MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_010524	GCG	2	6	791440	791445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057433
21003	NC_010524	GAT	3	9	791492	791500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057433
21004	NC_010524	GC	3	6	791509	791514	0 %	0 %	50 %	50 %	171057433
21005	NC_010524	GGCTTC	2	12	791541	791552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057433
21006	NC_010524	CGT	2	6	791645	791650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057433
21007	NC_010524	CA	3	6	791730	791735	50 %	0 %	0 %	50 %	171057433
21008	NC_010524	GTG	2	6	791763	791768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057433
21009	NC_010524	TGC	2	6	791839	791844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057433
21010	NC_010524	GCA	2	6	791855	791860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057433
21011	NC_010524	GC	3	6	791868	791873	0 %	0 %	50 %	50 %	171057433
21012	NC_010524	CGG	2	6	792222	792227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057434
21013	NC_010524	GTG	2	6	792228	792233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057434
21014	NC_010524	CGA	3	9	792275	792283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057434
21015	NC_010524	CCG	2	6	792298	792303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057434
21016	NC_010524	CGC	2	6	792320	792325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057434
21017	NC_010524	CAC	2	6	792329	792334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057434
21018	NC_010524	CGA	2	6	792338	792343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057434
21019	NC_010524	CTG	2	6	792345	792350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057434
21020	NC_010524	GGT	2	6	792365	792370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057434
21021	NC_010524	GC	3	6	792386	792391	0 %	0 %	50 %	50 %	171057434
21022	NC_010524	CGG	2	6	792425	792430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057434
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21024	NC_010524	GCC	2	6	792660	792665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057434
21025	NC_010524	CGC	2	6	792668	792673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057434
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21028	NC_010524	GGT	2	6	792740	792745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057434
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21033	NC_010524	GACC	2	8	792854	792861	25 %	0 %	25 %	50 %	171057434
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21036	NC_010524	GCT	2	6	793022	793027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057434
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21041	NC_010524	ACC	2	6	793120	793125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057434
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21043	NC_010524	TCA	2	6	793168	793173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057434
21044	NC_010524	TCG	2	6	793174	793179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057434
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21046	NC_010524	TGA	2	6	793198	793203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057434
21047	NC_010524	GCGG	2	8	793204	793211	0 %	0 %	75 %	25 %	171057434
21048	NC_010524	AAGG	2	8	793248	793255	50 %	0 %	50 %	0 %	171057434
21049	NC_010524	ACT	2	6	793306	793311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057434
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21052	NC_010524	CCG	2	6	793427	793432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057434
21053	NC_010524	CGA	2	6	793433	793438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057434
21054	NC_010524	GACC	2	8	793457	793464	25 %	0 %	25 %	50 %	171057434
21055	NC_010524	ACG	2	6	793474	793479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057434
21056	NC_010524	CCG	2	6	793486	793491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057434
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21058	NC_010524	TCGA	2	8	793542	793549	25 %	25 %	25 %	25 %	171057434
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21064	NC_010524	GGC	2	6	793716	793721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057434
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21067	NC_010524	GGC	2	6	793845	793850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057434
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21071	NC_010524	GGA	2	6	793961	793966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057434
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21075	NC_010524	GC	3	6	794097	794102	0 %	0 %	50 %	50 %	171057434
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21080	NC_010524	CGA	2	6	794324	794329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057434
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21087	NC_010524	AGA	2	6	794578	794583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057434
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21089	NC_010524	TGA	2	6	794668	794673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057434
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21092	NC_010524	GTGC	2	8	794727	794734	0 %	25 %	50 %	25 %	171057434
21093	NC_010524	GCG	3	9	794796	794804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057434
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21103	NC_010524	CGGCC	2	10	795191	795200	0 %	0 %	40 %	60 %	171057435
21104	NC_010524	GC	3	6	795203	795208	0 %	0 %	50 %	50 %	171057435
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21108	NC_010524	GCA	2	6	795293	795298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057435
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21358	NC_010524	CGG	2	6	803619	803624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057439
21359	NC_010524	GCT	2	6	803632	803637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057439
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21477	NC_010524	CG	3	6	808091	808096	0 %	0 %	50 %	50 %	171057440
21478	NC_010524	GCG	2	6	808125	808130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057440
21479	NC_010524	CG	3	6	808129	808134	0 %	0 %	50 %	50 %	171057440
21480	NC_010524	GTG	2	6	808227	808232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057440
21481	NC_010524	GGC	2	6	808235	808240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057440
21482	NC_010524	CAA	2	6	808280	808285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057440
21483	NC_010524	CGG	3	9	808357	808365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057440
21484	NC_010524	CGC	2	6	808430	808435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057440
21485	NC_010524	GCTG	2	8	808479	808486	0 %	25 %	50 %	25 %	171057440
21486	NC_010524	CAG	2	6	808508	808513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057440
21487	NC_010524	ACG	2	6	808531	808536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057440
21488	NC_010524	CGC	2	6	808537	808542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057440
21489	NC_010524	GC	4	8	808626	808633	0 %	0 %	50 %	50 %	171057440
21490	NC_010524	CAGCG	2	10	808644	808653	20 %	0 %	40 %	40 %	171057440
21491	NC_010524	GCAG	2	8	808696	808703	25 %	0 %	50 %	25 %	171057440
21492	NC_010524	GGC	2	6	808715	808720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057440
21493	NC_010524	GCG	2	6	808762	808767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057440
21494	NC_010524	CTG	2	6	808852	808857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057440
21495	NC_010524	TCT	2	6	809137	809142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057441
21496	NC_010524	TTG	2	6	809148	809153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057441
21497	NC_010524	TCT	2	6	809197	809202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057441
21498	NC_010524	ATG	2	6	809223	809228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057441
21499	NC_010524	CGC	2	6	809250	809255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057442
21500	NC_010524	GC	3	6	809254	809259	0 %	0 %	50 %	50 %	171057442

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