MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010524	CGGCC	2	10	542185	542194	0 %	0 %	40 %	60 %	171057191
14502	NC_010524	CCA	2	6	542196	542201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057191
14503	NC_010524	CGA	2	6	542205	542210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14504	NC_010524	CCA	2	6	542223	542228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057191
14505	NC_010524	GCC	2	6	542247	542252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057191
14506	NC_010524	GAA	2	6	542266	542271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057191
14507	NC_010524	GAA	2	6	542278	542283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057191
14508	NC_010524	CGA	2	6	542287	542292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14509	NC_010524	GCT	2	6	542322	542327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14510	NC_010524	CAG	4	12	542350	542361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14511	NC_010524	CGG	2	6	542364	542369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057191
14512	NC_010524	CGA	2	6	542370	542375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14513	NC_010524	ACC	2	6	542412	542417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057191
14514	NC_010524	GCTGG	2	10	542455	542464	0 %	20 %	60 %	20 %	171057191
14515	NC_010524	CAC	2	6	542467	542472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057191
14516	NC_010524	CTT	2	6	542500	542505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057191
14517	NC_010524	CCA	2	6	542529	542534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057191
14518	NC_010524	GCA	2	6	542535	542540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14519	NC_010524	GCG	2	6	542586	542591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057191
14520	NC_010524	CGA	3	9	542601	542609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14521	NC_010524	CGA	2	6	542649	542654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14522	NC_010524	GCCG	2	8	542674	542681	0 %	0 %	50 %	50 %	171057191
14523	NC_010524	CAG	2	6	542692	542697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14524	NC_010524	GCCGCA	2	12	542698	542709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057191
14525	NC_010524	CAG	2	6	542710	542715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057191
14526	NC_010524	GCC	2	6	542811	542816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057192
14527	NC_010524	GAA	2	6	542819	542824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057192
14528	NC_010524	GGTGCG	2	12	542839	542850	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171057192
14529	NC_010524	CGG	2	6	542855	542860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057192
14530	NC_010524	TCGG	2	8	542863	542870	0 %	25 %	50 %	25 %	171057192
14531	NC_010524	TCA	2	6	542888	542893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057192
14532	NC_010524	CGG	2	6	542912	542917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057192
14533	NC_010524	TCC	2	6	542974	542979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057192
14534	NC_010524	AGC	2	6	542998	543003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14535	NC_010524	GCC	2	6	543037	543042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057192
14536	NC_010524	ACC	3	9	543067	543075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057192
14537	NC_010524	CG	3	6	543086	543091	0 %	0 %	50 %	50 %	171057192
14538	NC_010524	TCG	2	6	543094	543099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14539	NC_010524	GGC	2	6	543153	543158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057192
14540	NC_010524	GCC	2	6	543210	543215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057192
14541	NC_010524	GGC	2	6	543225	543230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057192
14542	NC_010524	CCT	2	6	543257	543262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057192
14543	NC_010524	GCG	2	6	543282	543287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057192
14544	NC_010524	GCC	2	6	543408	543413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057192
14545	NC_010524	GCA	2	6	543446	543451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14546	NC_010524	GTT	2	6	543459	543464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057192
14547	NC_010524	TGC	2	6	543536	543541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14548	NC_010524	GCCG	2	8	543602	543609	0 %	0 %	50 %	50 %	171057192
14549	NC_010524	AGT	3	9	543668	543676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057192
14550	NC_010524	CGAC	2	8	543713	543720	25 %	0 %	25 %	50 %	171057192
14551	NC_010524	CGCCGT	2	12	543728	543739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057192
14552	NC_010524	GGT	2	6	543752	543757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057192
14553	NC_010524	GCGCT	2	10	543799	543808	0 %	20 %	40 %	40 %	171057192
14554	NC_010524	GGT	2	6	543813	543818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057192
14555	NC_010524	CGG	2	6	543858	543863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057192
14556	NC_010524	GC	3	6	543878	543883	0 %	0 %	50 %	50 %	171057192
14557	NC_010524	AGC	2	6	543889	543894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14558	NC_010524	TCGA	2	8	543901	543908	25 %	25 %	25 %	25 %	171057192
14559	NC_010524	CGA	2	6	543947	543952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14560	NC_010524	CCA	2	6	544019	544024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057192
14561	NC_010524	GC	3	6	544025	544030	0 %	0 %	50 %	50 %	171057192
14562	NC_010524	GCT	2	6	544095	544100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14563	NC_010524	GCC	2	6	544139	544144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057192
14564	NC_010524	CCT	2	6	544163	544168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057192
14565	NC_010524	GGT	2	6	544176	544181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057192
14566	NC_010524	TCC	2	6	544261	544266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057192
14567	NC_010524	CTC	2	6	544272	544277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057192
14568	NC_010524	TGGC	2	8	544327	544334	0 %	25 %	50 %	25 %	171057192
14569	NC_010524	GCG	2	6	544494	544499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057192
14570	NC_010524	CG	3	6	544505	544510	0 %	0 %	50 %	50 %	171057192
14571	NC_010524	ACC	2	6	544522	544527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057192
14572	NC_010524	TCG	2	6	544544	544549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14573	NC_010524	AGT	2	6	544601	544606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057192
14574	NC_010524	ACG	2	6	544618	544623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14575	NC_010524	CGA	2	6	544634	544639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14576	NC_010524	CAC	2	6	544665	544670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057192
14577	NC_010524	GTT	2	6	544680	544685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057192
14578	NC_010524	ACC	3	9	544714	544722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057192
14579	NC_010524	CAG	2	6	544746	544751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057192
14580	NC_010524	ATC	2	6	544837	544842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057192
14581	NC_010524	GC	3	6	544878	544883	0 %	0 %	50 %	50 %	171057193
14582	NC_010524	GCG	2	6	544890	544895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057193
14583	NC_010524	CAG	4	12	544897	544908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14584	NC_010524	CAG	2	6	544924	544929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14585	NC_010524	GCG	2	6	544941	544946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057193
14586	NC_010524	CAG	3	9	544948	544956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14587	NC_010524	CCG	2	6	544976	544981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057193
14588	NC_010524	GCA	3	9	544992	545000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14589	NC_010524	GCG	2	6	545015	545020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057193
14590	NC_010524	GCA	2	6	545031	545036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14591	NC_010524	CAG	2	6	545068	545073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14592	NC_010524	CGG	2	6	545075	545080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057193
14593	NC_010524	CAG	2	6	545104	545109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14594	NC_010524	CAG	2	6	545161	545166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14595	NC_010524	CCAGCG	2	12	545226	545237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057193
14596	NC_010524	GGC	2	6	545262	545267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057193
14597	NC_010524	GCA	2	6	545274	545279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14598	NC_010524	CAG	3	9	545296	545304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14599	NC_010524	GCA	3	9	545334	545342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057193
14600	NC_010524	CGC	2	6	545526	545531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057194
14601	NC_010524	GGC	3	9	545535	545543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057194
14602	NC_010524	GCA	2	6	545624	545629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057194
14603	NC_010524	GGC	3	9	545757	545765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057194
14604	NC_010524	TGCG	2	8	545821	545828	0 %	25 %	50 %	25 %	171057194
14605	NC_010524	CAG	2	6	545865	545870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057194
14606	NC_010524	CGG	2	6	545879	545884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057194
14607	NC_010524	CGT	2	6	545924	545929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057194
14608	NC_010524	CGC	2	6	545966	545971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057194
14609	NC_010524	CGG	2	6	546002	546007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057194
14610	NC_010524	CGT	2	6	546008	546013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057194
14611	NC_010524	CGG	2	6	546023	546028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057194
14612	NC_010524	GC	3	6	546052	546057	0 %	0 %	50 %	50 %	171057194
14613	NC_010524	GC	3	6	546070	546075	0 %	0 %	50 %	50 %	171057194
14614	NC_010524	GCA	2	6	546092	546097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057194
14615	NC_010524	CTG	2	6	546126	546131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057194
14616	NC_010524	GCG	2	6	546148	546153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057194
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14618	NC_010524	GC	3	6	546165	546170	0 %	0 %	50 %	50 %	171057194
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14856	NC_010524	GCG	2	6	553900	553905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057201
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14963	NC_010524	CGAT	2	8	557817	557824	25 %	25 %	25 %	25 %	171057205
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14976	NC_010524	GAA	2	6	558137	558142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057205
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14979	NC_010524	AGGA	2	8	558186	558193	50 %	0 %	50 %	0 %	171057205
14980	NC_010524	CCG	2	6	558210	558215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057205
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14982	NC_010524	CGCC	2	8	558430	558437	0 %	0 %	25 %	75 %	171057205
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