MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_010524	GAT	2	6	629255	629260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057271
17002	NC_010524	GCA	2	6	629263	629268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057271
17003	NC_010524	GCC	2	6	629282	629287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057271
17004	NC_010524	TCA	2	6	629308	629313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057271
17005	NC_010524	GCCGC	2	10	629327	629336	0 %	0 %	40 %	60 %	171057271
17006	NC_010524	GC	3	6	629357	629362	0 %	0 %	50 %	50 %	171057271
17007	NC_010524	CGG	2	6	629368	629373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057271
17008	NC_010524	CTC	2	6	629387	629392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057271
17009	NC_010524	GCC	2	6	629393	629398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057271
17010	NC_010524	CGA	2	6	629416	629421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057271
17011	NC_010524	GTC	3	9	629432	629440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057271
17012	NC_010524	CAG	2	6	629465	629470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057271
17013	NC_010524	GCG	2	6	629502	629507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057271
17014	NC_010524	GC	4	8	629517	629524	0 %	0 %	50 %	50 %	171057271
17015	NC_010524	TCG	2	6	629544	629549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057271
17016	NC_010524	GC	3	6	629560	629565	0 %	0 %	50 %	50 %	171057271
17017	NC_010524	GCT	2	6	629584	629589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057271
17018	NC_010524	CCA	2	6	629608	629613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057271
17019	NC_010524	CG	3	6	629625	629630	0 %	0 %	50 %	50 %	171057271
17020	NC_010524	GCG	2	6	629691	629696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057271
17021	NC_010524	GGC	2	6	629722	629727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057271
17022	NC_010524	GCT	2	6	629731	629736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057271
17023	NC_010524	GCCG	2	8	629863	629870	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17024	NC_010524	CGG	2	6	629885	629890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057272
17025	NC_010524	CGC	2	6	629895	629900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057272
17026	NC_010524	ACC	2	6	629918	629923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057272
17027	NC_010524	CGG	2	6	629925	629930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057272
17028	NC_010524	GC	4	8	629934	629941	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17029	NC_010524	TGC	2	6	629942	629947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17030	NC_010524	GC	3	6	629973	629978	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17031	NC_010524	GCA	2	6	629982	629987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17032	NC_010524	TCT	2	6	629988	629993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057272
17033	NC_010524	TCG	2	6	630026	630031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17034	NC_010524	CAG	2	6	630049	630054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17035	NC_010524	GC	4	8	630062	630069	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17036	NC_010524	GGCCTG	2	12	630094	630105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057272
17037	NC_010524	GAT	2	6	630175	630180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057272
17038	NC_010524	GTC	2	6	630244	630249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17039	NC_010524	CGT	2	6	630267	630272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17040	NC_010524	CGG	2	6	630338	630343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057272
17041	NC_010524	CG	3	6	630355	630360	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17042	NC_010524	CGA	2	6	630543	630548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17043	NC_010524	CCA	2	6	630558	630563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057272
17044	NC_010524	ATC	2	6	630569	630574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057272
17045	NC_010524	CGA	2	6	630585	630590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057272
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17047	NC_010524	GCC	2	6	630650	630655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057272
17048	NC_010524	GC	3	6	630669	630674	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17049	NC_010524	CGT	2	6	630739	630744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17050	NC_010524	CGG	2	6	630756	630761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057272
17051	NC_010524	TCGAG	2	10	630822	630831	20 %	20 %	40 %	20 %	171057272
17052	NC_010524	GC	3	6	630856	630861	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17053	NC_010524	GGC	2	6	630891	630896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057272
17054	NC_010524	GTC	2	6	630901	630906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057272
17055	NC_010524	CCG	2	6	630917	630922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057272
17056	NC_010524	GCCA	2	8	630929	630936	25 %	0 %	25 %	50 %	171057272
17057	NC_010524	CAC	2	6	630949	630954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057272
17058	NC_010524	GC	3	6	630967	630972	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17059	NC_010524	CGG	2	6	630978	630983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057272
17060	NC_010524	CGC	2	6	631021	631026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057272
17061	NC_010524	GCGCG	2	10	631032	631041	0 %	0 %	60 %	40 %	171057272
17062	NC_010524	GC	3	6	631052	631057	0 %	0 %	50 %	50 %	171057272
17063	NC_010524	GTG	2	6	631129	631134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057272
17064	NC_010524	CCGAT	2	10	631284	631293	20 %	20 %	20 %	40 %	171057273
17065	NC_010524	T	6	6	631297	631302	0 %	100 %	0 %	0 %	171057273
17066	NC_010524	CCTG	2	8	631333	631340	0 %	25 %	25 %	50 %	171057273
17067	NC_010524	GGC	2	6	631351	631356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057273
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17069	NC_010524	CTG	2	6	631367	631372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057273
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17071	NC_010524	GTG	2	6	631448	631453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057273
17072	NC_010524	GGCC	2	8	631462	631469	0 %	0 %	50 %	50 %	171057273
17073	NC_010524	TGG	2	6	631541	631546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057273
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17075	NC_010524	CCTG	2	8	631626	631633	0 %	25 %	25 %	50 %	171057274
17076	NC_010524	GC	3	6	631635	631640	0 %	0 %	50 %	50 %	171057274
17077	NC_010524	CAG	2	6	631648	631653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057274
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17081	NC_010524	CTG	2	6	631708	631713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057274
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17086	NC_010524	GCCGG	2	10	631827	631836	0 %	0 %	60 %	40 %	171057274
17087	NC_010524	CGC	2	6	631849	631854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057274
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17089	NC_010524	CGC	2	6	631925	631930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057274
17090	NC_010524	CGT	2	6	631968	631973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057274
17091	NC_010524	CAG	2	6	632044	632049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057274
17092	NC_010524	GCG	2	6	632102	632107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057274
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17100	NC_010524	CAG	2	6	632335	632340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057274
17101	NC_010524	CGTG	2	8	632360	632367	0 %	25 %	50 %	25 %	171057274
17102	NC_010524	CCAGCG	2	12	632373	632384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057274
17103	NC_010524	GCG	2	6	632390	632395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057274
17104	NC_010524	GCA	2	6	632448	632453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057274
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17108	NC_010524	ATC	2	6	632598	632603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057275
17109	NC_010524	CGAC	2	8	632604	632611	25 %	0 %	25 %	50 %	171057275
17110	NC_010524	GCCGC	2	10	632614	632623	0 %	0 %	40 %	60 %	171057275
17111	NC_010524	GCC	2	6	632630	632635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057275
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17119	NC_010524	ACG	2	6	632875	632880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057275
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17121	NC_010524	GTC	3	9	632924	632932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057275
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17358	NC_010524	CGA	2	6	642973	642978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057283
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17477	NC_010524	GC	3	6	646755	646760	0 %	0 %	50 %	50 %	171057288
17478	NC_010524	CTG	2	6	646767	646772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057288
17479	NC_010524	CGGCG	2	10	646790	646799	0 %	0 %	60 %	40 %	171057288
17480	NC_010524	TTG	2	6	646816	646821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057288
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