MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_010524	GCC	2	6	712890	712895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057348
19003	NC_010524	GCT	2	6	712911	712916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057348
19004	NC_010524	GCC	2	6	712917	712922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057348
19005	NC_010524	CCG	2	6	712991	712996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057348
19006	NC_010524	GAG	2	6	713017	713022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057348
19007	NC_010524	GCT	2	6	713073	713078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057348
19008	NC_010524	TGG	2	6	713186	713191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057348
19009	NC_010524	CGG	2	6	713193	713198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057348
19010	NC_010524	CAC	2	6	713226	713231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057348
19011	NC_010524	CGG	2	6	713259	713264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057348
19012	NC_010524	CGC	2	6	713265	713270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057348
19013	NC_010524	GC	3	6	713339	713344	0 %	0 %	50 %	50 %	171057349
19014	NC_010524	CTG	2	6	713349	713354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057349
19015	NC_010524	CCG	2	6	713386	713391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057349
19016	NC_010524	ACG	2	6	713419	713424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057349
19017	NC_010524	TGA	2	6	713428	713433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057349
19018	NC_010524	TGC	2	6	713443	713448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057349
19019	NC_010524	CG	3	6	713518	713523	0 %	0 %	50 %	50 %	171057349
19020	NC_010524	CG	3	6	713528	713533	0 %	0 %	50 %	50 %	171057349
19021	NC_010524	TGA	2	6	713581	713586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057349
19022	NC_010524	CGG	2	6	713594	713599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057349
19023	NC_010524	CGCC	2	8	713633	713640	0 %	0 %	25 %	75 %	171057349
19024	NC_010524	GC	3	6	713666	713671	0 %	0 %	50 %	50 %	171057349
19025	NC_010524	CGC	2	6	713764	713769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057350
19026	NC_010524	ACG	2	6	713789	713794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057350
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19028	NC_010524	TGG	2	6	713813	713818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057350
19029	NC_010524	AGG	2	6	713825	713830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057350
19030	NC_010524	CGGC	2	8	713873	713880	0 %	0 %	50 %	50 %	171057350
19031	NC_010524	ATC	2	6	713881	713886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057350
19032	NC_010524	CGA	2	6	713931	713936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057350
19033	NC_010524	CGG	2	6	713984	713989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057350
19034	NC_010524	ACT	2	6	714071	714076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057350
19035	NC_010524	GTG	2	6	714118	714123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057350
19036	NC_010524	GC	3	6	714187	714192	0 %	0 %	50 %	50 %	171057350
19037	NC_010524	GC	3	6	714195	714200	0 %	0 %	50 %	50 %	171057350
19038	NC_010524	GCG	2	6	714296	714301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057351
19039	NC_010524	ACG	2	6	714331	714336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057351
19040	NC_010524	CAGC	2	8	714344	714351	25 %	0 %	25 %	50 %	171057351
19041	NC_010524	ACG	2	6	714400	714405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057351
19042	NC_010524	GCCGC	2	10	714444	714453	0 %	0 %	40 %	60 %	171057351
19043	NC_010524	CAA	2	6	714455	714460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057351
19044	NC_010524	CGA	2	6	714464	714469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057351
19045	NC_010524	GGT	2	6	714470	714475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057351
19046	NC_010524	CGC	2	6	714494	714499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057351
19047	NC_010524	CG	3	6	714547	714552	0 %	0 %	50 %	50 %	171057351
19048	NC_010524	ACA	2	6	714610	714615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057351
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19051	NC_010524	CGGG	2	8	714668	714675	0 %	0 %	75 %	25 %	171057351
19052	NC_010524	CTT	2	6	714686	714691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057351
19053	NC_010524	ACG	2	6	714706	714711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057351
19054	NC_010524	GC	3	6	714718	714723	0 %	0 %	50 %	50 %	171057351
19055	NC_010524	CCAG	2	8	714754	714761	25 %	0 %	25 %	50 %	171057351
19056	NC_010524	GTG	2	6	714768	714773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057351
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19058	NC_010524	TGC	2	6	714781	714786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057351
19059	NC_010524	CTG	3	9	714831	714839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057351
19060	NC_010524	CGC	2	6	714864	714869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057351
19061	NC_010524	CGT	2	6	715028	715033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057352
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19068	NC_010524	GCT	2	6	715294	715299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057352
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19077	NC_010524	CCCG	2	8	715576	715583	0 %	0 %	25 %	75 %	171057352
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19087	NC_010524	GCCG	2	8	715836	715843	0 %	0 %	50 %	50 %	171057352
19088	NC_010524	GAA	2	6	715846	715851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057352
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19092	NC_010524	GCG	2	6	715897	715902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057352
19093	NC_010524	GC	3	6	715949	715954	0 %	0 %	50 %	50 %	171057352
19094	NC_010524	GCG	2	6	715992	715997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057352
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19099	NC_010524	CAG	2	6	716147	716152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057352
19100	NC_010524	GCTGA	2	10	716162	716171	20 %	20 %	40 %	20 %	171057352
19101	NC_010524	GCAC	2	8	716427	716434	25 %	0 %	25 %	50 %	171057353
19102	NC_010524	GC	3	6	716437	716442	0 %	0 %	50 %	50 %	171057353
19103	NC_010524	TGGCGC	2	12	716470	716481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057353
19104	NC_010524	GTC	2	6	716486	716491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057353
19105	NC_010524	CGG	2	6	716584	716589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057353
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19108	NC_010524	CGGCG	2	10	716753	716762	0 %	0 %	60 %	40 %	171057353
19109	NC_010524	TCG	3	9	716814	716822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057353
19110	NC_010524	CGG	2	6	716908	716913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057353
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19113	NC_010524	GCA	2	6	716953	716958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057353
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19115	NC_010524	CGT	2	6	717024	717029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057353
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19118	NC_010524	CGC	2	6	717314	717319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057354
19119	NC_010524	CGT	2	6	717350	717355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057354
19120	NC_010524	GC	3	6	717398	717403	0 %	0 %	50 %	50 %	171057354
19121	NC_010524	GCCGC	2	10	717448	717457	0 %	0 %	40 %	60 %	171057354
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19125	NC_010524	GC	3	6	717542	717547	0 %	0 %	50 %	50 %	171057354
19126	NC_010524	GCC	2	6	717552	717557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057354
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19236	NC_010524	GTC	2	6	722277	722282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057358
19237	NC_010524	GCA	2	6	722310	722315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057358
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19239	NC_010524	GCA	2	6	722367	722372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057358
19240	NC_010524	GGC	2	6	722407	722412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057358
19241	NC_010524	AGC	2	6	722429	722434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057358
19242	NC_010524	GC	4	8	722448	722455	0 %	0 %	50 %	50 %	171057358
19243	NC_010524	GC	3	6	722489	722494	0 %	0 %	50 %	50 %	171057358
19244	NC_010524	GGC	2	6	722502	722507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057358
19245	NC_010524	GC	3	6	722516	722521	0 %	0 %	50 %	50 %	171057358
19246	NC_010524	CGC	2	6	722541	722546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057358
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19250	NC_010524	GCGG	2	8	722605	722612	0 %	0 %	75 %	25 %	171057358
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19253	NC_010524	GACGA	2	10	722811	722820	40 %	0 %	40 %	20 %	171057359
19254	NC_010524	GCG	2	6	722829	722834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057359
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19271	NC_010524	CGA	2	6	723581	723586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057359
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19342	NC_010524	GATC	2	8	726340	726347	25 %	25 %	25 %	25 %	171057362
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19354	NC_010524	TGC	2	6	726585	726590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057362
19355	NC_010524	CGA	2	6	726595	726600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057362
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19473	NC_010524	CGA	2	6	730602	730607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057366
19474	NC_010524	CGA	2	6	730644	730649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057366
19475	NC_010524	CGC	2	6	730657	730662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057366
19476	NC_010524	GCG	2	6	730667	730672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057366
19477	NC_010524	CGG	2	6	730682	730687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057366
19478	NC_010524	AAG	2	6	730693	730698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057366
19479	NC_010524	CGC	3	9	730699	730707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057366
19480	NC_010524	GCCG	2	8	730716	730723	0 %	0 %	50 %	50 %	171057366
19481	NC_010524	GC	3	6	730904	730909	0 %	0 %	50 %	50 %	171057367
19482	NC_010524	GCT	2	6	730914	730919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057367
19483	NC_010524	GTG	2	6	730967	730972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057367
19484	NC_010524	TGC	2	6	731016	731021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057367
19485	NC_010524	GC	4	8	731020	731027	0 %	0 %	50 %	50 %	171057367
19486	NC_010524	CGCGC	2	10	731074	731083	0 %	0 %	40 %	60 %	171057367
19487	NC_010524	CTG	2	6	731099	731104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057367
19488	NC_010524	GTG	2	6	731117	731122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057367
19489	NC_010524	TGC	2	6	731178	731183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057367
19490	NC_010524	CTG	3	9	731210	731218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057367
19491	NC_010524	CGGCC	2	10	731227	731236	0 %	0 %	40 %	60 %	171057367
19492	NC_010524	CTGC	2	8	731242	731249	0 %	25 %	25 %	50 %	171057367
19493	NC_010524	GCCTG	2	10	731277	731286	0 %	20 %	40 %	40 %	171057367
19494	NC_010524	GCT	2	6	731481	731486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057368
19495	NC_010524	CG	3	6	731489	731494	0 %	0 %	50 %	50 %	171057368
19496	NC_010524	TTC	2	6	731503	731508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057368
19497	NC_010524	GGCCA	2	10	731527	731536	20 %	0 %	40 %	40 %	171057368
19498	NC_010524	CGATC	2	10	731583	731592	20 %	20 %	20 %	40 %	171057368
19499	NC_010524	CGC	2	6	731607	731612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057368
19500	NC_010524	CCG	2	6	731651	731656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057368

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