MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010524	CGG	2	6	501989	501994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
13502	NC_010524	CCACAC	2	12	501995	502006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057153
13503	NC_010524	CACG	2	8	502046	502053	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
13504	NC_010524	CCG	2	6	502082	502087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
13505	NC_010524	CGC	2	6	502115	502120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
13506	NC_010524	GGC	2	6	502136	502141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
13507	NC_010524	TGGAG	2	10	502183	502192	20 %	20 %	60 %	0 %	171057153
13508	NC_010524	CTG	2	6	502233	502238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13509	NC_010524	TGC	2	6	502270	502275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13510	NC_010524	CGA	2	6	502352	502357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13511	NC_010524	GAT	2	6	502400	502405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057153
13512	NC_010524	CCGA	2	8	502425	502432	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
13513	NC_010524	CTG	2	6	502488	502493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13514	NC_010524	GGT	2	6	502523	502528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
13515	NC_010524	CGG	2	6	502529	502534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
13516	NC_010524	CG	3	6	502535	502540	0 %	0 %	50 %	50 %	171057153
13517	NC_010524	TGC	2	6	502558	502563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13518	NC_010524	GCG	2	6	502607	502612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
13519	NC_010524	CGA	2	6	502667	502672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13520	NC_010524	GGT	2	6	502673	502678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
13521	NC_010524	GCCA	2	8	502725	502732	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
13522	NC_010524	TGC	2	6	502783	502788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13523	NC_010524	CTG	2	6	502803	502808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
13524	NC_010524	GGC	2	6	502829	502834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
13525	NC_010524	GGT	3	9	502934	502942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
13526	NC_010524	CGC	2	6	503030	503035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
13527	NC_010524	GCC	2	6	503062	503067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
13528	NC_010524	GCG	2	6	503083	503088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
13529	NC_010524	GGT	2	6	503138	503143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
13530	NC_010524	GGCC	2	8	503144	503151	0 %	0 %	50 %	50 %	171057153
13531	NC_010524	CGAC	2	8	503173	503180	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
13532	NC_010524	GCC	2	6	503205	503210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
13533	NC_010524	CGC	3	9	503257	503265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
13534	NC_010524	TGC	2	6	503310	503315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13535	NC_010524	TGC	2	6	503346	503351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13536	NC_010524	GCC	2	6	503367	503372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
13537	NC_010524	ACG	2	6	503421	503426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13538	NC_010524	GCGG	2	8	503438	503445	0 %	0 %	75 %	25 %	171057154
13539	NC_010524	CTG	2	6	503474	503479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13540	NC_010524	CG	3	6	503532	503537	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
13541	NC_010524	CGC	2	6	503581	503586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
13542	NC_010524	CGGC	2	8	503590	503597	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
13543	NC_010524	CAA	2	6	503620	503625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057154
13544	NC_010524	CTG	2	6	503651	503656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13545	NC_010524	GCT	2	6	503686	503691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13546	NC_010524	CCGCTT	2	12	503743	503754	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	171057154
13547	NC_010524	GCC	2	6	503782	503787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
13548	NC_010524	GCT	2	6	503830	503835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13549	NC_010524	CGC	2	6	503862	503867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
13550	NC_010524	GC	3	6	503887	503892	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
13551	NC_010524	GCG	2	6	503897	503902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057154
13552	NC_010524	GCT	2	6	503908	503913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
13553	NC_010524	GC	3	6	503930	503935	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
13554	NC_010524	CCG	2	6	503996	504001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
13555	NC_010524	GC	3	6	504003	504008	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
13556	NC_010524	GCCG	2	8	504155	504162	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
13557	NC_010524	GCT	2	6	504215	504220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13558	NC_010524	CGGC	2	8	504221	504228	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
13559	NC_010524	GCG	2	6	504286	504291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057155
13560	NC_010524	CGA	2	6	504317	504322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13561	NC_010524	GCT	2	6	504416	504421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13562	NC_010524	CGC	2	6	504537	504542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057155
13563	NC_010524	CCG	2	6	504581	504586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057155
13564	NC_010524	CGA	2	6	504593	504598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13565	NC_010524	ACT	2	6	504607	504612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057155
13566	NC_010524	CGGC	2	8	504629	504636	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
13567	NC_010524	GC	3	6	504662	504667	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
13568	NC_010524	GCGCC	2	10	504674	504683	0 %	0 %	40 %	60 %	171057155
13569	NC_010524	CGA	2	6	504686	504691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13570	NC_010524	CGGCTG	2	12	504728	504739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057155
13571	NC_010524	GC	3	6	504775	504780	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
13572	NC_010524	AGC	2	6	504808	504813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13573	NC_010524	CGCC	2	8	504821	504828	0 %	0 %	25 %	75 %	171057155
13574	NC_010524	TCGA	2	8	504921	504928	25 %	25 %	25 %	25 %	171057155
13575	NC_010524	CGT	2	6	504961	504966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
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13577	NC_010524	CGA	2	6	505034	505039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13578	NC_010524	CGAC	2	8	505063	505070	25 %	0 %	25 %	50 %	171057155
13579	NC_010524	CAG	2	6	505077	505082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13580	NC_010524	CGG	2	6	505094	505099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057155
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13583	NC_010524	CCG	2	6	505132	505137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057155
13584	NC_010524	GC	3	6	505139	505144	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
13585	NC_010524	TGG	2	6	505150	505155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057155
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13587	NC_010524	GC	3	6	505208	505213	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
13588	NC_010524	CGT	2	6	505331	505336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
13589	NC_010524	TGAAA	2	10	505359	505368	60 %	20 %	20 %	0 %	171057155
13590	NC_010524	CGT	2	6	505466	505471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057156
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13592	NC_010524	GC	3	6	505593	505598	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
13593	NC_010524	ACG	2	6	505644	505649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057156
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13595	NC_010524	GCCG	2	8	505691	505698	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
13596	NC_010524	TCGA	2	8	505760	505767	25 %	25 %	25 %	25 %	171057156
13597	NC_010524	CTGG	2	8	505813	505820	0 %	25 %	50 %	25 %	171057156
13598	NC_010524	GCGG	2	8	505828	505835	0 %	0 %	75 %	25 %	171057156
13599	NC_010524	CCGG	2	8	505869	505876	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
13600	NC_010524	TTC	2	6	505958	505963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057156
13601	NC_010524	CGC	2	6	505977	505982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057156
13602	NC_010524	GCCA	2	8	505994	506001	25 %	0 %	25 %	50 %	171057156
13603	NC_010524	GC	3	6	506002	506007	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
13604	NC_010524	GCA	2	6	506040	506045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057157
13605	NC_010524	GC	3	6	506058	506063	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
13606	NC_010524	GC	3	6	506078	506083	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
13607	NC_010524	TGC	3	9	506123	506131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
13608	NC_010524	TCGC	2	8	506161	506168	0 %	25 %	25 %	50 %	171057157
13609	NC_010524	CTG	4	12	506179	506190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
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13612	NC_010524	GCT	2	6	506247	506252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
13613	NC_010524	GGC	2	6	506253	506258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057157
13614	NC_010524	CG	3	6	506264	506269	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
13615	NC_010524	CGG	2	6	506286	506291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057157
13616	NC_010524	TCG	2	6	506318	506323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
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13618	NC_010524	GTG	2	6	506367	506372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057157
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13620	NC_010524	GC	3	6	506438	506443	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
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13735	NC_010524	GCGA	2	8	510720	510727	25 %	0 %	50 %	25 %	171057162
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13860	NC_010524	CCA	2	6	516079	516084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057170
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13865	NC_010524	CTA	2	6	516332	516337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057170
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13979	NC_010524	GGC	2	6	520610	520615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057174
13980	NC_010524	GTG	2	6	520697	520702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057174
13981	NC_010524	GT	3	6	520743	520748	0 %	50 %	50 %	0 %	171057174
13982	NC_010524	GC	3	6	520794	520799	0 %	0 %	50 %	50 %	171057174
13983	NC_010524	CAC	3	9	520849	520857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057174
13984	NC_010524	GCC	2	6	520907	520912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057174
13985	NC_010524	GAA	2	6	520978	520983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057174
13986	NC_010524	CCA	2	6	520995	521000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057174
13987	NC_010524	CGA	2	6	521047	521052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057174
13988	NC_010524	ATCG	2	8	521053	521060	25 %	25 %	25 %	25 %	171057174
13989	NC_010524	CAT	2	6	521065	521070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057174
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13991	NC_010524	TCA	2	6	521106	521111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057174
13992	NC_010524	CGT	2	6	521149	521154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057174
13993	NC_010524	TCA	2	6	521196	521201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057174
13994	NC_010524	AAGC	2	8	521213	521220	50 %	0 %	25 %	25 %	171057174
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13999	NC_010524	GGCC	2	8	521311	521318	0 %	0 %	50 %	50 %	171057174
14000	NC_010524	GCT	2	6	521323	521328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057174

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