MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_010610	GT	3	6	1509622	1509627	0 %	50 %	50 %	0 %	184155808
25003	NC_010610	GAT	2	6	1509632	1509637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155808
25004	NC_010610	TCA	2	6	1509657	1509662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155808
25005	NC_010610	GTC	2	6	1509681	1509686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155808
25006	NC_010610	GCG	2	6	1509720	1509725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155808
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25008	NC_010610	ATC	3	9	1509756	1509764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155808
25009	NC_010610	CTT	2	6	1509785	1509790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155808
25010	NC_010610	GAT	2	6	1509794	1509799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155808
25011	NC_010610	GTC	2	6	1509807	1509812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155808
25012	NC_010610	GTC	2	6	1509873	1509878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155808
25013	NC_010610	TGT	2	6	1509924	1509929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155808
25014	NC_010610	AGCGCC	2	12	1509957	1509968	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	184155808
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25016	NC_010610	TCG	2	6	1510237	1510242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155808
25017	NC_010610	CGCC	2	8	1510302	1510309	0 %	0 %	25 %	75 %	184155808
25018	NC_010610	CTGA	2	8	1510357	1510364	25 %	25 %	25 %	25 %	184155808
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25020	NC_010610	GTT	2	6	1510397	1510402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155808
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25023	NC_010610	AGT	2	6	1510537	1510542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155808
25024	NC_010610	CTT	2	6	1510598	1510603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155808
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25032	NC_010610	TGC	2	6	1510929	1510934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155808
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25051	NC_010610	CGTT	2	8	1512343	1512350	0 %	50 %	25 %	25 %	184155809
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25053	NC_010610	TTCTT	2	10	1512424	1512433	0 %	80 %	0 %	20 %	184155809
25054	NC_010610	TTG	2	6	1512438	1512443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155809
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25061	NC_010610	TCT	2	6	1512808	1512813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155809
25062	NC_010610	CATC	2	8	1512830	1512837	25 %	25 %	0 %	50 %	184155809
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25068	NC_010610	CGG	2	6	1513337	1513342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155809
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25101	NC_010610	ATC	2	6	1515078	1515083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155812
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25116	NC_010610	GGC	2	6	1515809	1515814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155812
25117	NC_010610	TCAAT	2	10	1515877	1515886	40 %	40 %	0 %	20 %	184155812
25118	NC_010610	CTG	2	6	1515896	1515901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155812
25119	NC_010610	CAAAA	2	10	1515918	1515927	80 %	0 %	0 %	20 %	184155812
25120	NC_010610	TTC	2	6	1515935	1515940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155812
25121	NC_010610	TTCTC	2	10	1516016	1516025	0 %	60 %	0 %	40 %	184155813
25122	NC_010610	GTT	2	6	1516031	1516036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155813
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25126	NC_010610	CCG	2	6	1516121	1516126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155813
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25132	NC_010610	GTC	2	6	1516383	1516388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155813
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25134	NC_010610	TAGG	2	8	1516452	1516459	25 %	25 %	50 %	0 %	184155813
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25136	NC_010610	AGCT	2	8	1516488	1516495	25 %	25 %	25 %	25 %	184155813
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25147	NC_010610	CTGG	2	8	1517244	1517251	0 %	25 %	50 %	25 %	184155814
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25152	NC_010610	TGG	2	6	1517397	1517402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155814
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25230	NC_010610	AGA	2	6	1521387	1521392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155820
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25232	NC_010610	TCG	2	6	1521463	1521468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155820
25233	NC_010610	C	6	6	1521469	1521474	0 %	0 %	0 %	100 %	184155820
25234	NC_010610	T	6	6	1521547	1521552	0 %	100 %	0 %	0 %	184155820
25235	NC_010610	ATCGTG	2	12	1521561	1521572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	184155820
25236	NC_010610	AAT	2	6	1521650	1521655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184155820
25237	NC_010610	CCG	2	6	1521695	1521700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155820
25238	NC_010610	ACAA	2	8	1521745	1521752	75 %	0 %	0 %	25 %	184155820
25239	NC_010610	TCG	2	6	1521754	1521759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155820
25240	NC_010610	CCA	2	6	1521818	1521823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155820
25241	NC_010610	TGT	2	6	1521832	1521837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155820
25242	NC_010610	TCA	2	6	1522012	1522017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155821
25243	NC_010610	CAG	2	6	1522030	1522035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155821
25244	NC_010610	ACC	2	6	1522056	1522061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155821
25245	NC_010610	T	6	6	1522101	1522106	0 %	100 %	0 %	0 %	184155821
25246	NC_010610	TCC	2	6	1522129	1522134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155821
25247	NC_010610	CTA	2	6	1522139	1522144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155821
25248	NC_010610	TTG	2	6	1522170	1522175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155821
25249	NC_010610	CGA	2	6	1522226	1522231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155821
25250	NC_010610	CAA	2	6	1522232	1522237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155821
25251	NC_010610	AAC	2	6	1522284	1522289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155821
25252	NC_010610	ATG	2	6	1522347	1522352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155821
25253	NC_010610	AAG	2	6	1522374	1522379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155821
25254	NC_010610	A	6	6	1522437	1522442	100 %	0 %	0 %	0 %	184155821
25255	NC_010610	TAC	3	9	1522491	1522499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155821
25256	NC_010610	GAAGAT	2	12	1522550	1522561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184155821
25257	NC_010610	TGAT	2	8	1522618	1522625	25 %	50 %	25 %	0 %	184155821
25258	NC_010610	CAC	2	6	1522799	1522804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155822
25259	NC_010610	AACTG	2	10	1522884	1522893	40 %	20 %	20 %	20 %	184155822
25260	NC_010610	GGC	2	6	1522896	1522901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155822
25261	NC_010610	CGT	2	6	1522917	1522922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155822
25262	NC_010610	GCT	2	6	1522930	1522935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155822
25263	NC_010610	GTTG	2	8	1523006	1523013	0 %	50 %	50 %	0 %	184155822
25264	NC_010610	GTCG	2	8	1523034	1523041	0 %	25 %	50 %	25 %	184155822
25265	NC_010610	AGC	2	6	1523058	1523063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155822
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25267	NC_010610	GCCG	2	8	1523178	1523185	0 %	0 %	50 %	50 %	184155822
25268	NC_010610	ACC	2	6	1523230	1523235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155822
25269	NC_010610	ATC	2	6	1523320	1523325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155822
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25271	NC_010610	GCTG	2	8	1523396	1523403	0 %	25 %	50 %	25 %	184155822
25272	NC_010610	AGCGT	2	10	1523421	1523430	20 %	20 %	40 %	20 %	184155822
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25300	NC_010610	CTTAAA	2	12	1524540	1524551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	184155823
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25302	NC_010610	GCG	2	6	1524607	1524612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155823
25303	NC_010610	TGA	2	6	1524653	1524658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155823
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25317	NC_010610	C	6	6	1525316	1525321	0 %	0 %	0 %	100 %	184155823
25318	NC_010610	ACC	2	6	1525532	1525537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155824
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25329	NC_010610	TGGTCG	2	12	1526149	1526160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	184155825
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25332	NC_010610	CGC	2	6	1526212	1526217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155825
25333	NC_010610	CTGG	2	8	1526227	1526234	0 %	25 %	50 %	25 %	184155825
25334	NC_010610	TCA	2	6	1526269	1526274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155825
25335	NC_010610	GGTA	2	8	1526329	1526336	25 %	25 %	50 %	0 %	184155825
25336	NC_010610	CCG	2	6	1526371	1526376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155825
25337	NC_010610	TTG	2	6	1526441	1526446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155825
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25339	NC_010610	ATCC	2	8	1526519	1526526	25 %	25 %	0 %	50 %	184155825
25340	NC_010610	AGT	2	6	1526542	1526547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155825
25341	NC_010610	GAGCTG	2	12	1526585	1526596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184155825
25342	NC_010610	AAG	2	6	1526601	1526606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155825
25343	NC_010610	GGC	2	6	1526621	1526626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155825
25344	NC_010610	GGC	2	6	1526657	1526662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155825
25345	NC_010610	CCG	2	6	1526785	1526790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155825
25346	NC_010610	CAG	2	6	1526840	1526845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155825
25347	NC_010610	TCG	2	6	1527000	1527005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155825
25348	NC_010610	CGA	2	6	1527010	1527015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155825
25349	NC_010610	CTT	2	6	1527026	1527031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155825
25350	NC_010610	GTA	2	6	1527071	1527076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155825
25351	NC_010610	GGC	2	6	1527077	1527082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155825
25352	NC_010610	GCCG	2	8	1527173	1527180	0 %	0 %	50 %	50 %	184155825
25353	NC_010610	TCA	2	6	1527216	1527221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155825
25354	NC_010610	C	6	6	1527226	1527231	0 %	0 %	0 %	100 %	184155825
25355	NC_010610	CCA	2	6	1527244	1527249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155825
25356	NC_010610	GGC	2	6	1527302	1527307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155825
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25359	NC_010610	TCA	2	6	1527382	1527387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155825
25360	NC_010610	CTT	2	6	1527430	1527435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155825
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25376	NC_010610	C	6	6	1528007	1528012	0 %	0 %	0 %	100 %	184155826
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25462	NC_010610	CTT	2	6	1532182	1532187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155830
25463	NC_010610	GGTCG	2	10	1532210	1532219	0 %	20 %	60 %	20 %	184155830
25464	NC_010610	AAG	2	6	1532239	1532244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155830
25465	NC_010610	GGC	2	6	1532287	1532292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155830
25466	NC_010610	TGT	2	6	1532365	1532370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155830
25467	NC_010610	CGT	2	6	1532425	1532430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155830
25468	NC_010610	CTT	2	6	1532507	1532512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155830
25469	NC_010610	TTC	2	6	1532528	1532533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155830
25470	NC_010610	CCA	2	6	1532542	1532547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155830
25471	NC_010610	CTTGGC	2	12	1532549	1532560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155830
25472	NC_010610	AAG	2	6	1532583	1532588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155830
25473	NC_010610	ACC	2	6	1532646	1532651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155830
25474	NC_010610	TGA	2	6	1532794	1532799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155830
25475	NC_010610	CGG	2	6	1532893	1532898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155830
25476	NC_010610	CGT	2	6	1532912	1532917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155830
25477	NC_010610	CAC	2	6	1532951	1532956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155830
25478	NC_010610	GGT	2	6	1532987	1532992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155830
25479	NC_010610	CGT	2	6	1533013	1533018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155830
25480	NC_010610	ACC	2	6	1533024	1533029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155830
25481	NC_010610	GTTGC	2	10	1533068	1533077	0 %	40 %	40 %	20 %	184155830
25482	NC_010610	ATC	2	6	1533116	1533121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155830
25483	NC_010610	ACC	2	6	1533191	1533196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155830
25484	NC_010610	CGA	2	6	1533214	1533219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155830
25485	NC_010610	CTT	2	6	1533220	1533225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155830
25486	NC_010610	CTT	2	6	1533299	1533304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155830
25487	NC_010610	GCT	2	6	1533310	1533315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155830
25488	NC_010610	GTA	2	6	1533338	1533343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155830
25489	NC_010610	CCG	2	6	1533478	1533483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155830
25490	NC_010610	GTA	2	6	1533632	1533637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155830
25491	NC_010610	CTT	2	6	1533638	1533643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155830
25492	NC_010610	GGA	2	6	1534085	1534090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155831
25493	NC_010610	TGG	2	6	1534171	1534176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155831
25494	NC_010610	GCG	2	6	1534209	1534214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155831
25495	NC_010610	CACC	2	8	1534265	1534272	25 %	0 %	0 %	75 %	184155831
25496	NC_010610	ATC	2	6	1534305	1534310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155831
25497	NC_010610	TGG	2	6	1534327	1534332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155831
25498	NC_010610	CGGGC	2	10	1534353	1534362	0 %	0 %	60 %	40 %	184155831
25499	NC_010610	ACG	2	6	1534444	1534449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155831
25500	NC_010610	GTC	2	6	1534587	1534592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155831

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