MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_010524	CAG	2	6	691608	691613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18502	NC_010524	GCA	2	6	691634	691639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18503	NC_010524	GCCA	2	8	691647	691654	25 %	0 %	25 %	50 %	171057331
18504	NC_010524	TCT	2	6	691661	691666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057331
18505	NC_010524	T	6	6	691727	691732	0 %	100 %	0 %	0 %	171057331
18506	NC_010524	TGAA	2	8	691759	691766	50 %	25 %	25 %	0 %	171057331
18507	NC_010524	GAA	3	9	691764	691772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057331
18508	NC_010524	TGG	2	6	691774	691779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057331
18509	NC_010524	CGA	2	6	691841	691846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18510	NC_010524	GAA	2	6	691850	691855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057331
18511	NC_010524	CGT	2	6	691856	691861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18512	NC_010524	TCA	2	6	691868	691873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057331
18513	NC_010524	CGA	2	6	691952	691957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18514	NC_010524	CAAG	2	8	692035	692042	50 %	0 %	25 %	25 %	171057332
18515	NC_010524	GTCG	2	8	692093	692100	0 %	25 %	50 %	25 %	171057332
18516	NC_010524	TGC	2	6	692139	692144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18517	NC_010524	TCT	2	6	692147	692152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057332
18518	NC_010524	TGC	2	6	692163	692168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18519	NC_010524	TGA	2	6	692258	692263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057332
18520	NC_010524	GACCTT	2	12	692280	692291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171057332
18521	NC_010524	TGC	2	6	692361	692366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18522	NC_010524	TCCGGG	2	12	692412	692423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057332
18523	NC_010524	GAT	2	6	692499	692504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057332
18524	NC_010524	CGG	2	6	692570	692575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057332
18525	NC_010524	CGT	2	6	692583	692588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18526	NC_010524	CTG	2	6	692636	692641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18527	NC_010524	GCAG	2	8	692643	692650	25 %	0 %	50 %	25 %	171057332
18528	NC_010524	CCA	2	6	692659	692664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057332
18529	NC_010524	GCA	2	6	692708	692713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18530	NC_010524	GT	3	6	692757	692762	0 %	50 %	50 %	0 %	171057332
18531	NC_010524	AGGTC	2	10	692771	692780	20 %	20 %	40 %	20 %	171057332
18532	NC_010524	GCCA	2	8	692794	692801	25 %	0 %	25 %	50 %	171057332
18533	NC_010524	ATCG	2	8	692881	692888	25 %	25 %	25 %	25 %	171057332
18534	NC_010524	GCTC	2	8	692980	692987	0 %	25 %	25 %	50 %	171057332
18535	NC_010524	CTG	2	6	693023	693028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18536	NC_010524	CGA	2	6	693056	693061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18537	NC_010524	TTGA	2	8	693075	693082	25 %	50 %	25 %	0 %	171057332
18538	NC_010524	CGA	2	6	693116	693121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057332
18539	NC_010524	ATG	2	6	693181	693186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057332
18540	NC_010524	GATT	2	8	693202	693209	25 %	50 %	25 %	0 %	171057332
18541	NC_010524	ATG	2	6	693211	693216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057332
18542	NC_010524	ATG	2	6	693243	693248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057333
18543	NC_010524	GTC	2	6	693314	693319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
18544	NC_010524	GC	3	6	693329	693334	0 %	0 %	50 %	50 %	171057333
18545	NC_010524	ACGA	2	8	693338	693345	50 %	0 %	25 %	25 %	171057333
18546	NC_010524	CCAA	2	8	693363	693370	50 %	0 %	0 %	50 %	171057333
18547	NC_010524	GCCG	2	8	693380	693387	0 %	0 %	50 %	50 %	171057333
18548	NC_010524	CTT	2	6	693451	693456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057333
18549	NC_010524	GAT	2	6	693482	693487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057333
18550	NC_010524	CGC	2	6	693570	693575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057333
18551	NC_010524	TCT	2	6	693633	693638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057333
18552	NC_010524	TGCAT	2	10	693653	693662	20 %	40 %	20 %	20 %	171057333
18553	NC_010524	GAA	2	6	693726	693731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057333
18554	NC_010524	AGGAA	2	10	693735	693744	60 %	0 %	40 %	0 %	171057333
18555	NC_010524	TC	3	6	693757	693762	0 %	50 %	0 %	50 %	171057333
18556	NC_010524	CGT	2	6	693775	693780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
18557	NC_010524	AGG	2	6	693867	693872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057333
18558	NC_010524	CCT	2	6	693940	693945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057333
18559	NC_010524	TCTG	2	8	694006	694013	0 %	50 %	25 %	25 %	171057333
18560	NC_010524	AGC	2	6	694019	694024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057333
18561	NC_010524	CGT	2	6	694043	694048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
18562	NC_010524	GTC	2	6	694085	694090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
18563	NC_010524	TCA	2	6	694153	694158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057333
18564	NC_010524	GCA	2	6	694195	694200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057333
18565	NC_010524	TGCTG	2	10	694221	694230	0 %	40 %	40 %	20 %	171057333
18566	NC_010524	CTG	2	6	694262	694267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057333
18567	NC_010524	CGT	2	6	694450	694455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18568	NC_010524	TACA	2	8	694483	694490	50 %	25 %	0 %	25 %	171057334
18569	NC_010524	GTT	2	6	694752	694757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057334
18570	NC_010524	CCT	2	6	694842	694847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057334
18571	NC_010524	CTG	2	6	694857	694862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18572	NC_010524	CCTGCG	2	12	694863	694874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057334
18573	NC_010524	TGAC	2	8	694880	694887	25 %	25 %	25 %	25 %	171057334
18574	NC_010524	GCT	2	6	694889	694894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18575	NC_010524	A	6	6	694993	694998	100 %	0 %	0 %	0 %	171057334
18576	NC_010524	TCG	2	6	695054	695059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18577	NC_010524	GCA	2	6	695081	695086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18578	NC_010524	GATCGT	2	12	695094	695105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171057334
18579	NC_010524	CGA	2	6	695235	695240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057334
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18581	NC_010524	CCGC	2	8	695321	695328	0 %	0 %	25 %	75 %	171057334
18582	NC_010524	TAG	2	6	695335	695340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057334
18583	NC_010524	TGT	2	6	695360	695365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057334
18584	NC_010524	TGC	2	6	695366	695371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18585	NC_010524	GTA	2	6	695376	695381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057334
18586	NC_010524	GGTC	2	8	695401	695408	0 %	25 %	50 %	25 %	171057334
18587	NC_010524	CAAC	2	8	695438	695445	50 %	0 %	0 %	50 %	171057334
18588	NC_010524	CGA	3	9	695457	695465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18589	NC_010524	CGT	2	6	695477	695482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057334
18590	NC_010524	CTC	2	6	695515	695520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057334
18591	NC_010524	CTGT	2	8	695568	695575	0 %	50 %	25 %	25 %	171057334
18592	NC_010524	ATG	2	6	695591	695596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057334
18593	NC_010524	A	6	6	695645	695650	100 %	0 %	0 %	0 %	171057335
18594	NC_010524	CAT	2	6	695739	695744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057335
18595	NC_010524	CCAG	2	8	696064	696071	25 %	0 %	25 %	50 %	171057336
18596	NC_010524	GCA	2	6	696280	696285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057336
18597	NC_010524	CGG	2	6	696286	696291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057336
18598	NC_010524	GCG	2	6	696298	696303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057336
18599	NC_010524	GC	3	6	696335	696340	0 %	0 %	50 %	50 %	171057336
18600	NC_010524	GCGCG	2	10	696349	696358	0 %	0 %	60 %	40 %	171057336
18601	NC_010524	GCA	3	9	696367	696375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057336
18602	NC_010524	TCG	2	6	696420	696425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057336
18603	NC_010524	CGT	2	6	696472	696477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057336
18604	NC_010524	CTG	2	6	696515	696520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057336
18605	NC_010524	CGT	2	6	696541	696546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057336
18606	NC_010524	CAG	2	6	696605	696610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057336
18607	NC_010524	TGG	2	6	696657	696662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057336
18608	NC_010524	CG	3	6	696682	696687	0 %	0 %	50 %	50 %	171057336
18609	NC_010524	GGT	2	6	696725	696730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057336
18610	NC_010524	TCG	2	6	696747	696752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057336
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18612	NC_010524	GTG	2	6	696813	696818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057336
18613	NC_010524	GCCGAC	2	12	696824	696835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057336
18614	NC_010524	GCC	2	6	696857	696862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057336
18615	NC_010524	GCA	2	6	696901	696906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057336
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18975	NC_010524	GCA	2	6	711724	711729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057346
18976	NC_010524	CGC	2	6	711775	711780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057346
18977	NC_010524	CGC	2	6	711794	711799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057346
18978	NC_010524	ACC	2	6	711834	711839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057346
18979	NC_010524	CTG	2	6	711843	711848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057346
18980	NC_010524	CGG	2	6	711910	711915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057346
18981	NC_010524	CGCAA	2	10	711949	711958	40 %	0 %	20 %	40 %	171057346
18982	NC_010524	GGCT	2	8	711984	711991	0 %	25 %	50 %	25 %	171057346
18983	NC_010524	ATC	2	6	712053	712058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057347
18984	NC_010524	ACC	2	6	712086	712091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057347
18985	NC_010524	ACC	2	6	712173	712178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057347
18986	NC_010524	GAT	2	6	712196	712201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057347
18987	NC_010524	TGC	3	9	712303	712311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057347
18988	NC_010524	ACA	2	6	712315	712320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057347
18989	NC_010524	ACGCC	2	10	712423	712432	20 %	0 %	20 %	60 %	171057347
18990	NC_010524	CGA	2	6	712439	712444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057347
18991	NC_010524	CGCC	2	8	712499	712506	0 %	0 %	25 %	75 %	171057347
18992	NC_010524	CGA	2	6	712511	712516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057347
18993	NC_010524	GTC	2	6	712520	712525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057347
18994	NC_010524	GCT	3	9	712538	712546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057347
18995	NC_010524	TCGA	2	8	712548	712555	25 %	25 %	25 %	25 %	171057347
18996	NC_010524	ACT	2	6	712661	712666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057348
18997	NC_010524	CTA	2	6	712692	712697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057348
18998	NC_010524	GC	3	6	712726	712731	0 %	0 %	50 %	50 %	171057348
18999	NC_010524	AGC	2	6	712757	712762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057348
19000	NC_010524	CGC	2	6	712766	712771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057348

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