MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 34533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_010610	CA	3	6	1162344	1162349	50 %	0 %	0 %	50 %	184155482
19002	NC_010610	GAACAA	2	12	1162351	1162362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	184155482
19003	NC_010610	CTC	2	6	1162363	1162368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155482
19004	NC_010610	ACCA	2	8	1162387	1162394	50 %	0 %	0 %	50 %	184155482
19005	NC_010610	CCGGTA	2	12	1162442	1162453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	184155482
19006	NC_010610	ACC	2	6	1162531	1162536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155482
19007	NC_010610	GCC	2	6	1162600	1162605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155482
19008	NC_010610	AAG	2	6	1162612	1162617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155482
19009	NC_010610	AGC	2	6	1162658	1162663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155482
19010	NC_010610	GTG	2	6	1162678	1162683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155482
19011	NC_010610	GGT	2	6	1162779	1162784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155482
19012	NC_010610	TCAC	2	8	1162856	1162863	25 %	25 %	0 %	50 %	184155482
19013	NC_010610	AAG	2	6	1162877	1162882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155482
19014	NC_010610	CCA	2	6	1162893	1162898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155482
19015	NC_010610	TTA	2	6	1162958	1162963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184155482
19016	NC_010610	CCG	2	6	1162973	1162978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155482
19017	NC_010610	CGG	2	6	1163054	1163059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155482
19018	NC_010610	ATC	3	9	1163260	1163268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155482
19019	NC_010610	GAC	2	6	1163356	1163361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155482
19020	NC_010610	CAG	2	6	1163372	1163377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155482
19021	NC_010610	ACCT	2	8	1163449	1163456	25 %	25 %	0 %	50 %	184155482
19022	NC_010610	CCA	2	6	1163492	1163497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155482
19023	NC_010610	ACC	2	6	1163537	1163542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155483
19024	NC_010610	CAT	2	6	1163583	1163588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155483
19025	NC_010610	CCT	2	6	1163634	1163639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155483
19026	NC_010610	CCGGG	2	10	1163661	1163670	0 %	0 %	60 %	40 %	184155483
19027	NC_010610	GCA	2	6	1163687	1163692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155483
19028	NC_010610	T	6	6	1163777	1163782	0 %	100 %	0 %	0 %	184155483
19029	NC_010610	ACG	2	6	1164383	1164388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155484
19030	NC_010610	GCC	2	6	1164446	1164451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155484
19031	NC_010610	TGG	2	6	1164462	1164467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155484
19032	NC_010610	GAT	2	6	1164514	1164519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155484
19033	NC_010610	ATC	2	6	1164623	1164628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155484
19034	NC_010610	AAT	2	6	1164637	1164642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184155484
19035	NC_010610	TTC	2	6	1164730	1164735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155484
19036	NC_010610	TCA	2	6	1164744	1164749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155485
19037	NC_010610	CTTT	2	8	1164752	1164759	0 %	75 %	0 %	25 %	184155485
19038	NC_010610	CTG	2	6	1164795	1164800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155485
19039	NC_010610	CTT	2	6	1164876	1164881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155485
19040	NC_010610	CGTT	2	8	1164883	1164890	0 %	50 %	25 %	25 %	184155485
19041	NC_010610	GCTT	2	8	1164903	1164910	0 %	50 %	25 %	25 %	184155485
19042	NC_010610	CCA	2	6	1164911	1164916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155485
19043	NC_010610	GCG	2	6	1164918	1164923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155485
19044	NC_010610	GTC	2	6	1164954	1164959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155485
19045	NC_010610	A	6	6	1164989	1164994	100 %	0 %	0 %	0 %	184155485
19046	NC_010610	TAGT	2	8	1165064	1165071	25 %	50 %	25 %	0 %	184155485
19047	NC_010610	TCCGGG	2	12	1165096	1165107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	184155485
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19049	NC_010610	GGT	2	6	1165128	1165133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155485
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19051	NC_010610	GTCG	2	8	1165191	1165198	0 %	25 %	50 %	25 %	184155485
19052	NC_010610	TTC	2	6	1165239	1165244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155485
19053	NC_010610	CCCG	2	8	1165770	1165777	0 %	0 %	25 %	75 %	184155486
19054	NC_010610	CCA	2	6	1165792	1165797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155486
19055	NC_010610	GGCGTT	2	12	1165925	1165936	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	184155486
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19059	NC_010610	CCGG	2	8	1166168	1166175	0 %	0 %	50 %	50 %	184155487
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19066	NC_010610	TGA	2	6	1166426	1166431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155487
19067	NC_010610	AG	3	6	1166444	1166449	50 %	0 %	50 %	0 %	184155487
19068	NC_010610	GTA	2	6	1166463	1166468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155487
19069	NC_010610	GAC	2	6	1166472	1166477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155487
19070	NC_010610	C	6	6	1166497	1166502	0 %	0 %	0 %	100 %	184155487
19071	NC_010610	ATC	2	6	1166512	1166517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155487
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19075	NC_010610	CCAA	2	8	1166767	1166774	50 %	0 %	0 %	50 %	184155487
19076	NC_010610	GAT	2	6	1166805	1166810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155487
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19116	NC_010610	TCG	2	6	1170872	1170877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155489
19117	NC_010610	GAT	2	6	1170952	1170957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184155489
19118	NC_010610	CTC	2	6	1171012	1171017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155489
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19123	NC_010610	GGGTG	2	10	1171509	1171518	0 %	20 %	80 %	0 %	184155489
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19216	NC_010610	TAAG	2	8	1178766	1178773	50 %	25 %	25 %	0 %	184155497
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19227	NC_010610	CGG	2	6	1179967	1179972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155498
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19230	NC_010610	GTGG	2	8	1180024	1180031	0 %	25 %	75 %	0 %	184155498
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19232	NC_010610	TCG	2	6	1180065	1180070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155498
19233	NC_010610	A	6	6	1180101	1180106	100 %	0 %	0 %	0 %	184155498
19234	NC_010610	TTC	2	6	1180116	1180121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184155498
19235	NC_010610	GTT	2	6	1180205	1180210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184155498
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19349	NC_010610	TTGC	2	8	1191273	1191280	0 %	50 %	25 %	25 %	184155503
19350	NC_010610	TGG	2	6	1191285	1191290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155503
19351	NC_010610	GGC	2	6	1191301	1191306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155503
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19465	NC_010610	GCC	2	6	1197256	1197261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155510
19466	NC_010610	CTGACC	2	12	1197274	1197285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	184155510
19467	NC_010610	TAC	2	6	1197358	1197363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155510
19468	NC_010610	TCG	2	6	1197383	1197388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155510
19469	NC_010610	CCT	2	6	1197402	1197407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155510
19470	NC_010610	AGC	2	6	1197464	1197469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155510
19471	NC_010610	CAA	2	6	1197787	1197792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155511
19472	NC_010610	CAC	2	6	1197804	1197809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155511
19473	NC_010610	GCGG	2	8	1197832	1197839	0 %	0 %	75 %	25 %	184155511
19474	NC_010610	CAG	2	6	1197868	1197873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155511
19475	NC_010610	GCC	2	6	1197946	1197951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155511
19476	NC_010610	AGC	2	6	1197956	1197961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155511
19477	NC_010610	CAG	2	6	1198000	1198005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155511
19478	NC_010610	CCG	2	6	1198012	1198017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155511
19479	NC_010610	GTC	2	6	1198048	1198053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155511
19480	NC_010610	TCA	2	6	1198058	1198063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155511
19481	NC_010610	T	6	6	1198065	1198070	0 %	100 %	0 %	0 %	184155511
19482	NC_010610	CGT	2	6	1198086	1198091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155511
19483	NC_010610	ATC	2	6	1198130	1198135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155511
19484	NC_010610	TCA	2	6	1198181	1198186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155511
19485	NC_010610	GGC	2	6	1198227	1198232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184155511
19486	NC_010610	TCA	2	6	1198236	1198241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155511
19487	NC_010610	CCA	2	6	1198265	1198270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155511
19488	NC_010610	GCC	2	6	1198317	1198322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155511
19489	NC_010610	CGT	2	6	1198356	1198361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184155511
19490	NC_010610	CAA	2	6	1198470	1198475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184155511
19491	NC_010610	ACC	2	6	1198502	1198507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155511
19492	NC_010610	CCA	2	6	1198524	1198529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184155511
19493	NC_010610	TCC	2	6	1198553	1198558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155511
19494	NC_010610	CCG	2	6	1198601	1198606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184155511
19495	NC_010610	TCC	2	6	1198636	1198641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184155511
19496	NC_010610	ACG	2	6	1198747	1198752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184155512
19497	NC_010610	CTA	2	6	1198766	1198771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184155512
19498	NC_010610	ATACG	2	10	1198811	1198820	40 %	20 %	20 %	20 %	184155512
19499	NC_010610	TGG	2	6	1198840	1198845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184155512
19500	NC_010610	GAA	2	6	1198875	1198880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184155512

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