MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010524	CGG	2	6	105816	105821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056792
3002	NC_010524	GGC	3	9	105826	105834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056792
3003	NC_010524	CGACGC	2	12	105911	105922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056793
3004	NC_010524	CCGC	2	8	105968	105975	0 %	0 %	25 %	75 %	171056793
3005	NC_010524	CGT	2	6	106007	106012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056793
3006	NC_010524	TGC	2	6	106064	106069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056793
3007	NC_010524	TCG	2	6	106096	106101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056793
3008	NC_010524	GCT	2	6	106166	106171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056793
3009	NC_010524	CGC	2	6	106172	106177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056793
3010	NC_010524	CGG	2	6	106337	106342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3011	NC_010524	CG	3	6	106363	106368	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3012	NC_010524	GCC	2	6	106388	106393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056794
3013	NC_010524	CAG	2	6	106400	106405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056794
3014	NC_010524	TGC	2	6	106408	106413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056794
3015	NC_010524	GGCG	2	8	106421	106428	0 %	0 %	75 %	25 %	171056794
3016	NC_010524	CG	3	6	106448	106453	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3017	NC_010524	CGA	2	6	106472	106477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056794
3018	NC_010524	GCG	2	6	106486	106491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3019	NC_010524	GGC	2	6	106502	106507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3020	NC_010524	CAC	2	6	106565	106570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056794
3021	NC_010524	GCGCCA	3	18	106582	106599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056794
3022	NC_010524	GGC	2	6	106610	106615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3023	NC_010524	AGT	2	6	106648	106653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056794
3024	NC_010524	GGTTGA	2	12	106657	106668	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	171056794
3025	NC_010524	GAC	2	6	106691	106696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056794
3026	NC_010524	CAG	2	6	106745	106750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056794
3027	NC_010524	CGGCG	2	10	106754	106763	0 %	0 %	60 %	40 %	171056794
3028	NC_010524	GC	3	6	106770	106775	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3029	NC_010524	TCG	2	6	106815	106820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056794
3030	NC_010524	GTT	2	6	106838	106843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056794
3031	NC_010524	CAC	2	6	106844	106849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056794
3032	NC_010524	CCA	2	6	106873	106878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056794
3033	NC_010524	CCG	2	6	106879	106884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056794
3034	NC_010524	GC	3	6	106891	106896	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3035	NC_010524	GGC	2	6	106901	106906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3036	NC_010524	GC	4	8	106951	106958	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3037	NC_010524	CGG	3	9	106963	106971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3038	NC_010524	TCGGCG	2	12	106977	106988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056794
3039	NC_010524	GGCG	2	8	107020	107027	0 %	0 %	75 %	25 %	171056794
3040	NC_010524	CG	3	6	107048	107053	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3041	NC_010524	GC	4	8	107063	107070	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3042	NC_010524	GCGG	2	8	107089	107096	0 %	0 %	75 %	25 %	171056794
3043	NC_010524	ACG	2	6	107100	107105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056794
3044	NC_010524	GCG	2	6	107118	107123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3045	NC_010524	CGAC	2	8	107286	107293	25 %	0 %	25 %	50 %	171056795
3046	NC_010524	GCGCAG	2	12	107315	107326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056795
3047	NC_010524	GCT	2	6	107377	107382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056795
3048	NC_010524	CGC	2	6	107392	107397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056795
3049	NC_010524	GGC	2	6	107414	107419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056795
3050	NC_010524	TGGCGC	2	12	107442	107453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056795
3051	NC_010524	TTA	2	6	107473	107478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171056795
3052	NC_010524	CG	3	6	107564	107569	0 %	0 %	50 %	50 %	171056795
3053	NC_010524	GC	3	6	107573	107578	0 %	0 %	50 %	50 %	171056795
3054	NC_010524	GCT	2	6	107659	107664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056795
3055	NC_010524	TCG	2	6	107700	107705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056795
3056	NC_010524	GC	3	6	107722	107727	0 %	0 %	50 %	50 %	171056795
3057	NC_010524	GGC	2	6	107749	107754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056795
3058	NC_010524	GTG	3	9	107816	107824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056795
3059	NC_010524	GCT	2	6	107833	107838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056795
3060	NC_010524	GCT	2	6	107857	107862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056795
3061	NC_010524	CCA	2	6	107875	107880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056795
3062	NC_010524	CGG	2	6	107916	107921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056795
3063	NC_010524	CCG	2	6	107922	107927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056795
3064	NC_010524	GCC	2	6	107971	107976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056795
3065	NC_010524	GGT	2	6	108004	108009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056795
3066	NC_010524	GC	3	6	108062	108067	0 %	0 %	50 %	50 %	171056795
3067	NC_010524	GCG	2	6	108071	108076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056795
3068	NC_010524	TTC	2	6	108077	108082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056795
3069	NC_010524	CG	3	6	108152	108157	0 %	0 %	50 %	50 %	171056795
3070	NC_010524	CCGACC	2	12	108165	108176	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171056795
3071	NC_010524	GGC	2	6	108238	108243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056795
3072	NC_010524	CCAG	2	8	108276	108283	25 %	0 %	25 %	50 %	171056795
3073	NC_010524	TGA	2	6	108294	108299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056795
3074	NC_010524	TCA	2	6	108363	108368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056795
3075	NC_010524	CGGC	2	8	108447	108454	0 %	0 %	50 %	50 %	171056795
3076	NC_010524	GCTG	2	8	108529	108536	0 %	25 %	50 %	25 %	171056796
3077	NC_010524	GGCT	2	8	108579	108586	0 %	25 %	50 %	25 %	171056796
3078	NC_010524	CTG	2	6	108675	108680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056796
3079	NC_010524	CG	5	10	108778	108787	0 %	0 %	50 %	50 %	171056797
3080	NC_010524	GCG	2	6	108805	108810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056797
3081	NC_010524	CGC	3	9	108822	108830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056797
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3083	NC_010524	GCG	3	9	108979	108987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056797
3084	NC_010524	CG	3	6	109022	109027	0 %	0 %	50 %	50 %	171056797
3085	NC_010524	CCA	2	6	109028	109033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056797
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3087	NC_010524	CAG	2	6	109089	109094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056797
3088	NC_010524	CGC	2	6	109095	109100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056797
3089	NC_010524	GTG	2	6	109147	109152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056797
3090	NC_010524	AGGC	2	8	109174	109181	25 %	0 %	50 %	25 %	171056797
3091	NC_010524	GCG	2	6	109213	109218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056797
3092	NC_010524	CAT	2	6	109230	109235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056797
3093	NC_010524	GGT	2	6	109262	109267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056797
3094	NC_010524	GC	3	6	109273	109278	0 %	0 %	50 %	50 %	171056797
3095	NC_010524	GCA	2	6	109310	109315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056797
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3097	NC_010524	CGC	2	6	109328	109333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056797
3098	NC_010524	GCA	2	6	109340	109345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056797
3099	NC_010524	CG	3	6	109382	109387	0 %	0 %	50 %	50 %	171056797
3100	NC_010524	GGC	2	6	109545	109550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056797
3101	NC_010524	TG	3	6	109571	109576	0 %	50 %	50 %	0 %	171056797
3102	NC_010524	GCCG	2	8	109586	109593	0 %	0 %	50 %	50 %	171056797
3103	NC_010524	TCG	2	6	109621	109626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056797
3104	NC_010524	GTCGC	2	10	109650	109659	0 %	20 %	40 %	40 %	171056797
3105	NC_010524	GTC	3	9	109665	109673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056797
3106	NC_010524	GC	3	6	109740	109745	0 %	0 %	50 %	50 %	171056797
3107	NC_010524	CGTG	2	8	109760	109767	0 %	25 %	50 %	25 %	171056797
3108	NC_010524	CGG	2	6	109814	109819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056797
3109	NC_010524	CCA	2	6	109820	109825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056797
3110	NC_010524	CAC	3	9	109845	109853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056797
3111	NC_010524	AGC	2	6	109882	109887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056797
3112	NC_010524	CGA	2	6	109907	109912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056797
3113	NC_010524	GCATC	2	10	109917	109926	20 %	20 %	20 %	40 %	171056797
3114	NC_010524	GCC	2	6	110043	110048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056798
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3116	NC_010524	GCC	2	6	110186	110191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056798
3117	NC_010524	CGA	2	6	110221	110226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056798
3118	NC_010524	GC	3	6	110228	110233	0 %	0 %	50 %	50 %	171056798
3119	NC_010524	CCG	2	6	110248	110253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056798
3120	NC_010524	GCT	2	6	110254	110259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056798
3121	NC_010524	CG	4	8	110269	110276	0 %	0 %	50 %	50 %	171056798
3122	NC_010524	GC	3	6	110326	110331	0 %	0 %	50 %	50 %	171056798
3123	NC_010524	GC	3	6	110371	110376	0 %	0 %	50 %	50 %	171056798
3124	NC_010524	CGGC	2	8	110389	110396	0 %	0 %	50 %	50 %	171056798
3125	NC_010524	CAC	2	6	110456	110461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056798
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3127	NC_010524	CGT	2	6	110500	110505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056798
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3129	NC_010524	TCA	2	6	110629	110634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056798
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3135	NC_010524	CG	3	6	110791	110796	0 %	0 %	50 %	50 %	171056799
3136	NC_010524	CAG	2	6	110804	110809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056799
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3152	NC_010524	GCC	2	6	111290	111295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056799
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3234	NC_010524	GCA	2	6	114271	114276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056801
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3240	NC_010524	ACC	2	6	114415	114420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056801
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3242	NC_010524	GCA	2	6	114494	114499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056801
3243	NC_010524	GCCG	2	8	114520	114527	0 %	0 %	50 %	50 %	171056801
3244	NC_010524	GCC	2	6	114558	114563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056801
3245	NC_010524	GCG	2	6	114568	114573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056801
3246	NC_010524	GCC	2	6	114580	114585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056801
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3253	NC_010524	TAG	2	6	114813	114818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056802
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3346	NC_010524	TCGA	2	8	117950	117957	25 %	25 %	25 %	25 %	171056804
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3350	NC_010524	TGC	2	6	118122	118127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056804
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3352	NC_010524	GGC	2	6	118182	118187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056804
3353	NC_010524	CGACC	2	10	118214	118223	20 %	0 %	20 %	60 %	171056804
3354	NC_010524	TCGG	2	8	118232	118239	0 %	25 %	50 %	25 %	171056804
3355	NC_010524	CGGG	2	8	118249	118256	0 %	0 %	75 %	25 %	171056804
3356	NC_010524	GGC	2	6	118270	118275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056804
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3358	NC_010524	GC	3	6	118295	118300	0 %	0 %	50 %	50 %	171056804
3359	NC_010524	GCC	2	6	118316	118321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056804
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3361	NC_010524	CGT	2	6	118389	118394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056804
3362	NC_010524	GC	3	6	118398	118403	0 %	0 %	50 %	50 %	171056804
3363	NC_010524	TCA	2	6	118413	118418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056805
3364	NC_010524	CGC	2	6	118428	118433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056805
3365	NC_010524	GC	3	6	118436	118441	0 %	0 %	50 %	50 %	171056805
3366	NC_010524	GCCG	2	8	118462	118469	0 %	0 %	50 %	50 %	171056805
3367	NC_010524	GCCG	2	8	118512	118519	0 %	0 %	50 %	50 %	171056805
3368	NC_010524	GTC	2	6	118543	118548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056805
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3370	NC_010524	GCG	2	6	118599	118604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056805
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3373	NC_010524	CCT	2	6	118768	118773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056806
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3386	NC_010524	GCT	3	9	119132	119140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056806
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3388	NC_010524	CGG	3	9	119186	119194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056806
3389	NC_010524	ACG	2	6	119293	119298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056806
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3393	NC_010524	AGGCC	2	10	119599	119608	20 %	0 %	40 %	40 %	171056807
3394	NC_010524	TTC	2	6	119616	119621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056807
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3396	NC_010524	GC	3	6	119632	119637	0 %	0 %	50 %	50 %	171056807
3397	NC_010524	CGG	2	6	119741	119746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056807
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3483	NC_010524	CGT	2	6	123074	123079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056810
3484	NC_010524	CGG	2	6	123113	123118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056810
3485	NC_010524	AGT	2	6	123152	123157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056810
3486	NC_010524	GCG	4	12	123211	123222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056810
3487	NC_010524	GC	3	6	123266	123271	0 %	0 %	50 %	50 %	171056810
3488	NC_010524	CGG	2	6	123299	123304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056810
3489	NC_010524	CG	4	8	123335	123342	0 %	0 %	50 %	50 %	171056810
3490	NC_010524	GCT	2	6	123353	123358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056810
3491	NC_010524	GGC	2	6	123360	123365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056810
3492	NC_010524	CTC	2	6	123369	123374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056810
3493	NC_010524	TCTCGG	2	12	123398	123409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056810
3494	NC_010524	GGC	2	6	123435	123440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056810
3495	NC_010524	CAG	2	6	123488	123493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056810
3496	NC_010524	CCG	2	6	123952	123957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056811
3497	NC_010524	CCG	2	6	124012	124017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056811
3498	NC_010524	CTG	2	6	124032	124037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056811
3499	NC_010524	CGGCG	2	10	124043	124052	0 %	0 %	60 %	40 %	171056811
3500	NC_010524	CG	3	6	124051	124056	0 %	0 %	50 %	50 %	171056811

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