MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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128002	NC_010524	CAG	2	6	4857916	4857921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
128003	NC_010524	GCC	2	6	4857928	4857933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061007
128004	NC_010524	TCC	2	6	4857956	4857961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171061007
128005	NC_010524	ACC	2	6	4857977	4857982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061007
128006	NC_010524	AGA	2	6	4857990	4857995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171061007
128007	NC_010524	GAT	2	6	4858006	4858011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061007
128008	NC_010524	TGA	2	6	4858026	4858031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061007
128009	NC_010524	AGT	2	6	4858074	4858079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061007
128010	NC_010524	AGC	2	6	4858085	4858090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061007
128011	NC_010524	TGA	2	6	4858110	4858115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061007
128012	NC_010524	AGCG	2	8	4858127	4858134	25 %	0 %	50 %	25 %	171061007
128013	NC_010524	GT	3	6	4858158	4858163	0 %	50 %	50 %	0 %	171061007
128014	NC_010524	TGT	2	6	4858167	4858172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171061007
128015	NC_010524	TCGC	2	8	4858604	4858611	0 %	25 %	25 %	50 %	171061008
128016	NC_010524	GC	3	6	4858610	4858615	0 %	0 %	50 %	50 %	171061008
128017	NC_010524	TCGCC	2	10	4858623	4858632	0 %	20 %	20 %	60 %	171061008
128018	NC_010524	TTC	2	6	4858655	4858660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171061008
128019	NC_010524	GGCCTG	2	12	4858736	4858747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171061008
128020	NC_010524	GCG	2	6	4858764	4858769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061008
128021	NC_010524	GAT	2	6	4858783	4858788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061008
128022	NC_010524	GCTG	2	8	4858797	4858804	0 %	25 %	50 %	25 %	171061008
128023	NC_010524	GCC	2	6	4858824	4858829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061008
128024	NC_010524	TGC	3	9	4858839	4858847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061008
128025	NC_010524	CTG	2	6	4858871	4858876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061008
128026	NC_010524	CGC	2	6	4858890	4858895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061008
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128028	NC_010524	GCC	2	6	4858988	4858993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061008
128029	NC_010524	GCAT	2	8	4859010	4859017	25 %	25 %	25 %	25 %	171061008
128030	NC_010524	GCC	3	9	4859018	4859026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061008
128031	NC_010524	CTG	2	6	4859063	4859068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061008
128032	NC_010524	GGCCG	2	10	4859077	4859086	0 %	0 %	60 %	40 %	171061008
128033	NC_010524	GCC	2	6	4859105	4859110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061008
128034	NC_010524	GCG	2	6	4859111	4859116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061008
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128038	NC_010524	GGT	2	6	4859212	4859217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061008
128039	NC_010524	GTG	2	6	4859231	4859236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061008
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128042	NC_010524	GGC	2	6	4859314	4859319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061008
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128045	NC_010524	CGA	2	6	4859401	4859406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061008
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128047	NC_010524	CGCTGG	2	12	4859427	4859438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171061008
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128050	NC_010524	GC	3	6	4859562	4859567	0 %	0 %	50 %	50 %	171061008
128051	NC_010524	CG	3	6	4859573	4859578	0 %	0 %	50 %	50 %	171061008
128052	NC_010524	GCG	4	12	4859576	4859587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061008
128053	NC_010524	TGG	2	6	4859604	4859609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061008
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128068	NC_010524	GCC	3	9	4860113	4860121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061009
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128110	NC_010524	CG	3	6	4861410	4861415	0 %	0 %	50 %	50 %	171061010
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128113	NC_010524	CCCGAC	2	12	4861492	4861503	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171061011
128114	NC_010524	TGC	2	6	4861547	4861552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061011
128115	NC_010524	CCG	2	6	4861553	4861558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061011
128116	NC_010524	CGA	2	6	4861575	4861580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061011
128117	NC_010524	CAC	2	6	4861594	4861599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061011
128118	NC_010524	TGCG	2	8	4861643	4861650	0 %	25 %	50 %	25 %	171061011
128119	NC_010524	CGC	2	6	4861669	4861674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061011
128120	NC_010524	CGT	2	6	4861689	4861694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061011
128121	NC_010524	CGA	2	6	4861734	4861739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061011
128122	NC_010524	CGC	2	6	4861756	4861761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061011
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128124	NC_010524	GTCGGC	2	12	4861807	4861818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171061011
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128128	NC_010524	GC	3	6	4862020	4862025	0 %	0 %	50 %	50 %	171061011
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128144	NC_010524	GC	5	10	4862568	4862577	0 %	0 %	50 %	50 %	171061012
128145	NC_010524	CAG	2	6	4862598	4862603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061012
128146	NC_010524	AGCG	2	8	4862620	4862627	25 %	0 %	50 %	25 %	171061012
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128152	NC_010524	CG	3	6	4862948	4862953	0 %	0 %	50 %	50 %	171061012
128153	NC_010524	TGG	2	6	4863001	4863006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061012
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128200	NC_010524	TCGA	2	8	4864413	4864420	25 %	25 %	25 %	25 %	171061015
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128215	NC_010524	CTG	2	6	4865580	4865585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061017
128216	NC_010524	CAC	2	6	4865609	4865614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061017
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128220	NC_010524	GGCC	2	8	4865717	4865724	0 %	0 %	50 %	50 %	171061017
128221	NC_010524	TGG	2	6	4865725	4865730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061017
128222	NC_010524	CCG	2	6	4865762	4865767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061017
128223	NC_010524	TTC	2	6	4865820	4865825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171061017
128224	NC_010524	CGA	2	6	4865843	4865848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061017
128225	NC_010524	GCA	2	6	4865906	4865911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061017
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128455	NC_010524	TCG	2	6	4874449	4874454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061025
128456	NC_010524	CGC	2	6	4874527	4874532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061025
128457	NC_010524	CCG	2	6	4874545	4874550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061025
128458	NC_010524	GCA	2	6	4874573	4874578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061025
128459	NC_010524	GCT	2	6	4874606	4874611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061025
128460	NC_010524	CTG	2	6	4874616	4874621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061025
128461	NC_010524	CG	3	6	4874626	4874631	0 %	0 %	50 %	50 %	171061025
128462	NC_010524	GC	3	6	4874639	4874644	0 %	0 %	50 %	50 %	171061025
128463	NC_010524	GGCG	2	8	4874702	4874709	0 %	0 %	75 %	25 %	171061025
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128482	NC_010524	GC	3	6	4875236	4875241	0 %	0 %	50 %	50 %	171061025
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128491	NC_010524	GCT	2	6	4875440	4875445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061025
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