MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22117	NC_010610	CGG	2	6	1355720	1355725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155653
22118	NC_010610	GCAA	2	8	1355778	1355785	50 %	0 %	25 %	25 %	184155653
22119	NC_010610	TGT	2	6	1355810	1355815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155653
22120	NC_010610	GCG	2	6	1355911	1355916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155653
22121	NC_010610	C	6	6	1355941	1355946	0 %	0 %	0 %	100 %	184155653
22122	NC_010610	AGG	2	6	1355995	1356000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155653
22123	NC_010610	ATC	2	6	1356001	1356006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155653
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22130	NC_010610	TGA	2	6	1356314	1356319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155653
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22144	NC_010610	GCT	2	6	1357047	1357052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155655
22145	NC_010610	GTC	2	6	1357084	1357089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155655
22146	NC_010610	GGT	2	6	1357155	1357160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155655
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22148	NC_010610	CGT	2	6	1357344	1357349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155655
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22152	NC_010610	ACC	2	6	1357630	1357635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155655
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22220	NC_010610	TTA	2	6	1361994	1361999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184155659
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22227	NC_010610	G	6	6	1362252	1362257	0 %	0 %	100 %	0 %	184155659
22228	NC_010610	ACC	2	6	1362283	1362288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155659
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22230	NC_010610	ACC	2	6	1362376	1362381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155659
22231	NC_010610	CGC	2	6	1362459	1362464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155659
22232	NC_010610	AAT	2	6	1362491	1362496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184155659
22233	NC_010610	GAA	2	6	1362497	1362502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155660
22234	NC_010610	CGG	2	6	1362538	1362543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155660
22235	NC_010610	TCT	2	6	1362573	1362578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155660
22236	NC_010610	GGC	2	6	1362619	1362624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155660
22237	NC_010610	CTA	2	6	1362634	1362639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155660
22238	NC_010610	ACC	3	9	1362686	1362694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155660
22239	NC_010610	CAA	3	9	1362709	1362717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155660
22240	NC_010610	CCG	2	6	1362811	1362816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
22241	NC_010610	GCG	2	6	1362860	1362865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155660
22242	NC_010610	G	6	6	1362902	1362907	0 %	0 %	100 %	0 %	184155660
22243	NC_010610	CAG	2	6	1362920	1362925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155660
22244	NC_010610	AAG	2	6	1362987	1362992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155660
22245	NC_010610	CTGG	2	8	1362994	1363001	0 %	25 %	50 %	25 %	184155660
22246	NC_010610	GCC	2	6	1363097	1363102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
22247	NC_010610	TAC	3	9	1363106	1363114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155660
22248	NC_010610	CTA	2	6	1363183	1363188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155660
22249	NC_010610	GCG	2	6	1363225	1363230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155660
22250	NC_010610	GCC	2	6	1363244	1363249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
22251	NC_010610	CCCAGG	2	12	1363272	1363283	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	184155660
22252	NC_010610	CGC	2	6	1363288	1363293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
22253	NC_010610	CCAC	2	8	1363326	1363333	25 %	0 %	0 %	75 %	184155660
22254	NC_010610	GGT	2	6	1363372	1363377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155660
22255	NC_010610	CCT	2	6	1363458	1363463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155660
22256	NC_010610	AAG	2	6	1363479	1363484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155660
22257	NC_010610	CGC	2	6	1363495	1363500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
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22259	NC_010610	TTCC	2	8	1363513	1363520	0 %	50 %	0 %	50 %	184155660
22260	NC_010610	CGT	2	6	1363549	1363554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155660
22261	NC_010610	GTG	2	6	1363610	1363615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155660
22262	NC_010610	ACCG	2	8	1363640	1363647	25 %	0 %	25 %	50 %	184155660
22263	NC_010610	TCC	2	6	1363649	1363654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155660
22264	NC_010610	GGCC	2	8	1363686	1363693	0 %	0 %	50 %	50 %	184155660
22265	NC_010610	CTA	2	6	1363717	1363722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155660
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22267	NC_010610	GCCG	2	8	1363840	1363847	0 %	0 %	50 %	50 %	184155660
22268	NC_010610	CGC	2	6	1363972	1363977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
22269	NC_010610	CGC	2	6	1363984	1363989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
22270	NC_010610	TAC	2	6	1364009	1364014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155660
22271	NC_010610	TAC	2	6	1364021	1364026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155660
22272	NC_010610	ACA	2	6	1364067	1364072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155660
22273	NC_010610	TCA	2	6	1364136	1364141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155660
22274	NC_010610	GCC	2	6	1364165	1364170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155660
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22280	NC_010610	GGC	2	6	1364362	1364367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155660
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22282	NC_010610	AGTTCT	2	12	1364564	1364575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184155660
22283	NC_010610	TTC	2	6	1364587	1364592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155660
22284	NC_010610	TCCAGT	2	12	1364612	1364623	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	184155660
22285	NC_010610	GAT	2	6	1364918	1364923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155661
22286	NC_010610	TCG	2	6	1364989	1364994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155661
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22289	NC_010610	AACC	2	8	1365112	1365119	50 %	0 %	0 %	50 %	184155661
22290	NC_010610	GTGACG	2	12	1365123	1365134	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184155661
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22292	NC_010610	ATC	2	6	1365186	1365191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155661
22293	NC_010610	ACC	2	6	1365207	1365212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155661
22294	NC_010610	GCG	2	6	1365214	1365219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155661
22295	NC_010610	TTCGT	2	10	1365222	1365231	0 %	60 %	20 %	20 %	184155661
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22300	NC_010610	GTA	2	6	1365491	1365496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155661
22301	NC_010610	GCGCT	2	10	1365552	1365561	0 %	20 %	40 %	40 %	184155661
22302	NC_010610	TCT	2	6	1365583	1365588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155661
22303	NC_010610	CGG	2	6	1365628	1365633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155661
22304	NC_010610	GCC	2	6	1365735	1365740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155661
22305	NC_010610	CGA	2	6	1365762	1365767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155661
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22308	NC_010610	ATC	2	6	1366042	1366047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155662
22309	NC_010610	GCC	2	6	1366051	1366056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155662
22310	NC_010610	CAA	2	6	1366089	1366094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155662
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22312	NC_010610	CGGC	2	8	1366131	1366138	0 %	0 %	50 %	50 %	184155662
22313	NC_010610	GACC	2	8	1366146	1366153	25 %	0 %	25 %	50 %	184155662
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22316	NC_010610	CAT	2	6	1366245	1366250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155662
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22318	NC_010610	CCA	2	6	1366371	1366376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155662
22319	NC_010610	ACT	2	6	1366406	1366411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155662
22320	NC_010610	CGA	2	6	1366436	1366441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155662
22321	NC_010610	GAC	2	6	1366447	1366452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155662
22322	NC_010610	CAA	2	6	1366590	1366595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155662
22323	NC_010610	CGG	2	6	1366613	1366618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155662
22324	NC_010610	GGC	2	6	1366626	1366631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155662
22325	NC_010610	GAC	2	6	1366635	1366640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155662
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22327	NC_010610	CCAAG	2	10	1366657	1366666	40 %	0 %	20 %	40 %	184155662
22328	NC_010610	GAG	2	6	1366758	1366763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155662
22329	NC_010610	TGG	2	6	1366769	1366774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155662
22330	NC_010610	AAC	2	6	1366805	1366810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155662
22331	NC_010610	TGA	2	6	1366854	1366859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155662
22332	NC_010610	GCT	2	6	1366876	1366881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155662
22333	NC_010610	GGC	2	6	1366884	1366889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155662
22334	NC_010610	TCTT	2	8	1367231	1367238	0 %	75 %	0 %	25 %	184155663
22335	NC_010610	CCG	2	6	1367299	1367304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155663
22336	NC_010610	TCA	2	6	1367344	1367349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155663
22337	NC_010610	TTA	2	6	1367394	1367399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184155663
22338	NC_010610	TCG	2	6	1367458	1367463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155663
22339	NC_010610	CGG	2	6	1367599	1367604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155663
22340	NC_010610	GAG	2	6	1367625	1367630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155663
22341	NC_010610	GGC	2	6	1367681	1367686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155663
22342	NC_010610	ACG	2	6	1367784	1367789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155663
22343	NC_010610	CCA	2	6	1367821	1367826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155663
22344	NC_010610	CGT	2	6	1367869	1367874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155663
22345	NC_010610	CTT	2	6	1367876	1367881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155663
22346	NC_010610	GGC	2	6	1367942	1367947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155663
22347	NC_010610	TGG	2	6	1367950	1367955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155663
22348	NC_010610	GAG	2	6	1368015	1368020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155663
22349	NC_010610	TCG	2	6	1368031	1368036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155663
22350	NC_010610	GAT	2	6	1368126	1368131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155663
22351	NC_010610	GTC	2	6	1368144	1368149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155663
22352	NC_010610	CGG	2	6	1368169	1368174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155663
22353	NC_010610	GAG	2	6	1368194	1368199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155663
22354	NC_010610	CGT	2	6	1368215	1368220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155663
22355	NC_010610	T	7	7	1368232	1368238	0 %	100 %	0 %	0 %	184155663
22356	NC_010610	T	6	6	1368364	1368369	0 %	100 %	0 %	0 %	184155664
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22361	NC_010610	CTT	2	6	1368558	1368563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155664
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22366	NC_010610	GGC	2	6	1368804	1368809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155664
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22372	NC_010610	TATT	2	8	1369154	1369161	25 %	75 %	0 %	0 %	184155665
22373	NC_010610	AAG	2	6	1369236	1369241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155665
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22375	NC_010610	ACC	2	6	1369382	1369387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155665
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22405	NC_010610	GTA	2	6	1370767	1370772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155666
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22462	NC_010610	TCT	2	6	1373294	1373299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155667
22463	NC_010610	CAGC	2	8	1373354	1373361	25 %	0 %	25 %	50 %	184155667
22464	NC_010610	AGG	2	6	1373380	1373385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184155667
22465	NC_010610	ATCG	2	8	1373514	1373521	25 %	25 %	25 %	25 %	184155667
22466	NC_010610	CCCG	2	8	1373545	1373552	0 %	0 %	25 %	75 %	184155667
22467	NC_010610	A	6	6	1373569	1373574	100 %	0 %	0 %	0 %	184155667
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22491	NC_010610	CGC	2	6	1374690	1374695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155668
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