MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_010524	GGT	2	6	667733	667738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057310
18003	NC_010524	CAC	2	6	667739	667744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057310
18004	NC_010524	GCA	2	6	667750	667755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057310
18005	NC_010524	TGA	2	6	667798	667803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057310
18006	NC_010524	CGG	2	6	667913	667918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057310
18007	NC_010524	ACA	2	6	667936	667941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057310
18008	NC_010524	CGG	2	6	667943	667948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057310
18009	NC_010524	CGC	2	6	668018	668023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057310
18010	NC_010524	ATC	2	6	668179	668184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057310
18011	NC_010524	GTG	2	6	668209	668214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057310
18012	NC_010524	GC	4	8	668429	668436	0 %	0 %	50 %	50 %	171057311
18013	NC_010524	CGC	2	6	668459	668464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057311
18014	NC_010524	GAGC	2	8	668492	668499	25 %	0 %	50 %	25 %	171057311
18015	NC_010524	CG	3	6	668507	668512	0 %	0 %	50 %	50 %	171057311
18016	NC_010524	CCA	2	6	668524	668529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057311
18017	NC_010524	TGC	2	6	668575	668580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057311
18018	NC_010524	CGC	2	6	668636	668641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057311
18019	NC_010524	CGC	2	6	668647	668652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057311
18020	NC_010524	GCG	2	6	668688	668693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057311
18021	NC_010524	GCC	2	6	668710	668715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057311
18022	NC_010524	GGC	2	6	668754	668759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057311
18023	NC_010524	TGC	2	6	668776	668781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057311
18024	NC_010524	GCGAGC	2	12	668791	668802	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057311
18025	NC_010524	CGA	2	6	668816	668821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057311
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18027	NC_010524	TGC	2	6	668875	668880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057311
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18029	NC_010524	CGG	2	6	668930	668935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057311
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18031	NC_010524	CGAC	2	8	669007	669014	25 %	0 %	25 %	50 %	171057311
18032	NC_010524	CGC	2	6	669017	669022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057311
18033	NC_010524	CAG	2	6	669029	669034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057311
18034	NC_010524	GCAGC	2	10	669048	669057	20 %	0 %	40 %	40 %	171057311
18035	NC_010524	GCA	2	6	669092	669097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057311
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18038	NC_010524	CTG	2	6	669351	669356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057312
18039	NC_010524	CGC	2	6	669364	669369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057312
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18041	NC_010524	CAGCC	2	10	669441	669450	20 %	0 %	20 %	60 %	171057312
18042	NC_010524	TCG	2	6	669490	669495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057312
18043	NC_010524	GCG	2	6	669496	669501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057312
18044	NC_010524	GC	3	6	669508	669513	0 %	0 %	50 %	50 %	171057312
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18047	NC_010524	TGC	2	6	669569	669574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057312
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18049	NC_010524	CGC	2	6	669752	669757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057312
18050	NC_010524	CCAGC	2	10	669764	669773	20 %	0 %	20 %	60 %	171057312
18051	NC_010524	CG	3	6	669775	669780	0 %	0 %	50 %	50 %	171057312
18052	NC_010524	CGC	2	6	669806	669811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057312
18053	NC_010524	TGA	2	6	670048	670053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057312
18054	NC_010524	GC	3	6	670067	670072	0 %	0 %	50 %	50 %	171057312
18055	NC_010524	CAT	2	6	670107	670112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057313
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18060	NC_010524	TGC	2	6	670271	670276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057313
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18110	NC_010524	TCGGC	2	10	672698	672707	0 %	20 %	40 %	40 %	171057315
18111	NC_010524	GC	3	6	672786	672791	0 %	0 %	50 %	50 %	171057315
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18119	NC_010524	GCA	2	6	672971	672976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057315
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18123	NC_010524	CGGC	2	8	673116	673123	0 %	0 %	50 %	50 %	171057315
18124	NC_010524	TGC	2	6	673193	673198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057315
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18231	NC_010524	CGA	2	6	678424	678429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
18232	NC_010524	CCA	3	9	678493	678501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057323
18233	NC_010524	TCG	2	6	678544	678549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057323
18234	NC_010524	TGCC	2	8	678559	678566	0 %	25 %	25 %	50 %	171057323
18235	NC_010524	TGG	2	6	678595	678600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
18236	NC_010524	CGACGT	2	12	678653	678664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057323
18237	NC_010524	CAG	2	6	678694	678699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
18238	NC_010524	CGACAG	2	12	678737	678748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
18239	NC_010524	CGGC	2	8	678760	678767	0 %	0 %	50 %	50 %	171057323
18240	NC_010524	CAA	2	6	678797	678802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057323
18241	NC_010524	TCA	2	6	678865	678870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057323
18242	NC_010524	CGT	2	6	678887	678892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057323
18243	NC_010524	ACG	2	6	678904	678909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
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18245	NC_010524	GGT	2	6	678929	678934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
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18249	NC_010524	TGG	2	6	679132	679137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
18250	NC_010524	GTG	2	6	679207	679212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057323
18251	NC_010524	CGC	2	6	679255	679260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057323
18252	NC_010524	GGC	2	6	679320	679325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
18253	NC_010524	CGG	2	6	679349	679354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057323
18254	NC_010524	GAC	2	6	679362	679367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057323
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18267	NC_010524	CAA	2	6	679904	679909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057323
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18272	NC_010524	GGGC	2	8	680200	680207	0 %	0 %	75 %	25 %	171057323
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18348	NC_010524	GC	4	8	684530	684537	0 %	0 %	50 %	50 %	171057325
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18351	NC_010524	ACG	2	6	684782	684787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057325
18352	NC_010524	TCGA	2	8	684815	684822	25 %	25 %	25 %	25 %	171057325
18353	NC_010524	GCC	2	6	684884	684889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057325
18354	NC_010524	TGCG	2	8	684893	684900	0 %	25 %	50 %	25 %	171057325
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18356	NC_010524	TGC	2	6	685065	685070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057325
18357	NC_010524	CA	3	6	685075	685080	50 %	0 %	0 %	50 %	171057325
18358	NC_010524	CAC	2	6	685150	685155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057325
18359	NC_010524	CG	3	6	685173	685178	0 %	0 %	50 %	50 %	171057325
18360	NC_010524	AG	3	6	685258	685263	50 %	0 %	50 %	0 %	171057326
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18369	NC_010524	AACG	2	8	685719	685726	50 %	0 %	25 %	25 %	171057326
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18373	NC_010524	TGA	2	6	685907	685912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057326
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18385	NC_010524	GCCT	2	8	686283	686290	0 %	25 %	25 %	50 %	171057326
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18475	NC_010524	CAGGG	2	10	690353	690362	20 %	0 %	60 %	20 %	171057330
18476	NC_010524	CGA	2	6	690444	690449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057330
18477	NC_010524	GTTC	2	8	690483	690490	0 %	50 %	25 %	25 %	171057330
18478	NC_010524	TCG	2	6	690522	690527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057330
18479	NC_010524	CGC	2	6	690528	690533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057330
18480	NC_010524	GTC	2	6	690586	690591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057330
18481	NC_010524	ACC	2	6	690610	690615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057330
18482	NC_010524	CCA	2	6	690618	690623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057330
18483	NC_010524	GATGCG	2	12	690655	690666	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057330
18484	NC_010524	GTC	2	6	690685	690690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057330
18485	NC_010524	GT	3	6	690822	690827	0 %	50 %	50 %	0 %	171057331
18486	NC_010524	TGC	2	6	690836	690841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18487	NC_010524	GAT	2	6	690882	690887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057331
18488	NC_010524	ACG	2	6	690983	690988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18489	NC_010524	ATG	2	6	691036	691041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057331
18490	NC_010524	TGC	2	6	691148	691153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18491	NC_010524	TCG	2	6	691183	691188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18492	NC_010524	GCA	2	6	691258	691263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18493	NC_010524	CAT	2	6	691271	691276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057331
18494	NC_010524	ATT	2	6	691278	691283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171057331
18495	NC_010524	CTG	2	6	691292	691297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057331
18496	NC_010524	CCA	2	6	691304	691309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057331
18497	NC_010524	GGT	3	9	691352	691360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057331
18498	NC_010524	CGC	2	6	691436	691441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057331
18499	NC_010524	TCT	2	6	691526	691531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057331
18500	NC_010524	AGC	2	6	691579	691584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057331

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