MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 36814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010609	AAC	2	6	196024	196029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152809
3502	NC_010609	ATA	2	6	196147	196152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152809
3503	NC_010609	AGC	2	6	196378	196383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152810
3504	NC_010609	AAAT	2	8	196397	196404	75 %	25 %	0 %	0 %	184152810
3505	NC_010609	GCG	2	6	196409	196414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152810
3506	NC_010609	CTT	2	6	196416	196421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152810
3507	NC_010609	CAA	2	6	196428	196433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152810
3508	NC_010609	CAA	2	6	196509	196514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152810
3509	NC_010609	ATT	2	6	196528	196533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152810
3510	NC_010609	ATTGCC	2	12	196547	196558	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	184152810
3511	NC_010609	TAA	2	6	196569	196574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152810
3512	NC_010609	GGC	2	6	196585	196590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152810
3513	NC_010609	TAC	2	6	196650	196655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152810
3514	NC_010609	TTG	2	6	196674	196679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152810
3515	NC_010609	AAG	2	6	196682	196687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152810
3516	NC_010609	TCT	2	6	196742	196747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152810
3517	NC_010609	ATT	2	6	196789	196794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152810
3518	NC_010609	TTG	2	6	196918	196923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152810
3519	NC_010609	CCA	2	6	197024	197029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152810
3520	NC_010609	TAA	2	6	197031	197036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152810
3521	NC_010609	AT	3	6	197048	197053	50 %	50 %	0 %	0 %	184152810
3522	NC_010609	AATG	2	8	197319	197326	50 %	25 %	25 %	0 %	184152811
3523	NC_010609	TAA	2	6	197336	197341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152811
3524	NC_010609	ATT	2	6	197362	197367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152811
3525	NC_010609	AAT	2	6	197477	197482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152812
3526	NC_010609	CGA	2	6	197527	197532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152812
3527	NC_010609	A	6	6	197532	197537	100 %	0 %	0 %	0 %	184152812
3528	NC_010609	GTG	2	6	197614	197619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152812
3529	NC_010609	TGT	2	6	197644	197649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152812
3530	NC_010609	TTG	2	6	197665	197670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152812
3531	NC_010609	TAG	2	6	197728	197733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152812
3532	NC_010609	TGA	2	6	197819	197824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152812
3533	NC_010609	CAG	2	6	197871	197876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152812
3534	NC_010609	ATTG	2	8	197913	197920	25 %	50 %	25 %	0 %	184152812
3535	NC_010609	CAG	2	6	197938	197943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152812
3536	NC_010609	CTA	2	6	197962	197967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152812
3537	NC_010609	ATT	3	9	197990	197998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152812
3538	NC_010609	CTG	2	6	198025	198030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152812
3539	NC_010609	GCCAC	2	10	198068	198077	20 %	0 %	20 %	60 %	184152812
3540	NC_010609	GCT	2	6	198234	198239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152813
3541	NC_010609	CAT	2	6	198322	198327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152813
3542	NC_010609	AT	3	6	198348	198353	50 %	50 %	0 %	0 %	184152813
3543	NC_010609	GAC	2	6	198358	198363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152813
3544	NC_010609	CTT	2	6	198364	198369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152813
3545	NC_010609	ATA	2	6	198411	198416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152813
3546	NC_010609	GCA	2	6	198574	198579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152814
3547	NC_010609	GATT	2	8	198674	198681	25 %	50 %	25 %	0 %	184152814
3548	NC_010609	GAA	2	6	198824	198829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152814
3549	NC_010609	CAA	2	6	198851	198856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152814
3550	NC_010609	ATG	2	6	198937	198942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152814
3551	NC_010609	TAA	2	6	198947	198952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152814
3552	NC_010609	ATG	2	6	199090	199095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152814
3553	NC_010609	GCCAAG	2	12	199164	199175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152814
3554	NC_010609	GGAA	2	8	199176	199183	50 %	0 %	50 %	0 %	184152814
3555	NC_010609	CAT	2	6	199275	199280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152814
3556	NC_010609	AAG	2	6	199324	199329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152814
3557	NC_010609	CAGG	2	8	199354	199361	25 %	0 %	50 %	25 %	184152814
3558	NC_010609	GGT	2	6	199368	199373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152814
3559	NC_010609	GGC	2	6	199419	199424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152814
3560	NC_010609	TGG	2	6	199430	199435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152814
3561	NC_010609	TTG	2	6	199550	199555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152814
3562	NC_010609	CAA	2	6	199589	199594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152814
3563	NC_010609	ACAA	2	8	199599	199606	75 %	0 %	0 %	25 %	184152814
3564	NC_010609	GAA	2	6	199623	199628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152814
3565	NC_010609	TTG	2	6	199664	199669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152814
3566	NC_010609	AGAA	2	8	199713	199720	75 %	0 %	25 %	0 %	184152814
3567	NC_010609	CATTC	2	10	199761	199770	20 %	40 %	0 %	40 %	184152814
3568	NC_010609	AAAT	2	8	199829	199836	75 %	25 %	0 %	0 %	184152814
3569	NC_010609	ATA	2	6	199867	199872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152814
3570	NC_010609	T	6	6	199948	199953	0 %	100 %	0 %	0 %	184152814
3571	NC_010609	TAA	2	6	199961	199966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152814
3572	NC_010609	GTTT	2	8	201962	201969	0 %	75 %	25 %	0 %	184152815
3573	NC_010609	ACC	2	6	202023	202028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152815
3574	NC_010609	GTC	2	6	202101	202106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152815
3575	NC_010609	CCA	2	6	202223	202228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152815
3576	NC_010609	ATG	2	6	202251	202256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152815
3577	NC_010609	CGA	2	6	202301	202306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152815
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3579	NC_010609	ATT	2	6	202408	202413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152815
3580	NC_010609	CTT	3	9	202421	202429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152815
3581	NC_010609	GTC	2	6	202446	202451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152815
3582	NC_010609	ATT	2	6	202492	202497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152815
3583	NC_010609	TAC	2	6	202526	202531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152816
3584	NC_010609	GAT	2	6	202538	202543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152816
3585	NC_010609	TAA	3	9	202544	202552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152816
3586	NC_010609	GGC	2	6	202595	202600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152816
3587	NC_010609	ATG	2	6	202664	202669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152816
3588	NC_010609	GAAAA	2	10	202701	202710	80 %	0 %	20 %	0 %	184152816
3589	NC_010609	TAAA	2	8	202801	202808	75 %	25 %	0 %	0 %	184152816
3590	NC_010609	ATA	2	6	202809	202814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152816
3591	NC_010609	TAA	2	6	202817	202822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152816
3592	NC_010609	GCT	2	6	202881	202886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152816
3593	NC_010609	T	7	7	202897	202903	0 %	100 %	0 %	0 %	184152816
3594	NC_010609	TGC	2	6	203055	203060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152817
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3597	NC_010609	CGG	2	6	203234	203239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152817
3598	NC_010609	AGAA	2	8	203435	203442	75 %	0 %	25 %	0 %	184152817
3599	NC_010609	TGA	2	6	203477	203482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152817
3600	NC_010609	GTT	2	6	203524	203529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152817
3601	NC_010609	GAA	2	6	203587	203592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152817
3602	NC_010609	ATA	2	6	203687	203692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152817
3603	NC_010609	TCGG	2	8	203735	203742	0 %	25 %	50 %	25 %	184152817
3604	NC_010609	T	6	6	203763	203768	0 %	100 %	0 %	0 %	184152817
3605	NC_010609	ATT	2	6	203780	203785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152817
3606	NC_010609	A	6	6	203787	203792	100 %	0 %	0 %	0 %	184152817
3607	NC_010609	A	7	7	203807	203813	100 %	0 %	0 %	0 %	184152817
3608	NC_010609	TGG	2	6	204103	204108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152818
3609	NC_010609	GCC	2	6	204194	204199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152818
3610	NC_010609	TGA	2	6	204319	204324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152818
3611	NC_010609	TCAA	2	8	204334	204341	50 %	25 %	0 %	25 %	184152818
3612	NC_010609	AGG	2	6	204343	204348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152818
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3616	NC_010609	GCT	2	6	204410	204415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152818
3617	NC_010609	GATT	2	8	204442	204449	25 %	50 %	25 %	0 %	184152818
3618	NC_010609	CAA	2	6	204575	204580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152818
3619	NC_010609	TTGA	2	8	204617	204624	25 %	50 %	25 %	0 %	184152818
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3986	NC_010609	ACT	2	6	223348	223353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152836
3987	NC_010609	ATC	2	6	223365	223370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152836
3988	NC_010609	TTC	2	6	223416	223421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152836
3989	NC_010609	CGG	2	6	223424	223429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152836
3990	NC_010609	CTT	2	6	223469	223474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152836
3991	NC_010609	AGC	2	6	223500	223505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152836
3992	NC_010609	CCGA	2	8	223533	223540	25 %	0 %	25 %	50 %	184152836
3993	NC_010609	T	7	7	223640	223646	0 %	100 %	0 %	0 %	184152836
3994	NC_010609	CGG	2	6	223684	223689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152836
3995	NC_010609	TCA	2	6	223699	223704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152836
3996	NC_010609	AGT	2	6	223745	223750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152836
3997	NC_010609	ACTTCA	2	12	223756	223767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152836
3998	NC_010609	TTA	2	6	223790	223795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152836
3999	NC_010609	ATA	2	6	223831	223836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152836
4000	NC_010609	TGG	2	6	223861	223866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152837

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