MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_010524	GCT	2	6	731667	731672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19502	NC_010524	TCA	2	6	731684	731689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057368
19503	NC_010524	GAC	2	6	731734	731739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19504	NC_010524	CTG	2	6	731749	731754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19505	NC_010524	ACG	2	6	731783	731788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19506	NC_010524	TCA	2	6	731795	731800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057368
19507	NC_010524	GAA	2	6	731803	731808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057368
19508	NC_010524	TGC	2	6	731839	731844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19509	NC_010524	GCT	2	6	731868	731873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19510	NC_010524	AGC	2	6	731890	731895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19511	NC_010524	CCA	2	6	731906	731911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057368
19512	NC_010524	GAG	2	6	731923	731928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057368
19513	NC_010524	ATCG	2	8	731929	731936	25 %	25 %	25 %	25 %	171057368
19514	NC_010524	AGC	2	6	731993	731998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19515	NC_010524	TGC	2	6	732171	732176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057369
19516	NC_010524	GCC	2	6	732215	732220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057369
19517	NC_010524	GGT	2	6	732235	732240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057369
19518	NC_010524	GCA	2	6	732262	732267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057369
19519	NC_010524	TTC	2	6	732287	732292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057369
19520	NC_010524	TGG	2	6	732297	732302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057369
19521	NC_010524	CGC	2	6	732328	732333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057369
19522	NC_010524	GATC	2	8	732367	732374	25 %	25 %	25 %	25 %	171057369
19523	NC_010524	GTG	2	6	732380	732385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057369
19524	NC_010524	GC	3	6	732390	732395	0 %	0 %	50 %	50 %	171057369
19525	NC_010524	TCA	2	6	732420	732425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057369
19526	NC_010524	GTG	2	6	732427	732432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057369
19527	NC_010524	TCG	2	6	732452	732457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057369
19528	NC_010524	CGG	2	6	732469	732474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057369
19529	NC_010524	TCG	2	6	732477	732482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057369
19530	NC_010524	GGT	2	6	732487	732492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057369
19531	NC_010524	ATCTTC	2	12	732545	732556	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	171057369
19532	NC_010524	GCTCG	2	10	732580	732589	0 %	20 %	40 %	40 %	171057369
19533	NC_010524	CTG	2	6	732590	732595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057369
19534	NC_010524	TGG	2	6	732597	732602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057369
19535	NC_010524	CGC	2	6	732630	732635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057369
19536	NC_010524	TCGA	2	8	732642	732649	25 %	25 %	25 %	25 %	171057369
19537	NC_010524	CGG	2	6	732656	732661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057369
19538	NC_010524	CGG	2	6	732675	732680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057369
19539	NC_010524	CGG	2	6	732700	732705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057369
19540	NC_010524	AGA	2	6	732717	732722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057369
19541	NC_010524	CAT	2	6	732730	732735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057369
19542	NC_010524	TGC	2	6	732741	732746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057369
19543	NC_010524	GCC	2	6	732784	732789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057369
19544	NC_010524	GATCTG	2	12	732799	732810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171057369
19545	NC_010524	CGG	2	6	732841	732846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057369
19546	NC_010524	GGC	2	6	732899	732904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057369
19547	NC_010524	CGG	2	6	732919	732924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057369
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19549	NC_010524	TCG	2	6	732996	733001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057369
19550	NC_010524	GC	3	6	733018	733023	0 %	0 %	50 %	50 %	171057369
19551	NC_010524	GCC	4	12	733100	733111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057369
19552	NC_010524	TGA	2	6	733136	733141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057369
19553	NC_010524	GC	4	8	733154	733161	0 %	0 %	50 %	50 %	171057370
19554	NC_010524	CCG	2	6	733244	733249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057370
19555	NC_010524	ACC	2	6	733282	733287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057370
19556	NC_010524	GCCG	2	8	733293	733300	0 %	0 %	50 %	50 %	171057370
19557	NC_010524	GC	3	6	733301	733306	0 %	0 %	50 %	50 %	171057370
19558	NC_010524	TCG	2	6	733345	733350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057370
19559	NC_010524	GCG	2	6	733372	733377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057370
19560	NC_010524	CGG	2	6	733385	733390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057370
19561	NC_010524	CCG	2	6	733402	733407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057370
19562	NC_010524	CAG	2	6	733416	733421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057370
19563	NC_010524	GTC	2	6	733434	733439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057370
19564	NC_010524	CAGC	2	8	733500	733507	25 %	0 %	25 %	50 %	171057370
19565	NC_010524	GCCA	2	8	733570	733577	25 %	0 %	25 %	50 %	171057370
19566	NC_010524	GCG	2	6	733611	733616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057371
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19569	NC_010524	GC	3	6	733725	733730	0 %	0 %	50 %	50 %	171057371
19570	NC_010524	GC	3	6	733838	733843	0 %	0 %	50 %	50 %	171057371
19571	NC_010524	CAG	2	6	733844	733849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057371
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19575	NC_010524	CGC	2	6	733981	733986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057371
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19577	NC_010524	CGT	2	6	734023	734028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057371
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19579	NC_010524	GCCGG	2	10	734141	734150	0 %	0 %	60 %	40 %	171057371
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19583	NC_010524	GCG	2	6	734427	734432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057372
19584	NC_010524	ACA	2	6	734441	734446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057372
19585	NC_010524	TCG	2	6	734447	734452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057372
19586	NC_010524	CCG	2	6	734469	734474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057372
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19591	NC_010524	GGCC	2	8	734735	734742	0 %	0 %	50 %	50 %	171057373
19592	NC_010524	GTG	2	6	734746	734751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057373
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19596	NC_010524	CGGCGA	2	12	735042	735053	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057373
19597	NC_010524	GTCG	2	8	735081	735088	0 %	25 %	50 %	25 %	171057373
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19600	NC_010524	TCG	2	6	735266	735271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057373
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19605	NC_010524	CGC	2	6	735633	735638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057374
19606	NC_010524	TGC	2	6	735653	735658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057374
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19610	NC_010524	GCC	3	9	735895	735903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057374
19611	NC_010524	CGG	2	6	735914	735919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057374
19612	NC_010524	TGC	2	6	735920	735925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057374
19613	NC_010524	GGC	2	6	735956	735961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057374
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19615	NC_010524	CGA	2	6	736044	736049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057374
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19977	NC_010524	GGC	2	6	748693	748698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057390
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19979	NC_010524	CGG	3	9	748780	748788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057390
19980	NC_010524	GAAT	2	8	748799	748806	50 %	25 %	25 %	0 %	171057390
19981	NC_010524	CGC	2	6	749258	749263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057391
19982	NC_010524	CGA	2	6	749277	749282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057391
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19985	NC_010524	GCC	2	6	749366	749371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057391
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19987	NC_010524	GCA	2	6	749466	749471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057391
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19999	NC_010524	CG	3	6	749981	749986	0 %	0 %	50 %	50 %	171057391
20000	NC_010524	CTG	2	6	750040	750045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057391

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