC	2	6	1833821	1833826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156095
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30170	NC_010610	ATCA	2	8	1833926	1833933	50 %	25 %	0 %	25 %	184156095
30171	NC_010610	ATA	2	6	1833941	1833946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184156095
30172	NC_010610	GCC	2	6	1833957	1833962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156095
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30174	NC_010610	CTG	2	6	1833995	1834000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156095
30175	NC_010610	T	7	7	1834006	1834012	0 %	100 %	0 %	0 %	184156095
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30178	NC_010610	AAAC	2	8	1834091	1834098	75 %	0 %	0 %	25 %	184156096
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30182	NC_010610	AAC	2	6	1834509	1834514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184156096
30183	NC_010610	CGG	2	6	1834535	1834540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156096
30184	NC_010610	CGG	2	6	1834565	1834570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156096
30185	NC_010610	GCA	2	6	1834592	1834597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156096
30186	NC_010610	CG	3	6	1834664	1834669	0 %	0 %	50 %	50 %	184156096
30187	NC_010610	GGC	2	6	1834707	1834712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156096
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30190	NC_010610	CGA	3	9	1834856	1834864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156096
30191	NC_010610	ACC	2	6	1834894	1834899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156096
30192	NC_010610	CGG	2	6	1834949	1834954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156096
30193	NC_010610	GAT	2	6	1834977	1834982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156096
30194	NC_010610	CGA	2	6	1834985	1834990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156096
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30201	NC_010610	TTA	2	6	1835401	1835406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156096
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30203	NC_010610	GCCG	2	8	1835848	1835855	0 %	0 %	50 %	50 %	184156097
30204	NC_010610	CAG	2	6	1835875	1835880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156097
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30209	NC_010610	CCA	2	6	1836093	1836098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156097
30210	NC_010610	TCC	2	6	1836140	1836145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156097
30211	NC_010610	TGG	2	6	1836198	1836203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156097
30212	NC_010610	CTGG	2	8	1836389	1836396	0 %	25 %	50 %	25 %	184156098
30213	NC_010610	TGGT	2	8	1836459	1836466	0 %	50 %	50 %	0 %	184156098
30214	NC_010610	GGC	2	6	1836551	1836556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156098
30215	NC_010610	TGG	2	6	1836562	1836567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156098
30216	NC_010610	ACC	2	6	1836573	1836578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156098
30217	NC_010610	GGT	2	6	1836590	1836595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156098
30218	NC_010610	GAT	2	6	1836635	1836640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156098
30219	NC_010610	CGC	2	6	1836677	1836682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156098
30220	NC_010610	CCT	2	6	1836700	1836705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156098
30221	NC_010610	GTG	2	6	1836728	1836733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156098
30222	NC_010610	CGGT	2	8	1836747	1836754	0 %	25 %	50 %	25 %	184156098
30223	NC_010610	GTA	2	6	1836758	1836763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156098
30224	NC_010610	CGG	2	6	1836790	1836795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156098
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30226	NC_010610	GGC	2	6	1836851	1836856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156098
30227	NC_010610	CCAG	2	8	1836859	1836866	25 %	0 %	25 %	50 %	184156098
30228	NC_010610	ACG	2	6	1836993	1836998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156098
30229	NC_010610	CTC	2	6	1837040	1837045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156098
30230	NC_010610	C	6	6	1837098	1837103	0 %	0 %	0 %	100 %	184156098
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30232	NC_010610	ACC	2	6	1837176	1837181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156098
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30346	NC_010610	CTC	2	6	1843155	1843160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156103
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30348	NC_010610	GTG	2	6	1843962	1843967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156104
30349	NC_010610	AGAC	2	8	1843984	1843991	50 %	0 %	25 %	25 %	184156104
30350	NC_010610	GTC	2	6	1844091	1844096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156104
30351	NC_010610	TCG	2	6	1844101	1844106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156104
30352	NC_010610	TCA	2	6	1844119	1844124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156104
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30367	NC_010610	TGA	4	12	1844963	1844974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156105
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30380	NC_010610	TGGT	2	8	1845820	1845827	0 %	50 %	50 %	0 %	184156106
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30434	NC_010610	CGT	2	6	1848862	1848867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156108
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30449	NC_010610	GTC	3	9	1849391	1849399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156108
30450	NC_010610	TGG	2	6	1849497	1849502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156108
30451	NC_010610	GCTAG	2	10	1849930	1849939	20 %	20 %	40 %	20 %	184156109
30452	NC_010610	ATC	2	6	1850027	1850032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156109
30453	NC_010610	GTCC	2	8	1850045	1850052	0 %	25 %	25 %	50 %	184156109
30454	NC_010610	GTA	2	6	1850094	1850099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156109
30455	NC_010610	GCTTT	2	10	1850137	1850146	0 %	60 %	20 %	20 %	184156109
30456	NC_010610	GCCA	2	8	1850173	1850180	25 %	0 %	25 %	50 %	184156109
30457	NC_010610	CTC	2	6	1850237	1850242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156109
30458	NC_010610	CTA	3	9	1850245	1850253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156109
30459	NC_010610	TTG	2	6	1850285	1850290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156109
30460	NC_010610	ATG	2	6	1850381	1850386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156109
30461	NC_010610	T	7	7	1850390	1850396	0 %	100 %	0 %	0 %	184156109
30462	NC_010610	GTT	2	6	1850401	1850406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156109
30463	NC_010610	AAG	2	6	1850502	1850507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156109
30464	NC_010610	AAG	2	6	1850598	1850603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156109
30465	NC_010610	TAT	2	6	1850725	1850730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156109
30466	NC_010610	GTTA	2	8	1850750	1850757	25 %	50 %	25 %	0 %	184156109
30467	NC_010610	T	6	6	1850767	1850772	0 %	100 %	0 %	0 %	184156109
30468	NC_010610	TCT	2	6	1850925	1850930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156109
30469	NC_010610	A	6	6	1851265	1851270	100 %	0 %	0 %	0 %	184156110
30470	NC_010610	TCG	2	6	1851290	1851295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156110
30471	NC_010610	GCA	2	6	1851395	1851400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156110
30472	NC_010610	ATGACA	2	12	1851409	1851420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	184156110
30473	NC_010610	T	7	7	1851535	1851541	0 %	100 %	0 %	0 %	184156110
30474	NC_010610	ATC	2	6	1851547	1851552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156110
30475	NC_010610	AAG	2	6	1851634	1851639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156110
30476	NC_010610	AT	3	6	1851650	1851655	50 %	50 %	0 %	0 %	184156110
30477	NC_010610	AAAC	2	8	1851676	1851683	75 %	0 %	0 %	25 %	184156110
30478	NC_010610	T	6	6	1851796	1851801	0 %	100 %	0 %	0 %	184156111
30479	NC_010610	CGG	2	6	1851814	1851819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156111
30480	NC_010610	CCA	2	6	1851829	1851834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156111
30481	NC_010610	CAT	2	6	1851875	1851880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156111
30482	NC_010610	CAC	2	6	1851881	1851886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156111
30483	NC_010610	CGC	3	9	1851902	1851910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156111
30484	NC_010610	CTT	2	6	1851913	1851918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156111
30485	NC_010610	CCT	2	6	1851934	1851939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156111
30486	NC_010610	GGT	2	6	1851947	1851952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156111
30487	NC_010610	CGC	2	6	1851979	1851984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156111
30488	NC_010610	ATG	2	6	1852020	1852025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156111
30489	NC_010610	GGT	2	6	1852037	1852042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156111
30490	NC_010610	TGG	2	6	1852111	1852116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156111
30491	NC_010610	ATT	2	6	1852936	1852941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156112
30492	NC_010610	TTC	2	6	1853056	1853061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156113
30493	NC_010610	TGG	2	6	1853112	1853117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156113
30494	NC_010610	TGT	2	6	1853124	1853129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184156113
30495	NC_010610	CGC	2	6	1853166	1853171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156113
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30497	NC_010610	CGTC	2	8	1853198	1853205	0 %	25 %	25 %	50 %	184156113
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30500	NC_010610	GCC	2	6	1853399	1853404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156113

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