MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
118501	NC_010524	GCT	2	6	4510244	4510249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060696
118502	NC_010524	AGC	2	6	4510252	4510257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060696
118503	NC_010524	GGC	2	6	4510284	4510289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060696
118504	NC_010524	GCG	2	6	4510388	4510393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060696
118505	NC_010524	G	6	6	4510397	4510402	0 %	0 %	100 %	0 %	171060696
118506	NC_010524	GCG	2	6	4510422	4510427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060696
118507	NC_010524	GCG	2	6	4510521	4510526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060697
118508	NC_010524	TGC	2	6	4510554	4510559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060697
118509	NC_010524	ATGCCG	2	12	4510565	4510576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060697
118510	NC_010524	CGG	2	6	4510606	4510611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060697
118511	NC_010524	CGGTG	2	10	4510639	4510648	0 %	20 %	60 %	20 %	171060697
118512	NC_010524	CG	4	8	4510663	4510670	0 %	0 %	50 %	50 %	171060697
118513	NC_010524	TCGG	2	8	4510721	4510728	0 %	25 %	50 %	25 %	171060697
118514	NC_010524	CTG	2	6	4510733	4510738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060697
118515	NC_010524	CGCCAC	2	12	4510747	4510758	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060697
118516	NC_010524	GCCG	2	8	4510813	4510820	0 %	0 %	50 %	50 %	171060697
118517	NC_010524	GGCC	2	8	4510880	4510887	0 %	0 %	50 %	50 %	171060697
118518	NC_010524	CG	3	6	4510971	4510976	0 %	0 %	50 %	50 %	171060698
118519	NC_010524	GCC	2	6	4510994	4510999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060698
118520	NC_010524	GCA	2	6	4511002	4511007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118521	NC_010524	GCC	2	6	4511109	4511114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060698
118522	NC_010524	GCA	2	6	4511152	4511157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118523	NC_010524	CG	3	6	4511214	4511219	0 %	0 %	50 %	50 %	171060698
118524	NC_010524	CAGCG	2	10	4511238	4511247	20 %	0 %	40 %	40 %	171060698
118525	NC_010524	GCA	2	6	4511254	4511259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118526	NC_010524	CGG	2	6	4511279	4511284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060698
118527	NC_010524	CGT	2	6	4511386	4511391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118528	NC_010524	CGGC	2	8	4511419	4511426	0 %	0 %	50 %	50 %	171060698
118529	NC_010524	GCC	2	6	4511439	4511444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060698
118530	NC_010524	GC	3	6	4511455	4511460	0 %	0 %	50 %	50 %	171060698
118531	NC_010524	CGA	2	6	4511465	4511470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118532	NC_010524	GC	3	6	4511480	4511485	0 %	0 %	50 %	50 %	171060698
118533	NC_010524	CAC	2	6	4511486	4511491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060698
118534	NC_010524	GAC	2	6	4511526	4511531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118535	NC_010524	GC	3	6	4511537	4511542	0 %	0 %	50 %	50 %	171060698
118536	NC_010524	GCGCCT	2	12	4511569	4511580	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171060698
118537	NC_010524	TCG	2	6	4511583	4511588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118538	NC_010524	CGG	2	6	4511599	4511604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060698
118539	NC_010524	CCG	2	6	4511605	4511610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060698
118540	NC_010524	CAC	2	6	4511618	4511623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060698
118541	NC_010524	CGGGC	2	10	4511669	4511678	0 %	0 %	60 %	40 %	171060698
118542	NC_010524	GCG	2	6	4511692	4511697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060698
118543	NC_010524	CCA	2	6	4511723	4511728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060698
118544	NC_010524	CAG	2	6	4511729	4511734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060698
118545	NC_010524	GAA	2	6	4511915	4511920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060699
118546	NC_010524	CCT	2	6	4511932	4511937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060699
118547	NC_010524	CCGCA	2	10	4511996	4512005	20 %	0 %	20 %	60 %	171060699
118548	NC_010524	GC	3	6	4512018	4512023	0 %	0 %	50 %	50 %	171060699
118549	NC_010524	GGC	2	6	4512054	4512059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060699
118550	NC_010524	GC	3	6	4512086	4512091	0 %	0 %	50 %	50 %	171060699
118551	NC_010524	ACC	2	6	4512099	4512104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060699
118552	NC_010524	GCA	2	6	4512115	4512120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118553	NC_010524	AGC	3	9	4512174	4512182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118554	NC_010524	GCC	2	6	4512189	4512194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060699
118555	NC_010524	CAG	2	6	4512221	4512226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118556	NC_010524	AGGCCG	2	12	4512249	4512260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171060699
118557	NC_010524	GCA	3	9	4512313	4512321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118558	NC_010524	CGT	2	6	4512323	4512328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118559	NC_010524	CGC	2	6	4512341	4512346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060699
118560	NC_010524	CGG	2	6	4512355	4512360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060699
118561	NC_010524	CG	3	6	4512424	4512429	0 %	0 %	50 %	50 %	171060699
118562	NC_010524	GCG	3	9	4512427	4512435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060699
118563	NC_010524	GTC	2	6	4512446	4512451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118564	NC_010524	AGC	2	6	4512492	4512497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118565	NC_010524	CG	3	6	4512500	4512505	0 %	0 %	50 %	50 %	171060699
118566	NC_010524	CGT	2	6	4512514	4512519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060699
118567	NC_010524	GGC	2	6	4512524	4512529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060699
118568	NC_010524	TTC	3	9	4512576	4512584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060699
118569	NC_010524	CGGGC	2	10	4512586	4512595	0 %	0 %	60 %	40 %	171060699
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118571	NC_010524	GGC	2	6	4512820	4512825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060700
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118573	NC_010524	GGC	2	6	4512845	4512850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060700
118574	NC_010524	CGC	2	6	4512895	4512900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060700
118575	NC_010524	CTGCG	2	10	4513012	4513021	0 %	20 %	40 %	40 %	171060700
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118579	NC_010524	CGG	2	6	4513192	4513197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060700
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118581	NC_010524	GC	3	6	4513260	4513265	0 %	0 %	50 %	50 %	171060700
118582	NC_010524	TCG	2	6	4513272	4513277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060700
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118585	NC_010524	TCG	2	6	4513506	4513511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060700
118586	NC_010524	ACG	2	6	4513534	4513539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060700
118587	NC_010524	CATGCT	2	12	4513562	4513573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171060700
118588	NC_010524	GCC	2	6	4513580	4513585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060700
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118596	NC_010524	TGC	2	6	4513858	4513863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060700
118597	NC_010524	GAA	2	6	4513865	4513870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060700
118598	NC_010524	GGC	2	6	4513904	4513909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060700
118599	NC_010524	CAG	2	6	4514023	4514028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060701
118600	NC_010524	GCC	2	6	4514083	4514088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060701
118601	NC_010524	CGC	2	6	4514097	4514102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060701
118602	NC_010524	ACC	2	6	4514108	4514113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060701
118603	NC_010524	GC	3	6	4514145	4514150	0 %	0 %	50 %	50 %	171060701
118604	NC_010524	GCC	2	6	4514158	4514163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060701
118605	NC_010524	TCG	2	6	4514193	4514198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060701
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118607	NC_010524	GCA	2	6	4514292	4514297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060701
118608	NC_010524	GC	3	6	4514361	4514366	0 %	0 %	50 %	50 %	171060701
118609	NC_010524	CGG	2	6	4514388	4514393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060701
118610	NC_010524	AAGG	2	8	4514410	4514417	50 %	0 %	50 %	0 %	171060701
118611	NC_010524	GCCG	2	8	4514440	4514447	0 %	0 %	50 %	50 %	171060701
118612	NC_010524	CG	3	6	4514458	4514463	0 %	0 %	50 %	50 %	171060701
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