MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_010524	CTG	4	12	576223	576234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057220
15502	NC_010524	GCT	2	6	576243	576248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057220
15503	NC_010524	GGT	2	6	576279	576284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057220
15504	NC_010524	GGC	3	9	576287	576295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057220
15505	NC_010524	ATC	2	6	576307	576312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057220
15506	NC_010524	GGCCT	2	10	576331	576340	0 %	20 %	40 %	40 %	171057220
15507	NC_010524	TGC	3	9	576350	576358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057220
15508	NC_010524	CCG	3	9	576451	576459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15509	NC_010524	GCCA	2	8	576477	576484	25 %	0 %	25 %	50 %	171057221
15510	NC_010524	GCC	2	6	576501	576506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15511	NC_010524	GCA	2	6	576532	576537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15512	NC_010524	GGC	2	6	576563	576568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15513	NC_010524	CCA	2	6	576595	576600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057221
15514	NC_010524	GCA	2	6	576628	576633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15515	NC_010524	CGC	2	6	576635	576640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15516	NC_010524	CGAG	2	8	576808	576815	25 %	0 %	50 %	25 %	171057221
15517	NC_010524	CGGCG	2	10	576817	576826	0 %	0 %	60 %	40 %	171057221
15518	NC_010524	CGC	2	6	576868	576873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15519	NC_010524	CAG	2	6	576890	576895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15520	NC_010524	GCG	2	6	576937	576942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15521	NC_010524	GC	3	6	576981	576986	0 %	0 %	50 %	50 %	171057221
15522	NC_010524	GGC	2	6	577007	577012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15523	NC_010524	GCA	2	6	577114	577119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15524	NC_010524	CGGC	2	8	577159	577166	0 %	0 %	50 %	50 %	171057221
15525	NC_010524	G	6	6	577171	577176	0 %	0 %	100 %	0 %	171057221
15526	NC_010524	CGGG	2	8	577183	577190	0 %	0 %	75 %	25 %	171057221
15527	NC_010524	TGCAGC	2	12	577209	577220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15528	NC_010524	CCG	2	6	577221	577226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15529	NC_010524	GGC	2	6	577235	577240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15530	NC_010524	CGG	2	6	577249	577254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15531	NC_010524	GCG	2	6	577275	577280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15532	NC_010524	GCC	2	6	577310	577315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15533	NC_010524	CTT	2	6	577325	577330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057221
15534	NC_010524	GCA	2	6	577360	577365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15535	NC_010524	CGT	2	6	577384	577389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15536	NC_010524	CAGG	2	8	577409	577416	25 %	0 %	50 %	25 %	171057221
15537	NC_010524	GTC	2	6	577422	577427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15538	NC_010524	AGGTCG	2	12	577428	577439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057221
15539	NC_010524	CGGG	2	8	577451	577458	0 %	0 %	75 %	25 %	171057221
15540	NC_010524	CTG	2	6	577466	577471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15541	NC_010524	CGC	2	6	577504	577509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15542	NC_010524	GCA	2	6	577516	577521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15543	NC_010524	ACG	2	6	577524	577529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15544	NC_010524	GGC	2	6	577546	577551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15545	NC_010524	GCA	2	6	577603	577608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15546	NC_010524	TCG	2	6	577611	577616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15547	NC_010524	GGTCGA	2	12	577657	577668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057221
15548	NC_010524	CAG	2	6	577673	577678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15549	NC_010524	CGT	2	6	577685	577690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15550	NC_010524	GCA	2	6	577735	577740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15551	NC_010524	CGT	2	6	577768	577773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15552	NC_010524	TGG	2	6	577785	577790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057221
15553	NC_010524	GCGCTC	2	12	577805	577816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057221
15554	NC_010524	GCT	2	6	577855	577860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15555	NC_010524	CAG	2	6	577950	577955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15556	NC_010524	GC	3	6	577956	577961	0 %	0 %	50 %	50 %	171057221
15557	NC_010524	CAC	2	6	577976	577981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057221
15558	NC_010524	GTC	2	6	577991	577996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15559	NC_010524	CAC	3	9	578024	578032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057221
15560	NC_010524	GGC	2	6	578048	578053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15561	NC_010524	CGG	2	6	578113	578118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15562	NC_010524	GGCC	2	8	578128	578135	0 %	0 %	50 %	50 %	171057221
15563	NC_010524	CGT	2	6	578152	578157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15564	NC_010524	CCA	2	6	578179	578184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057221
15565	NC_010524	GC	3	6	578257	578262	0 %	0 %	50 %	50 %	171057221
15566	NC_010524	GCT	2	6	578296	578301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15567	NC_010524	CAG	2	6	578321	578326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15568	NC_010524	GCG	2	6	578349	578354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15569	NC_010524	CCG	2	6	578394	578399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057221
15570	NC_010524	CCGGC	2	10	578424	578433	0 %	0 %	40 %	60 %	171057221
15571	NC_010524	CAG	2	6	578519	578524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15572	NC_010524	GCG	2	6	578604	578609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057221
15573	NC_010524	CGT	2	6	578617	578622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15574	NC_010524	GCA	2	6	578644	578649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057221
15575	NC_010524	CGAT	2	8	578654	578661	25 %	25 %	25 %	25 %	171057221
15576	NC_010524	G	6	6	578699	578704	0 %	0 %	100 %	0 %	171057221
15577	NC_010524	ATC	2	6	578705	578710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057221
15578	NC_010524	GGGT	2	8	578711	578718	0 %	25 %	75 %	0 %	171057221
15579	NC_010524	TCC	2	6	578751	578756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057221
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15582	NC_010524	GTG	2	6	578887	578892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057222
15583	NC_010524	GCC	2	6	578916	578921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057222
15584	NC_010524	GGCATG	2	12	578922	578933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057222
15585	NC_010524	GCA	2	6	578990	578995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057222
15586	NC_010524	GC	3	6	579027	579032	0 %	0 %	50 %	50 %	171057222
15587	NC_010524	CTT	2	6	579054	579059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057222
15588	NC_010524	GCCC	2	8	579092	579099	0 %	0 %	25 %	75 %	171057222
15589	NC_010524	GCC	2	6	579109	579114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057222
15590	NC_010524	GCC	2	6	579118	579123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057222
15591	NC_010524	CG	3	6	579125	579130	0 %	0 %	50 %	50 %	171057222
15592	NC_010524	AGC	3	9	579139	579147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057222
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15594	NC_010524	TCGA	2	8	579181	579188	25 %	25 %	25 %	25 %	171057222
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15600	NC_010524	TCGC	2	8	579626	579633	0 %	25 %	25 %	50 %	171057223
15601	NC_010524	GC	3	6	579688	579693	0 %	0 %	50 %	50 %	171057223
15602	NC_010524	CGCCCA	2	12	579720	579731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171057223
15603	NC_010524	GCC	2	6	579739	579744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057223
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15605	NC_010524	CTG	2	6	579814	579819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057223
15606	NC_010524	CAG	2	6	579892	579897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057223
15607	NC_010524	CG	3	6	579936	579941	0 %	0 %	50 %	50 %	171057223
15608	NC_010524	GATC	2	8	579978	579985	25 %	25 %	25 %	25 %	171057223
15609	NC_010524	AGC	2	6	579986	579991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057223
15610	NC_010524	GGC	2	6	580009	580014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057223
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15612	NC_010524	TCG	2	6	580031	580036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057223
15613	NC_010524	CGA	2	6	580062	580067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057223
15614	NC_010524	CGG	3	9	580086	580094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057223
15615	NC_010524	ACC	2	6	580103	580108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057223
15616	NC_010524	GAT	2	6	580120	580125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057223
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15618	NC_010524	CGC	2	6	580200	580205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057223
15619	NC_010524	CGC	2	6	580267	580272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057223
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15739	NC_010524	GGCC	2	8	584764	584771	0 %	0 %	50 %	50 %	171057228
15740	NC_010524	GC	3	6	584831	584836	0 %	0 %	50 %	50 %	171057228
15741	NC_010524	GC	3	6	584839	584844	0 %	0 %	50 %	50 %	171057228
15742	NC_010524	CTC	2	6	584891	584896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057228
15743	NC_010524	CG	3	6	584923	584928	0 %	0 %	50 %	50 %	171057228
15744	NC_010524	TGC	2	6	584956	584961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057228
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15746	NC_010524	CGGC	2	8	585021	585028	0 %	0 %	50 %	50 %	171057228
15747	NC_010524	TGCG	2	8	585102	585109	0 %	25 %	50 %	25 %	171057228
15748	NC_010524	TCG	2	6	585147	585152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057228
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15752	NC_010524	CGACC	2	10	585282	585291	20 %	0 %	20 %	60 %	171057228
15753	NC_010524	CCAGC	2	10	585338	585347	20 %	0 %	20 %	60 %	171057228
15754	NC_010524	GC	3	6	585352	585357	0 %	0 %	50 %	50 %	171057228
15755	NC_010524	TGC	2	6	585370	585375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057228
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15758	NC_010524	GTC	2	6	585437	585442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057228
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15763	NC_010524	TGC	2	6	585766	585771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057228
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15768	NC_010524	CGG	2	6	585856	585861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057228
15769	NC_010524	GCC	2	6	585886	585891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057228
15770	NC_010524	TCAGGC	2	12	585976	585987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057228
15771	NC_010524	GCCG	2	8	586009	586016	0 %	0 %	50 %	50 %	171057228
15772	NC_010524	GCT	2	6	586027	586032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057228
15773	NC_010524	GGTC	2	8	586099	586106	0 %	25 %	50 %	25 %	171057228
15774	NC_010524	GGTGCT	2	12	586112	586123	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171057228
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15851	NC_010524	ACT	2	6	588826	588831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057232
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15977	NC_010524	CACG	2	8	593441	593448	25 %	0 %	25 %	50 %	171057239
15978	NC_010524	GCA	2	6	593453	593458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057239
15979	NC_010524	GCG	2	6	593515	593520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057239
15980	NC_010524	GCG	2	6	593534	593539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057239
15981	NC_010524	CAGGCC	2	12	593562	593573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057239
15982	NC_010524	AGC	2	6	593575	593580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057239
15983	NC_010524	GCA	2	6	593600	593605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057239
15984	NC_010524	GGT	2	6	593607	593612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057239
15985	NC_010524	GATC	2	8	593618	593625	25 %	25 %	25 %	25 %	171057239
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15987	NC_010524	CGC	2	6	593646	593651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057239
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15989	NC_010524	GCCA	2	8	593791	593798	25 %	0 %	25 %	50 %	171057239
15990	NC_010524	CCAGC	2	10	593823	593832	20 %	0 %	20 %	60 %	171057239
15991	NC_010524	AGCGCG	2	12	593852	593863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057239
15992	NC_010524	CGC	2	6	593915	593920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057239
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15994	NC_010524	TGC	2	6	593932	593937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057239
15995	NC_010524	GCA	2	6	593993	593998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057239
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15997	NC_010524	CAG	2	6	594111	594116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057239
15998	NC_010524	CGA	2	6	594126	594131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057239
15999	NC_010524	CGA	2	6	594137	594142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057239
16000	NC_010524	ACC	2	6	594162	594167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057240

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