MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010524	GCC	2	6	594209	594214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16002	NC_010524	GAT	2	6	594215	594220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057240
16003	NC_010524	ACG	2	6	594231	594236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16004	NC_010524	ATG	2	6	594237	594242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057240
16005	NC_010524	TCG	2	6	594279	594284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16006	NC_010524	CCT	2	6	594286	594291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057240
16007	NC_010524	CGAG	2	8	594328	594335	25 %	0 %	50 %	25 %	171057240
16008	NC_010524	GCA	2	6	594364	594369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16009	NC_010524	GCGCC	2	10	594412	594421	0 %	0 %	40 %	60 %	171057240
16010	NC_010524	GCCG	2	8	594473	594480	0 %	0 %	50 %	50 %	171057240
16011	NC_010524	CGC	2	6	594481	594486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16012	NC_010524	CGG	2	6	594520	594525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057240
16013	NC_010524	GC	3	6	594545	594550	0 %	0 %	50 %	50 %	171057240
16014	NC_010524	GC	3	6	594554	594559	0 %	0 %	50 %	50 %	171057240
16015	NC_010524	GCG	2	6	594641	594646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057240
16016	NC_010524	GCC	2	6	594683	594688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16017	NC_010524	GAA	2	6	594713	594718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057240
16018	NC_010524	CGATCA	2	12	594730	594741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171057240
16019	NC_010524	ACG	2	6	594790	594795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16020	NC_010524	CCA	3	9	594835	594843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057240
16021	NC_010524	CGG	2	6	594946	594951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057240
16022	NC_010524	GGC	2	6	595003	595008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057240
16023	NC_010524	GCC	2	6	595014	595019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16024	NC_010524	CGC	2	6	595045	595050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16025	NC_010524	CGA	2	6	595099	595104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16026	NC_010524	GCA	2	6	595117	595122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16027	NC_010524	TGG	2	6	595144	595149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057240
16028	NC_010524	GCC	2	6	595196	595201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16029	NC_010524	GCG	2	6	595208	595213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057240
16030	NC_010524	CTT	2	6	595214	595219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057240
16031	NC_010524	GAC	2	6	595226	595231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16032	NC_010524	ATG	2	6	595233	595238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057240
16033	NC_010524	GGC	2	6	595243	595248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057240
16034	NC_010524	CGC	2	6	595273	595278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16035	NC_010524	GC	3	6	595281	595286	0 %	0 %	50 %	50 %	171057240
16036	NC_010524	CGC	2	6	595291	595296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16037	NC_010524	TCT	2	6	595351	595356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057240
16038	NC_010524	CGC	2	6	595358	595363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057240
16039	NC_010524	GCT	2	6	595371	595376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057240
16040	NC_010524	TTGG	2	8	595438	595445	0 %	50 %	50 %	0 %	171057241
16041	NC_010524	CTT	2	6	595458	595463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057241
16042	NC_010524	GTG	2	6	595469	595474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057241
16043	NC_010524	GCCC	2	8	595477	595484	0 %	0 %	25 %	75 %	171057241
16044	NC_010524	GGC	2	6	595531	595536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16045	NC_010524	CCCG	2	8	595623	595630	0 %	0 %	25 %	75 %	171057241
16046	NC_010524	GTT	2	6	595639	595644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057241
16047	NC_010524	AGC	2	6	595653	595658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16048	NC_010524	TCG	2	6	595694	595699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16049	NC_010524	GC	3	6	595712	595717	0 %	0 %	50 %	50 %	171057241
16050	NC_010524	AGC	2	6	595718	595723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16051	NC_010524	CG	3	6	595728	595733	0 %	0 %	50 %	50 %	171057241
16052	NC_010524	GAT	2	6	595798	595803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057241
16053	NC_010524	CGG	2	6	595822	595827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16054	NC_010524	AGC	2	6	595841	595846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16055	NC_010524	GGC	2	6	595909	595914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16056	NC_010524	CGG	2	6	595929	595934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16057	NC_010524	GC	3	6	595991	595996	0 %	0 %	50 %	50 %	171057241
16058	NC_010524	CGTTGA	2	12	596028	596039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171057241
16059	NC_010524	CAGG	2	8	596119	596126	25 %	0 %	50 %	25 %	171057241
16060	NC_010524	ATC	2	6	596174	596179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057241
16061	NC_010524	CAG	2	6	596203	596208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16062	NC_010524	CGA	2	6	596260	596265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16063	NC_010524	TCT	2	6	596289	596294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057241
16064	NC_010524	TTG	2	6	596339	596344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057241
16065	NC_010524	GGC	2	6	596400	596405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16066	NC_010524	TGA	2	6	596406	596411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057241
16067	NC_010524	CGG	2	6	596449	596454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16068	NC_010524	TCT	2	6	596565	596570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057241
16069	NC_010524	CAC	2	6	596581	596586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057241
16070	NC_010524	GGT	2	6	596605	596610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057241
16071	NC_010524	CCT	2	6	596613	596618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057241
16072	NC_010524	CGA	2	6	596673	596678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16073	NC_010524	CGA	2	6	596718	596723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16074	NC_010524	CGA	2	6	596745	596750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16075	NC_010524	GGTC	2	8	596805	596812	0 %	25 %	50 %	25 %	171057241
16076	NC_010524	GCC	2	6	596821	596826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057241
16077	NC_010524	CAGCAC	2	12	596854	596865	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171057241
16078	NC_010524	GC	3	6	596884	596889	0 %	0 %	50 %	50 %	171057241
16079	NC_010524	GTCGAG	2	12	596929	596940	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057241
16080	NC_010524	CAG	2	6	596992	596997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16081	NC_010524	CGG	2	6	597012	597017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16082	NC_010524	CGA	2	6	597018	597023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057241
16083	NC_010524	GCG	2	6	597028	597033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057241
16084	NC_010524	GGCG	2	8	597048	597055	0 %	0 %	75 %	25 %	171057241
16085	NC_010524	TTC	2	6	597058	597063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057241
16086	NC_010524	CG	3	6	597067	597072	0 %	0 %	50 %	50 %	171057241
16087	NC_010524	TGC	2	6	597569	597574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16088	NC_010524	AAC	3	9	597676	597684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057242
16089	NC_010524	CG	3	6	597733	597738	0 %	0 %	50 %	50 %	171057242
16090	NC_010524	GCG	2	6	597741	597746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057242
16091	NC_010524	TCA	2	6	597752	597757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057242
16092	NC_010524	CGG	2	6	597779	597784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057242
16093	NC_010524	CGCGC	2	10	597944	597953	0 %	0 %	40 %	60 %	171057242
16094	NC_010524	AGC	2	6	597985	597990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16095	NC_010524	CGAGGA	2	12	598065	598076	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	171057242
16096	NC_010524	CAT	2	6	598107	598112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057242
16097	NC_010524	CGA	2	6	598197	598202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16098	NC_010524	CAA	2	6	598215	598220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057242
16099	NC_010524	GGC	2	6	598221	598226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057242
16100	NC_010524	GCA	2	6	598241	598246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16101	NC_010524	CGC	2	6	598310	598315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057242
16102	NC_010524	GCT	2	6	598362	598367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16103	NC_010524	GGC	2	6	598417	598422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057242
16104	NC_010524	TCA	2	6	598448	598453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057242
16105	NC_010524	GAC	2	6	598456	598461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16106	NC_010524	CTG	2	6	598546	598551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16107	NC_010524	GCC	3	9	598648	598656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057242
16108	NC_010524	GAAG	2	8	598704	598711	50 %	0 %	50 %	0 %	171057242
16109	NC_010524	GCT	2	6	598752	598757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16110	NC_010524	CGA	2	6	598779	598784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16111	NC_010524	GC	3	6	598810	598815	0 %	0 %	50 %	50 %	171057242
16112	NC_010524	GAAG	2	8	598818	598825	50 %	0 %	50 %	0 %	171057242
16113	NC_010524	AGG	2	6	598829	598834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057242
16114	NC_010524	CTA	2	6	598839	598844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057242
16115	NC_010524	GCTG	2	8	598860	598867	0 %	25 %	50 %	25 %	171057242
16116	NC_010524	AAG	3	9	598900	598908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057242
16117	NC_010524	TGC	2	6	598919	598924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16118	NC_010524	ACCG	2	8	598930	598937	25 %	0 %	25 %	50 %	171057242
16119	NC_010524	CGA	2	6	598941	598946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057242
16120	NC_010524	GAA	2	6	599043	599048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057242
16121	NC_010524	GCC	2	6	599062	599067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057242
16122	NC_010524	GAA	2	6	599097	599102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057242
16123	NC_010524	ACC	2	6	599137	599142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057242
16124	NC_010524	GCCT	2	8	599161	599168	0 %	25 %	25 %	50 %	171057242
16125	NC_010524	GAG	2	6	599176	599181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057242
16126	NC_010524	GC	3	6	599203	599208	0 %	0 %	50 %	50 %	171057242
16127	NC_010524	GGCC	2	8	599220	599227	0 %	0 %	50 %	50 %	171057242
16128	NC_010524	GGC	2	6	599292	599297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057242
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16131	NC_010524	CTG	2	6	599356	599361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057242
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16138	NC_010524	ACG	2	6	599533	599538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057243
16139	NC_010524	TGA	2	6	599596	599601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057243
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16143	NC_010524	CGC	2	6	599713	599718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057243
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16149	NC_010524	CTGGC	2	10	599898	599907	0 %	20 %	40 %	40 %	171057243
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16154	NC_010524	GCC	2	6	600098	600103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057243
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16160	NC_010524	CGG	2	6	600232	600237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057243
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16221	NC_010524	CGGGGC	2	12	602614	602625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057246
16222	NC_010524	CG	3	6	602626	602631	0 %	0 %	50 %	50 %	171057246
16223	NC_010524	GCC	3	9	602656	602664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057246
16224	NC_010524	GCT	2	6	602665	602670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057246
16225	NC_010524	GCC	2	6	602671	602676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057246
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16229	NC_010524	CCG	4	12	602726	602737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057246
16230	NC_010524	GCC	2	6	602746	602751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057246
16231	NC_010524	CGA	2	6	602772	602777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057246
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16233	NC_010524	CCTT	2	8	602801	602808	0 %	50 %	0 %	50 %	171057246
16234	NC_010524	GGC	2	6	602832	602837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057246
16235	NC_010524	GGC	2	6	602853	602858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057246
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16477	NC_010524	CGC	2	6	611034	611039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057253
16478	NC_010524	AGC	2	6	611049	611054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16479	NC_010524	TGC	2	6	611064	611069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16480	NC_010524	GC	4	8	611068	611075	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
16481	NC_010524	CAC	2	6	611089	611094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057253
16482	NC_010524	TGC	2	6	611097	611102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16483	NC_010524	ACCG	2	8	611138	611145	25 %	0 %	25 %	50 %	171057253
16484	NC_010524	GC	3	6	611158	611163	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
16485	NC_010524	CCG	2	6	611190	611195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057253
16486	NC_010524	GCC	2	6	611232	611237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057253
16487	NC_010524	CCGG	2	8	611260	611267	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
16488	NC_010524	CTCG	2	8	611299	611306	0 %	25 %	25 %	50 %	171057253
16489	NC_010524	GC	3	6	611363	611368	0 %	0 %	50 %	50 %	171057253
16490	NC_010524	TCG	2	6	611373	611378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16491	NC_010524	GCT	2	6	611413	611418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16492	NC_010524	CTG	2	6	611435	611440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16493	NC_010524	GCA	2	6	611446	611451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
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16495	NC_010524	TGCG	2	8	611535	611542	0 %	25 %	50 %	25 %	171057253
16496	NC_010524	TGC	2	6	611589	611594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16497	NC_010524	GAC	2	6	611633	611638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057253
16498	NC_010524	ACC	2	6	611679	611684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057253
16499	NC_010524	GCC	2	6	611703	611708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057253
16500	NC_010524	GAT	2	6	611710	611715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057253

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