MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_010524	ATC	2	6	4611635	4611640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060773
121502	NC_010524	CGC	2	6	4611645	4611650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060773
121503	NC_010524	ATC	2	6	4611659	4611664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060773
121504	NC_010524	CGA	2	6	4611691	4611696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060773
121505	NC_010524	GCA	2	6	4611720	4611725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060773
121506	NC_010524	ACG	2	6	4611749	4611754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060773
121507	NC_010524	CAG	2	6	4611790	4611795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060773
121508	NC_010524	GCACC	2	10	4611807	4611816	20 %	0 %	20 %	60 %	171060773
121509	NC_010524	CGG	2	6	4611820	4611825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060773
121510	NC_010524	CAG	2	6	4611841	4611846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060773
121511	NC_010524	CAG	3	9	4611856	4611864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060773
121512	NC_010524	CCAG	2	8	4611876	4611883	25 %	0 %	25 %	50 %	171060773
121513	NC_010524	CGC	2	6	4611887	4611892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060773
121514	NC_010524	CGGG	2	8	4611903	4611910	0 %	0 %	75 %	25 %	171060773
121515	NC_010524	GCG	2	6	4611927	4611932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060773
121516	NC_010524	CCA	2	6	4612093	4612098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060773
121517	NC_010524	GC	3	6	4612104	4612109	0 %	0 %	50 %	50 %	171060773
121518	NC_010524	CGG	3	9	4612131	4612139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060773
121519	NC_010524	CGG	2	6	4612149	4612154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060773
121520	NC_010524	GCC	2	6	4612354	4612359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060774
121521	NC_010524	GCAC	2	8	4612475	4612482	25 %	0 %	25 %	50 %	171060774
121522	NC_010524	GGC	2	6	4612500	4612505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060774
121523	NC_010524	GC	4	8	4612512	4612519	0 %	0 %	50 %	50 %	171060774
121524	NC_010524	CGG	2	6	4612584	4612589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060774
121525	NC_010524	CGC	2	6	4612592	4612597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060774
121526	NC_010524	CGG	2	6	4612613	4612618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060774
121527	NC_010524	GAA	2	6	4612648	4612653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060774
121528	NC_010524	TCG	2	6	4612670	4612675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060774
121529	NC_010524	ACGCC	2	10	4612706	4612715	20 %	0 %	20 %	60 %	171060774
121530	NC_010524	CGG	2	6	4612728	4612733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060774
121531	NC_010524	GCG	2	6	4612882	4612887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060775
121532	NC_010524	CGA	2	6	4612904	4612909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060775
121533	NC_010524	GCT	2	6	4612952	4612957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060775
121534	NC_010524	CGC	2	6	4612966	4612971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060775
121535	NC_010524	GTG	2	6	4613048	4613053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060775
121536	NC_010524	GCC	2	6	4613091	4613096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060775
121537	NC_010524	CGA	2	6	4613138	4613143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060775
121538	NC_010524	CACGC	2	10	4613161	4613170	20 %	0 %	20 %	60 %	171060775
121539	NC_010524	GCT	3	9	4613189	4613197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060775
121540	NC_010524	GCC	2	6	4613221	4613226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060775
121541	NC_010524	GCG	2	6	4613230	4613235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060775
121542	NC_010524	CGC	2	6	4613243	4613248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060775
121543	NC_010524	GCA	2	6	4613267	4613272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060775
121544	NC_010524	CG	3	6	4613292	4613297	0 %	0 %	50 %	50 %	171060776
121545	NC_010524	CGG	2	6	4613312	4613317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060776
121546	NC_010524	GTC	2	6	4613332	4613337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060776
121547	NC_010524	CG	4	8	4613359	4613366	0 %	0 %	50 %	50 %	171060776
121548	NC_010524	GAT	2	6	4613377	4613382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060776
121549	NC_010524	CGC	2	6	4613397	4613402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060776
121550	NC_010524	GGCC	2	8	4613418	4613425	0 %	0 %	50 %	50 %	171060776
121551	NC_010524	GC	3	6	4613454	4613459	0 %	0 %	50 %	50 %	171060776
121552	NC_010524	CAG	2	6	4613473	4613478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060776
121553	NC_010524	CACG	2	8	4613499	4613506	25 %	0 %	25 %	50 %	171060776
121554	NC_010524	CAC	2	6	4613536	4613541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060776
121555	NC_010524	CAG	2	6	4613677	4613682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060776
121556	NC_010524	TCGA	2	8	4613717	4613724	25 %	25 %	25 %	25 %	171060776
121557	NC_010524	CGG	2	6	4613799	4613804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060776
121558	NC_010524	CGC	2	6	4613817	4613822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060776
121559	NC_010524	TGG	2	6	4613955	4613960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060776
121560	NC_010524	CGA	2	6	4613964	4613969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060776
121561	NC_010524	GGC	2	6	4613971	4613976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060776
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121563	NC_010524	AGC	2	6	4614056	4614061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060776
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121565	NC_010524	ACG	2	6	4614133	4614138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060777
121566	NC_010524	GCATC	2	10	4614160	4614169	20 %	20 %	20 %	40 %	171060777
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121568	NC_010524	TTG	2	6	4614258	4614263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060777
121569	NC_010524	CTT	2	6	4614274	4614279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060777
121570	NC_010524	CTT	2	6	4614286	4614291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060777
121571	NC_010524	GTT	2	6	4614382	4614387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060777
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121586	NC_010524	CCG	2	6	4615320	4615325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060778
121587	NC_010524	GTT	2	6	4615474	4615479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060778
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121591	NC_010524	AAGTC	2	10	4615613	4615622	40 %	20 %	20 %	20 %	171060778
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121594	NC_010524	TG	3	6	4615711	4615716	0 %	50 %	50 %	0 %	171060778
121595	NC_010524	GC	3	6	4615732	4615737	0 %	0 %	50 %	50 %	171060778
121596	NC_010524	GCC	2	6	4615807	4615812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060778
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121598	NC_010524	CTG	2	6	4615901	4615906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060778
121599	NC_010524	CAG	2	6	4615927	4615932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060778
121600	NC_010524	ACCATG	2	12	4615973	4615984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060778
121601	NC_010524	GC	3	6	4616018	4616023	0 %	0 %	50 %	50 %	171060778
121602	NC_010524	CGCGC	2	10	4616085	4616094	0 %	0 %	40 %	60 %	171060779
121603	NC_010524	GCC	2	6	4616102	4616107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060779
121604	NC_010524	CAG	2	6	4616137	4616142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060779
121605	NC_010524	AGGTCG	2	12	4616165	4616176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060779
121606	NC_010524	GC	3	6	4616196	4616201	0 %	0 %	50 %	50 %	171060779
121607	NC_010524	CTT	2	6	4616227	4616232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060779
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121610	NC_010524	TCGGC	2	10	4616283	4616292	0 %	20 %	40 %	40 %	171060779
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