MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010524	TGC	2	6	481389	481394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057131
13002	NC_010524	GCT	2	6	481435	481440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057131
13003	NC_010524	CGGC	2	8	481488	481495	0 %	0 %	50 %	50 %	171057131
13004	NC_010524	ACG	3	9	481506	481514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057131
13005	NC_010524	CCG	2	6	481536	481541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057131
13006	NC_010524	GTG	2	6	481547	481552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057131
13007	NC_010524	TGC	2	6	481611	481616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057131
13008	NC_010524	ACG	2	6	481632	481637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057131
13009	NC_010524	GC	3	6	481655	481660	0 %	0 %	50 %	50 %	171057131
13010	NC_010524	TGC	2	6	481668	481673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057131
13011	NC_010524	CGC	2	6	481680	481685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057131
13012	NC_010524	CTGC	2	8	481885	481892	0 %	25 %	25 %	50 %	171057131
13013	NC_010524	TGC	2	6	481896	481901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057131
13014	NC_010524	CAT	2	6	482049	482054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057132
13015	NC_010524	GCT	2	6	482088	482093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13016	NC_010524	AGC	2	6	482126	482131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13017	NC_010524	GCG	2	6	482135	482140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057132
13018	NC_010524	CGA	2	6	482199	482204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13019	NC_010524	GC	4	8	482216	482223	0 %	0 %	50 %	50 %	171057132
13020	NC_010524	CAC	2	6	482245	482250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057132
13021	NC_010524	CGG	2	6	482307	482312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057132
13022	NC_010524	CG	3	6	482348	482353	0 %	0 %	50 %	50 %	171057132
13023	NC_010524	GC	3	6	482381	482386	0 %	0 %	50 %	50 %	171057132
13024	NC_010524	GCA	2	6	482432	482437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13025	NC_010524	ACCT	2	8	482449	482456	25 %	25 %	0 %	50 %	171057132
13026	NC_010524	GCCG	2	8	482538	482545	0 %	0 %	50 %	50 %	171057132
13027	NC_010524	GGCT	2	8	482581	482588	0 %	25 %	50 %	25 %	171057132
13028	NC_010524	CGG	2	6	482612	482617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057132
13029	NC_010524	CGA	2	6	482619	482624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13030	NC_010524	GCA	2	6	482663	482668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13031	NC_010524	GCA	2	6	482672	482677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13032	NC_010524	CG	3	6	482739	482744	0 %	0 %	50 %	50 %	171057132
13033	NC_010524	GCC	2	6	482765	482770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057132
13034	NC_010524	GCC	3	9	482782	482790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057132
13035	NC_010524	TCGA	2	8	482809	482816	25 %	25 %	25 %	25 %	171057132
13036	NC_010524	CGC	2	6	482828	482833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057132
13037	NC_010524	GCCGA	2	10	482848	482857	20 %	0 %	40 %	40 %	171057132
13038	NC_010524	GCC	2	6	482890	482895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057132
13039	NC_010524	GCC	2	6	482904	482909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057132
13040	NC_010524	GGC	3	9	482934	482942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057132
13041	NC_010524	CGA	2	6	483006	483011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13042	NC_010524	CTG	2	6	483076	483081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057132
13043	NC_010524	CGGC	2	8	483092	483099	0 %	0 %	50 %	50 %	171057132
13044	NC_010524	GCCG	2	8	483165	483172	0 %	0 %	50 %	50 %	171057132
13045	NC_010524	GAG	2	6	483214	483219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057132
13046	NC_010524	CGC	2	6	483273	483278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13047	NC_010524	GGCC	2	8	483301	483308	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13048	NC_010524	GCT	2	6	483319	483324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13049	NC_010524	TGC	2	6	483327	483332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13050	NC_010524	GCC	2	6	483367	483372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13051	NC_010524	TGC	2	6	483396	483401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13052	NC_010524	TCG	2	6	483408	483413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13053	NC_010524	GTG	2	6	483440	483445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057133
13054	NC_010524	GGC	2	6	483499	483504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13055	NC_010524	GC	3	6	483513	483518	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13056	NC_010524	GCTGGC	2	12	483529	483540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057133
13057	NC_010524	GC	3	6	483579	483584	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13058	NC_010524	GCT	2	6	483595	483600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13059	NC_010524	CGCC	2	8	483615	483622	0 %	0 %	25 %	75 %	171057133
13060	NC_010524	GCG	2	6	483642	483647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13061	NC_010524	GCT	2	6	483652	483657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13062	NC_010524	CGG	2	6	483703	483708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13063	NC_010524	GCC	3	9	483716	483724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13064	NC_010524	CGC	2	6	483766	483771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13065	NC_010524	CGC	3	9	483775	483783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13066	NC_010524	GCG	2	6	483814	483819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13067	NC_010524	CGC	2	6	483834	483839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13068	NC_010524	CTG	3	9	483854	483862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13069	NC_010524	GCTGG	2	10	483871	483880	0 %	20 %	60 %	20 %	171057133
13070	NC_010524	CTG	2	6	483881	483886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13071	NC_010524	GC	3	6	483921	483926	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13072	NC_010524	CCG	2	6	483953	483958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13073	NC_010524	GGCGCT	2	12	483997	484008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057133
13074	NC_010524	GGC	2	6	484054	484059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13075	NC_010524	TCG	2	6	484095	484100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13076	NC_010524	CGG	2	6	484123	484128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
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13078	NC_010524	CGCT	2	8	484166	484173	0 %	25 %	25 %	50 %	171057133
13079	NC_010524	GC	4	8	484191	484198	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13080	NC_010524	CGC	2	6	484200	484205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13081	NC_010524	GCT	4	12	484231	484242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
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13084	NC_010524	GCT	2	6	484297	484302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13085	NC_010524	TGG	2	6	484308	484313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057133
13086	NC_010524	GCT	2	6	484321	484326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13087	NC_010524	GGC	2	6	484353	484358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13088	NC_010524	CGC	2	6	484381	484386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13089	NC_010524	GCT	2	6	484393	484398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13090	NC_010524	GACGCT	2	12	484402	484413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13091	NC_010524	CCG	2	6	484525	484530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13092	NC_010524	GTG	2	6	484535	484540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057133
13093	NC_010524	CTG	2	6	484586	484591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
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13096	NC_010524	CTG	2	6	484682	484687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13097	NC_010524	CG	3	6	484760	484765	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13098	NC_010524	GCG	2	6	484770	484775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
13099	NC_010524	CCGC	2	8	484789	484796	0 %	0 %	25 %	75 %	171057133
13100	NC_010524	GCA	2	6	484821	484826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13101	NC_010524	AGCGC	2	10	484872	484881	20 %	0 %	40 %	40 %	171057133
13102	NC_010524	CCG	2	6	484897	484902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
13103	NC_010524	CGA	3	9	484957	484965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057133
13104	NC_010524	CG	3	6	484968	484973	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
13105	NC_010524	CTGAT	2	10	484976	484985	20 %	40 %	20 %	20 %	171057133
13106	NC_010524	GCACC	2	10	485053	485062	20 %	0 %	20 %	60 %	171057134
13107	NC_010524	CTG	2	6	485093	485098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057134
13108	NC_010524	GCT	2	6	485119	485124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057134
13109	NC_010524	CGA	2	6	485140	485145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057134
13110	NC_010524	GC	3	6	485152	485157	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
13111	NC_010524	GGC	2	6	485203	485208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057134
13112	NC_010524	TGGC	2	8	485282	485289	0 %	25 %	50 %	25 %	171057134
13113	NC_010524	TGC	2	6	485313	485318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057134
13114	NC_010524	GC	4	8	485331	485338	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
13115	NC_010524	GCA	2	6	485349	485354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057134
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13117	NC_010524	CGC	2	6	485476	485481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057134
13118	NC_010524	CTGG	2	8	485488	485495	0 %	25 %	50 %	25 %	171057134
13119	NC_010524	GCA	3	9	485497	485505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057134
13120	NC_010524	GC	4	8	485512	485519	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
13121	NC_010524	GTG	2	6	485630	485635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057134
13122	NC_010524	GCTG	2	8	485652	485659	0 %	25 %	50 %	25 %	171057134
13123	NC_010524	CGC	2	6	485667	485672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057134
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13128	NC_010524	CG	3	6	485777	485782	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
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13239	NC_010524	CAT	2	6	491540	491545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057141
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13241	NC_010524	ACT	2	6	491608	491613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057141
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13247	NC_010524	TGC	2	6	491713	491718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057141
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13251	NC_010524	TGC	2	6	491827	491832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057141
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13349	NC_010524	CAG	2	6	494887	494892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057144
13350	NC_010524	GTC	2	6	494953	494958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057144
13351	NC_010524	CGAC	2	8	494976	494983	25 %	0 %	25 %	50 %	171057144
13352	NC_010524	GGC	2	6	495025	495030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057144
13353	NC_010524	GC	4	8	495063	495070	0 %	0 %	50 %	50 %	171057144
13354	NC_010524	CGT	2	6	495096	495101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057144
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13474	NC_010524	GCG	2	6	500134	500139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057151
13475	NC_010524	TGG	2	6	500158	500163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057151
13476	NC_010524	CAG	2	6	500198	500203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057151
13477	NC_010524	CGT	2	6	500231	500236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057151
13478	NC_010524	CAC	2	6	500240	500245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057151
13479	NC_010524	CGC	2	6	500258	500263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057151
13480	NC_010524	GCA	2	6	500296	500301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057151
13481	NC_010524	CTC	2	6	500330	500335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057151
13482	NC_010524	CG	3	6	500353	500358	0 %	0 %	50 %	50 %	171057151
13483	NC_010524	CCA	2	6	500380	500385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057151
13484	NC_010524	GC	4	8	500473	500480	0 %	0 %	50 %	50 %	171057151
13485	NC_010524	GTC	2	6	500510	500515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057151
13486	NC_010524	GCGG	2	8	500534	500541	0 %	0 %	75 %	25 %	171057151
13487	NC_010524	GCC	2	6	500549	500554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057151
13488	NC_010524	TCG	2	6	500586	500591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057151
13489	NC_010524	GGCTG	2	10	500704	500713	0 %	20 %	60 %	20 %	171057151
13490	NC_010524	GCG	2	6	500726	500731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057151
13491	NC_010524	GCG	2	6	500800	500805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057151
13492	NC_010524	GGTG	2	8	500819	500826	0 %	25 %	75 %	0 %	171057151
13493	NC_010524	CGT	2	6	501012	501017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057152
13494	NC_010524	GCT	2	6	501098	501103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057152
13495	NC_010524	CGAT	2	8	501108	501115	25 %	25 %	25 %	25 %	171057152
13496	NC_010524	TGG	2	6	501262	501267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057152
13497	NC_010524	CGGT	2	8	501486	501493	0 %	25 %	50 %	25 %	171057152
13498	NC_010524	TCG	2	6	501527	501532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057152
13499	NC_010524	CTT	2	6	501554	501559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057152
13500	NC_010524	GAGC	2	8	501935	501942	25 %	0 %	50 %	25 %	171057153

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