MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010524	GTG	2	6	463852	463857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057113
12502	NC_010524	GC	3	6	463864	463869	0 %	0 %	50 %	50 %	171057113
12503	NC_010524	GCG	2	6	463896	463901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057113
12504	NC_010524	GCG	2	6	463910	463915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057113
12505	NC_010524	GCG	2	6	463968	463973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057113
12506	NC_010524	TGC	2	6	463988	463993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057113
12507	NC_010524	CAC	2	6	464011	464016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057113
12508	NC_010524	GCC	2	6	464044	464049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057113
12509	NC_010524	GC	4	8	464074	464081	0 %	0 %	50 %	50 %	171057113
12510	NC_010524	CAG	2	6	464095	464100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057113
12511	NC_010524	GGT	2	6	464107	464112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057113
12512	NC_010524	GCC	3	9	464114	464122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057113
12513	NC_010524	CAGCAC	2	12	464140	464151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171057113
12514	NC_010524	CAG	2	6	464230	464235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057113
12515	NC_010524	CGGT	2	8	464271	464278	0 %	25 %	50 %	25 %	171057113
12516	NC_010524	GC	3	6	464320	464325	0 %	0 %	50 %	50 %	171057114
12517	NC_010524	CGC	2	6	464334	464339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057114
12518	NC_010524	TGA	2	6	464358	464363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057114
12519	NC_010524	CG	3	6	464367	464372	0 %	0 %	50 %	50 %	171057114
12520	NC_010524	GCTC	2	8	464402	464409	0 %	25 %	25 %	50 %	171057114
12521	NC_010524	GCA	2	6	464457	464462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057114
12522	NC_010524	TGC	2	6	464505	464510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057114
12523	NC_010524	GCC	2	6	464521	464526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057114
12524	NC_010524	CGT	2	6	464587	464592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057114
12525	NC_010524	ACG	2	6	464601	464606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057114
12526	NC_010524	TGGCGG	2	12	464639	464650	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171057114
12527	NC_010524	TCG	2	6	464666	464671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057114
12528	NC_010524	GGT	2	6	464674	464679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057114
12529	NC_010524	GGC	3	9	464695	464703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057114
12530	NC_010524	GCC	2	6	464723	464728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057114
12531	NC_010524	GCG	2	6	464733	464738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057114
12532	NC_010524	CGGG	2	8	464740	464747	0 %	0 %	75 %	25 %	171057114
12533	NC_010524	G	6	6	464752	464757	0 %	0 %	100 %	0 %	171057114
12534	NC_010524	CCGG	2	8	464771	464778	0 %	0 %	50 %	50 %	171057114
12535	NC_010524	GGC	2	6	464794	464799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057114
12536	NC_010524	GGCCGG	2	12	464814	464825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057114
12537	NC_010524	CCGT	2	8	464864	464871	0 %	25 %	25 %	50 %	171057114
12538	NC_010524	CAG	3	9	464932	464940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057114
12539	NC_010524	GC	3	6	464944	464949	0 %	0 %	50 %	50 %	171057114
12540	NC_010524	CG	3	6	464950	464955	0 %	0 %	50 %	50 %	171057114
12541	NC_010524	TGC	2	6	464967	464972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057114
12542	NC_010524	GCA	2	6	465099	465104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12543	NC_010524	CAC	2	6	465235	465240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057115
12544	NC_010524	CTT	2	6	465370	465375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057115
12545	NC_010524	CGA	2	6	465381	465386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12546	NC_010524	TCG	2	6	465404	465409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12547	NC_010524	CGG	2	6	465444	465449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057115
12548	NC_010524	GTC	2	6	465556	465561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12549	NC_010524	AGC	2	6	465563	465568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12550	NC_010524	GTG	2	6	465617	465622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057115
12551	NC_010524	TCGG	2	8	465623	465630	0 %	25 %	50 %	25 %	171057115
12552	NC_010524	GCC	2	6	465635	465640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057115
12553	NC_010524	ACC	2	6	465641	465646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057115
12554	NC_010524	TCT	2	6	465693	465698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057115
12555	NC_010524	CTG	2	6	465721	465726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12556	NC_010524	GCC	3	9	465736	465744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057115
12557	NC_010524	GGT	2	6	465789	465794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057115
12558	NC_010524	GCC	2	6	465843	465848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057115
12559	NC_010524	CGGC	2	8	465867	465874	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12560	NC_010524	CG	3	6	465879	465884	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12561	NC_010524	CAT	2	6	465928	465933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057115
12562	NC_010524	GC	3	6	465969	465974	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12563	NC_010524	GCA	2	6	466041	466046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12564	NC_010524	CCA	2	6	466053	466058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057115
12565	NC_010524	GCA	3	9	466068	466076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12566	NC_010524	GGT	2	6	466096	466101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057115
12567	NC_010524	GCC	2	6	466102	466107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057115
12568	NC_010524	GCA	2	6	466116	466121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12569	NC_010524	CGT	2	6	466128	466133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12570	NC_010524	CTT	2	6	466231	466236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057115
12571	NC_010524	CAC	2	6	466246	466251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057115
12572	NC_010524	CGA	2	6	466257	466262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12573	NC_010524	CAC	2	6	466306	466311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057115
12574	NC_010524	CTG	2	6	466339	466344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12575	NC_010524	GC	4	8	466381	466388	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12576	NC_010524	CG	3	6	466416	466421	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12577	NC_010524	ACC	2	6	466445	466450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057115
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12579	NC_010524	GC	3	6	466460	466465	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12580	NC_010524	GCCACC	2	12	466475	466486	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171057115
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12583	NC_010524	TCG	2	6	466580	466585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12584	NC_010524	TCG	2	6	466655	466660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057115
12585	NC_010524	CGGC	2	8	466701	466708	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12586	NC_010524	GCCG	2	8	466711	466718	0 %	0 %	50 %	50 %	171057115
12587	NC_010524	ACC	2	6	466949	466954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057116
12588	NC_010524	CAT	2	6	466975	466980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057116
12589	NC_010524	TTG	2	6	467042	467047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057116
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12591	NC_010524	CAC	2	6	467128	467133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057116
12592	NC_010524	GAT	2	6	467149	467154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057116
12593	NC_010524	TCC	2	6	467189	467194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057116
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12596	NC_010524	GC	4	8	467345	467352	0 %	0 %	50 %	50 %	171057116
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12599	NC_010524	GTC	2	6	467416	467421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057116
12600	NC_010524	GCT	2	6	467445	467450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057116
12601	NC_010524	GC	3	6	467454	467459	0 %	0 %	50 %	50 %	171057116
12602	NC_010524	GCT	2	6	467462	467467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057116
12603	NC_010524	CCG	2	6	467483	467488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
12604	NC_010524	GCC	2	6	467491	467496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
12605	NC_010524	GAA	2	6	467509	467514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057116
12606	NC_010524	ATG	2	6	467537	467542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057116
12607	NC_010524	GTT	2	6	467599	467604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171057116
12608	NC_010524	CGG	2	6	467622	467627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057116
12609	NC_010524	GAC	3	9	467659	467667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057116
12610	NC_010524	GCC	2	6	467680	467685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
12611	NC_010524	GAT	3	9	467692	467700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057116
12612	NC_010524	GCCAGC	2	12	467720	467731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057116
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12614	NC_010524	GGTGAA	2	12	467758	467769	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	171057116
12615	NC_010524	CCAGGC	2	12	467772	467783	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057116
12616	NC_010524	GCC	2	6	467824	467829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057116
12617	NC_010524	GCGATG	2	12	468017	468028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057116
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12976	NC_010524	TCG	2	6	480790	480795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057130
12977	NC_010524	GCT	2	6	480803	480808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057130
12978	NC_010524	GCG	2	6	480824	480829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057130
12979	NC_010524	GT	3	6	480837	480842	0 %	50 %	50 %	0 %	171057130
12980	NC_010524	GCGCG	2	10	480851	480860	0 %	0 %	60 %	40 %	171057130
12981	NC_010524	CGG	3	9	480868	480876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057130
12982	NC_010524	GGCCG	2	10	480900	480909	0 %	0 %	60 %	40 %	171057130
12983	NC_010524	GGC	2	6	480911	480916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057130
12984	NC_010524	CCGG	2	8	480948	480955	0 %	0 %	50 %	50 %	171057130
12985	NC_010524	CGC	2	6	480962	480967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057130
12986	NC_010524	CGC	2	6	481144	481149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057131
12987	NC_010524	CCG	2	6	481158	481163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057131
12988	NC_010524	ACG	3	9	481164	481172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057131
12989	NC_010524	GCT	2	6	481174	481179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057131
12990	NC_010524	CGC	2	6	481180	481185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057131
12991	NC_010524	CGC	2	6	481188	481193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057131
12992	NC_010524	GCG	2	6	481205	481210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057131
12993	NC_010524	CTG	2	6	481223	481228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057131
12994	NC_010524	CCGC	2	8	481252	481259	0 %	0 %	25 %	75 %	171057131
12995	NC_010524	GC	3	6	481285	481290	0 %	0 %	50 %	50 %	171057131
12996	NC_010524	CGC	3	9	481303	481311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057131
12997	NC_010524	GC	3	6	481310	481315	0 %	0 %	50 %	50 %	171057131
12998	NC_010524	GCTCAC	2	12	481324	481335	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171057131
12999	NC_010524	CG	3	6	481348	481353	0 %	0 %	50 %	50 %	171057131
13000	NC_010524	CGGC	2	8	481360	481367	0 %	0 %	50 %	50 %	171057131

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